犬瘟热病毒TN野毒株核蛋白基因的克隆与序列分析

作     者：孟庆玲 乔军 陈创夫 

作者机构：塔里木农垦大学动物科技学院新疆阿拉尔843300 石河子大学动物科技学院新疆石河子833200 

出 版 物：《中国兽医科技》 (Chinese Journal of Veterinary Science and Technology)

年 卷 期：2004年第34卷第4期

页      面：24-28页

核心收录：

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

主　　题：犬瘟热病毒 TN野毒株 核蛋白基因 克隆 序列分析 分子结构 氨基酸 CDV 

摘      要：根据GenBank中收录的犬瘟热病毒(CDV)Onderstepoort株核蛋白基因(N)序列,设计了1对特异性引物,用该引物对分离的TN野毒株进行了RT PCR扩增;将扩增得到的PCR片段纯化后与pGEM T质粒连接,得到重组质粒pTN。经核苷酸序列测定,CDVTN株N基因的ORF全长1569bp,编码523个氨基酸;将TN野毒株与GenBank中收录的其他CDV毒株进行比较,N基因核苷酸序列的同源性为94%～99%,推导的N蛋白氨基酸序列的同源性为97%～99%。TN株与Onderstepoort疫苗株氨基酸序列的差异主要集中在N端(17～159位)和C端(408～519位),中间的区域则高度保守。此外,在CDVN蛋白N端281～289位上也发现存在与麻疹病毒(MV)N蛋白完全相同的Y P A L G L H E F9肽序列,推测可能是诱导CTL活性的靶蛋白的抗原表位之一。氨基酸组成分析发现,推导的N蛋白氨基酸序列中亮氨酸、丝氨酸和异亮氨酸所占比例很高,提示该蛋白具有高度螺旋和缠绕的分子结构。