人类基因组中单倍型（haplotype）和单倍域（haplotype block）的结构提供了人类进化的宝贵信息,并成为发现人类复杂疾病易感基因的有效策略。一个单倍域可分割成多个具有有限单倍型多样性的离散的区域,代表每个区域结构特征的少量标签单核苷酸多态性（tag single nucleotide polymorphism,tSNP）可使绝大部分单倍型相互区分开来。因此,标签SNP在单倍型和单倍域的构建和关联研究中具有重要地位。构建单倍型和单倍域的方法分为两类,分别是基于大家系中基因分型数据和基于统计学的算法。通过系统回顾几种单倍型和单倍域的构建方法,了解它们在不同的疾病模型或根据不同的分割标准,进行关联研究的检验效能,客观评价每种方法的优、缺点、应用前景及其在关联研究中的应用。随着国际人类基因组单倍型图的完成和单倍型构建统计学运算规则的完善,融合数学、物理学、计算机科学等学科的单倍型构建方法将对人类遗传学、复杂疾病易感基因的定位和克隆鉴定等生命科学的相关领域产生深远的影响。
探讨载脂蛋白B（apolipoprotein B，apoB）基因单体型与维吾尔族自然长寿之间的关系．选择新疆和田地区191名年龄90岁以上的健康维吾尔族个体为研究对象，另选53名年龄65—70岁、民族、性别、地域相匹配的正常个体为对照．采用PCR—SSP（sequence specific primer），PCR—RFLP（restriction fragment length polymorphism）和PCR-直接测序（PCR—sequencing）等技术对apoB基因第1外显子5＇端信号肽插入／缺失（insertion／deletion，PD）、第26外显子Xba Ⅰ限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphisms，Xba Ⅰ—RFLP）和第29外显子3＇端可变数目重复序列（vaffable number of tandemly repeat，VNTR）进行分型．经Logistic回归分析显示，长寿组apoB基因X^＋X^＋基因型频率显著高于对照组；M，L的等位基因频率和其组成的基因型频率显著增高；在单体型分析中，长寿组中由X^＋和M等位基因组成的单体型频率显著增高，而由X^-和S等位基因组成的单体型频率显著降低（均P〈0．05）．研究认为：等位基因M，L，基因型X^＋X^＋，MM，ML，LL和单体型I—X^＋-M，X^＋-M与自然长寿显著正相关，可能为长寿的保护因素，而等位基因S，基因型SS和单体型X^＋-S，D—S和D—X^＋-S则可能是影响长寿的不利因素．
目的探讨HLA-B基因多态性与类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的关联性。方法采用DNA测序和序列特异性引物聚合酶链式反应(polymerase chain reaction-sequence specific primer, PCR-SSP)方法检测云南汉族中271例类风湿性关节...
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目的探讨HLA-B基因多态性与类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的关联性。方法采用DNA测序和序列特异性引物聚合酶链式反应(polymerase chain reaction-sequence specific primer, PCR-SSP)方法检测云南汉族中271例类风湿性关节炎患者和264例正常人群的HLA-B基因多态性并进行关联性分析。结果女性类风湿性关节炎患者的HLA-B*40基因频率(8.84%)明显低于女性对照组(18.33%)(P=0.000), HLA-B*51基因频率(9.53%)明显高于对照组(2.83%)(P=0.000), HLA-B*48基因频率(0.23%)明显低于对照组(2.33%)(P=0.007), 差异均有统计学意义。HLA-B*40、HLA-B*51、HLA-B*48的基因频率在男性类风湿性关节炎患者和男性对照中的分布无统计学差异(P值分别为0.535、0.691、0.289)。结论云南汉族人群中HLA-B基因分布存在多态性。HLA-B基因多态性与云南汉族人群女性类风湿性关节炎的发病相关, HLA-B*51可能是易感基因, HLA-B*40、HLA-B*48可能是保护性等位基因。
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