检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：陈新朱忠旭王纬韬 310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号

本发明公开了一种基于概率框架和重测序技术快速发现表型相关基因的方法，建立了一种基于概率框架的方法，对基于基因组重测序技术的正向遗传学研究过程建模，通过计算四个指标评估研究过程中每一个步骤的设计对研究整体有效性造成的影... 详细信息

标准号: CN105404793B

本发明公开了一种基于概率框架和重测序技术快速发现表型相关基因的方法，建立了一种基于概率框架的方法，对基于基因组重测序技术的正向遗传学研究过程建模，通过计算四个指标评估研究过程中每一个步骤的设计对研究整体有效性造成的影响，从而指导对当前实验方案和分析方法的优化，达到使用尽可能少的样本，快速发现可能与特定表型相关的基因的目的。首次提出用四个指标来评估基于基因组重测序技术的正向遗传学研究过程的整体有效性，其中方法成功率和非孟德尔表型显著性是创新提出的指标，对于指导整个研究过程优化有重要价值。

关键词：测序技术遗传学研究概率框架基因组表型正向表型相关基因过程建模过程优化指标评估显著性研究成功率样本发现基因评估优化分析

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基于概率框架和重测序技术快速发现表型相关基因的方法

基于概率框架和重测序技术快速发现表型相关基因的方法

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作者：陈新朱忠旭王纬韬 310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号

标准号: CN105404793A

关键词：重测序遗传学研究基因组表型四个一种正向表型相关基因过程建模过程优化实验方案指标评估显著性概率研究成功率样本指导发现基因计算评估优化设计公开创新建立影响

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一种DNA及蛋白质水平突变分析系统

一种DNA及蛋白质水平突变分析系统

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作者：薛成海龚永辉刘宇 300220 天津市河西区洞庭路20号陈塘科技商务区服务中心214

本发明提供了一种DNA及蛋白质水平突变分析系统，包括读取及索引判断模块，用于读取基因突变文件，格式化处理成标准名称；索引转录本序列、基因信息和基因转录本注释信息、构建氨基酸密码子对应关系表；判断突变发生的水平、突变的模... 详细信息

标准号: CN106021980B

本发明提供了一种DNA及蛋白质水平突变分析系统，包括读取及索引判断模块，用于读取基因突变文件，格式化处理成标准名称；索引转录本序列、基因信息和基因转录本注释信息、构建氨基酸密码子对应关系表；判断突变发生的水平、突变的模式；判断突变命名是蛋白质水平突变或是基因组DNA水平突变或是CDS编码区突变；映射模块，用于根据读取及索引判断模块的判断结果，分别进入不同的水平突变映射流程，得到三种突变命名的映射关系。本发明承接文献挖掘的表型相关基因突变和多态位点，输出多种突变命名的映射关系，以达到完成注释文献挖掘的致病变异与测序识别的基因突变和多态位点间对应等目的。

关键词：突变读取蛋白质水平多态位点基因突变索引判断文献挖掘映射关系氨基酸密码子表型相关基因格式化处理基因转录本基因组DNA 基因信息判断结果突变分析映射模块注释信息编码区关系表转录本映射测序构建索引承接输出

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一种DNA及蛋白质水平突变分析方法

一种DNA及蛋白质水平突变分析方法

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作者：薛成海龚永辉王晓君 300220 天津市河西区洞庭路20号陈塘科技商务区服务中心214

本发明提供了一种DNA及蛋白质水平突变分析方法，包括以下步骤：1)1)读取基因突变文件，格式化处理成标准名称；2)索引转录本序列、基因信息和基因转录本注释信息、构建氨基酸密码子对应关系表；3)判断突变发生的水平、突变的模式；判... 详细信息

标准号: CN106021983B

本发明提供了一种DNA及蛋白质水平突变分析方法，包括以下步骤：1)1)读取基因突变文件，格式化处理成标准名称；2)索引转录本序列、基因信息和基因转录本注释信息、构建氨基酸密码子对应关系表；3)判断突变发生的水平、突变的模式；判断突变命名是蛋白质水平突变或是基因组DNA水平突变或是CDS编码区突变；4)根据步骤3)的判断结果，分别进入不同的水平突变映射流程，得到三种突变命名的映射关系。本发明承接文献挖掘的表型相关基因突变和多态位点，输出多种突变命名的映射关系，以达到完成注释文献挖掘的致病变异与测序识别的基因突变和多态位点间对应等目的。

关键词：突变蛋白质水平多态位点基因突变文献挖掘映射关系氨基酸密码子表型相关基因读取格式化处理基因转录本基因组DNA 基因信息判断结果突变分析注释信息编码区关系表转录本映射测序构建索引承接输出

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Notch信号通路重编程线粒体代谢调控巨噬细胞的促炎反应

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中华烧伤杂志 2016年第7期32卷 421-421页

作者：蔡维霞胡大海

代谢重编程参与巨噬细胞的激活，但其分子机制尚不清楚。本研究得出结论：在分离的小鼠肝脏巨噬细胞和巨噬细胞系中，Notch1信号通路通过上调I型巨噬细胞表型相关基因的表达，使巨噬细胞向I型巨噬细胞活化；上述现象同时伴有线粒体氧化... 详细信息

代谢重编程参与巨噬细胞的激活，但其分子机制尚不清楚。本研究得出结论：在分离的小鼠肝脏巨噬细胞和巨噬细胞系中，Notch1信号通路通过上调I型巨噬细胞表型相关基因的表达，使巨噬细胞向I型巨噬细胞活化；上述现象同时伴有线粒体氧化磷酸化水平升高以及线粒体活性氧增加。此外本实验显示：Notchl胞内结构域入核及进入线粒体使呼吸链编码基因表达增加，或者Notch信号依赖的丙酮酸脱氢酶磷酸酶1（Pdpl）的诱导表达、

关键词： Notch信号通路巨噬细胞系线粒体氧化代谢调控编程反应表型相关基因 Notch1

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一种DNA及蛋白质水平突变分析方法

一种DNA及蛋白质水平突变分析方法

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作者：薛成海龚永辉王晓君 300220 天津市河西区洞庭路20号陈塘科技商务区服务中心214

标准号: CN106021983A

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一种DNA及蛋白质水平突变分析系统

一种DNA及蛋白质水平突变分析系统

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作者：薛成海龚永辉刘宇 300220 天津市河西区洞庭路20号陈塘科技商务区服务中心214

标准号: CN106021980A

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外源E2F和CArG顺式元件对血管平滑肌细胞表型相关基因表达的影响

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中国生物化学与分子生物学报 2001年第5期17卷 626-630页

作者：韩梅温进坤河北医科大学基础医学研究所生物化学研究室石家庄050017

利用转录因子“诱骗”策略 ,阻断血管平滑肌细胞 (VSMC)表型特异基因和增殖相关基因的反式激活 ,揭示VSMC表型转化和增殖之间的关系 .电泳迁移率改变分析结果表明 ,相当于分化型VSMC特异表达基因共有顺式元件CArG和细胞增殖相关基因共... 详细信息

利用转录因子“诱骗”策略 ,阻断血管平滑肌细胞 (VSMC)表型特异基因和增殖相关基因的反式激活 ,揭示VSMC表型转化和增殖之间的关系 .电泳迁移率改变分析结果表明 ,相当于分化型VSMC特异表达基因共有顺式元件CArG和细胞增殖相关基因共有顺式元件E2F的双股寡核苷酸(ODNs)可分别与从分化型和去分化型VSMC中提取的核蛋白特异性结合 ,形成DNA 蛋白质复合物 .Northern杂交结果显示 ,导入VSMC中的CArGODN可使平滑肌α肌动蛋白 (α actin)表达活性降低 ,肌丝数量减少 ,明显抑制转染细胞的再分化过程 .去分化型VSMC被E2FODN转染后 ,增殖相关基因c myc表达受到抑制 ,细胞增殖速率减慢 ,去分化表型特征减弱 .结果提示 ,E2F和CArG调控元件分别对VSMC增殖和分化起重要调节作用 ,并证实VSMC表型转化与增殖是两个密切相关但不完全相同的细胞事件 .

关键词：顺式元件诱骗表型转化基因调控血管平滑肌细胞 VSMC 表型相关基因

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