检索结果-内蒙古大学图书馆

基于网络药理学、生物信息学及分子动力学模拟探讨冬虫夏草治疗非小细胞肺癌机制

现代药物与临床 2024年第9期39卷 2222-2234页

作者：梁鸿彬张晖史经龙雷蕾谢旖阳任川吴发胜广西中医药大学广西南宁530200 广西中医药大学附属瑞康医院广西南宁530000

目的利用生物信息学、网络药理学、分子对接、动力学模拟方法探讨冬虫夏草治疗非小细胞肺癌的关键靶点及其分子机制。方法利用TCMSP数据库检索冬虫夏草的活性成分和靶点,并利用GEO数据库获取与非小细胞肺癌相关的数据集,使用R语言软件... 详细信息

目的利用生物信息学、网络药理学、分子对接、动力学模拟方法探讨冬虫夏草治疗非小细胞肺癌的关键靶点及其分子机制。方法利用TCMSP数据库检索冬虫夏草的活性成分和靶点,并利用GEO数据库获取与非小细胞肺癌相关的数据集,使用R语言软件进行差异分析,获取差异表达基因(DEGs)。通过WGCNA分析确定与肿瘤发生密切相关的基因模块,并取交集获取非小细胞肺癌的枢纽基因,将这些枢纽基因与药物靶点进行映射,利用Cytoscape软件构建“活性成分-疾病枢纽靶点”网络图。使用String数据库和Cytoscape构建靶标蛋白相互作用(PPI)网络,筛选出关键靶点。利用Enrihr在线工具进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用CB-Dock2平台和Discovery Studio 2021Client软件对关键成分和靶点进行分子对接验证和可视化。最后利用Gromacs v2022.03软件对分子对接所得的复合物进行100 ns分子动力学模拟分析。结果共筛选得到冬虫夏草活性成分10个,自身靶点276个和作用于非小细胞肺癌的靶点9个,通过对虫草甾醇和花生四烯酸2个核心成分富集分析提示,主要涉及氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、神经活性配体与受体的相互作用、脂肪细胞的脂肪分解调节、腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路、叉头框转录因子(FoxO)信号通路等。分子对接结果显示,虫草甾醇和花生四烯酸与过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、1型血管紧张素ⅱ受体(AGTR1)和内皮PAS结构域蛋白1(EPAS1)这3个核心靶点具有良好的结合能力,动力学模拟进一步验证虫草甾醇与PPARG、AGTR1复合物结合稳定。结论冬虫夏草可能通过调控巨噬细胞极化、神经活性配体与受体、脂质代谢、氧化应激、免疫调节等过程,多种协同作用发挥抗非小细胞肺癌作用。

关键词：冬虫夏草非小细胞肺癌生物信息学网络药理学分子动力学虫草甾醇花生四烯酸过氧化物酶体增殖物激活受体γ 1型血管紧张素ⅱ受体

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血管生成因子、抗血管生成因子表达变化在子痫前期发病中的作用机制研究进展

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山东医药 2017年第15期57卷 112-114页

作者：张展宋婉玉张琳琳王金铭郑州大学第三附属医院郑州450052 河南商丘医学高等专科学校

子痫前期的基本病理特征是母体全身血管内皮功能障碍。有证据表明,血管生成因子、抗血管生成因子表达改变可能与子痫前期的发病有关。母血中高水平的抗血管生成因子(如s Flt-1、s Eng、AT1、HIF-1α等)可破坏血管生成因子(如VEGF、PIGF... 详细信息

子痫前期的基本病理特征是母体全身血管内皮功能障碍。有证据表明,血管生成因子、抗血管生成因子表达改变可能与子痫前期的发病有关。母血中高水平的抗血管生成因子(如s Flt-1、s Eng、AT1、HIF-1α等)可破坏血管生成因子(如VEGF、PIGF等)的生物学功能,打破血管生成因子/抗血管生成因子生理性平衡状态,造成血管内皮细胞功能障碍,出现各组织细胞缺血缺氧,产生子痫前期临床症状。多项研究发现,母血s Flt-1/PIGF比值变化或可预测子痫前期的发生并评估病情,但该预测值还未纳入任何一项官方临床指南,仍需要后续研究证实。

关键词：子痫前期血管内皮生长因子成纤维生长因子胎盘生长因子可溶性血管内皮生长因子受体1 可溶性内皮糖蛋白 1型血管紧张素ⅱ受体

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抗AT_1受体自身抗体与冠脉内支架术后再狭窄的关系

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临床心血管病杂志 2016年第11期32卷 1111-1114页

作者：盛丽田苗黄鹏李军张传焕李留东青岛大学医学院附属毓璜顶医院心内科山东烟台264000

目的:探讨不稳定型心绞痛患者血清中是否存在抗血管紧张素Ⅱ1型受体自身抗体及其与冠状动脉(冠脉)支架内再狭窄的关系。方法:随机抽选95例不稳定型心绞痛患者和98例健康受试者,检测外周血清中的抗血管紧张素Ⅱ1型受体自身抗体、细胞因... 详细信息

目的:探讨不稳定型心绞痛患者血清中是否存在抗血管紧张素Ⅱ1型受体自身抗体及其与冠状动脉(冠脉)支架内再狭窄的关系。方法:随机抽选95例不稳定型心绞痛患者和98例健康受试者,检测外周血清中的抗血管紧张素Ⅱ1型受体自身抗体、细胞因子以及该抗体对血管平滑肌细胞增殖和c-fos、c-jun基因表达的影响。结果:空白对照组、不稳定型心绞痛组及支架植入组的抗体阳性率分别为10.20%、35.79%和47.37%。抗体阳性组及阴性组间细胞因子的变化无统计学意义。体外试验中该自身抗体显示出激动剂样作用,可刺激血管平滑肌细胞增殖,上调c-fos及c-jun基因的表达。这些效应与血管紧张素Ⅱ类似,可部分被AT_1受体拮抗剂缬沙坦阻断。结论:不稳定型心绞痛患者血清中的自身抗体有类似于血管紧张素Ⅱ的效应,可能在冠脉支架术后支架内再狭窄的发病机制中发挥了重要作用。

关键词： 1型血管紧张素ⅱ受体自身抗体支架内再狭窄血管平滑肌细胞

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奥美沙坦抑制低渗液诱导的豚鼠心房肌细胞I_(Ks)电流增加和动作电位时程缩短

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山西医科大学学报 2015年第4期46卷 283-288页

作者：高洁盛婴叶莎刘传镐赵进西安交通大学第二附属医院干部二病区西安710004 西安交通大学第一附属医院干五病区西安交通大学医学部药理学系西安交通大学医学部机能教学中心

目的研究选择性AT1受体阻滞剂(ARB)奥美沙坦对牵拉心房肌细胞诱导的IKs电流增加和动作电位时程(APD)缩短的影响,探讨ARB防治房颤(AF)的可能机制。方法采用低渗液(Hypo-S,渗透压降低26%)作用于豚鼠心房肌细胞以模拟细胞牵张,然后利用膜... 详细信息

目的研究选择性AT1受体阻滞剂(ARB)奥美沙坦对牵拉心房肌细胞诱导的IKs电流增加和动作电位时程(APD)缩短的影响,探讨ARB防治房颤(AF)的可能机制。方法采用低渗液(Hypo-S,渗透压降低26%)作用于豚鼠心房肌细胞以模拟细胞牵张,然后利用膜片钳技术记录心房肌细胞IKs电流和APD。结果 1μmol/L和7μmol/L奥美沙坦可降低由Hypo-S诱导的豚鼠心房肌细胞IKs增加和动作电位复极90%时程(APD90)缩短,但不影响基础IKs电流。Hypo-S可使IKs电流增加105.60%,而Hypo-S+1μmol/L和Hypo-S+7μmol//L奥美沙坦仅分别使IKs电流增加70.64%和68.22%(与Hypo-S比较,均P<0.05)。同时,Hypo-S使APD90缩短20.22%,而Hypo-S+1μmol/L奥美沙坦和Hypo-S+7μmol/L奥美沙坦分别使APD90缩短11.89%和11.56%(与Hypo-S比较,均P<0.01)。结论奥美沙坦对牵张心房肌细胞诱导的电生理变化与阻断AT1受体有关。由于房颤时常伴有心房肌细胞扩张和有效不应期增加,因而奥美沙坦的作用有益于心房纤颤治疗。

关键词： 1型血管紧张素ⅱ受体奥美沙坦心房肌细胞 IKs 动作电位

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ErbB家族与GPCR家族靶标的分子动力学模拟研究

ErbB家族与GPCR家族靶标的分子动力学模拟研究

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作者：杜芸中国科学院大学

学位级别：博士

蛋白质的功能是在动态变化的过程中实现的。分子动力学(MolecularDynamics，MD)模拟可以揭示构象变化动态过程中原子水平的细节信息，成为观察微观世界动态变化过程的“显微镜”，受到越来越多的关注和重视。近年来，随着计算机硬件及... 详细信息

蛋白质的功能是在动态变化的过程中实现的。分子动力学(MolecularDynamics，MD)模拟可以揭示构象变化动态过程中原子水平的细节信息，成为观察微观世界动态变化过程的“显微镜”，受到越来越多的关注和重视。近年来，随着计算机硬件及软件的不断发展，分子动力学模拟所能够达到的时间尺度正向“达到”生物过程真实时间尺度发展，其多个重要应用领域都取得了长足的进步。本博士论文围绕重要膜蛋白类药物靶标的结构功能关系开展了分子动力学模拟的多种应用研究，分别阐述了配体诱导ErbB4胞外区构象变化的机制、研究了β2肾上腺素受体的二聚体的动态特征、预测了野生型及突变体1型血管紧张素ⅱ受体的热稳定性并且优化了GPR45与腺苷复合物筛选模型。　　ErbB4是ErbB酪氨酸激酶受体家族成员，在细胞的生长和分化等过程中发挥着重要作用，然而ErbB4胞外区激活机制一直存在较大争议。通过1微秒的长时间分子分子动力学模拟，本论文第二章研究了ErbB4原子水平上的激活机制，得到以下结论：配体(NRG1β)的结合是ErbB4构象转变和进一步形成二聚体的主动诱导力;自由配体最先结合在ErbB4的结构域Ⅰ上，通过配体与结构域Ⅲ之间的静电吸引拉动结构域Ⅰ和Ⅲ互相靠近，从而带动ErbB4的构象转变。结构域Ⅱ的弯曲运动对破坏分子内结构域Ⅱ/Ⅳ之间的“钩锁结构”(激活过程中的主要障碍)起着重要的作用，在“钩锁结构”被破坏之后，整个分子进一步发生巨大构象变化。计算所得ErbB4胞外区钩锁结构打开所需跨过的能垒(～2.7kcal/mol)与同家族ErbB1的实验值(1-2kcal/mol)高度一致。此外，通过ErbB4能量图景分析捕获到的局部稳定状态构象与ErbB1/EGF复合物晶体结构的构象非常相似。第二章所提出的ErbB4的配体诱导激活的机制为研究其他ErbB的激活机制以及针对这些受体的药物设计提供了新的线索与思路。　　G蛋白偶联受体(GPCR)广泛参与多种生命活动和多种生理过程，因而与一些重大疾病的发生发展密切相关，是最重要的一类药物靶标。利用分子动力学模拟，本论文第三到第五章对GPCR家族的三个成员分别进行了不同角度的研究。论文第三章借助1微秒的长时间分子动力学模拟，发现了野生型与突变体β2肾上腺素受体二聚体分子间相互作用模式的差别，揭示了E338与K60对于β2肾上腺素受体二聚化的重要作用以及胆固醇的重要贡献，证实了依据晶体结构堆叠模式提出的β2肾上腺素受体二聚体模型的正确性。利用分子动力学模拟，论文第四章针对结构未知的Ⅰ型血管紧张素Ⅱ受体中可增加热稳定性的突变位点进行了预测。采用去污剂包裹Ⅰ型血管紧张素Ⅱ受体疏水区构成的微球结构作为模拟体系，在原子水平上通过分子动力学模拟重现了测定热稳定性的实验体系，并预测W153Y、L202F、C121F、L72F和1124F一系列定点突变可以增加1型血管紧张素ⅱ受体的热稳定性。作为孤儿GPCR的一员，GPR45的内源性配体仍未知，而最近研究表明腺苷可以剂量依赖性地激活GPR45。为研究腺苷与GPR45的结合方式，并根据其结合模式寻找新的配体分子，论文第五章采用分子动力学模拟研究GPR45/腺苷复合物在动力学上可能采取的构象，并基于分子动力学模拟的结果构建了分子对接模型，用于开展化合物筛选工作。

关键词：分子动力学模拟 G蛋白偶联受体 β2肾上腺素受体 1型血管紧张素ⅱ受体

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1型血管紧张素ⅱ受体拮抗剂对胰腺星状细胞的影响

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中华消化杂志 2006年第9期26卷 598-601页

作者：张汝玲刘文滨王兴鹏吴恺龚自华吴丽颖董育玮上海交通大学附属第一人民医院消化科 200080

目的探讨1型血管紧张素ⅱ受体(AT_1)拮抗剂氯沙坦对胰腺星状细胞(PSC)的影响及其可能机制。方法①从胰腺癌患者胰腺组织中分离PSC并检测其AT_1的表达,用血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)和氯沙坦干预后检测其Ⅰ型胶原的表达情况。②90只雄性SD大鼠... 详细信息

目的探讨1型血管紧张素ⅱ受体(AT_1)拮抗剂氯沙坦对胰腺星状细胞(PSC)的影响及其可能机制。方法①从胰腺癌患者胰腺组织中分离PSC并检测其AT_1的表达,用血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)和氯沙坦干预后检测其Ⅰ型胶原的表达情况。②90只雄性SD大鼠均分为正常组、对照组和治疗组。后2组胰管内注射2%三硝基苯磺酸(TNBS)制成大鼠胰腺纤维化模型。治疗组给予氯沙坦灌胃,对照组给予等容积的无菌蒸馏水。于制模后第3、7、14、21和28天分别处死大鼠,留取胰腺组织。电镜下观察胰腺组织超微结构改变；应用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测胰腺组织转化生长因子β_1(TGFβ_1)、Ⅰ型前胶原mRNA表达；应用免疫组化法检测胰腺组织α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)和TGFβ_1蛋白表达；应用Western印迹法检测胰腺组织α-SMA动态表达水平。结果体外研究显示,AT_1表达于人胰腺癌组织PSC,氯沙坦可抑制其Ⅰ型胶原的表达。体内研究表明,氯沙坦可逆转胰腺纤维化大鼠电镜下胰腺细胞异常改变；胰腺纤维化大鼠胰腺组织α-SMA、TGFβ_1和Ⅰ型前胶原表达增加,氯沙坦可下调其表达。结论AT_1拮抗剂通过阻断AT_1途径抑制PSC活化及其促纤维化作用。

关键词：胰腺星状细胞纤维化 1型血管紧张素ⅱ受体

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1型血管紧张素ⅱ受体在肝纤维化及正常肝组织中的表达及意义

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中华肝脏病杂志 2004年第2期12卷 91-91页

作者：王卫卫杨希山王捷李旭广州军区总医院消化内科广州510010

通过对人肝组织中1型血管紧张素ⅱ受体(AT1R)的检测,探讨肝纤维化形成过程中AT1R的表达变化及它的肝纤维化发生发展中可能的作用.

关键词： 1型血管紧张素ⅱ受体肝纤维化检测发病机制

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1型血管紧张素ⅱ受体基因多态性与2型糖尿病伴高血压的相关性

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第一军医大学学报 2002年第5期22卷 444-446页

作者：薛耀明周琳罗仁第一军医大学南方医院分泌科广东广州510515 第一军医大学南方医院中医科广东广州510515

目的探讨1型血管紧张素ⅱ受体(ATIR)基因多态与2型糖尿病病伴高血压之间的相互关系。方法以ATIF基因为侯选基因,就用PCR方法,检测132例2型糖尿病伴高血压２型糖尿病无高血压患者的ATIR基因多态性。结果２组研究对象AA基因型分布频率... 详细信息

目的探讨1型血管紧张素ⅱ受体(ATIR)基因多态与2型糖尿病病伴高血压之间的相互关系。方法以ATIF基因为侯选基因,就用PCR方法,检测132例2型糖尿病伴高血压２型糖尿病无高血压患者的ATIR基因多态性。结果２组研究对象AA基因型分布频率分别为88.79%与96.97%基因型分布频率分别为11.21%3.03%;A等位基因携带率分别为94.39%与98.48%,C等位基因携带率为5.61与1.52%,均有显著性差异(P＜0.05),提示ATIR基因多态性与２M糖尿病伴高血压的发生有相关性,且糖尿病伴高血压患者病程显著延长。正常血压糖尿病患者与单纯舒张压升高糖尿病患者之间ATIR-A1166-C基因多态性无显著差异,而与单纯收缩压升高糖尿病患者之间有显著性差异,结论,ATIR基因参与2型糖尿病伴高血压的发病,并仅与收缩压升高有关。

关键词： 1型血管紧张素ⅱ受体糖尿病高血压 2型糖尿病 AT1R基因基因多态性

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1型血管紧张素ⅱ受体基因多态性与中国人脑血管病的相关性研究

1型血管紧张素Ⅱ受体基因多态性与中国人脑血管病的相关性研究

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作者：王慧源青岛大学

学位级别：硕士

目的:该研究旨在观察1型血管紧张素ⅱ受体(ATR)基因多态性与中国人脑梗死(CI)和原发性高血压(HTN)的相关关系,探索CI的发病机理.结论:提示ATR的多态性参与CI发病,尤其是女性患者CI的发病.

目的:该研究旨在观察1型血管紧张素ⅱ受体(AT<,1>R)基因多态性与中国人脑梗死(CI)和原发性高血压(HTN)的相关关系,探索CI的发病机理.结论:提示AT<,1>R的多态性参与CI发病,尤其是女性患者CI的发病.

关键词： 1型血管紧张素ⅱ受体基因多态性脑梗死

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血管紧张素Ⅱ受体1反义寡核苷酸转染心肌细胞

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高血压杂志 2003年第3期11卷 223-225,T002页

作者：王颖王晋明李建军李艳孙琦王晶周心房武汉大学人民医院心内科湖北武汉430060 武汉大学人民医院检验科湖北武汉430060

目的　探讨血管紧张素Ⅱ 1型受体反义寡核苷酸转染心肌细胞的可行性。方法　应用显微荧光技术观察反义寡核苷酸在原代培养的心肌细胞内的转染效率 ,及其在细胞内的时相性分布 ;MTT法检测转染复合物对心肌细胞活力的影响。结果　寡核苷... 详细信息

目的　探讨血管紧张素Ⅱ 1型受体反义寡核苷酸转染心肌细胞的可行性。方法　应用显微荧光技术观察反义寡核苷酸在原代培养的心肌细胞内的转染效率 ,及其在细胞内的时相性分布 ;MTT法检测转染复合物对心肌细胞活力的影响。结果　寡核苷酸单独转染时 ,30分钟开始进入心肌细胞 ;6 0分钟进入细胞核 ,转染效率达峰值为 30 % ;12 0分钟部分被降解 ;4小时后大部分降解。脂质体的介导能显著提高反义寡核苷酸对心肌细胞的转染效率 ,6 0分钟达峰值为 6 0 % ,并且能改变寡核苷酸在细胞内的分布 ,4小时后仍能使寡核苷酸稳定于细胞核内 ;MTT法证实转染复合物对心肌细胞的活力无显著性影响。结论　反义寡核苷酸能成功的转染心肌细胞 ;脂质体的包裹能提高反义寡核苷酸转染效率、延长其作用时间 ,并改变寡核苷酸在细胞内的分布 ,使其长时间的稳定在细胞核内。本研究浓度的转染复合物对心肌细胞无明显的细胞毒性。

关键词：反义寡核苷酸脂质体 1型血管紧张素ⅱ受体心肌细胞

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