湖南湖北两省H_6亚型禽流感病毒表面基因的序列分析

作     者：丁晴微 于杨 崔鹏飞 齐瑛琳 李印 施建忠 崔佳莹 邱伯根 陈化兰 邓国华 Ding Qingwei;Yu Yang;Cui Pengfei;Qi Yinglin;Li Yin;Shi Jianzhong;Cui Jiaying;Qiu Bogen;Chen Hualan;Deng Guohua

作者机构：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室兽医生物技术国家重点实验室哈尔滨150001 湖南农业大学动物医学院长沙410128 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2011年第30卷第3期

页      面：282-287页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家重点实验室国家开放基金(SKLVBP201003)资助 

主　　题：禽流感病毒 H6亚型 HA NA 基因分析 

摘      要：2008年至2009年间,在湖南和湖北两省的活禽市场中分离到了14株H6亚型禽流感病毒,为了解这14株病毒之间的分子特征和差异,我们运用PCR和测序鉴定对这14株病毒的NA基因进行了分型,并对其表面基因HA和NA进行序列测定及序列分析。14株H6亚型病毒中,H6N2亚型12株,H6N6亚型2株。序列测定和进化分析结果显示:DK/HN/284的HA基因与其它13株的HA差异性较大,差异性达到19.4%～20.2%,其余13株毒同源性在94.2%～99.9%;N2亚型NA基因的同源性在91.1%～99.9%,差异性比较大;两株N6亚型NA基因同源性为89.5%,差异明显。这些数据表明:不同毒株呈现一定的地域性差异。与我国周边其它地区的H6亚型禽流感毒株序列进行比较发现,只有DK/HN/284的HA基因与香港早期的毒株可能有着共同的来源,其余都与香港和韩国等的毒株有着较大的差异性,并且各个毒株的HA基因上潜在的糖基化位点和受体结合位点也有所不同,这些数据表明,这些毒株表现出明显的异源性。