检索结果-内蒙古大学图书馆

中国水产科学 2023年第4期30卷 447-456页

作者：关伟晔周振旗谢昕洋侯鑫王军王成辉上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

本研究通过低氧-复氧处理,分析了中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)的分子育种群体(M选育系)与传统育种群体(JH选育系)的低氧耐受性能差异。结果显示,M选育系与JH选育系在低氧状态下的半致死浓度(LC50)分别为(0.952±0.058)mg/L和(1.0... 详细信息

本研究通过低氧-复氧处理,分析了中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)的分子育种群体(M选育系)与传统育种群体(JH选育系)的低氧耐受性能差异。结果显示,M选育系与JH选育系在低氧状态下的半致死浓度(LC50)分别为(0.952±0.058)mg/L和(1.000±0.053)mg/L。在低氧处理12 h时,两系的血细胞总数(THC)均达最高峰,M选育系(26.58×10^(6)个/mL)高于JH选育系(23.88×10^(6)个/mL),但差异不显著(P>0.05);而在低氧处理24 h时,M选育系的THC显著高于JH选育系(P<0.05)。在低氧处理3 h和24 h时,M选育系的血蓝蛋白含量均高于JH选育系(P>0.05)。在低氧处理3 h时,M选育系与JH选育系的血淋巴中葡萄糖含量分别下降9.55%与14.64%。在低氧处理3 h和12 h时,M选育系的肝胰腺中糖原含量显著高于JH选育系(P<0.05)。在整个低氧期间,M选育系的肝胰腺中可溶性蛋白含量均高于JH选育系,而乳酸含量均低于JH选育系(P>0.05);M选育系的总抗氧化能力(T-AOC)和过氧化氢酶(CAT)活性均高于JH选育系,且M选育系在复氧24 h后的超氧化物歧化酶(SOD)活性也显著高于JH选育系(P<0.05)。在低氧处理3 h和12 h时,M选育系的低氧诱导因子(Es-HIF-1α)与葡萄糖转运蛋白(Es-GLUT4)基因表达均显著上调。研究表明,M选育系具有更强的氧运输能力、更高的糖原和可溶性蛋白储备与抗氧化水平,具备更好的耐低氧性能。

关键词：中华绒螯蟹低氧刺激育种群体糖代谢抗氧化能力

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野生型和人工选育全蓝型七彩神仙鱼群体的遗传多样性分析

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广东农业科学 2024年第4期51卷 65-78页

作者：吉钰陈再忠温彬高建忠上海海洋大学水产与生命学院/农业农村部淡水水产种质资源重点实验室/水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/上海水产养殖工程技术研究中心/水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

【目的】研究七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)的遗传多样性,分析野生型和两种人工选育蓝色群体的亲缘关系和遗传差异,获得与体色形成相关的候选基因组区域及位点,同时为七彩神仙鱼分类系统的制订提供参考。【方法】对9尾野生型(... 详细信息

【目的】研究七彩神仙鱼(Symphysodon aequifasciatus)的遗传多样性,分析野生型和两种人工选育蓝色群体的亲缘关系和遗传差异,获得与体色形成相关的候选基因组区域及位点,同时为七彩神仙鱼分类系统的制订提供参考。【方法】对9尾野生型(WF)、8尾全蓝型(BF)和10尾白化蓝型(ABF)七彩神仙鱼个体进行全基因组重测序,获得单核苷酸多态性(SNP)位点,计算群体遗传多样性指标,分析群体遗传结构,进行群体间的选择消除分析。考虑SNP注释和突变率,结合PCR和Sanger测序,验证候选SNP。【结果】在3个七彩神仙鱼群体中共鉴定出1360293个SNP,PIC、Pi、Ho、He表明,野生型、全蓝型和白化蓝型的遗传多样性递减,选育群体的杂合度很低。系统发育进化树、群体结构分析和多态性位点主成分分析结果均显示,3个群体之间相互独立,且群体内部聚集明显。连锁不平衡衰减分析结果表明,白化蓝型群体承受着巨大的选择压力,其次是全蓝型群体。基于群体分化指数F_(ST)和Pi进行选择消除分析,结果表明,全蓝型群体的第3、12、13、18、20号染色体和白化蓝型群体的第1、16、18、19号染色体的较大区域内存在强烈的选择信号。在全蓝型群体和白化蓝型群体中分别鉴定出13个和9个候选SNP。【结论】3个七彩神仙鱼群体的遗传多样性较低,遗传关系显示出与人工选育进程的一致性。USP43、FGFR2、DENND4、MLL1基因可能与七彩神仙鱼体色形成密切相关。

关键词：七彩神仙鱼群体遗传学遗传多样性单核苷酸多态性(SNP) 选择消除分析

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神仙鱼透明鳃盖转录组解析

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广东农业科学 2024年第4期51卷 54-64页

作者：张纬宇陈再忠温彬高建忠上海海洋大学水产与生命学院/农业农村部淡水水产种质资源重点实验室/水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/上海水产养殖工程技术研究中心/水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

【目的】神仙鱼透明性状具有很高的经济价值和科研价值。探究神仙鱼透明鳃盖(Transparent gill cover,TGC)和不透明鳃盖(Opaque gill cover,OGC)之间的差异表达基因(Differential expression genes,DEG),并挖掘影响神仙鱼透明鳃盖性状... 详细信息

【目的】神仙鱼透明性状具有很高的经济价值和科研价值。探究神仙鱼透明鳃盖(Transparent gill cover,TGC)和不透明鳃盖(Opaque gill cover,OGC)之间的差异表达基因(Differential expression genes,DEG),并挖掘影响神仙鱼透明鳃盖性状的相关信号通路,可为后续筛选调控神仙鱼透明鳃盖性状的关键基因并开展相关机制研究提供理论基础。【方法】选取红顶三色品系神仙鱼的鳃盖组织为研究材料,OGC和TGC各选取6个样本。基于Illumina Novaseq 6000测序平台进行转录组学测序,利用Fastp对原始测序数据进行质控,利用Trinity软件对质控后的数据进行从头组装获得转录本(Transcript)和对应的单基因(Unigene),利用CD-HIT软件和BUSCO软件分别对初始组装序列进行去冗余分析和结果评估。去冗余后的Unigene基于序列同源性进行功能注释。利用RSEM软件计算每个样本中Unigene的表达量。使用DESeq2软件计算OGC和TGC之间的DEG。使用Goatools软件和KOBAS软件对DEG分别进行GO和KEGG通路富集分析。【结果】(1)测序数据质控后每个样本测序碱基平均错误率均低于0.1%,Q20均高于97.78%,Q30均高于93.58%,测序质量可靠。从头组装后获得200 303个Transcript,对应123 178个Unigene。组装后数据去冗余后共获得147 932个Transcript,对应108 070个Unigene,平均长度为991.85 bp,N50为2 430 bp。(2)共有40 180个Unigene在NR、KEGG、eggNOG、GO、Pfam、Swiss-Prot数据库中获得功能注释,占总体的37.98%,其中10 747个基因在6个数据库中同时被注释,占总体的26.75%。(3)TGC相对于OGC共432个DEG,其中TGC相对于OGC显著上调267个基因、下调165个基因。(4)GO富集结果显示,432个DEG主要富集在IMP生物合成过程、IMP代谢过程、“从头”IMP生物合成过程、氨基酸结合、修饰氨基酸结合等5条生物通路中。(5)KEGG富集结果显示,432个DEG主要富集在神经活性配体-受体相互作用、酪氨酸代谢、嘌呤代谢、1个叶酸碳池、苯丙氨酸代谢、核苷酸代谢、泛醌和其他萜类化合物-醌生物合成等7条生物通路中。【结论】利用转录组学测序技术获得与神仙鱼透明鳃盖性状相关的432个基因,这些基因主要参与12条信号通路。研究结果将为神仙鱼透明鳃盖性状相关基因的挖掘和功能研究提供参考。

关键词：神仙鱼转录组学透明性状差异表达基因 GO富集分析 KEGG富集分析

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三角帆蚌开闭壳频率与心率的昼夜变化特征及其对摄食和免疫应激的响应

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大连海洋大学学报 2025年第2期40卷 263-270页

作者：陈扬吕雪峰陆婷婷王志炎傅百成袁屹平白志毅上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 浙江佰瑞拉农业科技有限公司浙江绍兴311800 上海海洋大学上海水产动物良种创制与绿色养殖协同中心上海201306

为探究三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)开闭壳频率作为机体健康指征的科学性,本研究评估了三角帆蚌(体质量为25.50 g±3.32 g)的开闭壳频率和心率的昼夜变化特征,比较了其开闭壳频率和心率对摄食和免疫应激的响应特点,并分析了正常养... 详细信息

为探究三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)开闭壳频率作为机体健康指征的科学性,本研究评估了三角帆蚌(体质量为25.50 g±3.32 g)的开闭壳频率和心率的昼夜变化特征,比较了其开闭壳频率和心率对摄食和免疫应激的响应特点,并分析了正常养殖条件下同群体三角帆蚌开闭壳频率差异和免疫相关酶活性差异。结果表明:三角帆蚌夜间开闭壳频率和心率均高于白天,但无显著性差异(P>0.05);昼夜投饵后1 h的开闭壳频率和心率均显著高于投饵前(P<0.05),且心率振幅增大,表明三角帆蚌开闭壳频率能响应摄食行为;感染嗜水气单胞菌后3 h,三角帆蚌开闭壳频率达到最高值18.75次/h,为感染前频率的1.52倍(P<0.05),感染后15 h已降低至感染前开闭壳频率的31.29%;感染嗜水气单胞菌后5 h,心率显著高于正常水平并达到峰值14.65 bpm,为感染前心率的1.25倍(P<0.05),随后频率缓慢降低,12 h后恢复至正常水平,表明开闭壳频率能对细菌感染做出响应,且开闭壳频率响应较心率更为敏感;试验还发现,正常养殖条件下同群体三角帆蚌存在开闭壳频率差异,可分为高、中、低开闭壳频率组,4种免疫相关酶活性均在肝胰腺中表达量最高,除高开闭壳频率组超氧化物歧化酶(SOD)仅显著高于低频率组外,高开闭壳频率组碱性磷酸酶(AKP)、酸性磷酸酶(ACP)和过氧化氢酶(CAT)活性均显著高于中、低频率组(P<0.05)。研究表明,开闭壳频率较心率对环境变化响应更敏感,高开闭壳频率组的上述免疫相关酶活性较高,本研究对将开壳频率这一计数指标作为三角帆蚌新的健康指征和评价方法进行了有益尝试,对推动贝类健康养殖具有积极意义。

关键词：三角帆蚌开闭壳频率心率免疫相关酶活性健康指标

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安徽地区克氏原螯虾群体的遗传多样性和遗传结构

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水产学报 2023年第9期47卷 92-101页

作者：崔文涛邹宇凡白志毅王志炎李典中上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心芜湖盛典休闲生态园有限公司

为了解安徽地区克氏原螯虾养殖群体的遗传多样性，实验以安徽芜湖（WH）、宣城（XC）、合肥（HF） 3个地区克氏原螯虾人工养殖群体为研究对象，分别以安徽铜陵（TL）、马鞍山（MAS） 2个野生群体和监利（JL）、建湖（JH）、滆湖（GH）... 详细信息

为了解安徽地区克氏原螯虾养殖群体的遗传多样性，实验以安徽芜湖（WH）、宣城（XC）、合肥（HF） 3个地区克氏原螯虾人工养殖群体为研究对象，分别以安徽铜陵（TL）、马鞍山（MAS） 2个野生群体和监利（JL）、建湖（JH）、滆湖（GH）、兴化（XH） 4个人工养殖群体作为对照，选用10对克氏原螯虾微卫星引物对其进行微卫星遗传多样性和遗传结构研究。结果显示，安徽地区人工养殖克氏原螯虾群体的平均遗传多样性均高于2个野生群体和江苏、湖北4个地区的人工养殖群体，其中XC群体的遗传多样性最高。9个群体全部10个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且绝大多数位点显示杂合不足。AMOVA分析表明遗传变异是由群体内部决定的；大多数组的Fst表现出中度分化(0.05st <0.15)。基因流表明不同群体之间存在着广泛的基因交换，尤其是GH和JH群体之间。基于群体间Nei氏遗传距离及UPGMA聚类树结果显示，WU、GH、MAS和JH群体聚为一组，XC和HF群体同属于一组，而JL、TL和XH群体分别自成一组。STRUCTUR结果显示，XC和HF群体的大多数个体被分配到相同的遗传群中，说明上述群体起源相同。研究表明，安徽地区克氏原螯虾人工养殖群体具有较高的遗传多样性。实验结果可为安徽地区克氏原螯虾种质资源的保护和改良提供参考资料。

关键词：克氏原螯虾遗传多样性遗传结构微卫星

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黄颡鱼维氏气单胞菌的盐酸多西环素控制技术

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水产科学 2024年第1期43卷 61-70页

作者：宣杰翟玉菲沈飞吕利群上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

为探明盐酸多西环素治疗黄颡鱼维氏气单胞菌感染的防耐药给药方案,体外测定盐酸多西环素对维氏气单胞菌的最小抑菌质量浓度、最小杀菌质量浓度、防耐药突变质量浓度、耐药选择窗以及抗菌后效应等药效学参数,并根据国标渔药盐酸多西环素... 详细信息

为探明盐酸多西环素治疗黄颡鱼维氏气单胞菌感染的防耐药给药方案,体外测定盐酸多西环素对维氏气单胞菌的最小抑菌质量浓度、最小杀菌质量浓度、防耐药突变质量浓度、耐药选择窗以及抗菌后效应等药效学参数,并根据国标渔药盐酸多西环素的使用方案,在水温(20±2)℃下,体质量(200±50)g的黄颡鱼口灌20 mg/kg的盐酸多西环素,给药后0.5、1、2、4、8、12、24、48、78 h取血、肌肉、脑组织、肝胰脏、肾脏样品,利用高效液相色谱法测定和分析盐酸多西环素在黄颡鱼体内5个组织的药代动力学参数。试验结果显示,盐酸多西环素对维氏气单胞菌的最小抑菌质量浓度为0.5μg/mL,最小杀菌质量浓度为1.0μg/mL,防耐药突变质量浓度为4.0μg/mL,耐药选择窗为0.5~4.0μg/mL,抗菌后效应分别为(0.95±0.24)、(0.79±0.58)、(1.92±0.71)h。黄颡鱼口灌20 mg/kg的盐酸多西环素后,血清、肝胰脏、肾脏、肌肉、脑中的曲线下面积(0~78 h)与最小抑菌质量浓度的比值(AUC0~78h/MIC)分别为75.5580、686.5486、557.2362、736.9682、234.9658,最大药物质量浓度与最小抑菌质量浓度的比值(ρmax/MIC)为2.4908、18.6652、15.3044、24.1590、10.9018。根据浓度依赖型药物曲线下面积(0~t)与最小抑菌质量浓度的比值(AUC0~t/MIC)>125、最大药物质量浓度与最小抑菌质量浓度的比值(ρmax/MIC)>8的有效标准,确定盐酸多西环素用药方案为20 mg/kg,每日1次。依据肌肉中的药物残留动力学数据,确定休药期至少11.2 d。综合药代动力学参数和药效学参数,试验结果可为利用国标渔药盐酸多西环素有效治疗黄颡鱼维氏气单胞菌感染提供理论依据。

关键词：盐酸多西环素黄颡鱼维氏气单胞菌药代动力学药效学

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发酵豆粕部分替代鱼粉后添加晶体赖氨酸对凡纳滨对虾肝胰腺代谢的转录调控

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水产学报 2023年第10期47卷 136-147页

作者：郭旭陈晨戴习林王文雁高斐斐华雪铭上海海洋大学农业农村部鱼类营养与环境生态研究中心上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海市奉贤区水产技术推广站

为研究发酵豆粕部分替代鱼粉后，饲料中赖氨酸(Lys)含量变化在凡纳滨对虾机体内的响应调控机制，在基础饲料中分别添加0%、0.25%、0.50%、0.75%和1.00%的晶体赖氨酸配制5种等氮等脂的实验饲料，记为Lys0、Lys25、Lys50、Lys75和Lys100... 详细信息

为研究发酵豆粕部分替代鱼粉后，饲料中赖氨酸(Lys)含量变化在凡纳滨对虾机体内的响应调控机制，在基础饲料中分别添加0%、0.25%、0.50%、0.75%和1.00%的晶体赖氨酸配制5种等氮等脂的实验饲料，记为Lys0、Lys25、Lys50、Lys75和Lys100。选择初始体重为(2.0±0.1) g的凡纳滨对虾在室内水泥池中进行56 d的养殖实验。饲养结束后对生长性能、肌肉粗蛋白和脂肪含量、肝胰腺健康程度差异显著的Lys0组和Lys75组对虾肝胰腺进行了代谢组学和转录组学分析。结果显示，以Lys0作对照，Lys75组共检测出28个差异代谢物，其中有2个代谢物下调，26个代谢物上调；对注释到KEGG数据库中7种差异代谢物进行信号通路分析，筛选出4条比较重要的代谢通路，分别为甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢，花生四烯酸代谢，鞘脂类代谢和甘油磷脂代谢。Lys75组对虾肝胰腺中胆碱显著下调，γ-丁甜菜碱双加氧酶表达显著上调，己糖激酶基因和乙酰胆碱酯酶基因表达显著下调。研究表明，饲料赖氨酸水平的提高有助于对虾肝胰腺中脂肪酸的β氧化供能，起到节约蛋白质的作用，也能保护对虾肝胰腺健康，促进对虾生长。

关键词：凡纳滨对虾发酵豆粕晶体赖氨酸转录代谢

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嗜水气单胞菌RPA-LFD快速检测方法的建立

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水生生物学报 2024年第5期48卷 849-858页

作者：王姝然徐嘉楠范厚勇郑跃平周天琦张也许丹上海海洋大学上海201306 上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海市水生野生动植物保护研究中心上海200092

文章旨在建立一种针对嗜水气单胞菌的敏感性高、特异性强的快速临床诊断方法。研究根据嗜水气单胞菌促旋酶B亚单位(gyrase subunit B,gyrB)基因的保守序列,设计特异性重组酶聚合酶扩增技术(RPA)扩增引物,通过结合琼脂糖凝胶电泳(AGE)和... 详细信息

文章旨在建立一种针对嗜水气单胞菌的敏感性高、特异性强的快速临床诊断方法。研究根据嗜水气单胞菌促旋酶B亚单位(gyrase subunit B,gyrB)基因的保守序列,设计特异性重组酶聚合酶扩增技术(RPA)扩增引物,通过结合琼脂糖凝胶电泳(AGE)和侧流层析试纸条(LFD)的方法进行反应条件的优化、特异性及灵敏度检测。实验结果表明,所建立的嗜水气单胞菌RPA-LFD快速检测方法可在38℃最适温度下30min内无干扰地检测到嗜水气单胞菌,对嗜水气单胞菌纯培养物和基因组DNA的最小检出限为10^(3)cfu/mL和100 pg/μL。利用建立的RPA-LFD与普通PCR同时检测杂交鲟鱼处理临床样品的结果表明,两种方法的结果一致。综上所述,通过对RPA反应条件的探索和优化,成功建立了嗜水气单胞菌快速检测方法。该方法操作简便,反应迅速,与普通PCR相比,不需要昂贵的仪器,为未来嗜水气单胞菌细菌性疾病的早期诊断提供了更有效的技术支持。

关键词：快速检测重组酶聚合酶扩增技术侧向流动试纸条嗜水气单胞菌

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弗氏柠檬酸杆菌RPA-LFD快速检测方法的建立及应用

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大连海洋大学学报 2024年第2期39卷 241-249页

作者：王姝然范厚勇徐嘉楠周天琦许丹郑跃平上海海洋大学水产与生命学院上海201306 上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海市水生野生动植物保护研究中心上海200092

为建立一种针对弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)敏感性高、特异性强的临床快速检测方法,根据该菌定居因子基因cfa的保守序列,设计特异性引物,采用重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA),并结合琼脂糖... 详细信息

为建立一种针对弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)敏感性高、特异性强的临床快速检测方法,根据该菌定居因子基因cfa的保守序列,设计特异性引物,采用重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA),并结合琼脂糖凝胶电泳(AGE)和侧流层析试纸条(LFD)方法进行反应条件的优化及特异性与灵敏度的检测。结果表明:本研究中所建立的弗氏柠檬酸杆菌重组酶聚合酶扩增结合侧向流动试纸条(RPA-LFD)快速检测方法,在38℃条件下扩增20 min后,能特异性地检测到弗氏柠檬酸杆菌,对弗氏柠檬酸杆菌纯培养物和基因组DNA的最小检出限分别为1.5×102 CFU/mL和200 fg/μL,是常规PCR(cfa引物)检测灵敏度(20 pg/μL)的100倍;利用所建立的RPA-LFD法与常规PCR同时检测杂交鲟攻毒试验样本,两种方法的检测结果一致。研究表明,本研究中建立的弗氏柠檬酸杆菌RPA-LFD方法,操作简便、反应迅速、特异性好、灵敏度高,并且不需要昂贵的仪器,该方法可为未来弗氏柠檬酸杆菌细菌性疾病的早期诊断提供更有效的技术支持。

关键词：弗氏柠檬酸杆菌快速检测重组酶聚合酶扩增技术侧向流动试纸条

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低氧胁迫对鱼类影响的研究进展

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水产科学 2024年第2期43卷 333-340页

作者：余欣欣郑国栋陈杰邹曙明上海海洋大学农业农村部团头鲂遗传育种中心上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

溶解氧作为水环境中重要的环境因子,是鱼类健康生存的基础。适宜的溶解氧水平能够促进鱼类的生长,对鱼类的繁殖、捕食和运动等产生积极的影响[1]。低氧胁迫不仅严重制约了鱼类的生长发育,而且会引起鱼类产生应激反应,导致代谢紊乱,严重... 详细信息

溶解氧作为水环境中重要的环境因子,是鱼类健康生存的基础。适宜的溶解氧水平能够促进鱼类的生长,对鱼类的繁殖、捕食和运动等产生积极的影响[1]。低氧胁迫不仅严重制约了鱼类的生长发育,而且会引起鱼类产生应激反应,导致代谢紊乱,严重时导致鱼体死亡[2]。而经长期演化,鱼类已进化出一系列机制来应对低氧。低氧环境中,鱼类可以通过各种生理反应来抵抗溶解氧的不足,如降低机体能量的消耗、增强氧吸收的能力等,从而应对低氧胁迫[3]。

关键词：低氧胁迫鱼类信号通路调控机制

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