检索结果-内蒙古大学图书馆

中华实用儿科临床杂志 2025年第4期40卷 268-272页

作者：孙金山陈朝英涂娟耿海云李华荣万灵王弘扬首都儿科研究所附属儿童医院肾脏内科北京100020 首都儿科研究所附属儿童医院泌尿外科北京100020

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在儿童泌尿道感染(UTI)病原菌的诊断价值和临床应用。方法回顾性研究。收集2023年3月至2024年3月于首都儿科研究所附属儿童医院肾脏内科住院诊断为UTI患儿的临床资料,比较mNGS技术与尿培养病原菌检... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在儿童泌尿道感染(UTI)病原菌的诊断价值和临床应用。方法回顾性研究。收集2023年3月至2024年3月于首都儿科研究所附属儿童医院肾脏内科住院诊断为UTI患儿的临床资料,比较mNGS技术与尿培养病原菌检出阳性率、时效性和一致性。组间比较采用独立样本t检验及χ^(2)检验或Fisher′s精确概率检验。结果共纳入193例患儿,尿培养检出阳性率为70/193(36.3%),对42例进行mNGS检测的患儿中检出阳性菌者37例(88.1%),mNGS检查阳性率显著高于尿培养检查,差异有统计学意义(χ^(2)=37.357,P<0.001)。同时mNGS报告时间显著低于尿培养报告时间(Z=3.524,P<0.001)。在42例进行mNGS检测的病例中2种方法检测尿液病原菌均阴性5例(11.9%),有21例(50.0%)mNGS检测结果阳性而尿培养结果阴性,余16例(38.1%)mNGS和尿培养结果均阳性的病例中,完全匹配14例(33.3%),完全不匹配1例(2.4%),1例(2.4%)部分匹配。比较尿培养和mNGS检测阳性率与留取标本前抗感染治疗时间,经统计分析发现尿培养阳性中位数持续时间为5d,而mNGS检测阳性中位数持续时间为20d,差异有统计学意义(χ^(2)=0.537,P<0.001)。结论mNGS检测技术对于儿童UTI病原菌的诊断有较高的敏感性,和尿培养相比具有良好的一致性,并大大缩短检出时间,且检出阳性率不易受抗菌治疗影响,对于儿童UTI尤其是经验性抗感染治疗失败、尿培养检查无法明确致病菌的患儿建议尽早完善mNGS检查。

关键词：儿童宏基因组二代测序泌尿道感染

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宏基因组二代测序诊断儿童造血干细胞移植后毛霉菌病3例

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中国当代儿科杂志 2025年第2期27卷 219-224页

作者：李越周小辉王晓东王春静曹科刘四喜深圳市儿童医院血液肿瘤科广东深圳518000 深圳市儿童医院检验科广东深圳518000

该文报道3例儿童造血干细胞移植术后合并毛霉菌病的临床特点和诊治经过并对相关文献进行复习。3例患儿以胸痛为首发症状,均经宏基因组二代测序早期明确为毛霉菌感染,2例治疗后痊愈,1例因播散性感染死亡。宏基因组二代测序推动了毛霉菌... 详细信息

该文报道3例儿童造血干细胞移植术后合并毛霉菌病的临床特点和诊治经过并对相关文献进行复习。3例患儿以胸痛为首发症状,均经宏基因组二代测序早期明确为毛霉菌感染,2例治疗后痊愈,1例因播散性感染死亡。宏基因组二代测序推动了毛霉菌病的早期诊断和治疗,降低病死率,联合手术治疗是改善预后的重要手段。

关键词：毛霉菌病造血干细胞移植宏基因组二代测序儿童

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病原宏基因组二代测序在肺部感染所致脓毒症患者中的应用

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上海交通大学学报(医学版) 2025年第2期45卷 169-178页

作者：徐斐翔俞凤王瑞兰宋振举童朝阳朱长清上海交通大学医学院附属仁济医院急诊科上海200127 安徽医科大学第一附属医院急诊科合肥230032 上海交通大学医学院附属第一人民医院急诊与重症医学科上海200080 复旦大学附属中山医院急诊科上海200032

目的·探讨病原宏基因组二代测序(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)在肺部感染所致脓毒症患者中协助病原体早期诊断、指导临床抗感染方案调整、改善患者近期预后的价值。方法·该研究由一项多中心、前瞻性、非随... 详细信息

目的·探讨病原宏基因组二代测序(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)在肺部感染所致脓毒症患者中协助病原体早期诊断、指导临床抗感染方案调整、改善患者近期预后的价值。方法·该研究由一项多中心、前瞻性、非随机对照试验及一项诊断试验构成。纳入2020年3月—2021年10月在4家医院住院治疗的肺部感染所致脓毒症患者,所有患者均符合美国重症医学会与欧洲重症医学会发布的脓毒症3.0标准和肺部感染的临床诊断标准。入组患者根据自身意愿选择感染部位标本的病原学检测方法,包括仅送检传统病原学检测(传统病原学检测组),或在送检传统病原学检测的基础上同步送检mNGS(联合mNGS检测组)。患者预后的主要评价指标为7 d全因死亡率,次要评价指标包括7 d序贯器官衰竭评分(Sequential Organ Failure Assessment,SOFA)变化、7 d急性生理与慢性健康状况评分Ⅱ(Acute Physiology and Chronic Health EvaluationⅡ,APACHEⅡ)变化、28 d全因死亡率、28 d机械通气或死亡的复合终点发生率、28 d无呼吸机天数、28 d非住院天数和住院期间日均花费。采用倾向性评分匹配均衡2组的协变量分布,采用Kaplan-Meier生存曲线和Cox比例风险模型比较2组死亡率。使用联合mNGS检测组患者感染部位标本的病原学检测结果进行诊断试验。以临床综合判定的责任病原体为参考标准,分别将传统病原学检测和mNGS检测结果与参考标准相比较,计算2种方法和参考标准之间的阳性百分比一致性、阴性百分比一致性、阳性预测值和阴性预测值,并采用McNemar配对χ^(2)检验比较2种检测方法的责任病原体检出能力。结果·共入组患者533例,其中311例选择接受额外的mNGS检测,222例仅接受传统病原学检测。非随机对照试验中,经倾向性评分匹配平衡协变量后,联合mNGS检测组的7 d全因死亡率低于传统病原学检测组[4.8%vs 8.6%,HR 0.37(95%CI 0.15~0.91),P=0.031],联合mNGS检测组的28 d无呼吸机天数多于传统病原学检测组(19.9 d vs 18.4 d,P=0.041)。2组在28 d全因死亡率和日均住院花费上差异无统计学意义。诊断试验提示,mNGS检测结果与临床综合判定的责任病原体的阳性百分比一致性高于传统病原学检测[91.9%(95%CI 87.7%~95.0%)vs 56.1%(95%CI49.7%~62.4%),P<0.001],阴性百分比一致性低于传统病原学检测[29.2%(95%CI 18.6%~41.8%)vs 69.2%(95%CI56.6%~80.1%),P<0.001],阴性预测值高于传统病原学检测[48.7%(95%CI 32.4%~65.2%)vs 29.4%(95%CI 22.3%~37.3%),P=0.001]。结论·与传统病原学检测相比,肺部感染所致脓毒症患者感染部位标本行mNGS可提高责任病原体的检出率。相比于仅行传统病原学检测,联合mNGS检测的患者7 d全因死亡率更低,提示mNGS在肺部感染所致脓毒症患者中具有临床价值及应用前景。

关键词：宏基因组二代测序脓毒症肺部感染全因死亡

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宏基因组二代测序在非HIV感染的耶氏肺孢子菌肺炎中的诊疗价值

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医药论坛杂志 2025年第1期46卷 1-7页

作者：杨佳林晨晨罗培园文菲菲武旋刘红梅张茜茜河南省人民医院郑州大学人民医院呼吸与危重症医学科郑州450003 河南省人民医院河南大学人民医院呼吸与危重症医学科郑州450003

目的探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术对于非HIV感染的耶氏肺孢子菌肺炎(Pneumocystis jirovecii pneumonia,PJP)在诊断灵敏度、特异度和混合感染方面的价值。方法采用回顾性研究方法,以临床复... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术对于非HIV感染的耶氏肺孢子菌肺炎(Pneumocystis jirovecii pneumonia,PJP)在诊断灵敏度、特异度和混合感染方面的价值。方法采用回顾性研究方法,以临床复合诊断为标准,纳入河南省人民医院2022年7月至2024年7月收治的78例非HIV感染PJP和81例非PJP肺炎患者,比较两组患者临床特征的差异,比较mNGS与血清1,3-β-D葡聚糖[serum(1,3)-β-D-glucan,BDG]检测、六胺银染色在PJP中的诊断效能,进一步分析了PJP患者混合感染中病原体分布情况。结果PJP组中合并基础疾病、有激素和免疫抑制剂应用史的患者比例明显高于非PJP组(P<0.001)。mNGS诊断PJP的灵敏度为100%,明显高于六胺银染色(16.7%)和血清BDG(24.4%),差异有统计学意义(P<0.05);特异度为86.4%,低于六胺银染色(100%),与血清BDG检测(91.4%)差异无统计学意义(P>0.05)。绝大部分(93%)PJP患者为混合性感染,PJP同时合并细菌、真菌和病毒感染的病例最多(26例,33%)。结论mNGS在PJP的诊断中具有良好的灵敏度和特异度,且能快速识别混合感染中的共致病菌,有助于PJP的早期、快速、准确诊断和精准抗感染治疗。

关键词：宏基因组二代测序耶氏肺孢子菌肺炎肺泡灌洗液混合感染诊疗价值

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宏基因组二代测序和半乳甘露聚糖检测对侵袭性肺曲霉菌病的诊断价值

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中华实用诊断与治疗杂志 2025年第3期39卷 277-282页

作者：杨佳张茜茜林晨晨武旋于奕张鑫妍安云霞河南省人民医院呼吸与危重症医学科郑州大学人民医院河南郑州1450003

目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)、BALF半乳甘露聚糖(GM)试验、血清GM试验诊断侵袭性肺曲霉菌病(IPA)的价值。方法 2021年6月—2024年2月河南省人民医院诊治235例肺部感染患者,均行传统微生物学检测(CMT)(包括... 详细信息

目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组二代测序(mNGS)、BALF半乳甘露聚糖(GM)试验、血清GM试验诊断侵袭性肺曲霉菌病(IPA)的价值。方法 2021年6月—2024年2月河南省人民医院诊治235例肺部感染患者,均行传统微生物学检测(CMT)(包括痰涂片、痰培养、气管镜刷检和BALF培养)、血清GM试验、BALF GM试验和BALF mNGS检测。临床诊断IPA患者118例为IPA组,非IPA的肺部感染患者117例为非IPA组,比较2组血清GM、BALF GM值;以临床诊断结果为金标准,计算血清GM、BALF GM、BALF mNGS诊断IPA的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值;根据血清GM和BALF GM诊断IPA的约登指数确定其最佳截断值,绘制ROC曲线,评估血清GM、BALF GM以及BALF mNGS诊断IPA的效能。结果 (1)IPA组118例中血清GM阳性22例,GM值为0.252(0.129,0.756);BALF GM阳性58例,GM值为0.894(0.382,2.994)。非IPA组117例中血清GM阳性3例,GM值为0.182(0.134,0.236);BALF GM阳性7例,GM值为0.270(0.176,0.412)。IPA组血清GM、BALF GM值均高于非IPA组(U=-7.83,P<0.001;U=-2.90,P=0.004)。(2)IPA组118例中BALF mNGS检出曲霉菌109例,其中烟曲霉菌60例、黄曲霉菌35例、黑曲霉菌11例、土曲霉菌3例、构巢曲霉菌1例、百岁兰曲霉菌2例,19例患者为多种曲霉菌混合感染。(3)以临床诊断结果为金标准,血清GM、BALF GM诊断IPA的灵敏度分别为18.6%、49.2%,特异度分别为97.4%、94.0%,阳性预测值分别为88.0%、89.2%,阴性预测值分别为54.3%、64.7%,约登指数分别为0.16、0.43。BALF mNGS诊断IPA的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为92.4%、94.0%、93.9%和92.4%。(4)ROC曲线分析结果显示,血清GM、BALF GM分别以0.295、0.546为最佳截断值,BALF mNGS以阳性为节点,诊断IPA的AUC分别为0.61(95%CI:0.53~0.69,P=0.002)、0.80(95%CI:0.74~0.85,P<0.001)、0.94(95%CI:0.91~0.97,P<0.001)。结论与非IPA的肺部感染患者比较,IPA患者血清GM、BALF GM值增高;BALF GM诊断IPA的效能优于血清GM;BALF mNGS可明显提高IPA的诊断灵敏度,减少漏诊,在IPA的早期诊断和针对性治疗中具有更高的应用价值。

关键词：侵袭性肺曲霉菌病支气管肺泡灌洗液宏基因组二代测序半乳甘露聚糖检测

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宏基因组二代测序在社区获得性肺炎病原学中的应用进展

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甘肃医药 2025年第1期44卷 13-16页

作者：彭媛媛牛长春重庆医科大学重庆400016 重庆市人民医院重庆401147

社区获得性肺炎(CAP)是一种常见的呼吸道感染性疾病,其病原学复杂多样,涉及细菌、病毒、真菌和非典型病原等。宏基因组二代测序技术(mNGS)是一种基于高通量测序的无偏向性病原检测技术,能够在单一样本中同时检测所有类型的已知和未知病... 详细信息

社区获得性肺炎(CAP)是一种常见的呼吸道感染性疾病,其病原学复杂多样,涉及细菌、病毒、真菌和非典型病原等。宏基因组二代测序技术(mNGS)是一种基于高通量测序的无偏向性病原检测技术,能够在单一样本中同时检测所有类型的已知和未知病原,为CAP病原学研究提供了新的工具。本文综述了mNGS技术在CAP病原学中的应用价值,包括细菌、病毒、真菌、非典型病原和混合病原的检测,分析了mNGS技术在CAP病原检测中的优势和局限性,以助于更好地理解并应用这一技术于实际诊疗过程中,提高病原体诊断的准确性和效率。

关键词：宏基因组二代测序社区获得性肺炎病原学

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宏基因组二代测序在肺部感染中的应用价值

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热带医学杂志 2025年第1期25卷 53-57页

作者：高丽刘斌阜阳市人民医院呼吸与危重症医学科安徽阜阳236000

目的评估宏基因组二代测序(mNGS)在肺部感染诊断中的应用价值,为患者精准治疗提供相应依据。方法选取阜阳市人民医院2022年1-12月住院期间行mNGS检查的106例疑似肺部感染患者为研究对象,3例因资料不齐全排除,共纳入103例患者进行研究。... 详细信息

目的评估宏基因组二代测序(mNGS)在肺部感染诊断中的应用价值,为患者精准治疗提供相应依据。方法选取阜阳市人民医院2022年1-12月住院期间行mNGS检查的106例疑似肺部感染患者为研究对象,3例因资料不齐全排除,共纳入103例患者进行研究。比较mNGS和常规检测结果,并对病原学结果进行分析。结果mNGS病原体阳性检出率为87.38%(90/103),高于常规检测方法的30.10%(31/103),差异有统计学意义(χ^(2)=18.733,P<0.05)。混合感染组与单一感染组在临床症状胸闷和影像学分布方面,差异均有统计学意义(χ^(2)=12.604、7.913,P均<0.05)。混合感染最常见的模式是细菌和细菌混合感染(6例,18.75%),其次是细菌、真菌、病毒混合感染(5例,15.63%)。mNGS对肺部感染诊断的敏感性为92.31%,明显高于常规检测方法的28.57%,差异有统计学意义(χ^(2)=83.042,P<0.05),特异性差异无统计学意义(50.00%vs.58.33%,χ^(2)=1.288,P>0.05)。结论mNGS对病原体检测的敏感性较高,是检测肺部感染特别是混合性肺部感染的一种有价值的工具。

关键词：宏基因组二代测序肺部感染病原体检测混合感染

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宏基因组二代测序与细菌培养对儿童中枢神经系统感染的诊断价值比较

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安徽医药 2025年第4期29卷 777-780页

作者：杨艳祁亚平田启运漯河市第二人民医院儿科重症监护室河南漯河462000

目的比较宏基因组二代测序(mNGS)与细菌培养对疑似中枢神经系统感染(CNSI)儿童的临床诊断价值。方法收集2020年6月至2023年1月于漯河市第二人民医院住院的疑似CNSI病儿120例脑脊液标本,并行mNGS检测和细菌培养。计算诊断CNSI的灵敏度、... 详细信息

目的比较宏基因组二代测序(mNGS)与细菌培养对疑似中枢神经系统感染(CNSI)儿童的临床诊断价值。方法收集2020年6月至2023年1月于漯河市第二人民医院住院的疑似CNSI病儿120例脑脊液标本,并行mNGS检测和细菌培养。计算诊断CNSI的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值,评估两种方法诊断CNSI的临床价值,比较两种方法送检至收到反馈结果的时间。结果纳入的120例疑似CNSI病儿中,临床诊断出CNSI病人78例。mNGS阳性70例,细菌培养阳性30例,两种检验方法结果相一致的26例,细菌培养结果阴性而mNGS结果阳性30例,在42例非CNSI病人中,mNGS阳性但细菌培养阴性病人4例,两种检测方法结果均为阴性4例。mNGS检测出的革兰阴性菌、革兰阳性菌、病毒和真菌检出构成比依次降低(64.3%>20.0%>11.4%>4.3%),细菌培养检测出的30例阳性均为革兰阴性菌。根据CNSI临床诊断标准,mNGS和细菌培养诊断CNSI的灵敏度为89.7%、38.5%,特异度为83.3%、100.0%,阳性预测值为90.9%、100.0%,阴性预测值为81.4%、46.7%,mNGS诊断CNSI的曲线下面积(AUC)95%CI为0.88(0.81,0.95)高于细菌培养诊断CNSI的AUC 95%CI为0.65(0.54,0.76)(P<0.05)。mNGS检测自标本送检至临床医师收到结果所用时间为(38.36±4.85)h显著低于细菌培养(198.51±8.47)h(t=26.35,P<0.001)。mNGS检测细菌阳性的结果反馈时间(32.47±3.14)h显著低于细菌培养(92.68±10.52)h(t=15.63,P<0.001)。结论mNGS对疑似CNSI的病儿具有较高的临床效能,病原体检测出率高,更有利于指导临床用药。

关键词：中枢神经系统感染宏基因组二代测序脑脊液细菌培养儿童

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智慧健康 2025年第04期 63-65+69页

作者：王雯欣刘梦琳王英慧赵晶崔翰文黑龙江省医院

耶氏肺孢子菌肺炎(pneumocystis jirovecii pneumonia,PJP)在免疫力低下者中常见，临床及影像学表现不典型，诊治困难。然而，在噬血细胞综合征患者中鲜有报道。本文报告1例淋巴瘤相关噬血细胞综合征患者通过宏基因组二代测序技术精准... 详细信息

耶氏肺孢子菌肺炎(pneumocystis jirovecii pneumonia,PJP)在免疫力低下者中常见，临床及影像学表现不典型，诊治困难。然而，在噬血细胞综合征患者中鲜有报道。本文报告1例淋巴瘤相关噬血细胞综合征患者通过宏基因组二代测序技术精准诊治的经过，并进行文献复习，以提高对该病的认识，为该病的早诊早治提供思路。

关键词：淋巴瘤噬血细胞综合征耶氏肺孢子菌肺炎宏基因组二代测序

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宏基因组二代测序在儿童中枢神经系统感染中的应用价值

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中国医药科学 2025年第2期15卷 8-11页

作者：南在元冯德琳王春雨石佳慧首都医科大学附属北京儿童医院黑龙江医院神经内科黑龙江哈尔滨150010 首都医科大学附属北京儿童医院黑龙江医院中医科黑龙江哈尔滨150010

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在儿童中枢神经系统感染中的价值。方法选择2023年1月至2024年5月首都医科大学附属北京儿童医院黑龙江医院收治的45例疑似中枢神经系统感染的患儿,收集脑脊液6 ml,分别进行mNGS与常规检测后进行比较。结... 详细信息

目的探讨宏基因组二代测序(mNGS)在儿童中枢神经系统感染中的价值。方法选择2023年1月至2024年5月首都医科大学附属北京儿童医院黑龙江医院收治的45例疑似中枢神经系统感染的患儿,收集脑脊液6 ml,分别进行mNGS与常规检测后进行比较。结果经过mNGS技术检测,成功识别出共计26例可疑病原体,同时,脑脊液微生物培养技术检测出3例疑似存在的可疑病原体。在诊断中枢神经系统感染性疾病方面,mNGS组的灵敏度、准确度以及阴性预测值均高于微生物培养组,差异有统计学意义(P<0.05),而mNGS组的特异度及阳性预测值方面均相近于微生物培养组,差异无统计学意义(P>0.05)。结论在评估儿童中枢神经系统感染的诊断时,相较于脑脊液微生物培养检查,mNGS的优势显著,但仍应结合多种检验方法综合判断,以达到准确判断的目的。

关键词：儿童宏基因组二代测序感染中枢神经系统

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