检索结果-内蒙古大学图书馆

解放军医学杂志 2025年

作者：张泰民张曦喆张多森马亚东李甜新疆医科大学第二临床医学院新疆医科大学第五临床医学院新疆医科大学基础医学院组织胚胎学教研室

糖尿病肾病(DKD)是并发于糖尿病的一种微血管疾病，发病机制复杂。近年来的研究发现，自噬与铁死亡作为两种程序性细胞死亡方式，在DKD中呈现动态交互作用：自噬通过清除受损细胞器维持稳态，而铁死亡是由铁依赖性脂质过氧化驱动，二者... 详细信息

糖尿病肾病(DKD)是并发于糖尿病的一种微血管疾病，发病机制复杂。近年来的研究发现，自噬与铁死亡作为两种程序性细胞死亡方式，在DKD中呈现动态交互作用：自噬通过清除受损细胞器维持稳态，而铁死亡是由铁依赖性脂质过氧化驱动，二者失衡可加剧肾脏损伤。本文系统综述自噬与铁死亡相关的信号通路和关键调控因子及其交互机制(如NCOA4介导的铁蛋白自噬、时钟自噬、脂肪自噬等)，并阐述二者协同调控DKD进展的分子网络；进一步阐述现代药物及中药活性成分通过靶向自噬和铁死亡改善肾损伤的潜力，提出靶向二者的交互通路可为DKD的治疗提供新策略。本文阐述了自噬和铁死亡在DKD进程中的分子机制，旨在为靶向干预策略的提出及精准化治疗方案的制定奠定理论基础。

关键词：糖尿病肾病自噬铁死亡

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NUF2对泛癌的预后和免疫治疗效果的预测价值

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南方医科大学学报 2025年第1期45卷 137-149页

作者：王耀彬陈柳燕罗伊凌申继清周素芳广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室//广西高校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021

目的探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用。方法综合利用人类蛋白质图谱(HPA)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达计划(GTEx)、癌细胞系百科全书(CCLE)、TIMER的数据集,采用生物信息学方法挖掘NUF2的潜在致癌... 详细信息

目的探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用。方法综合利用人类蛋白质图谱(HPA)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达计划(GTEx)、癌细胞系百科全书(CCLE)、TIMER的数据集,采用生物信息学方法挖掘NUF2的潜在致癌作用,包括剖析NUF2在各种类型肿瘤组织中的表达水平、预后价值及免疫价值;采用RT-qPCR、Western blotting、免疫组化(IHC)等实验检测NUF2在肝癌细胞系和肝癌患者癌组织及血液中的表达情况。利用基因本体论(GO)、基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)探索NUF2及相关基因的分子机制并在肝癌中构建了NUF2的竞争性内源RNA(ceRNA)网络。结果与正常组织相比,NUF2表达在27种肿瘤中上调并与多种类型肿瘤的临床分期相关(P<0.05)。在部分肿瘤中,NUF2的表达上调与肿瘤患者的不良预后(总体生存期、疾病特异性生存期、无病生存期和无进展生存期)相关(P<0.05)。NUF2表达水平与多种肿瘤的肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、浸润免疫细胞(B细胞、髓样树突状细胞、中性粒细胞、CD4+T细胞)、免疫细胞maker基因(CCR7、CD163、CD19、CD4、CD79A、CD8A、CD8B、IRF5、ITGAX和MS4A4A)以及免疫检查点基因(CTLA4、HAVCR2、LAG3、PDCD1和PDCD1LG2)呈正相关(P<0.05)。RT-qPCR等实验结果显示NUF2在肝癌细胞系、肝癌患者癌组织和血液中表达上调(P<0.05),其中肝癌患者经手术治疗之后,使得血液中NUF2表达下调(P<0.05)。GO和KEGG富集分析表明,NUF2相关基因与染色体分离、微管运动以及细胞周期相关(P<0.05)。GSEA分析提示,在肝癌中NUF2高表达与甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢以及调控神经活性配体受体相互作用有关(P<0.05)。结论NUF2在27种肿瘤中表达上调并与部分肿瘤的临床分期、不良预后有关。此外NUF2的表达与多种肿瘤的免疫细胞浸润密切相关,可能作为这些癌症免疫治疗效果的潜在预测因子。

关键词： NUF2 泛癌分析免疫浸润预后

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人正常宫颈上皮细胞感染沙眼衣原体的基因表达谱分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2023年第2期43卷 93-101页

作者：贾如斯辰力李明洋杨佳吴芯蕾朱珊丽温州医科大学第一临床医学院(信息与工程学院) 温州325035 武汉大学医学部基础医学院武汉430062 温州医科大学基础医学院微生物学和免疫学教研室温州325035 温州医科大学第二临床医学院温州325035

目的分析人正常宫颈上皮细胞(HcerEpic)感染沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,Ct)前后基因表达谱差异。方法HcerEpic细胞经DEAE-D预处理后加入E型Ct标准株,培养44 h后收集HcerEpic细胞(感染组),并以未感染Ct的HcerEpic细胞作为对照组,... 详细信息

目的分析人正常宫颈上皮细胞(HcerEpic)感染沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,Ct)前后基因表达谱差异。方法HcerEpic细胞经DEAE-D预处理后加入E型Ct标准株,培养44 h后收集HcerEpic细胞(感染组),并以未感染Ct的HcerEpic细胞作为对照组,提取两组总RNA后反转录并构建cDNA文库。通过高通量测序分析两组基因表达谱差异,并选择代表性基因通过实时荧光定量PCR(qPCR)验证。结果共检测23997个基因,差异基因125个,其中上调基因119个,下调基因6个;GO分析显示差异基因富集于对病毒防御反应、Ⅰ型干扰素(interferon,IFN)信号通路、对Ⅰ型IFN的细胞反应等条目;KEGG富集通路为甲型流感、单纯疱疹病毒感染、EB病毒感染、HPV感染、NOD样受体通路等相关通路。结论人正常宫颈上皮细胞感染Ct前后转录组存在差异,差异基因主要富集于IFN通路,与细胞抗病毒过程密切相关。qPCR验证了ISG15、IFIT2、OASL、UBE2L6等差异显著且与IFN通路密切相关的基因。

关键词：沙眼衣原体宫颈上皮细胞转录组差异表达基因

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环状RNA circNEIL3高表达促进乳腺癌细胞增殖

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海军军医大学学报 2024年第6期45卷 725-731页

作者：陈航李墨林陈义重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室重庆400016 四川省达州市万源市中心医院外二科达州636350 重庆医科大学生命科学研究院骨发育与再生实验室重庆400016

目的探究环状RNA circNEIL3在乳腺癌中的表达、生物学功能及其对细胞周期相关蛋白表达的影响。方法收集50例经病理证实的乳腺癌患者的临床病理资料及乳腺癌组织和癌旁正常组织样本。采用环状RNA测序分析3对乳腺癌组织与癌旁正常组织的... 详细信息

目的探究环状RNA circNEIL3在乳腺癌中的表达、生物学功能及其对细胞周期相关蛋白表达的影响。方法收集50例经病理证实的乳腺癌患者的临床病理资料及乳腺癌组织和癌旁正常组织样本。采用环状RNA测序分析3对乳腺癌组织与癌旁正常组织的差异表达环状RNA,利用RNA酶消化实验和核质分离实验验证差异表达环状RNA circNEIL3的特征。采用qPCR检测circNEIL3在乳腺癌组织和细胞中的表达,分析circNEIL3表达与患者临床病理资料的关系。采用CCK-8实验和集落形成实验检测circNEIL3对BT-549和MCF-7细胞增殖的影响,运用流式细胞术检测细胞凋亡及细胞周期变化,采用蛋白质印迹法检测细胞周期蛋白D1(CCND1)、细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)4、细胞周期蛋白E1(CCNE1)和CDK2蛋白的表达水平。结果乳腺癌组织与癌旁正常组织中差异表达的circNEIL3不易被RNA酶R降解,其主要分布于乳腺癌细胞的细胞质中。与癌旁正常乳腺组织及细胞相比,乳腺癌组织和细胞中circNEIL3的表达水平均增高(均P<0.05)。肿瘤最大径>2 cm和高TNM分期(Ⅲ期)的乳腺癌患者多表现为circNEIL3高表达(均P<0.05)。circNEIL3过表达可增强乳腺癌细胞增殖活性,并上调CCND1、CDK4、CCNE1和CDK2的蛋白表达水平(均P<0.05)。敲低circNEIL3可诱导乳腺癌细胞凋亡(P<0.01),导致细胞周期阻滞于G1期(P<0.01)。结论乳腺癌组织和细胞中高表达的circNEIL3可通过调控细胞周期相关蛋白的表达促进乳腺癌细胞增殖。

关键词：乳腺肿瘤 circNEIL3 细胞增殖细胞凋亡细胞周期

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环氧化物水解酶2在肝细胞癌中的表达水平与功能作用

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中国生物化学与分子生物学报 2022年第4期38卷 505-514页

作者：张文桃胡艳芬吴昊刘铭李莉杜根来朱剑军山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001

本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及... 详细信息

本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及其相关基因在肝细胞癌中的表达水平;运行R包绘制Kaplan-Meier生存曲线和功能富集分析;基于STRING和GSEA构建蛋白质互作网络和基因集富集分析;荧光定量PCR和GEO数据集验证EPHX2在肝细胞癌中的表达水平。本研究共筛选得到15个在肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因。EPHX2在肝细胞癌组织中的表达水平显著降低(P<0.01)。EPHX2表达水平与肝癌患者性别、分期和级别有关,而与年龄、T分期等因素无关。与EPHX2低表达组肝癌患者相比,EPHX2高表达组肝癌患者预后较好。功能富集结果显示,EPHX2与补体途径、脂肪酸降解等信号通路有关。蛋白质互作网络结果显示,EPHX2与HAO1、AGXT、ACOX1、GSTκ1、SCP-2、CAT、CYP2C8,CYP2C9,CYP2B6,和CYP2J2等密切相关。GSEA结果显示,EPHX2低表达组与肝癌细胞增殖、肝癌复发等基因集正相关。荧光定量PCR和GEO数据集验证结果显示,EPHX2在肝细胞癌组织和肝癌细胞株中呈显著低表达。EPHX2在肝细胞癌中呈显著低表达,提示其可能在肝细胞癌发生发展过程中发挥抑癌基因作用,但具体作用机制还需进一步验证。

关键词：肝细胞癌环氧化物水解酶2 公共数据库

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基于模式生物秀丽隐杆线虫的环境污染物多世代毒性效应和机制研究进展

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生态毒理学报 2025年

作者：王新怡夏启明刘梦可詹洪迪陈中豪马瑞王牧笛安徽医科大学基础医学院组织胚胎学教研室安徽医科大学第二临床医学院

随着经济的高速发展，当今世界面临的环境问题日益严峻，我们对于环境污染的研究以及环境污染对生态和人类产生问题的研究也日益重要。在环境毒理学研究中，有一种使用率非常高的模式生物——秀丽隐杆线虫(简称秀丽线虫，Caenorhabditis... 详细信息

随着经济的高速发展，当今世界面临的环境问题日益严峻，我们对于环境污染的研究以及环境污染对生态和人类产生问题的研究也日益重要。在环境毒理学研究中，有一种使用率非常高的模式生物——秀丽隐杆线虫(简称秀丽线虫，Caenorhabditis elegans)，具有获得渠道便利、生长维持简单、生存周期短、易于观察、与人类基因组高度相似等优点。在环境毒理学实验中，可以利用不同缺陷型品系的秀丽线虫进行环境污染物的多世代毒性效应研究，其中进行毒理表型分析有寿命、发育、产卵、运动行为等实验终点。除此之外，可利用高敏感多组学对暴露于污染物的线虫进行基因分析，达到全面解读环境污染物对生物机体产生的毒性效应以及作用机制。本文重点叙述了亲本单代暴露、连续多代暴露、隔代暴露、间接暴露于重金属、纳米材料、有机物等环境中持久存在的污染物对秀丽线虫产生的毒性影响，归纳了每种环境污染物及4种暴露方式对线虫亲代和子代造成毒效应的机制，如DNA损伤、氧化应激、生殖毒性、代谢损伤以及神经损伤等。在此需要说明的是，每种污染物产生的毒效应在一定程度上与自身理化性质有关。最后，论文提出此后秀丽线虫在环境毒理学中的研究关键以及重点，其中包括：环境污染物诱导秀丽线虫毒效应的分子机制，如毒性物质的作用靶点、信号通路、基因表达调控等；秀丽线虫在不同生长发育阶段暴露于污染物对发育、寿命等的影响；综合考虑实验条件，如暴露介质不同、暴露环境温度和湿度不同以及样品制备和统计分析方法不同造成的误差等。综合现实意义来看，未来的研究应利用秀丽线虫作为模式生物继续深入探索环境污染物毒性效应的分子机制，结合实际条件应用先进的数据采集技术、标准化实验方法为环境保护和毒性物质评估提供更为可靠的科学依据。

关键词：环境污染物秀丽隐杆线虫多世代毒性模式生物

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法医学DNA遗传标记和DNA甲基化分子标记的集成检验技术

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生物化学与生物物理进展 2024年第9期51卷 2156-2167页

作者：易娜赵光斌康克莱姚伊人郭柯利赵杰张驰缪磊王乐季安全昆明医科大学法医学院昆明650500 公安部鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室北京100038

DNA遗传标记在法医学领域的个体识别、亲缘关系鉴定、始祖推断和表型特征刻画等方面具有重要作用。DNA甲基化分子标记在法医学领域的生物学年龄推断、组织体液鉴定和表型预测等方面具有独特优势。目前的研究多是在不同的检验流程中对DN... 详细信息

DNA遗传标记在法医学领域的个体识别、亲缘关系鉴定、始祖推断和表型特征刻画等方面具有重要作用。DNA甲基化分子标记在法医学领域的生物学年龄推断、组织体液鉴定和表型预测等方面具有独特优势。目前的研究多是在不同的检验流程中对DNA甲基化分子标记和DNA遗传标记独立地进行检验,通过不同的分析流程分别解读这两种标记所蕴含的生物信息。用一份生物检材通过一次检测同时得到DNA遗传信息和表观遗传信息的集成检验方法,能够在获得丰富遗传数据的基础上有效关联这两种标记的生物学信息,节省检验时间,降低检验成本和简化实验流程。本文分别介绍了基于毛细管电泳平台、焦磷酸测序平台和二代测序平台进行DNA遗传标记和DNA甲基化分子标记集成检验的多种方案,分析了各方案在不同平台的技术特点,归纳了各方案的集成化程度和实际应用能力,重点分析了在其他领域中基于二代测序技术进行集成检验的技术路线,以期挖掘其在法医学生物检材中的应用潜力,探讨了位点间相互作用和甲基化预处理方法对DNA遗传标记和DNA甲基化分子标记集成检验的影响,提出了在法医学生物检材中应用集成检验技术所面临的挑战,期望为法医学研究实践提供参考。

关键词：法医遗传学 DNA 甲基化集成检验方法二代测序

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ULK3基因在前列腺癌中的生物信息学分析及其在DU145中的表达

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基因组学与应用生物学 2025年第1期44卷 80-91页

作者：邹雨轩张云博孙梦李梦佳韩洋洋新疆医科大学基础医学院生物学教研室乌鲁木齐830017 新疆地方病分子生物学重点实验室乌鲁木齐830017

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer,PCa)中的潜在作用,并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况;利用STR... 详细信息

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer,PCa)中的潜在作用,并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况;利用STRING数据库分析与ULK3相关的互作蛋白质,并对ULK3差异表达基因进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA);通过GO、KEGG分析,探讨ULK3的潜在作用机制;通过miRNet平台预测调控ULK3的微RNA(miRNA),并构建PCa中潜在的ULK3-miRNA-mRNA调控网络;利用TIMER 2.0数据库分析ULK3在PCa中与免疫浸润的关系。基于上述生物信息学分析,对PCa细胞DU145进行ULK3敲降处理,并通过实时定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)和Western blot检测ULK3下调效率;通过划痕实验和MTT法检测ULK3稳定下调对前列腺癌细胞增殖的影响。结果显示,ULK3在PCa癌组织中比在正常前列腺组织中高表达;通过富集分析发现ULK3的表达与多种生物学功能有关,其中主要作用的通路有范可尼贫血途径和Notch信号通路;通过免疫浸润分析发现ULK3高表达时多种免疫细胞的浸润水平显著下降。此外,成功构建敲降ULK3的前列腺癌细胞系DU145,通过划痕实验和MTT法发现敲降ULK3后对DU145细胞的迁移和增殖起到抑制作用。以上结果表明ULK3在前列腺癌中发挥重要生物学作用,敲降ULK3可能对PCa存在抑制作用,这为后续PCa的基础研究与临床治疗提供了新的思路。

关键词： ULK3 前列腺癌(PCa) 生物信息学慢病毒增殖

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采用流式细胞分选术区分中枢神经系统内小胶质细胞和浸润巨噬细胞

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海军军医大学学报 2024年第4期45卷 448-453页

作者：周锦涛俞仲望曹莉海军军医大学(第二军医大学)基础医学院神经生物学教研室上海200433

目的建立通过流式细胞分选术区分中枢神经系统内小胶质细胞和浸润巨噬细胞的方法。方法用成年C57BL/6小鼠建立双侧颈总动脉狭窄模型,分别采用集落刺激因子1受体抑制剂PLX5622或氯膦酸盐脂质体处理。将分离、匀浆、重悬后的小鼠脑和脊髓... 详细信息

目的建立通过流式细胞分选术区分中枢神经系统内小胶质细胞和浸润巨噬细胞的方法。方法用成年C57BL/6小鼠建立双侧颈总动脉狭窄模型,分别采用集落刺激因子1受体抑制剂PLX5622或氯膦酸盐脂质体处理。将分离、匀浆、重悬后的小鼠脑和脊髓组织进行Percoll密度梯度离心,得到单核细胞悬液。采用CD45、CD11b和淋巴细胞抗原6家族成员C(Ly6C)抗体进行流式分选,获得小胶质细胞(CD11b^(+)CD45^(low)Ly6C^(-)细胞)和浸润巨噬细胞(CD11b^(+)CD45^(high)Ly6C^(+)细胞),并验证PLX5622和氯膦酸盐脂质体2种给药范式获得的处理效果。结果通过CD45、CD11b和Ly6C抗体可以有效区分中枢神经系统中小胶质细胞和浸润巨噬细胞。与对照组比较,PLX5622处理后小胶质细胞数量减少(P=0.001),而氯膦酸盐脂质体处理后浸润巨噬细胞数量减少(P<0.001)。结论所建立的流式细胞分选方法可有效区分中枢神经系统中小胶质细胞和浸润巨噬细胞,PLX5622和氯膦酸盐脂质体2种给药范式可分别选择性清除中枢神经系统内的小胶质细胞和浸润巨噬细胞。

关键词：小胶质细胞浸润巨噬细胞流式细胞分选术双侧颈总动脉狭窄 PLX5622 氯膦酸盐脂质体

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香猪MAP3K4基因结构变异多态性和基因表达研究

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畜牧兽医学报 2023年第12期54卷 5046-5055页

作者：徐婷婷齐芬芳黄世会牛熙李升冉雪琴王嘉福谢健贵州大学动物科学学院贵阳550025 贵州大学农业生物工程研究院贵阳550025 遵义医科大学医学遗传学教研室遵义563000

基于前期比较基因组学分析,在香猪的丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶4(mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4,MAP 3K4)基因第15内含子中发现一个189 bp的结构变异(MAP3K4-I15-sv189)。为探究该结构变异(structural variation,SV)在香猪群体中的多态性分布及其对基因表达的影响,本研究设计一对特异性引物,建立MAP 3K4基因SV的PCR检测技术,分析香猪群体中该结构变异的基因类型;采用RT-qPCR研究结构变异不同基因型之间基因的差异表达。结果显示,香猪群体中MAP3K4-I15-sv189位点存在两种基因型,DD型和ID型(D为缺失基因,I与参考基因一致),其中D等位基因的频率为97.35%;大白猪群体中检测到3种基因型,DD型、ID型和II型,D等位基因频率为80%。相比之下,香猪的D等位基因频率显著高于大白猪的相应值(P<0.05)。采用生物信息学方法分析结构变异区域得到多种剪接元件和重复元件,可能影响MAP 3K4基因的表达。比较香猪各组织中MAP 3K4基因的表达量,发现该基因在肺组织的表达量最高。进一步检测肺组织中3种结构变异类型的相对表达量,显示:DD型>ID型>II型,表明SV的缺失可能促进MAP 3K4基因的表达。本研究表明,香猪MAP 3K4的结构变异MAP3K4-I15-sv189以缺失型为主,缺失型可促进肺组织MAP 3K4基因的表达。研究结果有助于解析香猪易感肺部疾病的分子机制。

关键词：香猪结构变异 MAP 3K4基因多态性肺

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