检索结果-内蒙古大学图书馆

植物生态学报 2011年第12期35卷 1256-1270页

作者：高利霞毕润成闫明山西师范大学生命科学学院山西临汾041004

物种多度格局分析对理解群落结构具有重要的意义。该文首次选用描述种-多度关系的生态位模型(生态位优先模型NPM、分割线段模型BSM、生态位重叠模型ONM)、生物统计模型(对数级数分布模型LSD、对数正态分布模型LN)以及中性理论模型NT,对... 详细信息

物种多度格局分析对理解群落结构具有重要的意义。该文首次选用描述种-多度关系的生态位模型(生态位优先模型NPM、分割线段模型BSM、生态位重叠模型ONM)、生物统计模型(对数级数分布模型LSD、对数正态分布模型LN)以及中性理论模型NT,对山西霍山油松(Pinus tabulaeformis)林的物种数量关系进行了拟合研究,并采用卡方(χ2)检验、Likelihood-ratios(L-R)检验、Kolmogorov-Smirnov(K-S)检验和赤池信息量准则(AIC)选择最适合模型,结果表明:(1)描述乔木层物种多度格局的最优生态位模型为NPM(3种检验方法均接受该模型,p>0.05,且该模型具有最小的AIC值),ONM的拟合效果次之,不服从BSM;三种生态位模型均可较好地拟合灌木层物种多度格局;ONM是草本层最佳生态位模型,BSM、NPM拟合效果较差;LSD可以描述油松林各层物种多度结构;LN可以很好地解释灌草层物种数量关系;NT不能解释油松林任何层次的物种多度结构。(2)霍山油松林乔木层和灌木层的物种丰富度和物种多样性均明显小于草本层;该群落物种富集种少而稀疏种多,且群落的均匀度相对较小。(3)从该区油松林种-多度分布来看,同一个模型可以拟合不同的物种多度数据,相同的数据可以由不同的模型来解释。因此,研究森林群落物种分布时,应采用多个模型进行拟合,同时选用多种方法筛选最优模型。

关键词：中性理论模型生态位模型油松林种-多度曲线物种多度分布种-多度关系统计模型

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长白山不同演替阶段针阔混交林群落物种多度分布格局

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植物生态学报 2012年第9期36卷 923-934页

作者：闫琰张春雨赵秀海北京林业大学森林资源与生态系统过程北京市重点实验室北京100083

为解释长白山温带森林群落构建和物种多度格局的形成过程,该文以不同演替阶段的针阔混交林监测样地数据为基础,采用中性理论模型、生物统计模型(对数正态分布模型)和生态位模型(Zifp模型、分割线段模型、生态位优先模型)拟合森林群落物... 详细信息

为解释长白山温带森林群落构建和物种多度格局的形成过程,该文以不同演替阶段的针阔混交林监测样地数据为基础,采用中性理论模型、生物统计模型(对数正态分布模型)和生态位模型(Zifp模型、分割线段模型、生态位优先模型)拟合森林群落物种多度分布,并用χ2检验、Kolmogorov-Smirnov(K-S)检验和赤池信息准则(AIC)选择最佳拟合模型。结果显示:中性模型能很好地预测长白山温带森林不同演替阶段植物群落的物种多度分布。在10m×10m尺度上,5种模型均可被χ2检验和K-S检验接受,但中性模型拟合效果不如对数正态分布模型、Zifp模型、分割线段模型和生态位优先模型,表明小尺度上中性过程和生态位过程均能解释群落物种多度分布,但生态位过程的解释能力相对较大。而在中大尺度上(30m×30m、60m×60m和90m×90m),中性模型为最优拟合模型,并且随着研究尺度增加,生态位模型和生物统计模型逐渐被χ2检验拒绝,表明中性过程在长白山针阔混交林群落物种多度分布格局形成中的作用随着研究尺度增加而逐渐增大。该文证实了中性过程在长白山温带针阔混交林群落结构形成中具有重要作用,但未否认生态位机制在群落构建中的贡献。因此,温带森林群落构建过程中中性理论和生态位理论并非相互矛盾,而是相互融合的。在研究森林群落物种多度分布时,应重视取样尺度和演替阶段的影响,并采用多种模型进行拟合。

关键词：中性理论模型生态位模型取样尺度统计模型温带森林

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天童常绿阔叶林中常绿与落叶物种的物种多度分布格局

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生物多样性 2016年第6期24卷 629-638页

作者：方晓峰杨庆松刘何铭马遵平董舒曹烨袁铭皎费希旸孙小颖王希华华东师范大学生态与环境科学学院上海200241 河北地质大学水资源与环境学院石家庄050031 浙江天童森林生态系统国家野外科学观测研究站浙江宁波315114

物种多度分布是对群落内不同物种多度情况的数量描述,作为理解群落性质的基石,其形成机制受到广泛关注。常绿与落叶物种是两类有着不同物候性状与生长策略的物种集合,它们普遍共存于常绿阔叶林中。在天童20 ha常绿阔叶林动态监测样地内... 详细信息

物种多度分布是对群落内不同物种多度情况的数量描述,作为理解群落性质的基石,其形成机制受到广泛关注。常绿与落叶物种是两类有着不同物候性状与生长策略的物种集合,它们普遍共存于常绿阔叶林中。在天童20 ha常绿阔叶林动态监测样地内,虽然常绿物种在物种多度和胸高断面积等指标上占有绝对优势,但其在物种丰富度上却不及落叶物种。分析两者在常绿阔叶林中的物种多度分布特征,能够为理解常绿阔叶林内物种多样性的维持机制提供一个全新的视角。为此,我们基于天童样地的植被调查数据,一方面利用累积经验分布函数对两类生活型植物的物种多度分布进行描述,使用Kolmogorov-Smirnov检验(K-S检验)判断其差异性;另一方面,采用纯统计模型、生态位模型和中性理论模型对二者的物种多度分布曲线进行拟合,并基于K-S检验的结果以及AIC值进行最优模型的筛选。结果显示:(1)常绿与落叶物种的物种多度分布曲线间并无显著差异。(2)在选用的3类模型中,中性理论模型对于两类物种多度分布曲线的拟合效果都最好,而生态位模型的拟合效果则一般。从上述结果可以看出,尽管常绿与落叶物种在物种数量和多度等方面均存在差异,但它们却有着近似的物种多度分布格局以及相近的多样性维持机制。然而,鉴于模型拟合的结果只能作为理解群落多样性构建机制的必要非充分条件,故而只能初步判定中性过程对于常绿与落叶物种的物种多样性格局影响更大,却不能排除或衡量诸如生态位分化等其他过程在两类生活型多样性格局形成中的贡献。

关键词：累积经验分布函数模型拟合中性理论模型生态位模型纯统计模型物种多度分布

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亚热带常绿阔叶林群落物种多度分布格局对取样尺度的响应

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生物多样性 2011年第2期19卷 168-177页

作者：程佳佳米湘成马克平张金屯北京师范大学生命科学学院北京100875 中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室北京100093

为揭示物种多度格局随尺度的变化规律,探讨多度格局形成的机理及生态学过程,作者以古田山亚热带常绿阔叶林24ha固定监测样地为背景,采用断棍模型(broken stick model)、对数正态模型(lognormal distribution model)、生态位优先占领模型... 详细信息

为揭示物种多度格局随尺度的变化规律,探讨多度格局形成的机理及生态学过程,作者以古田山亚热带常绿阔叶林24ha固定监测样地为背景,采用断棍模型(broken stick model)、对数正态模型(lognormal distribution model)、生态位优先占领模型(preemption model)、Zipf模型(Zipf model)、Zipf-Mandelbrot模型(Zipf-Mandelbrotmodel)及中性理论模型(neutral model),对不同尺度下的物种多度分布格局进行拟合,并采用AIC检验和卡方检验选择最优拟合模型。结果表明,不同尺度上适合的物种–多度曲线模型不同;在取样边长为10m和20m时,除中性模型外的5个模型均不能被拒绝,它们均适合小尺度下的格局,这表明在小的尺度上生态位过程对物种–多度曲线的格局贡献较大;在取样边长为40m时,最适合的模型为对数正态模型;取样边长为60m和80m时,Zipf-Mandelbrot模型为最优拟合模型;在取样边长为100m时,尽管Zipf-Mandelbrot模型有最小的AIC值,但卡方检验拒绝了除中性模型外的5个模型;中性理论模型除了边长为10m和20m尺度以外,在其他尺度上均比前面5种模型的预测效果更好。因此在研究物种多度分布规律时必须注意空间尺度的影响。研究结果表明随着尺度的增加,中性过程成为决定物种–多度曲线格局的主要生态过程。

关键词：物种多度分布生态过程模型拟合中性理论模型

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关于人类结直肠癌的肠道微生物群落的生态统计分析

关于人类结直肠癌的肠道微生物群落的生态统计分析

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作者：寇贺丹昆明理工大学

学位级别：硕士

结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是世界上常见的恶性肿瘤之一。研究结果表明,肠道微生物群落组成的变化可能诱发结直肠癌的发生,因此可以作为这一疾病的敏感信号。然而,结直肠癌是否与肠道微生物群落的维持机制有关仍然知之甚少。本文... 详细信息

结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是世界上常见的恶性肿瘤之一。研究结果表明,肠道微生物群落组成的变化可能诱发结直肠癌的发生,因此可以作为这一疾病的敏感信号。然而,结直肠癌是否与肠道微生物群落的维持机制有关仍然知之甚少。本文从生态统计学角度对与结直肠癌有关组织的微生物群落的多样性及其分布进行统计分析,主要内容为:第一,对微生物群落建立线性模型研究其分布关系。进而利用扩展的Taylor幂法则研究结直肠癌患者与健康人相关组织的微生物群落的空间异质性(种间异质性及种内异质性),一方面对8名结直肠癌患者的癌变组织的异质性与邻近的正常组织的异质性进行比较,另一方面对46位结直肠癌患者患病组织与56位健康人相同部位的组织的异质性进行比较,以探讨罹患结直肠癌是否与组织的微生物群落的空间异质性的改变有关。第二,用Ewens和Etienne两种抽样方法对来自8位结直肠癌患者的癌变组织和邻近正常组织的采样数据以及46位结直肠癌患者和56位健康人的采样数据进行中性检验,运用卡方检验比较两种方法的差异,总结中性率。对中性模型里的基础多样性参数和Simpson多样性指数进行了详细阐述,深入探讨它们之间的关系。研究将回归、检验、估计等相关的统计方法应用并扩展到生态领域中的结直肠癌有关的肠道微生物群落中,试图在这一新的环境群落中探索相关组织间的生态机制和聚集、维护能力的差异,结果表明癌变组较正常对照组的种间异质性和多样性发生了相应的变化,初步结果对于展开后续关于肠道微生物疾病相关的生态统计研究是有意义的。

关键词：微生物群落结直肠癌 Taylor幂法则中性理论模型 Simpson多样性指数

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肺癌患者不同部位微生物菌群特征的比较研究

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中国肿瘤临床与康复 2024年第12期31卷 775-783页

作者：陈佳丽王静静李士杰陈勇王长军卓明磊南开大学医学院天津300071 北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所胸部肿瘤内一科、恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室北京100142 北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所内镜中心、恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室北京100142 中国人民解放军疾病预防控制中心北京100071

目的基于16S核糖体RNA(rRNA)扩增子测序技术,比较肺癌患者肺部和口腔菌群构成差异,量化随机过程对肺癌患者肺部、口腔微生物的影响。方法选取2022年2-9月北京大学肿瘤医院90例肺癌患者作为研究对象,收集患者的唾液样本。提取样本DNA,... 详细信息

目的基于16S核糖体RNA(rRNA)扩增子测序技术,比较肺癌患者肺部和口腔菌群构成差异,量化随机过程对肺癌患者肺部、口腔微生物的影响。方法选取2022年2-9月北京大学肿瘤医院90例肺癌患者作为研究对象,收集患者的唾液样本。提取样本DNA,对细菌基因的16S rRNA V3~V4区扩增后进行测序。基于TNM分期进行不同分期(Ⅰ~ⅢA和ⅢB~Ⅳ)肺癌患者口腔菌群的多样性比较。结合研究前期已有的肺泡灌洗液(BALF)测序数据,使用R4.1.0软件进行BALF和唾液样本中菌群多样性比较、物种组成分析和相对丰度前10的属在组间的差异比较。应用中性理论模型(NCM)量化随机过程对肺癌患者肺部、口腔微生物的影响。结果不同TNM分期肺癌患者口腔微生物菌群的多样性比较,Ⅰ~ⅢA和ⅢB~Ⅳ2组间Chao1指数和β多样性差异有统计学意义(P<0.05), Simpson指数差异无统计学意义(P>0.05)。对肺癌患者肺部和口腔微生物菌群特征进行比较,发现2种来源不同的样本在α和β多样性上差异均有统计学意义(均P<0.05)。NCM估计了扩增子序列变体(ASVs)发生频率与其相对丰度变化之间的部分关系,分别在BALF、唾液和2种样本中解释了5.7%、61.7%、41.5%的微生物群落变化。结论不同样本类型菌群多样性不同。NCM提示随机过程对肺癌患者口腔微生物的影响更大,即口腔微生物的迁移率更高。

关键词：肺肿瘤口腔菌群 16S核糖体RNA 中性理论模型

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湿地草本植物冠层昆虫群落的中性理论验证

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陕西林业科技 2009年第4期33卷 6-10页

作者：张弘董欣然童盟孙旸董慧琴潘晓云复旦大学生命科学学院上海200433 复旦大学生物多样性科学研究所上海200433

生物多样性中性理论(Unified Neutral Theory of Biodiversity)对群落中物种共存机制和多度分布提出不同于传统生态位理论的另一种解释:由处于同一营养级的物种构成的群落中,不同物种的个体间在生态学上是等价的;物种多度的分布主要决... 详细信息

生物多样性中性理论(Unified Neutral Theory of Biodiversity)对群落中物种共存机制和多度分布提出不同于传统生态位理论的另一种解释:由处于同一营养级的物种构成的群落中,不同物种的个体间在生态学上是等价的;物种多度的分布主要决定于随机过程,如物种灭绝和物种迁入/新物种分化之间的动态平衡。对于中性理论模型是否可以准确预测物种多度分布一直存在不小的争论。本文对生长在天目山地区的湿地草本植物冠层的昆虫群落进行取样调查,分别采用中性理论模型和对数正态模型预测昆虫多度分布。采用置信区间、拟合优度检验和卡方检验等方法验证中性理论的预测。中性模型拟合的基本多样性指数θ=5.89,迁移率m=0.208 8。实测物种多度数据全部落入中性模型预测的95%置信区间内,说明中性模型预测的多度分布与实测数据基本吻合。Pearson相关性检验、Kolmogorov-Smirnov检验和卡方检验的结果表明,中性最优拟合曲线(200次中性模型模拟的平均值)的拟合优度与对数正态模型很接近,但中性理论模型的预测结果只在4%～14%的情况下(中性模型模拟200次)优于对数正态模型。因此,中性理论模型可以较好地预测天目山湿地草本植物冠层中的昆虫群落的多度分布情况,但其拟合优度并不优于对数正态模型。

关键词：昆虫群落中性理论模型对数正态模型

来源：评论

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