检索结果-内蒙古大学图书馆

北方园艺 2018年第8期 149-154页

作者：孟丽张兰增周和云周森李玉谢宝贵山东农业大学植物保护学院山东泰安271018 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心吉林长春130118 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心福建福州350002

为筛选出与草菇子实体发育相关的转录因子,以不同发育时期的草菇子实体为试材,利用数字基因表达谱对不同发育时期的基因进行表达分析。结果表明:获得8个差异表达的Homeobox转录因子,其中5个在草菇原基期阶段上调表达,3个在伸长期阶段下... 详细信息

为筛选出与草菇子实体发育相关的转录因子,以不同发育时期的草菇子实体为试材,利用数字基因表达谱对不同发育时期的基因进行表达分析。结果表明:获得8个差异表达的Homeobox转录因子,其中5个在草菇原基期阶段上调表达,3个在伸长期阶段下调表达。这些差异表达的转录因子可能参与草菇子实体不同发育阶段的形态建成。

关键词：草菇数字基因表达谱子实体发育转录因子

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蔗茅野生种响应低温胁迫的数字基因表达谱

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分子植物育种 2018年第12期16卷 3877-3886页

作者：孟玉陈疏影徐荣曹哲群刘鲁峰王先宏何丽莲李富生云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201

以蔗茅野生种(昆明蔗茅99-1)为材料,利用数字基因表达谱(DGE)技术,对4℃低温胁迫处理后的蔗茅野生种构建的c DNA文库进行差异基因表达谱分析。结果表明,低温处理24 h(ER-LT1)有2 391个基因,低温处理72 h(ER-LT2)有4 892个基因因低温处... 详细信息

以蔗茅野生种(昆明蔗茅99-1)为材料,利用数字基因表达谱(DGE)技术,对4℃低温胁迫处理后的蔗茅野生种构建的c DNA文库进行差异基因表达谱分析。结果表明,低温处理24 h(ER-LT1)有2 391个基因,低温处理72 h(ER-LT2)有4 892个基因因低温处理而发生表达变化。GO功能显著性富集分析表明,差异基因主要涉及对非生物刺激反应、氧化还原过程、能量代谢以及催化活性。KEGG富集分析表明,两个不同处理时间下共同富集的通路主要为植物激素信号转导途径、植物-病原体互作通路、光合作用通路、淀粉和蔗糖代谢途径和苯丙烷生物合成途径等。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)验证2个在低温胁迫条件下的差异表达基因,其结果与DGE分析结果基本一致,证实了DGE测序结果的可靠性。

关键词：蔗茅低温胁迫数字基因表达谱差异基因

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整合数字基因表达谱与全基因组关联分析鉴定猪血液性状候选基因

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中国农业科学 2016年第2期49卷 348-360页

作者：徐盼张震章峰杨斌段艳宇江西农业大学省部共建猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室

【目的】整合数字基因表达谱与全基因组关联分析鉴定白色杜洛克×二花脸F资源群体的血液性状候选基因。【方法】白色杜洛克×二花脸F资源群体在(240±3)d屠宰,收集血液于抗凝管中进行血常规检测。利用Illumina 60K SNP芯片... 详细信息

【目的】整合数字基因表达谱与全基因组关联分析鉴定白色杜洛克×二花脸F资源群体的血液性状候选基因。【方法】白色杜洛克×二花脸F资源群体在(240±3)d屠宰,收集血液于抗凝管中进行血常规检测。利用Illumina 60K SNP芯片对1 020头F资源群体进行基因分型。剔除基因型检出率<90%和孟德尔错误检出率>5%的个体。检出率<95%、次等位基因频率<5%、哈代-温伯格检验(HWE)P<5×10、与性染色体连锁疑似常染色体的SNP被筛除。利用Illumina GA II测序仪测序对502头F资源群体的肝脏进行数字基因表达谱测序。测序得到的原始数据经过滤获得清洁标签后与参考标签数据库比对,将能唯一比对到参考基因序列的清洁标签数量进行标准化处理以获得标准化的基因表达量。每个转录本的表达水平进一步转化为lg2值。在少于20%的个体中表达的转录本被滤去。表型性状和基因表达性状使用R程序包中Gen ABEL内polygentic功能进行性别、批次和亲缘关系的校正。其残差使用R程序包中斯皮尔曼系数评估基因表达水平与表型数据的关联性,设定保守阈值P<5×10时调整多重检验。将检测到的表达数量性状位点(eQTL)及其对应基因根据其位置相对照的关系进行绘图。搜寻前期GWAS最高点5.0 Mb区域内eQTL结合GWAS结果进行综合分析。Gene Ontology&KEGG pathway富集分析使用在线工具DAVID。基因共表达网络使用在线工具Gene MANIA进行构建。【结果】白色杜洛克×二花脸F资源群体中502个个体的20 108个肝脏转录本通过了质检。当P<5×10时鉴别到与血红蛋白(HGB)、红细胞数目(RBC)、红细胞压积(HCT)、平均红细胞体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白含量(MCH)和白细胞数目(WBC)关联的转录本共259个。有34个转录本与一个以上表型关联。用上述血细胞性状关联的转录本进行eQTL定位,当阈值P<10时得到304个eQTL,每个转录本映射到1—6个eQTL,其中有35个顺式eQTL,120个反式eQTL。MCH和MCV的顺式eQTL位置重叠位于8号染色体。7号染色体存有数量最多的eQTL,其中多数为反式eQTL。通过eQTL定位确定了KIT为候选基因。Gene Ontology&KEGG pathway富集分析鉴别到与红细胞性状相关的基因KIT、PSEN2和TFRC,与白细胞性状相关的基因THBS1和CYR61。通过整合前期GWAS数据及eQTL定位并建立基因共表达网络,鉴定到与白细胞性状相关的基因RPS10。【结论】利用基于白色杜洛克×二花脸F资源群体的eQTL定位并结合前期GWAS数据,鉴别到与红细胞性状相关的基因KIT、PSEN2和TFRC,与白细胞性状相关的基因THBS1、CYR61和RPS10。

关键词：猪血液性状数字基因表达谱表达数量性状位点全基因组关联分析候选基因

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甘蔗印度种响应干旱胁迫的数字基因表达谱

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分子植物育种 2018年第7期16卷 2099-2106页

作者：李穆程志远何丽莲王先宏李富生云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 广西壮族自治区亚热带作物研究所南宁530001 中国农业科学院作物科学研究所北京100081

本研究以甘蔗印度种的代表品种"春尼"为试材,采用数字基因表达谱(DGE)技术对干旱胁迫后的"春尼"进行差异基因表达分析,共筛选到差异表达基因9 810个,其中上调表达4 687个,下调表达5 123个。GO功能显著性富集分析表... 详细信息

本研究以甘蔗印度种的代表品种"春尼"为试材,采用数字基因表达谱(DGE)技术对干旱胁迫后的"春尼"进行差异基因表达分析,共筛选到差异表达基因9 810个,其中上调表达4 687个,下调表达5 123个。GO功能显著性富集分析表明:差异表达基因主要定位于细胞质、质体、叶绿体、类囊体等,主要行使催化活性、氧化还原酶活性、辅因子结合、裂解酶活性等功能,主要涉及小分子代谢、细胞酮体代谢、有机酸代谢、含氧酸代谢、化学刺激应答、非生物刺激应答等生物过程。KEGG显著性富集分析表明:差异表达基因主要涉及植物激素信号转导、RNA转运、次生代谢产物的生物合成、淀粉和蔗糖代谢、泛素化蛋白降解、嘌呤碱代谢等通路。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)分析2个差异表达上调基因在"春尼"的苗期、伸长期、成熟期受干旱诱导的表达情况,结果均为"上调-上调-上调"模式,验证了DGE测序结果可靠、重复性好。

关键词：甘蔗印度种春尼干旱数字基因表达谱差异表达基因

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基于数字基因表达谱筛选黄瓜中水杨酸诱导基因

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核农学报 2015年第5期29卷 874-884页

作者：刘双乔禹王芳韩旭金晓霞池春玉于丽杰丁国华哈尔滨师范大学生命科学与技术学院/黑龙江省高校植物学重点实验室黑龙江哈尔滨150025

本文通过筛选水杨酸诱导黄瓜叶片差异表达基因(DEGs),旨在揭示水杨酸提高黄瓜抗病性机制和信号转导过程。以抗霜霉病黄瓜东农649为试材,无菌培养幼苗至4叶期,喷施5 mmol·L-1的水杨酸,喷施前和喷施后3、12和24 h分别采取叶片,提取总... 详细信息

本文通过筛选水杨酸诱导黄瓜叶片差异表达基因(DEGs),旨在揭示水杨酸提高黄瓜抗病性机制和信号转导过程。以抗霜霉病黄瓜东农649为试材,无菌培养幼苗至4叶期,喷施5 mmol·L-1的水杨酸,喷施前和喷施后3、12和24 h分别采取叶片,提取总RNA,制备c DNA文库,应用Illumina高通量测序技术对水杨酸处理前后的4个叶片c DNA文库进行差异基因数字表达谱分析。结果表明,SA诱导了多数与叶绿体和细胞壁相关基因的下调表达和多个与抗病相关基因的上调表达,对受体激酶、细胞色素P450、脂氧合酶和脂转运蛋白等信号转导相关基因的表达均有显著影响。本研究获取了丰富有效的数据,初步筛选的DGEs涉及到植物的PCD(程序性细胞死亡)、信号转导、系统获得性抗性(SAR)形成等过程,证实了SA与上述过程有密切关系,为最终揭示SA提高黄瓜抗病性机制奠定了基础。

关键词：黄瓜水杨酸数字基因表达谱高通量测序差异表达基因系统获得性抗性

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桃种质资源群体遗传分析及果实数字基因表达谱构建

桃种质资源群体遗传分析及果实数字基因表达谱构建

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作者：李雄伟浙江大学

学位级别：博士

桃(Prunus persica [L.] Batsch)是蔷薇科李属重要的核果类果树,因果实口感好,营养物质丰富,深受消费者喜欢。过去20年,通过传统育种方法国内外已经选出2000多个优良品种,但大多来源于少数亲本材料,遗传背景狭窄,使桃遗传多样性没有随... 详细信息

桃(Prunus persica [L.] Batsch)是蔷薇科李属重要的核果类果树,因果实口感好,营养物质丰富,深受消费者喜欢。过去20年,通过传统育种方法国内外已经选出2000多个优良品种,但大多来源于少数亲本材料,遗传背景狭窄,使桃遗传多样性没有随品种资源数量的增加而增加,不利于一些优良性状的改良。国内外应用分子标记已经对桃遗传多样性进行了大量研究,但不同研究组所选标记、植物材料及分析方法不同,难以进行数据整合,所得结果主要适用于所测样本,缺乏一个全景式品种群体分析图。作为桃的原产国,我国拥有4000多年的栽培历史及丰富多样的种质资源,如何选择优良性状亲本,对桃育种进程具有重要意义。为此,本研究采用ABI3130分析系统及48个高多态性SSR标记对我国的434份桃种质资源进行基因分型,并结合前期西班牙研究组用相同标记、相同方法下所得到的224份欧美桃种质资源基因型数据,对世界范围桃种质资源进行遗传对比分析,明确世界范围内桃品种资源的遗传多样性、品种群结构、连锁不平衡程度和在连锁群上分布。选择出中国核心桃种质资源材料采用新型高密度SNP芯片检测遗传变异,并进行简单性状的全基因组关联分析。桃果实品质研究方面,果实香气及硬度是评价果实品质的重要指标,两者均是由多基因控制的复杂性状,前人采用候选基因克隆、EST文库及微阵列芯片在香气、质地基因功能研究中取得了很大进展,但受基因数量有限,其分子调控机理仍不明确。本研究采用高通量Illumina RNA-seq技术,对‘湖景蜜露’、‘玉露’、‘锦绣黄桃’和‘中华寿桃’4个优良桃栽培品种及‘湖景蜜露’的三个成熟期进行数字基因表达谱构建,从转录组水平全面系统地分析了果实香气物质合成及果实软化的分子调控机理。主要结果如下： 1.653份桃种质资源的遗传多样性分析 48个SSR位点在653份桃种质资源中共扩增得到588个等位基因,平均每位点扩增得到12.25个等位基因,观察杂合度(Ho)则从0.13(PMS02)到0.63(UDP96-005),平均0.47。东亚桃亚组的遗传多样性显著高于欧美桃亚组,引进东亚品种的可以提高欧美品种的遗传多样性水平。聚类分析可将658份材料按地理起源、驯化进程和果实性状显著区分：野生近缘种与普通桃显著分开;古老地方品种与栽培种显著分开,东亚桃和欧美桃品种群可显著分开;欧美桃和油桃显著分开,选出281份中国桃种质资源用于高密度SNP芯片构建。不同群体LD分析发现东亚品种群LD遗传衰减距离(3.36cM)比欧美品种群(5.50cM)小,东亚品种群在应用高密度SNP全基因组关联分析中有更大的优势。‘玉露’亚群的LD水平最高,地方品种群LD水平最低。东亚品种群、欧美品种群及地方品种群在第1、第4连锁群的LD位点组合比例较高,重要的果肉色泽和果肉质地、香气分别位于这两的连锁群上。 2.桃品种特异性荧光SSR分子标记数据库建立及应用从全基因组范围的48个荧光SSR分子标记中选出15个高多态性标记,经不同荧光标识,最终分为3组在ABI3130测序仪测试。目前数据库包含669份材料。445个中国桃品种中有426(96.6%)个具有特异基因型组合,研究初步建立了159份中国桃核心种质资源分子标记数据库,并提出8个中国品系用作今后资源评价的参照。对17个桃品种进行系谱验证发现,我国资源圃所育成的7个品种系谱信息正确,但日本桃品种系谱信息与文献出现偏差。 3.基于9K高密度SNP芯片的全基因组关联分析对281份中国桃种质资源进行9K SNP芯片构建,共得到3781个多态性SNP,最小等位基因频率均大于0.03,并选出159个中国桃核心种质资源用于资源保存、管理及全基因组关联分析。邻接法聚类结果显示：3781个SNP与48个SSR聚类结果一致,且与群体结构分析结果一致。叶腺、花型、果肉颜色、果实质地、果皮茸毛、粘离核及果形7个质量性状进行关联分析,Scaffold5上的SNPGA44512标记与叶腺性状呈显著相关性,Scaffold1上的SNPGA03771和Scaffold6上的SNPGA86125与花形呈显著相关,Scaffold1上的SNPGA3479和SNPGA3768与果肉颜色显著相关,Scaffold4上的SNPGA77941、SNPGA77945、SNPGA77951与果肉溶质／不溶质呈显著相关,Scaffold5上的SNPGA96063与果皮茸毛显著相关,Scaffold6和Scaffold1上的SNPGA10889釉SNPGA24466与果实粘离核显著相关,Scaffold6上的SNPGA98099、SNPGA97021和SNP IGA697026与果形显著相关。 4.应用数字基因表达谱挖掘桃果实香气物质合成及果实质地相关基因 12个数字基因表达谱经过滤共产

关键词：桃 SSR 遗传多样性连锁不平衡单核苷酸多态性全基因组关联分析数字基因表达谱香气

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利用数字基因表达谱对鸡卵泡发育相关基因的筛选

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河南农业科学 2014年第10期43卷 117-122页

作者：朱桂玉泰山学院生物与酿酒工程学院山东泰安271021

为筛选禽类卵泡募集、等级化维持及排卵过程中的关键基因,通过数字基因表达谱检测鸡卵巢内等级前小白卵泡(SWF)和发育到最大期的等级卵泡(F1)中的差异表达基因。结果显示,随着卵泡的成熟,显著上调表达的基因有784个,显著下调的基因有1 ... 详细信息

为筛选禽类卵泡募集、等级化维持及排卵过程中的关键基因,通过数字基因表达谱检测鸡卵巢内等级前小白卵泡(SWF)和发育到最大期的等级卵泡(F1)中的差异表达基因。结果显示,随着卵泡的成熟,显著上调表达的基因有784个,显著下调的基因有1 526个。基因表达差异倍数达到5倍以上的上调基因包括PTGS1、TEK、VEGF-A、MMP-3、CDK1等;下调基因包括β-catenin、ZO-1、Nectin-3、PTPX15、Gadd45等。对差异表达基因进行基因本体(GO)生物学分析和信号通路显著富集分析发现,差异表达的基因所编码的蛋白主要参与生物学催化反应、分子连接、转移酶活性、水解等生物学过程;主要与细胞黏合通路、p53信号通路、蛋白合成通路及细胞周期通路等信号通路有关。对卵泡发育过程中的基质金属蛋白酶家族(MMPs)的MMP-3与MMP-9基因表达变化进行测定发现,MMP-3基因表达量在卵泡发育过程中显著升高,排卵后的卵泡中显著下降;MMP-9基因表达量则持续显著升高,在排卵后第2天的卵泡中下降,但下降不明显。

关键词：鸡卵泡数字基因表达谱差异表达基因基质金属蛋白酶

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基于高通量测序的数字基因表达谱技术研究进展

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北方园艺 2015年第10期 170-176页

作者：张渝刘玉洁郭丹妮李惠敏秦新民广西师范大学生命科学学院珍稀濒危动植物生态与环境保护教育部重点实验室广西桂林541004

数字基因表达谱(digital gene expression profiling,DGE)是一种全面、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下基因表达情况的高通量测序技术。通过对基因表达谱的生物信息学搜索、比较和分析,可从中获取基因转录、基因调控、信号转导... 详细信息

数字基因表达谱(digital gene expression profiling,DGE)是一种全面、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下基因表达情况的高通量测序技术。通过对基因表达谱的生物信息学搜索、比较和分析,可从中获取基因转录、基因调控、信号转导通路、蛋白质功能等相关信息。该研究主要介绍了数字基因表达谱的原理以及在生物学和医学研究等方面的应用。

关键词：数字基因表达谱高通量测序技术差异表达基因

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附子理中汤干预IBS-D大鼠数字基因表达谱和免疫功能研究

附子理中汤干预IBS-D大鼠数字基因表达谱和免疫功能研究

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作者：谭玮璐广州中医药大学

学位级别：博士

目的肠易激综合征(Irritable bowel syndrome,IBS)是一种临床表现为反复发作的腹痛,与排便相关或伴随排便习惯改变的功能性胃肠病,典型的排便习惯异常可表现为便秘、腹泻,或便秘与腹泻交替,同时可有腹胀的症状。IBS患者的临床症状可持... 详细信息

目的肠易激综合征(Irritable bowel syndrome,IBS)是一种临床表现为反复发作的腹痛,与排便相关或伴随排便习惯改变的功能性胃肠病,典型的排便习惯异常可表现为便秘、腹泻,或便秘与腹泻交替,同时可有腹胀的症状。IBS患者的临床症状可持续存在或反复发作,肠道病理组织学未见器质性改变。腹泻型肠易激综合征(Irritable bowel syndrome with predominant diarrhea,IBS-D)是 IBS 中最常见的亚型,影响患者生活质量,同时也对国家医疗体系疗构成巨大负担。目前认为IBS是由多因素引起的具有复杂病理生理机制的疾病,在治疗上多以对症治疗为主,常用药物有解痉剂、止泻剂、微生态调节剂、内脏感觉调节药、三环类抗抑郁药等,但目前仍暂未有较为理想治疗方法和特效药物。中医认为IBS-D的发病与肝、脾、肾三脏密切相关。肝气郁结,疏泄失调,导致木旺克土;脾土受制,脾虚失运,水道失司,发为泄泻、腹痛;脾虚日久,脾病及肾,损及肾阳,脾肾两虚。肝郁、脾虚、肾阳不足是IBS-D的主要病机。IBS-D是中医药治疗的优势病种,具有巨大发展潜力,应用辨证论治结合针刺、艾灸等传统疗法从整体综合治疗本病有良好的临床效果,现代大量文献报道和荟萃分析显示出中医药治疗IBS-D的特色和优势。因此,探寻IBS-D的发病机制和药物的疗效机制是当今功能性胃肠病的研究热点之一,也是临床治疗的关键问题,具有重要的科学价值和社会意义。本研究分文献综述和实验研究两大部分。文献综述分别从两方面进行论述,其一是从现代医学的角度,对IBS-D的流行病学、病因与发病机制、诊断标准、临床治疗的研究进展情况进行归纳;其二是从祖国传统医学的角度,对IBS-D的中医病名、病因病机、证候分型、治法方药、专家经验和现代中医药临床分析的研究进展情况进行分析与总结。实验研究设计以脾肾阳虚型症状为主要表现的IBS-D模型大鼠,从模型评价、基因研究层面和组织学层面探讨附子理中汤对大鼠的一般情况、症状评分和结肠黏膜组织病理学、结肠黏膜组织的数字基因表达谱(Digital Gene Expression Tag Profiling,DGE)、胸腺指数和脾脏指数、结肠黏膜的肥大细胞计数、NALP-3炎性体、CD4+、CD8+、CD4+/CD8+比值的影响。方法30只SPF级大鼠随机分为中药组、模型组、对照组三组,每组10只,雌雄各半,应用束缚应激联合番泻叶灌胃法复制IBS-D大鼠模型。造模后进行模型评价,评价合格造模成功后开始给药。中药组按1.5g/kg给药,模型组与对照组予生理盐水灌胃(20mL/kg/d),1次/d,连续14d。实验结束后,对各组大鼠的一般情况、体重相对增长率、粪便Bristol分级评分、腹泻率、腹泻指数、肛温、中医证候积分、肠道组织形态学和胸腺指数、脾脏指数进行检测;应用Trizol经典法进行RNA提取,mRNA纯化后进行文库构建和质检,以高通量测序技术对各组大鼠结肠组织黏膜的数字基因表达谱(DGE)进行检测;应用免疫组化法检测NALP-3炎性体、CD4+、CD8+在结肠黏膜组织中表达水平,应用醛品红染色法检测肥大细胞计数。结果***-D大鼠模型评价1.1大鼠一般情况:对照组大鼠精神状态良好,毛色光亮,饮食、粪便颜色和性状正常。参与造模的两组大鼠从造模第5d开始出现精神萎靡,饮食减少,毛色晦暗,排便次数增多、解稀便。中药组大鼠从给药第4d开始排便次数减少和粪便性状改善,精神饮食、毛色亮泽逐渐恢复。1.2体重相对增长率:造模后三组大鼠体重相对增长率无统计学差异(P>0.05),实验后三组大鼠体重相对增长率有差异(P<0.05),中药组大鼠体重相对增长率高于模型组(P<0.05),其余组间对比无差异(P>0.05)。1.3大鼠粪便Bristol分级评分:造模后、实验后三组大鼠粪便Bristol分级评分比较均有显著统计学差异(P<0.01)。造模后,模型组显著高于对照组(P<0.01),中药组显著高于对照组(P<0.01),中药组与模型组比较无统计学差异(P>0.05);实验后,中药组显著低于模型组(P<0.01),模型组显著高于对照组(P<0.01),中药组与对照组比较无统计学差异(P>0.05)。1.4腹泻率:造模后、实验后三组大鼠的腹泻率比较均有显著统计学差异(P<0.01)。造模后,模型组显著高于对照组比较(P<0.01),中药组显著高于对照组(P<0.01),中药组与模型组对比无统计学差异(P>0.05);实验后,中药组显著低于模型组(P<0.01),模型组显著高于对照组(P<0.01),中药组与对照组比较无统计学差异(P>0.05)。1.5腹泻指数:造模后、实验后三组大鼠腹泻指数的比较均有显著统计学差异(P<0.01)。造模后,模

关键词：附子理中汤腹泻型肠易激综合征数字基因表达谱 NALP-3炎性体免疫指标

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红掌佛焰苞数字基因表达谱及关键基因表达水平分析

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江苏农业科学 2016年第3期44卷 48-52页

作者：彭佳佳刘克林刘丽娅吕学华杨哲李佩愉刘春明军袁素霞平吉成张黎宁夏大学农学院宁夏银川750001 中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081 北京市大东流苗圃北京102211 河北省平泉县林木种苗管理站河北平泉067000

以红掌佛焰苞S5(盛花期:红色)、S8(衰老期:绿色)时期为试验材料进行数字基因表达谱(digital gene expression profiling,DGE)测序,分别得到12 766 374条(1.28 G)、18 583 390条(1.86 G)可分析序列(clean reads),被成功注释有差异表达的... 详细信息

以红掌佛焰苞S5(盛花期:红色)、S8(衰老期:绿色)时期为试验材料进行数字基因表达谱(digital gene expression profiling,DGE)测序,分别得到12 766 374条(1.28 G)、18 583 390条(1.86 G)可分析序列(clean reads),被成功注释有差异表达的基因序列2 316条。为探究红掌佛焰苞颜色变化过程中关键基因的表达水平,将差异基因定位在花青素生物合成途径11条表达量变化的序列上,并通过实时荧光定量PCR对其中的4条序列进行检验,验证了DGE测序结果的准确性。同时研究这4个序列在红掌佛焰苞生长过程中的表达水平,结果表明:在佛焰苞发育初期,3条序列相对表达量逐渐增高,1条在S2时期降低,但均在S3时期达到最高或较高值;在S4、S5、S6、S7、S8时期,随着佛焰苞的成熟,4条序列表达量大体上均逐渐下降,在S8衰老期表达量最低。研究结果证明了这4条基因序列是红掌佛焰苞花色形成中的关键基因,S3时期是花青素生物合成的高峰期。

关键词：数字基因表达谱红掌佛焰苞花青素基因表达水平基因序列关键基因花色变化关键酶

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