检索结果-内蒙古大学图书馆

中国电子学会电路与系统学会第二十二届年会

作者：苏洪全朱义胜大连海事大学信息科学技术学院，大连，116026

基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression，SAGE)是分析全基因组表达模式的有力工具。SAGE数据具有维数高、数量大等特点，在模式识别和聚类分析前需降维。根据SAGE数据满足Poisson分布的特性，设计了新的核函数，结合核... 详细信息

基因表达系列分析(Serial analysis of gene expression，SAGE)是分析全基因组表达模式的有力工具。SAGE数据具有维数高、数量大等特点，在模式识别和聚类分析前需降维。根据SAGE数据满足Poisson分布的特性，设计了新的核函数，结合核主分量分析(KernelPrinciple Component Analysis，KPCA)，本文提出了基于Poisson模型的KPCA算法(Poisson-Model basedKPCA,PMKPCA)。通过对老鼠视网膜细胞发育的SAGE数据的分析，结果表明，该算法相对于KPCA，能有效的去除冗余数据，降低维数。

关键词：基因表达系列分析 Poisson分布核函数核主分量分析

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系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的建立

系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析文库的建立

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第十届全国风湿病学学术会议

作者：李守新黄睿王晓慧刘文华中科技大学同济医学院附属同济医院华中科技大学同济医学院附属同济医院华中科技大学同济医学院附属同济医院华中科技大学同济医学院附属同济医院

构建系统性红斑狼疮(systemic lupus exythematosus,SLE)外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)文库,为筛选SLE患者差异表达基因奠定基础。改良SAGE技术... 详细信息

关键词：系统性红斑狼疮外周血单个核细胞基因表达系列分析

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肝癌细胞HepG2基因表达谱的构建与分析

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复旦学报（自然科学版） 2009年第5期48卷 656-660,667页

作者：金维荣董辉张洪义陈样宜钱震孔亚林沈艳生物芯片上海国家工程研究中心上海201203 国家人类基因组南方研究中心上海201203 空军总医院肝胆外科北京100036

为从转录组水平识别HepG2与正常肝组织间的基因表达差异,寻找可能参与肝癌发生发展的重要基因,应用基因表达系列分析技术(SAGE)构建了HepG2的基因表达谱.通过DGED软件进行SAGE标签序列的注释,并与NCBI公共数据库中已有的正常肝脏数据进... 详细信息

为从转录组水平识别HepG2与正常肝组织间的基因表达差异,寻找可能参与肝癌发生发展的重要基因,应用基因表达系列分析技术(SAGE)构建了HepG2的基因表达谱.通过DGED软件进行SAGE标签序列的注释,并与NCBI公共数据库中已有的正常肝脏数据进行比较分析,使用KEGG软件对差异表达基因进行功能分类.共发现HepG2与正常肝组织间差异表达的基因733个,其中表达上调的基因主要与MAPK信号传导通路、细胞周期、细胞粘附等相关,下调基因则主要与烟酸/烟酰胺代谢以及凝血和补体功能相关.荧光实时定量RT-PCR证实了在HepG2中表达升高的IGF2BP2和PEG3基因,在原发性肝癌中的表达亦上调(P<0.05),提示该基因可能是肝癌相关基因.

关键词：基因表达谱基因表达系列分析 HepG2 IGF2BP2基因 PEG3基因

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SAGE方法分析永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞的基因表达

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癌症 2001年第1期20卷 12-17页

作者：葛世丽李刚陈伟楼铁柱吴德昌军事医学科学院放射医学研究所北京100850

目的：采用基因表达系列分析（ｓｅｒｉａｌ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　ｇｅｎｅ　ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＳＡＧＥ）方法，分析永生化ＢＥＰ２Ｄ细胞及α粒子诱发恶性转化ＢＥＰ２Ｄ细胞的基因表达。方法：细胞培养，收获永生化ＢＥＰ... 详细信息

目的：采用基因表达系列分析（ｓｅｒｉａｌ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　ｇｅｎｅ　ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，ＳＡＧＥ）方法，分析永生化ＢＥＰ２Ｄ细胞及α粒子诱发恶性转化ＢＥＰ２Ｄ细胞的基因表达。方法：细胞培养，收获永生化ＢＥＰ２Ｄ细胞及α粒子诱发恶性转化ＢＥＰ２Ｄ细胞；提取细胞总ＲＮＡ，分离ｍＲＮＡ，合成生物素标记的双链ｃＤＮＡ；采用ＳＡＧＥ方法获取标签序列，结合ＵｎｉＧｅｎｅ文库分析标签代表的转录本，最终通过ＳＡＧＥ软件分析标签丰度，比较两组细胞基因表达差异。选取ＳＡＧＥ实验得到的在两组细胞中表达的已知基因Ｓｍａｄ７和ＣＣＲ１１，以ＲＴ－ＰＣＲ方法制备探针，用两组细胞等量总ＲＮＡ为样本，做Ｎｏｒｔｈｅｒｎｂｌｏｔ杂交。结果：建立了２个独立的ＳＡＧＥ文库。一个是１．５Ｇｙα粒子照射诱发恶性转化ＢＥＰ２Ｄ细胞的ＳＡＧＥ文库，一个是永生化ＢＥＰ２Ｄ细胞ＳＡＧＥ文库。从２个文库中分别挑取克隆５３个、５０个，进行测序，测序一共得到总标签２３３１个，代表单一转录本２５２个，有７０％的ＳＡＧＥ标签可找到与之一一对应的基因，有８４个核糖体蛋白基因，约占３３％；有１２个转录本（４．８％）找不到与之理想匹配的已知基因；

关键词：基因表达系列分析 BEP2D细胞 SAGE 肺肿瘤 α粒子

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原发性肝细胞癌基因表达谱和全基因组DNA高分辨率图谱的构建与分析

原发性肝细胞癌基因表达谱和全基因组DNA高分辨率图谱的构建与分析

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作者：董辉复旦大学

学位级别：博士

原发性肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是全球最常见的恶性肿瘤之一,在中国更是位居肿瘤致死性疾病的第二位,严重危害了我国人民健康。多年来科学家们在HCC的基础和临床研究中取得了显著成就,但由于HCC的高度异质性,还需要更... 详细信息

原发性肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是全球最常见的恶性肿瘤之一,在中国更是位居肿瘤致死性疾病的第二位,严重危害了我国人民健康。多年来科学家们在HCC的基础和临床研究中取得了显著成就,但由于HCC的高度异质性,还需要更多的研究来进一步加深对其致病分子机理的认识和理解。本研究中,我们从寻找HCC差异表达基因和基因组DNA水平异常改变两方面入手,对HCC发生发展的分子机制进行了探讨。在第一部分研究工作中,我们应用SAGE和LongSAGE技术构建了正常肝组织、HepG2细胞和HCC的基因表达谱,其中用于构建HCC的SAGE文库和LongSAGE文库的组织标本来自于同一个病人。通过对HepG2细胞与正常肝组织的基因表达谱的比较分析,我们发现在HepG2细胞中差异表达的基因主要涉及编码核糖体蛋白的基因、MAPK信号传导通路基因、细胞周期相关基因、细胞粘附相关基因、钙离子信号传导通路基因、凝血和补体功能相关的基因以及烟酸／烟酰胺代谢相关的基因。比较HCC与正常肝组织的基因表达谱的差异,我们发现在HCC中差异表达的基因主要包括细胞合成、细胞增殖与死亡、信号传导、物质转运、凝血功能、细胞代谢以及细胞对外界刺激发生反应等生物过程相关的基因。选取部分差异表达基因进行验证,结果表明,PEG10、SGCE、ZNF83、PTPN12和TM4SF1基因等12个基因在肝癌组织中的表达高于相应的癌旁组织,差异具有显著性(p<0.05)。值得注意的是,SGCE和PEG10基因共同位于7q21区域,两基因的5’端仅相距115bp,并且两基因在75%的HCC病例中同时发生表达上调或下调,以上调为主。在第二部分研究工作中,我们借助Digital karyotyping技术和Genome Sequencer FLX超高通量第二代测序系统,绘制了HCC全基因组DNA异常改变的高分辨率图谱。我们将Genome Sequencer FLX测序系统自备的平端接头改造为粘端接头,从而保留了基因组序列标签串联体的粘性末端所携带的信息,提高了测序效率。Digital karyotyping文库总共测序111,585条,得到358,931个有效序列标签。通过对序列标签数据的分析,发现在HCC中发生扩增的染色体主要有1、4、6、7、8、9、12、15、17、19、21、X和Y染色体,发生扩增的染色体区域内包含了BAGE、UTRN、DYNC1I1、SLC25A13、POTEB和CEACAM21等多个基因。其中DYNC1I1和SLC25A13基因在染色体上的位置邻近PEG1O和SGCE基因,也位于7q21区域。进一步的研究发现,DYNC1I1、SLC25A13、POTEB、CEACAM21、PEG10和SGCE基因分别在36%、52%、50%、36%、23%和32%的HCC病例中出现基因组DNA的扩增,且PEG10、SGCE、DYNC1I1和SLC25A13基因在HCC中的表达显著高于相应的癌旁组织(p<0.05)。在55-69%的HCC病例中,PEG10、SGCE、DYNC1I1和SLC25A13基因组DNA的扩增同时伴有基因表达水平的上调。这些结果提示,位于7q21区域的4个基因—PEG10、SGCE、DYNC1I1和SLC25A13可能共同参与了HCC发生发展的分子机制,而基因组DNA的扩增可能是这些基因表达上调的原因之一酪氨酸磷酸酶的异常失活或激活,导致蛋白质分子中酪氨酸残基的磷酸化水平异常升高或降低,是HCC的重要生物学特征之一。在第三部分研究工作中,我们应用酵母双杂交技术,对受体型酪氨酸磷酸酶PCP-2相互作用蛋白进行了初步研究。通过筛选人脑组织酵母cDNA文库,找到可能与PCP-2发生相互作用的蛋白质—衔接蛋白3(adaptor protein-3, AP-3)的p3A亚基,并在哺乳动物细胞中进一步验证了两者之间的相互作用。AP-3的β3A亚基可能通过识别PCP-2胞浆区的YXXΦ模体和／或LL模体与PCP-2结合,从而参与PCP-2细胞内转运、定位、以及受体的循环再利用等过程。我们通过对HCC基因转录水平和基因组DNA水平异常改变的研究,进一步加深了对HCC致病分子机制的认识,为今后选择可用于HCC诊断、病程预测、转归和预后判断的分子标记物,以及分子靶向药物治疗的作用靶点提供了新的理论依据。

关键词：原发性肝细胞癌基因表达系列分析 Digital karyotyping PEG10 SGCE DYNC1l1 SLC25A13 PCP-2

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胃癌S100基因表达的生物信息学分析及S100A3与胃癌相关性研究

胃癌S100基因表达的生物信息学分析及S100A3与胃癌相关性研究

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作者：刘骥第四军医大学

学位级别：博士

胃癌是一个由环境和多基因共同参与的病理过程,其死亡率占全世界癌症死亡率第二位[1,2]。在过去的二十年里,胃癌相关基因的研究已经取得很大进展。已发现的众多胃癌癌基因与抑癌基因一定程度上阐述了胃癌发病机理及相关“分子事件”,也... 详细信息

胃癌是一个由环境和多基因共同参与的病理过程,其死亡率占全世界癌症死亡率第二位[1,2]。在过去的二十年里,胃癌相关基因的研究已经取得很大进展。已发现的众多胃癌癌基因与抑癌基因一定程度上阐述了胃癌发病机理及相关“分子事件”,也能作为胃癌早期诊断和药物治疗的生物标记。最近,大规模基因表达分析已经渐渐成为筛选肿瘤相关基因的重要工具[3]。两类重要的生物学实验方法是:1)以DNA测序为基础的基因表达系列分析(SAGE)和表达系列标签(EST);2)以斑点杂交为基础的微阵列分析。来源于这些方法的大量生物信息数据收集和注解在多种高度组织的网络数据库内。癌基因组解剖计划(CGAP)和基因表达综合数据库(GEO)是其中最重要的两个网络数据库[4,5]。利用生物信息学方法,挖掘CGAP和GEO的生物信息资料数据,研究者已经发现并鉴定了多个肿瘤相关基因或新的癌基因[6,7]。 S100蛋白家族是一个具有EF螺旋结构、钙结合蛋白家族,至少有22个家族成员[8]。S100蛋白广泛分布于人体细胞的胞浆和胞核内,参与细胞周期活动、细胞分化等众多活动。17个S100家族成员基因定位均位于稳定性差、易在肿瘤发生中出现染色体重排的1号染色体长臂2区1带(1q21)。既往的研究已经证实了一些S100家族成员在胃癌组织中有差异表达[9,10],包括S100A2,S100A4,S100A7和S100A10。因此,很有必要系统的分析和验证S100其它家族成员在胃癌和胃正常组织中的表达情况。本研究探讨利用生物信息学方法,挖掘CGAP和GEO生物信息数据,系统分析22个S100家族成员在胃癌与正常胃组织的基因表达情况,并通过生物学实验方法验证和分析胃癌中差异表达的S100基因及其功能。为“硅片实验”的数据库挖掘法筛选肿瘤相关基因提供方法学的探讨,也为阐明S100和胃癌的相关性提供重要理论依据。第一部分:胃癌S100基因表达的生物信息学分析目的:探讨利用生物信息学方法筛选胃癌组织与正常胃组织差异表达基因的可行性及具体方法,寻找胃癌相关S100基因。方法:联合SAGE分析、虚拟电子杂交和虚拟微阵列,挖掘CGAP和GEO资源中关于胃癌和正常胃组织差异表达S100基因。结果:5个S100基因在胃癌组织中上调表达,包括S100A2、S100A3、S100A4、S100A7和S100A10。S100A3是新的胃癌过表达基因。结论:首次探讨性利用生物信息学方法系统分析胃癌S100基因表达。多个S100家族成员在胃癌中上调表达。联合多数据库挖掘肿瘤相关基因是一个可靠的方法,给进一步的生物学实验以大量的提示。第二部分:胃癌S100A3基因表达的生物学实验分析目的:利用生物学实验方法分析胃癌S100A3基因表达情况,探讨S100A3和胃癌的相关性,并进一步验证生物信息学分析可靠性。方法:采用RT-PCR和Western blot分析90例胃癌组织及正常胃组织标本和胃癌细胞系中S100A3基因和蛋白表达水平。利用组织微阵列进一步研究S100A3的蛋白表达和组织学定位。结果:胃癌组织S100A3基因表达高于正常胃组织2.5倍,S100A3的上调表达与肿瘤分化程度、TNM分期相关,胃癌细胞S100A3基因呈上调表达。胃癌组织中S100A3基因阳性表达率低于蛋白阳性表达率。结论:首次证实S100A3是胃癌相关基因,其上调表达与胃癌分化程度及TNM分期密切相关。第三部分:S100A3基因对胃癌细胞生物学特性的影响目的:利用RNA干扰(RNAi)技术进一步研究胃癌差异表达基因S100A3对胃癌细胞周期和细胞生长的影响。方法:针对S100A3基因设计siRNA,采用重组DNA技术构建S100A3特异性shRNA表达载体,转染胃癌细胞,RT-PCR检测S100A3基因表达;流式细胞仪检测细胞周期和细胞凋亡;MTT检测细胞生长活性。结果:1、RNAi对胃癌细胞BGC823中S100A3基因表达的影响:S100A3特异性shRNA转染BGC823细胞后,经RT-PCR检测证实S100A3基因被明显抑制。2、RNAi抑制S100A3基因表达对胃癌细胞凋亡、增殖的影响:抑制S1000A3基因表达使BGC823细胞凋亡增加、细胞周期G1期阻滞、增殖力降低。结论:S100A3特异性shRNA表达载体转染胃癌细胞可有效抑制S100A3基因表达。RNAi抑制S100A3基因表达后胃癌细胞凋亡增加,细胞周期的G1期阻滞。

关键词：胃癌 S100 生物信息学基因表达系列分析表达系列标签微阵列基因表达综合数据库癌症基因组解剖计划

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全基因组基因表达分析技术及其在果树上的应用

全基因组基因表达分析技术及其在果树上的应用

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2007年全国分子生物学技术在果树上应用学术研讨会

作者：张志宏代红艳沈阳农业大学园艺学院沈阳 110161

基因表达分析对于揭示基因功能、了解基因间相互关系、阐明植物生长发育过程中的生理生化调控机制起着至关重要的作用。本文综述了mRNA差异显示、cDNA-AFLP、基因芯片、EST数据分析、基因表达系列分析(SAGE)等全基因组基因的表达分析技... 详细信息

基因表达分析对于揭示基因功能、了解基因间相互关系、阐明植物生长发育过程中的生理生化调控机制起着至关重要的作用。本文综述了mRNA差异显示、cDNA-AFLP、基因芯片、EST数据分析、基因表达系列分析(SAGE)等全基因组基因的表达分析技术的原理特点及在果树上的应用情况,并介绍了利用全基因组基因表达分析技术开展果树研究的思路。

关键词：基因表达果树基因芯片表达序列标签基因表达系列分析

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联合多种高通量表达谱数据分析筛选胃癌相关基因的研究

联合多种高通量表达谱数据分析筛选胃癌相关基因的研究

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作者：赵林胜天津医科大学

学位级别：硕士

目的联合利用多种高通量表达谱数据库资源筛选分析胃癌与正常胃组织间的差异表达基因,探讨利用数据库筛选胃癌与正常胃组织间的差异表达基因信息的可行性及具体方法,寻找胃癌发生发展相关基因,为进一步研究胃癌的发生发展机制,发现具... 详细信息

目的联合利用多种高通量表达谱数据库资源筛选分析胃癌与正常胃组织间的差异表达基因,探讨利用数据库筛选胃癌与正常胃组织间的差异表达基因信息的可行性及具体方法,寻找胃癌发生发展相关基因,为进一步研究胃癌的发生发展机制,发现具有诊断和治疗价值的潜在相关基因,为进一步制定基因治疗方案提供基础的依据。方法 1.应用10个已知的胃癌发生发展相关基因进行EST vNorthern和SAGE Virtual Northern分析,将分析结果与已知基因表达情况相比较,确定Virtual Northern筛选胃癌相关基因的可行性。 2.应用美国国立生物技术信息中心(NCBI)中的UniGene数据库中DDD工具筛查胃癌和正常胃组织的差异表达基因。 3.应用肿瘤基因解剖工程(CGAP)数据库中基于EST数据的cDNA Digital Gene Expression Displayer(cDNA DGED)工具筛查胃癌和正常组织差异表达基因。 4.应用肿瘤基因解剖工程(CGAP)数据库中基于SAGE数据的SAGE Digital Gene Expression Displayer(SAGE DGED)工具筛查胃癌和正常胃组织差异表达基因。 5. 将DDD、cDNA DGED和SAGE DGED筛选出的基因进行Virtual Northern

关键词：胃肿瘤数字差异显示表达序列标签基因表达系列分析微阵列数据挖掘膜联蛋白A1

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对人工饲料摄食性不同蚕品种Long-SAGE文库的构建与差异表达基因分析

对人工饲料摄食性不同蚕品种Long-SAGE文库的构建与差异表达基因...

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作者：张进山东农业大学

学位级别：硕士

家蚕（Bombyx mori）食性的研究，是家蚕生物学、生理学和遗传学的重要组成部分，其中家蚕对人工饲料的摄食性则是其研究的重点。家蚕对人工饲料的摄食性，在品种间、个体间都存在显著差异，食性的个体差异是导致人工饲料育发育不齐的... 详细信息

家蚕（Bombyx mori）食性的研究，是家蚕生物学、生理学和遗传学的重要组成部分，其中家蚕对人工饲料的摄食性则是其研究的重点。家蚕对人工饲料的摄食性，在品种间、个体间都存在显著差异，食性的个体差异是导致人工饲料育发育不齐的根本原因，也是限制人工饲料实用化的主要技术障碍。前人在家蚕对人工饲料摄食性的生理遗传学及嗅觉、味觉的分子机理等方面已进行了广泛深入的研究，取得了丰富的研究成果，但是关于家蚕摄食性相关基因的分子水平研究尚未获得突破。 1995年Velculescu等首先提出了基因表达系列分析（Serial analysis of geneexpression，SAGE）的方法，该方法具有快速、灵敏、高通量、高丰度、易于发现未知序列等优点，是一种广泛适用的定量分类和各种状态中表达基因比对的有力工具。本论文以对人工饲料摄食性存在显著差异的蚕品种（品系）为材料，构建了摄食性不同家蚕的Long-SAGE表达谱文库，利用生物信息学方法系统分析了高食性蚕和低食性蚕之间差异表达的标签（Tag），挖掘了与家蚕对人工饲料摄食性相关的基因。主要获得如下结果： 1分别以广食和鲁七品种3龄起蚕的头部和中肠、菁松A高食性品系和低食性品系以及菁松B高食性品系和菁松B低食性品系的2龄起蚕为材料，构建了8个Long-SAGE数字表达谱文库，其中以广食和鲁七中肠SAGE文库为消减库。每个比较文库都以高食性蚕与低食性蚕进行比对，获得了4个比较文库。 2对可以匹配到已知基因，并且符合差异标准的差异标签进行筛选，其中在广食与鲁七头部差异比较文库、菁松A比较文库和菁松B比较文库共同存在的差异表达基因有34个；在广食与鲁七头部差异比较文库和菁松A比较文库的共有差异表达基因119个，其中上下调趋势一致的有50个；在广食与鲁七头部差异比较文库和菁松B比较文库中共同存在的共有差异差异基因179个，上下调趋势一致的有82个；菁松A比较文库和菁松B比较文库中共同存在的共有差异表达基因113个；上下调趋势一致的有21个。 3对构建Long-SAGE文库时未匹配到基因的标签进行筛选，在符合差异标准的广食与鲁七头部差异比较文库、菁松A比较文库和菁松B比较文库中筛选到共同存在的差异标签84条，并对得到的84条差异标签（Tag）再次在NCBI中进行BLAST比对，共有39条差异标签重新匹配到已知基因或EST序列，45条差异标签未能成功匹配。 4对上述未匹配到已知基因的差异标签（Tag），进行了标签的延长（GLGI），共成功延长17条Tag，其中12条比对到了已知基因。 5对上述差异表达基因进行PATHWAY分析，有42个基因比对到相关的代谢通路，参与到42个PATHWAY通路的过程。分析这些通路的功能，其中1个基因参与有机体系统的构建，24个基因涉及到代谢过程，18个基因与遗传信息的处理相关，3个基因参与了细胞过程，还有一个基因参与了环境信息处理过程。 6将家蚕中已有报道的嗅味觉相关基因，在所构建的8个SAGE文库和4个比较文库中进行查找，大多数基因没有显著差异，只有少数基因存在差异，但差异较小，且在各高低食性差异组合之间没有共性。

关键词：家蚕人工饲料摄食性基因表达系列分析差异表达基因

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联合多种高通量表达谱数据分析筛选胃癌相关基因的研究

联合多种高通量表达谱数据分析筛选胃癌相关基因的研究

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第四届中国肿瘤学术大会暨第五届海峡两岸肿瘤学术会议

作者：邢军赵林胜李艳芸李燕妮张维铭天津医科大学实验中心天津医科大学基础医学院天津医科大学实验中心天津医科大学基础医学院天津医科大学实验中心天津医科大学基础医学院天津医科大学实验中心天津医科大学基础医学院天津医科大学实验中心天津医科大学基础医学院

目的:挖掘胃癌与正常组织间差异表达基因,寻找潜在的诊断与治疗价值的基因标志。方法:分别应用CAGP中 EST和SAGE数据库筛查胃癌和正常组织差异表达基因,用虚拟电子杂交方法对候选基因进行进一步筛选,并同SMD中胃组织基因表达谱芯片数据... 详细信息

目的:挖掘胃癌与正常组织间差异表达基因,寻找潜在的诊断与治疗价值的基因标志。方法:分别应用CAGP中 EST和SAGE数据库筛查胃癌和正常组织差异表达基因,用虚拟电子杂交方法对候选基因进行进一步筛选,并同SMD中胃组织基因表达谱芯片数据比较。结果:应用DDD、cDNA DGED和SAGE DGED工具分别筛选出165、286和181个基因,经vNorthern分析,共获得45个差异表达的基因,45个基因同芯片数据比较分析,其中12个基因表达一致,对其中与胃癌关系尚未见明确报道的基因进行RT-PCR验证,4个基因(ANXA1、MSMB、ANXA10、PSCA)与数据筛选结果一致。结论:利用表达谱数据库资源能快速高效地筛选、确定胃癌相关基因,对这些基因进一步分析可能为胃癌的临床诊断与治疗提供分子标志。

关键词：胃肿瘤表达序列标签基因表达系列分析微阵列数据挖掘

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