检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：何崇单中南林业科技大学

学位级别：硕士

银杏（Ginkgo biloba L.）是地球上现存的最古老树种之一，是我国特有的集食用、药用和观赏等多种价值于一体的经济树种。我国拥有全世界的80％以上的银杏资源，近二十年来，银杏产业发展迅速，然而，银杏是单科单属单种的孑遗植物，遗... 详细信息

银杏（Ginkgo biloba L.）是地球上现存的最古老树种之一，是我国特有的集食用、药用和观赏等多种价值于一体的经济树种。我国拥有全世界的80％以上的银杏资源，近二十年来，银杏产业发展迅速，然而，银杏是单科单属单种的孑遗植物，遗传背景狭窄，优良品种缺乏，选育难度大。而且，银杏童期长达20年，又名公孙树，严重限制了银杏育种的进程，也降低了农民栽培的积极性。另外，虽然银杏常作为庭园、行道树，但由于其外种皮的异味和花粉的飞扬，导致其应用范围也十分有限。因此，银杏优良品种的选育是银杏产业亟待解决的核心问题。缩短银杏的童期，培育早花品种对于银杏的推广种植十分关键。揭示银杏开花调控的分子机理，则是解决这一关键问题的前提条件。鉴定银杏开花调控的关键基因，揭示银杏开花调控的主要分子机制，为选育银杏早花品种提供理论指导。\n 1、采用高通量测序技术对银杏3个发育时期（花芽未分化期、花芽分化始期、花芽分化盛期）的样本进行转录组测序，并通过数字表达谱分析筛选与银杏开花调控相关的基因和代谢途径。转录组测序共产生52.34 Gb原始数据，各样品数据量均达到7.13 Gb以上。序列比对发现，银杏基因与裸子植物北美云杉（Picea sitchensis）的同源基因数量最高(10，834，31.14％)，其次是同为孑遗植物的无油樟(Amborella trichopoda)(3，675，10.56％)，再其次是莲(Nelumbonucifera)(2，721，7.82％);注释到8大功能数据库(GO、COG、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot、eggNOG)上的Unigene总数为35，179个，在大部分数据库中注释的Unigenes数量都超过20，000条。Unigene GO数据库比对分析，序列分成分子功能、细胞组分、生物过程3个大类50个小类。其中，代谢过程(7，344条)、催化活性（5，440条）、细胞过程（3，314条）、细胞成分（2，638条）、单一有机体进程（2，570条）等富集程度较高。Unigenes与COG数据库比对并进行直系同源分类，结果显示共分为25个类别，其中R（一般功能预测）包含的基因数最多，有3，356条，L（复制、重组、修复）2，234条、K（转录）1，710条和T（信号转导机制）1，504条等途径数量较多。\n 2、银杏转录组差异表达基因分析显示，花芽分化始期vs.花芽未分化期有2，253个基因上调，2，032个基因下调;花芽分化盛期vs.花芽分化始期有1，770个基因上调，1，901个基因下调;花芽分化盛期vs.花芽未分化期有1，865个基因上调，2，042个基因下调。KEGG分析表明，差异表达基因多富集于与花芽分化相关的代谢途径中。发掘出大量与开花相关的基因，并分析其表达模式，筛选出与开花相关的6个候选关键基因:***_17618（GI基因）、***_19790（FT/TFL1同源基因）、***_16301(AG同源基因)、***_28337（花发育MADS-box基因）、***_41704（CO同源基因）、***_01884(SOC1同源基因GbMADS9)。\n 3、结合转录组数据库对银杏短枝茎端花芽进行qPCR内参基因选择，为后期的银杏相关基因的表达分析提供一个可靠的均一化标准。采用qPCR技术分析了银杏中6个管家基因18S rRNA（18S核糖体RNA）、Actin-7（肌动蛋白）、β-TUB（β微管蛋白）、DNAJ（DnaJ蛋白）、EF1a（转录延伸因子）、GAPDH（3-磷酸甘油醛脱氢酶）的表达量，再使用geNorm和Norm Fmder软件，对6个候选内参基因在银杏花芽中的表达稳定性进行评价。筛选出表达稳定的GADPH基因作为内参基因。然后，通过qPCR筛选出的内参基因检测6个候选关键基因***_17618、***_19790、***_16301、***_28337、***_41704、***_01884的表达量以验证转录组数据库的正确性，确保分析结果的真实性和准确性。结果显示，定量PCR结果与转录组数据分析结果一致。

关键词：银杏花芽转录组测序开花基因 qPCR技术

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基于银杏花芽3个分化时期转录组测序的相关基因筛选与表达分析

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园艺学报 2018年第8期45卷 1479-1490页

作者：何崇单蔡雨蒙李萌董金金刘伟王俊燚王义强中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室长沙410004 中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室长沙410004

鉴定银杏花芽分化调控的关键基因,揭示银杏花芽分化调控的主要分子机制,为缩短银杏童期和选育银杏早花品种提供理论指导。本研究中采用高通量测序技术对银杏花芽分化3个时期(花芽未分化期、花芽分化始期、花芽分化盛期)的样品进行转录... 详细信息

鉴定银杏花芽分化调控的关键基因,揭示银杏花芽分化调控的主要分子机制,为缩短银杏童期和选育银杏早花品种提供理论指导。本研究中采用高通量测序技术对银杏花芽分化3个时期(花芽未分化期、花芽分化始期、花芽分化盛期)的样品进行转录组测序,并分析数字表达谱,筛选开花调控相关基因并进行荧光定量PCR(RT-qPCR)表达验证。转录组测序共产生27.52 Gb原始数据,注释到8大功能数据库(GO、COG、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot、egg NOG)上的unigene总数为35 179个。通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,将unigene分别归于55个GO类别和126个代谢途径。差异表达基因分析显示,花芽未分化期较花芽分化始期有2 253个基因上调,2 032个基因下调;花芽分化始期较花芽分化盛期有1 770个基因上调,1 901个基因下调;花芽未分化期较花芽分化盛期有1 865个基因上调,2 042个基因下调。发掘出大量的开花相关的基因涉及5个开花调控途径(光周期途径、春化途径、赤霉素途径、自主途径和年龄途径)。筛选出***_17618(GI序列)、***_19790(FT/TFL1序列)、***_16301(AG序列)、***_28337(花发育MADS-box序列)、***_01884(SOC1序列)和***_41704(CO序列)等6个银杏花芽分化差异表达关键基因序列,荧光定量PCR检测表达水平与转录组结果一致。

关键词：银杏转录组测序开花调控 GI FT/TFL1 SOC1

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高等植物开花调控关键基因研究进展

高等植物开花调控关键基因研究进展

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全国第二十二次银杏学术研讨会、首届国际银杏峰会

作者：何崇单蔡雨蒙王启业王义强中南林业科技大学生命科学与技术学院生物技术实验室长沙410004

开花是开花植物从营养生长向生殖生长的转变过程,是植物繁衍和进化的重要途径.本文以高等植物开花过程中基因参与调控的多条遗传路径为出发点,对FT、SOC1、FLC、TFL1、SPL、AP1等关键整合因子为纽带的植物开花基因调控模式进行了归纳总... 详细信息

开花是开花植物从营养生长向生殖生长的转变过程,是植物繁衍和进化的重要途径.本文以高等植物开花过程中基因参与调控的多条遗传路径为出发点,对FT、SOC1、FLC、TFL1、SPL、AP1等关键整合因子为纽带的植物开花基因调控模式进行了归纳总结,以期为进一步研究高等植物开花分子调控机制提供参考.

关键词：高等植物开花过程基因调控遗传路径

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外源K-IBA对北美香柏扦插生根和内源激素含量变化的影响

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中南林业科技大学学报 2017年第10期37卷 7-12页

作者：何崇单姚锐黄瑞春米小琴张超谭益民王义强中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南吉首416713 中南林业科技大学中南林业科技大学生物技术实验室湖南长沙410004 湘西州森林生态研究实验站湖南吉首416713

以北美香柏Thuja occidentals L.2年生枝条为材料,采用3-吲哚丁酸钾盐(K-IBA)3个浓度(3 000、6 000、10 000 mg/L)处理扦插生根试验,清水处理为对照。扦插60天后统计插穗生根率、平均根长、最长根长、平均生根数。扦插后每隔15 d从6 000... 详细信息

以北美香柏Thuja occidentals L.2年生枝条为材料,采用3-吲哚丁酸钾盐(K-IBA)3个浓度(3 000、6 000、10 000 mg/L)处理扦插生根试验,清水处理为对照。扦插60天后统计插穗生根率、平均根长、最长根长、平均生根数。扦插后每隔15 d从6 000 mg/L K-IBA与对照处理插穗的基部取样,测定生根过程中内源激素吲哚乙酸(IAA)、赤霉素(GA)、脱落酸(ABA)和玉米素(ZT)含量的变化。结果表明:外源K-IBA对北美香柏扦插生根有促进作用,其中6 000 mg/L K-IBA的处理效果最好,其生根率为87.78%、生根数22.33根、平均根长12.33 mm、最长根长75.20 mm,显著高于对照。与对照相比,6 000 mg/L K-IBA处理组的内源IAA含量、GA含量提高,而内源ABA、ZT含量下降,促使生根率提高。在北美香柏扦插生根过程中,K-IBA处理调节了内源激素IAA、GA、ABA和ZT含量的变化,而内源激素的动态变化,共同调控插穗不定根的形成。

关键词：北美香柏扦插不定根发育内源激素

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银杏CONSTANS-LIKE基因的克隆与序列分析

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中南林业科技大学学报 2018年第12期38卷 121-128页

作者：蔡雨蒙何崇单李萌董金金刘伟王俊燚王义强中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙410004

为阐明银杏开花调控机制,对不同时期的银杏叶片进行了转录组测序,通过分析开花前后表达量差异较大的基因,筛选出1个与开花调控相关的CONSTANS-LIKE基因。使用RT-PCR法从银杏叶片cDNA中克隆得到该基因的完整编码序列(CDS),命名为GbCOL。G... 详细信息

为阐明银杏开花调控机制,对不同时期的银杏叶片进行了转录组测序,通过分析开花前后表达量差异较大的基因,筛选出1个与开花调控相关的CONSTANS-LIKE基因。使用RT-PCR法从银杏叶片cDNA中克隆得到该基因的完整编码序列(CDS),命名为GbCOL。GbCOL基因的CDS序列全长为1 239 bp,编码产物含412个氨基酸。核苷酸和蛋白质序列多重比对结果显示,GbCOL与其他植物的CO基因的核苷酸与蛋白质序列具有一定的同源性,与裸子植物中的CO基因同源性较高。该基因的蛋白产物具有典型的CONSTANS蛋白保守结构,包含2个高度保守的B-box及CCT结构域。该基因可能在银杏开花调控过程中发挥重要作用。

关键词：银杏 CONSTANS基因克隆开花调控

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一种用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒

一种用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒

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作者：何崇单申耘田洁 518000 广东省深圳市光明区马田街道合水口社区第七工业区第三栋厂房A802

本发明公开了一种用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒，方法包括:获取具有多态性区域的靶基因序列，所述靶基因序列包括插入/缺失多态性位点；将所述靶基因序列中的高度保守区作为引物设计区，将具有多态性位点的区域... 详细信息

标准号: CN116397009A

本发明公开了一种用于基因多态性检测的探针设计方法、检测方法和试剂盒，方法包括:获取具有多态性区域的靶基因序列，所述靶基因序列包括插入/缺失多态性位点；将所述靶基因序列中的高度保守区作为引物设计区，将具有多态性位点的区域作为扩增区，以所述多态性位点作为探针结合区，设计与所述靶基因序列对应的若干个检测对，其中，每一个所述检测对包括上游引物、下游引物和探针序列，所述探针序列包括分别与所述插入序列的上游区域、插入片段的重复区域和所述插入序列的下游区域结合的片段；基于预设的筛选规则，对所述探针序列进行筛选，得到目标探针。本发明通过单条探针实现对基因多态性的精确检测，提高检测效率。

关键词：靶基因序列探针序列检测多态性位点插入序列基因多态性检测多态性区域高度保守区基因多态性缺失多态性探针结合区插入片段目标探针筛选规则上游区域上游引物探针设计下游区域下游引物引物设计重复区域试剂盒单条扩增探针位点预设筛选

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基于转录组测序的银杏类黄酮生物合成关键基因表达分析

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中草药 2018年第23期49卷 5633-5639页

作者：刘伟王俊燚李萌董金金何崇单汪贵斌郁万文王义强中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室湖南长沙410004 南京林业大学林学院江苏南京210037

目的对银杏进行转录组测序,分析银杏生长发育不同时期类黄酮生物合成关键基因的表达。方法以银杏幼年树和成年树不同时期叶片作为供试材料,利用Illumina HiSeq 2000进行转录组测序,对Unigene进行功能注释,分析银杏类黄酮生物合成关键基... 详细信息

目的对银杏进行转录组测序,分析银杏生长发育不同时期类黄酮生物合成关键基因的表达。方法以银杏幼年树和成年树不同时期叶片作为供试材料,利用Illumina HiSeq 2000进行转录组测序,对Unigene进行功能注释,分析银杏类黄酮生物合成关键基因的表达特征。结果转录组测序共获得43 073条Unigene,其中35 179条被注释,基因差异表达(DEG)筛选得到5 117个基因。通过对类黄酮合成相关KEGG途径进行分析,筛选出50条候选基因。分析50条候选基因的表达规律,发现类黄酮合成关键基因均在银杏幼叶中高表达,但在成年树与幼年树同时期叶片之间表达差异不显著。分析与类黄酮合成关系密切的13个基因发现,其中肉桂酸4-羟化酶(C4H)、查耳酮合成酶(CHS)、花青素合成酶(ANS)、花青素还原酶(ANR)和类黄酮O-甲基转移酶(FOMT)基因的表达量较高,类黄酮3′-羟化酶(F3′H)、类黄酮3′,5′-羟化酶(F3′5′H)和黄酮醇合成酶(FLS)基因的表达量则相对较低。结论通过转录组高通量测序,筛选分析了银杏类黄酮生物合成的关键基因及其表达特征,为提高银杏类黄酮产量提供了分子生药学理论基础。

关键词：银杏转录组类黄酮黄酮醇 Illumina HiSeq 2000

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银杏MADS-box基因家族的表达及系统发育分析

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植物生理学报 2018年第6期54卷 1055-1063页

作者：董金金刘伟李萌王俊燚何崇单蔡雨蒙王启业王义强中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室长沙410004 中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室长沙410004

MADS-box基因是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物花器官发育中发挥重要的调控作用。为了探究MADS-box家族基因在银杏花发育中的功能,本文对银杏花芽分化4个时期的样品进行转录组测序,筛选其中的MADS-box家族基因,利用... 详细信息

MADS-box基因是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物花器官发育中发挥重要的调控作用。为了探究MADS-box家族基因在银杏花发育中的功能,本文对银杏花芽分化4个时期的样品进行转录组测序,筛选其中的MADS-box家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位和系统进化分析。结果显示:共得到15个银杏MADS-box家族基因。表达分析表明,目标基因根据表达模式可以分为3种类型。分析目标基因的编码序列显示,15个银杏MADS-box蛋白的主要构件均为α-螺旋和无规则卷曲;亚细胞定位预测主要在细胞核内;所有表达产物均包含MADS结构域。聚类分析显示,银杏MADSbox基因家族可分为6个亚类。银杏MADS-box基因家族中的new Gb2734、Gb38883、Gb28587和Gb33168可能在银杏开花调控中发挥重要作用;Gb16301可能是银杏花器官的发育过程中的关键基因。

关键词：银杏 MADS-box基因家族开花调控花器官发育

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一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置

一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置

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作者：刘振利张荣杰李溟王维刘振国徐鑫吴宏立马永权单国志王丽莉何崇杰 130000 吉林省长春市高新区卫明街999号

本发明涉及一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置，属于机械加工领域。在两个立板内侧的上部，靠近上板的位置，有两个键槽，在键槽里分别装有夹紧块，夹紧块有两个沉头孔，两个内六角螺栓分别穿过夹紧块的沉头孔，和立板通过螺纹连接，... 详细信息

标准号: CN106975939A

本发明涉及一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置，属于机械加工领域。在两个立板内侧的上部，靠近上板的位置，有两个键槽，在键槽里分别装有夹紧块，夹紧块有两个沉头孔，两个内六角螺栓分别穿过夹紧块的沉头孔，和立板通过螺纹连接，并采用螺母锁紧内六角螺栓，弹簧限位销装在夹紧块的限位销孔内，调整螺栓通过螺纹连接装在立板上，在调整螺栓的头部有弹簧限位孔，压缩弹簧一头装在弹簧限位销上，另一头装在调整螺栓头部的弹簧限位孔里，夹紧块上斜面角度α在40—45°之间，下斜面角度β在60—65°之间，两面连接圆弧面半径在R2.0—R3.0之间。本发明的优点在于：结构新颖简单，在装夹工件时能够实现单手操作，减少操作步骤，工件装夹稳定，装夹工件可靠，调整简单方便。

关键词：夹紧块调整螺栓立板弹簧限位孔内六角螺栓弹簧限位螺纹连接装夹工件沉头孔键槽辅助夹紧装置机械加工领域单手操作工件装夹连接圆弧限位销孔压缩弹簧螺母锁上斜面下斜面上板竖孔轴向穿过加工夹紧块调整螺栓立板弹簧限位孔内六角螺栓弹簧限位螺纹连接沉头孔键槽辅助夹紧装置连接圆弧限位销孔压缩弹簧螺母锁上斜面下斜面上板竖孔轴向穿过加工

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一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置

一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置

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作者：刘振利张荣杰李溟王维刘振国徐鑫吴宏立马永权单国志王丽莉何崇杰 130000 吉林省长春市高新区卫明街999号

本实用新型涉及一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置，属于机械加工领域。在两个立板内侧的上部，靠近上板的位置，有两个键槽，在键槽里分别装有夹紧块，夹紧块有两个沉头孔，两个内六角螺栓分别穿过夹紧块的沉头孔，和立板通过螺纹连... 详细信息

标准号: CN206795269U

本实用新型涉及一种用于轴向竖孔加工的辅助夹紧装置，属于机械加工领域。在两个立板内侧的上部，靠近上板的位置，有两个键槽，在键槽里分别装有夹紧块，夹紧块有两个沉头孔，两个内六角螺栓分别穿过夹紧块的沉头孔，和立板通过螺纹连接，并采用螺母锁紧内六角螺栓，弹簧限位销装在夹紧块的限位销孔内，调整螺栓通过螺纹连接装在立板上，在调整螺栓的头部有弹簧限位孔，压缩弹簧一头装在弹簧限位销上，另一头装在调整螺栓头部的弹簧限位孔里，夹紧块上斜面角度α在40—45°之间，下斜面角度β在60—65°之间，两面连接圆弧面半径在R2.0—R3.0之间。本实用新型的优点在于：结构新颖简单，在装夹工件时能够实现单手操作，减少操作步骤，工件装夹稳定，装夹工件可靠，调整简单方便。

关键词：夹紧块调整螺栓立板本实用新型弹簧限位孔内六角螺栓弹簧限位螺纹连接装夹工件沉头孔键槽辅助夹紧装置机械加工领域单手操作工件装夹连接圆弧限位销孔压缩弹簧螺母锁上斜面下斜面上板竖孔轴向穿过加工

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