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基础医学与临床 2021年第5期41卷 729-734页

作者：肖晓莲刘晓燕朱文凤杨晔宏杨俊涛孙伟中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院药理系北京100005 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的比较全扫描采集(FSA)模式和数据依赖采集(DDA)模式用于非靶向代谢组分析的优缺点。方法用代谢物标准品混合物和健康人尿液样品分别进行两种模式的质谱采集,比较两种模式的定性和定量效果。结果在标准品代谢物分析时,FSA模式下的标... 详细信息

目的比较全扫描采集(FSA)模式和数据依赖采集(DDA)模式用于非靶向代谢组分析的优缺点。方法用代谢物标准品混合物和健康人尿液样品分别进行两种模式的质谱采集,比较两种模式的定性和定量效果。结果在标准品代谢物分析时,FSA模式下的标准品代谢物丰度比DDA模式平均高2.36倍(P<0.05),FSA、DDA组的丰度变异系数(CV)范围分别为0.81%~6.35%和2.14%~11.20%。在进行尿液样品分析时,FSA模式的谱图数和代谢特征数量与DDA模式差异无统计学意义。不同进样量(1、2和4μL)时,FSA模式鉴定的代谢物数量比DDA模式多(分别高于9.5%、1.9%和10%),FSA模式代谢物定量CV中位数(分别为7.1%、3.0%和2.6%)明显低于DDA模式者(分别为10.3%、7.0%和6.5%)。进样量1、2和4μL时,随着代谢物丰度的升高,DDA的CV均数较FSA组分别高1.3~1.7、1.7~1.8和1.4~1.9倍(P<0.05);而且,随着峰宽增加,DDA组的CV均数较FSA组分别高1.5~1.8、1.7~2.1和2.0~2.2倍(P<0.05)。结论FSA模式对系统稳定性要求高,更适合短时间小规模样品量分析;DDA模式对系统稳定性要求相对较低,操作简便省时,可用于长时间大规模样品量的分析。

关键词：非靶向代谢组学全扫描采集(FSA) 数据依赖采集(DDA)

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热休克蛋白90靶向抑制剂多肽P7联合替莫唑胺协同抗胶质母细胞瘤的作用

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中国药业 2021年第12期30卷 30-33页

作者：薛瞳瞳黄薇杨楠刘雁勇中国医学科学院基础医学研究所·北京协和医学院基础学院药理学系北京100005

目的探讨双功能小分子多肽P7(序列LPLTPLP)联合替莫唑胺(TMZ)对人胶质母细胞瘤细胞系U87MG的影响。方法以TMZ与P7单用或联用处理U87MG细胞,采用CCK-8法检测细胞活性,流式细胞术检测U87MG细胞凋亡水平,蛋白质免疫印迹法检测U87MG细胞凋... 详细信息

目的探讨双功能小分子多肽P7(序列LPLTPLP)联合替莫唑胺(TMZ)对人胶质母细胞瘤细胞系U87MG的影响。方法以TMZ与P7单用或联用处理U87MG细胞,采用CCK-8法检测细胞活性,流式细胞术检测U87MG细胞凋亡水平,蛋白质免疫印迹法检测U87MG细胞凋亡相关蛋白水平。以溶剂作对照。结果TMZ和P7均能抑制U87MG细胞的生长,当P7与TMZ浓度比为1∶1时,协同作用最明显;与对照组比较,联合给药组的U87MG细胞凋亡率显著升高(P<0.01),cleaved caspase-9和cleaved caspase-3表达水平显著升高(P<0.05)。结论P7联合TMZ能协同抑制U87MG细胞活力,并促进其凋亡,其机制可能与显著上调促凋亡蛋白cleaved caspase-9和cleaved caspase-3水平有关。

关键词：胶质母细胞瘤 U87MG细胞热休克蛋白90 靶向抑制剂多肽P7 细胞凋亡协同作用机制

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大肠杆菌离体重组系统转运FhaB突变体

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基础医学与临床 2022年第4期42卷 565-569页

作者：黄丕英蔡锟韦良婉王星媛王哲储引娣范恩国中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院病原生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的探讨离体重组系统用于双组分转运系统机制研究的可行性。方法通过构建不同分子质量大小的FhaB突变体,制备成原生质球,加入到FhaC蛋白脂质体中,使用蛋白酶K消化的方法检测所构建的离体重组体系转运不同大小底物的能力。结果成功构建... 详细信息

目的探讨离体重组系统用于双组分转运系统机制研究的可行性。方法通过构建不同分子质量大小的FhaB突变体,制备成原生质球,加入到FhaC蛋白脂质体中,使用蛋白酶K消化的方法检测所构建的离体重组体系转运不同大小底物的能力。结果成功构建突变体后,检测到原生质球分泌的37、60和80 ku大小的条带,并且含FhaC的蛋白脂质体能转运这3种分子质量大小的底物,此次所转运的底物分子质量高达80 ku。结论体外构建的重组转运系统可以转运大分子质量的底物,可尝试使用该体系进行双组分系统机制的研究。

关键词：双组分转运系统突变体 FhaC FhaB

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诊断性试验准确性比较研究

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中国循证医学杂志 2022年第5期22卷 590-594页

作者：田晨杨秋玉赖鸿皓孙铭谣陆瑶谢欣玲田金徽李霓王慧琳郑亚迪李江葛龙兰州大学公共卫生学院循证社会科学研究中心兰州730000 兰州大学公共卫生学院社会医学与卫生事业管理研究所兰州730000 兰州大学护理学院循证护理研究中心兰州730000 兰州大学第二临床医学院兰州730000 兰州大学基础医学院循证医学中心兰州730000 甘肃省循证医学与临床转化重点实验室兰州730000 国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院癌症早诊早治办公室北京100021

在同一个研究中对多个诊断性试验的诊断准确性进行比较,可筛选出准确性较高的诊断性试验。因此,诊断性试验准确性比较研究的开展尤为重要。本文介绍了诊断性试验准确性比较研究的概念,比较了其与单个诊断性试验研究的不同,并从其作用、... 详细信息

在同一个研究中对多个诊断性试验的诊断准确性进行比较,可筛选出准确性较高的诊断性试验。因此,诊断性试验准确性比较研究的开展尤为重要。本文介绍了诊断性试验准确性比较研究的概念,比较了其与单个诊断性试验研究的不同,并从其作用、研究设计、统计分析、现状与挑战的角度进行了阐述。

关键词：诊断性试验诊断性试验准确性比较研究准确性

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基于探针的无标记表面增强拉曼光谱(SERS)用于鉴别乳腺癌患者的血清代谢谱

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基础医学与临床 2025年第5期45卷 651-657页

作者：王盟沈学静刘佳尚璐璐张沫中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物物理及结构生物学系北京100005 钢研纳克检测技术股份有限公司纳克研究院北京100081 中国人民解放军河南省军区郑州第三离职干部休养所综合门诊部河南郑州450006

目的应用无标记的表面增强拉曼光谱(SERS)检测血清代谢物,快速区分乳腺癌患者和健康受试者的代谢谱。方法合成等离激元纳米材料作为SERS的探针,检测拉曼报告分子,评估基于该探针的SERS分析能力。收集乳腺癌患者和健康受试者的血清样品,... 详细信息

目的应用无标记的表面增强拉曼光谱(SERS)检测血清代谢物,快速区分乳腺癌患者和健康受试者的代谢谱。方法合成等离激元纳米材料作为SERS的探针,检测拉曼报告分子,评估基于该探针的SERS分析能力。收集乳腺癌患者和健康受试者的血清样品,用甲醇沉淀蛋白质并去除后得到血清代谢物。基于探针的SERS分析患者的血清代谢物,探究乳腺癌患者的代谢谱变化。结果合成了SERS探针并进行了表征;建立了基于SERS探针的分析方法,实现了4个数量级的线性范围(LR),检测限(LOD)可达10 nmol/L;分析了5例乳腺癌患者和5名健康受试者的血清代谢物的拉曼光谱(RS),研究了代谢物变化的差异(P<0.001)。结论本研究通过基于探针的SERS方法筛选出乳腺癌患者血清代谢物的分子谱图差异,有助于解释乳腺癌引起的代谢改变,为乳腺癌的筛查、快速检测提供新方法。

关键词：乳腺癌探针快速检测表面增强拉曼光谱代谢谱

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风湿免疫病合并肝功能异常患者的临床特征

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中华内科杂志 2023年第9期62卷 1102-1113页

作者：吴婵媛李慕聪段新旺李洪斌王艳红李芹罗卉徐健武丽君王永福赵铖方勇飞林书典徐东田新平李梦涛曾小峰中国医学科学院、北京协和医学院、北京协和医院风湿免疫科、国家皮肤与免疫疾病临床医学研究中心、疑难重症及罕见病国家重点实验室、风湿免疫病学教育部重点实验室北京100730 南昌大学第二附属医院风湿免疫科南昌330006 内蒙古医科大学附属医院风湿免疫科呼和浩特028000 中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院流行病与卫生统计学系北京100005 云南省第一人民医院风湿免疫科昆明650032 中南大学湘雅医院风湿免疫科长沙410008 昆明医科大学第一附属医院风湿免疫科昆明650032 新疆维吾尔自治区人民医院风湿免疫科、新疆维吾尔自治区类风湿关节炎临床医学研究中心乌鲁木齐830001 内蒙古科技大学包头医学院第一附属医院风湿免疫科包头014010 广西医科大学第一附属医院风湿免疫科南宁530021 陆军军医大学西南医院风湿免疫科重庆400038 海南省人民医院风湿免疫科海口570311

目的分析常见风湿免疫病患者合并肝功能异常的临床特征及严重程度。方法横断面调查。患者来自2011至2021年在国家风湿病诊疗数据中心(CRDC)平台登记注册的类风湿关节炎(RA)、系统性红斑狼疮(SLE)、干燥综合征(SS)、强直性脊柱炎(AS)、... 详细信息

目的分析常见风湿免疫病患者合并肝功能异常的临床特征及严重程度。方法横断面调查。患者来自2011至2021年在国家风湿病诊疗数据中心(CRDC)平台登记注册的类风湿关节炎(RA)、系统性红斑狼疮(SLE)、干燥综合征(SS)、强直性脊柱炎(AS)、痛风患者。收集患者的一般人口学资料(包括年龄、性别、体重指数、吸烟史等)、肝功能检查结果(包括丙氨酸转氨酶、天冬氨酸转氨酶、碱性磷酸酶、总胆红素等)、抗风湿免疫药物和保肝药物的使用情况。分析患者的临床特征、肝功能异常的比例、不同性别和年龄段的肝功能异常率。结果共纳入116308例患者,其中RA患者49659例,SLE患者17597例,SS患者9039例,AS患者11321例,痛风患者28692例。RA患者肝功能异常比例最低[11.02%(5470/49659)],其次是SS患者[17.97%(1624/9039)]和AS患者[18.22%(2063/11321)],而SLE患者[21.14%(3720/17597)]和痛风患者[28.73%(8242/28692)]最高。肝功能异常以丙氨酸转氨酶升高为主,且大多数为1级,碱性磷酸酶升高的比例最低。服用保肝药物的患者中,肝功能正常比例痛风患者最低[7.45%(36/483)],余为21.7%~30.34%。RA、SLE、SS、AS、痛风患者中,男性肝功能异常率均高于女性[RA:13.8%(1368/9906)比10.3%(4102/39753);SLE:33.6%(479/1424)比20.0%(3241/16173);SS:25.4%(111/437)比17.6%(1513/8602);AS:20.1%(1629/8119)比13.6%(434/3202);痛风:29.3%(8033/27394)比16.1%(209/1298)]。RA、SLE、AS患者中,各年龄段的肝功能异常率相似;SS患者中,肝功能异常率随年龄增大而升高[<40岁者为14.9%(294/1979);40~59岁者为18.1%(858/4741);≥60岁者为20.4%(472/2319)];痛风患者肝功能异常率随年龄增大而降低[<40岁者为34.9%(4294/12320);40~59岁者为25.5%(2905/11398);≥60岁者为21.0%(1042/4971)]。结论风湿免疫病患者合并肝功能异常的比例较高,但保肝药物的使用率低。风湿免疫病的诊疗过程中需提高对肝功能监测的重视,可考虑适时应用保肝药物,优化保肝治疗方案。

关键词：风湿免疫病关节炎,类风湿红斑狼疮,系统性干燥综合征脊柱炎,强直性痛风肝功能横断面研究

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抗肿瘤药物FTY720对p53依赖的基因转录调控

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基础医学与临床 2021年第3期41卷 311-317页

作者：姚涵徐文彬王冬来中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学遗传学系北京100005

目的探究抗肿瘤药物FTY720是否参与p53依赖的基因表达调控,分析FTY720-p53轴潜在的生物学调控作用。方法在表达野生型p53的人骨肉瘤细胞系U2OS中利用CRISPR/Cas9技术构建p53敲除(p53-KO)的细胞株;将野生型或p53-KO的U2OS细胞给予FTY720... 详细信息

目的探究抗肿瘤药物FTY720是否参与p53依赖的基因表达调控,分析FTY720-p53轴潜在的生物学调控作用。方法在表达野生型p53的人骨肉瘤细胞系U2OS中利用CRISPR/Cas9技术构建p53敲除(p53-KO)的细胞株;将野生型或p53-KO的U2OS细胞给予FTY720处理,通过转录组测序(RNA-seq)结合基因功能富集分析表征p53依赖的差异表达基因及其潜在的生物学功能。结果获得U2OS p53-KO细胞株,筛选出220个FTY720作用下p53依赖的差异表达基因。这些基因主要在血小板活化、细胞趋化因子反应、Rho蛋白信号传导、多细胞生物体内平衡、黏蛋白型O-聚糖生物合成、细胞外基质(ECM)-受体相互作用、病毒蛋白质与细胞因子和细胞因子受体相互作用等生物学过程中起着调控作用。结论p53的激活可能在FTY720抑制肿瘤进展的过程中起到一定作用。

关键词： p53 FTY720 U2OS 基因表达调控生物信息学分析

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羧基末端乙酰化修饰调控抑癌蛋白p53转录特异性

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基础医学与临床 2021年第11期41卷 1577-1582页

作者：闫晓俊徐文彬王冬来中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学遗传学系北京100005

目的探究在非小细胞肺癌细胞系H1299中,p53羧基末端(CTD)乙酰化修饰是否特异性调控基因转录,分析p53 CTD乙酰化修饰潜在的生物学功能。方法在p53表达缺失的H1299细胞中构建可诱导表达野生型p53(p53-WT)或模拟CTD乙酰化修饰p53(p53-6KQ)... 详细信息

目的探究在非小细胞肺癌细胞系H1299中,p53羧基末端(CTD)乙酰化修饰是否特异性调控基因转录,分析p53 CTD乙酰化修饰潜在的生物学功能。方法在p53表达缺失的H1299细胞中构建可诱导表达野生型p53(p53-WT)或模拟CTD乙酰化修饰p53(p53-6KQ)的稳转细胞株;以doxycycline(Doxy)处理诱导稳转细胞株,表达外源性p53-WT或p53-6KQ,通过全转录组测序结合生物学信息分析,表征p53 CTD乙酰化修饰特异性调控的基因及其潜在的生物学功能。结果获得可诱导表达p53的质粒和稳转细胞株;筛选出306个p53-6KQ特异性调控的差异表达基因,发现这些基因主要与细胞命运决定、基因转录调控、神经元发育、肿瘤坏死因子信号通路等生物学过程有关。结论CTD乙酰化修饰可以特异性调控p53对某些下游基因的转录,进而调节某些生物学过程。

关键词： p53 乙酰化修饰基因转录调控肿瘤生物信息学分析

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氢氧化钠增强雷帕霉素抑制Tsc2缺失的小鼠胚胎成纤维细胞的增殖

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基础医学与临床 2021年第7期41卷 951-956页

作者：李凯王亚南中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生理学系北京100005

目的研究氢氧化钠(NaOH)与雷帕霉素(Rapa)单独或联合处理对Tsc2基因缺失(Tsc2^(-/-))小鼠胚胎成纤维细胞的影响。方法将Tsc2^(-/-)细胞及其对照野生型(WT)细胞按照处理方式分为:对照组、NaOH处理组,Rapa处理组和NaOH+Rapa联合(Combo)处... 详细信息

目的研究氢氧化钠(NaOH)与雷帕霉素(Rapa)单独或联合处理对Tsc2基因缺失(Tsc2^(-/-))小鼠胚胎成纤维细胞的影响。方法将Tsc2^(-/-)细胞及其对照野生型(WT)细胞按照处理方式分为:对照组、NaOH处理组,Rapa处理组和NaOH+Rapa联合(Combo)处理组。采用MTT法检测细胞增殖能力;克隆形成实验检测细胞集落形成能力;流式细胞测量术检测细胞周期;免疫印迹法检测p-4EBP1、p-S6和S6蛋白表达水平。结果与对照组相比,NaOH组和Rapa组的Tsc2^(-/-)细胞均表现为增殖能力降低、克隆形成数减少(P<0.05);仅Rapa组的Tsc2^(-/-)细胞G1期比例升高且p-S6和p-4EBP1的蛋白表达水平降低(P<0.05)。与单独的NaOH组和Rapa组相比,Combo组的Tsc2^(-/-)细胞在增殖能力和克隆形成数量上呈进一步降低,G1期细胞的比例呈进一步升高(P<0.05),p-S6和p-4EBP1的蛋白表达水平低于NaOH组(P<0.05)。结论氢氧化钠(15μmol/L)能增强Rapa抑制Tsc2^(-/-)细胞增殖的效果。

关键词：结节性硬化症 mTOR 肿瘤微环境雷帕霉素

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以“肾-三焦”系统诠释间充质干细胞实质

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基础医学与临床 2023年第1期43卷 46-50页

作者：张晓彤赵月纯朱镕嘉赵春华宋坪中国中医科学院广安门医院皮肤科北京100053 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院组织工程研究中心干细胞新药研发及临床转化研究北京市重点实验室(BZ0381)北京100005

肾与三焦在结构与功能上密不可分,故此提出“肾-三焦”可能是间充质干细胞(MSCs)系统的本质,“肾-三焦”是对MSCs系统中医属性的探讨,以肾为本源、三焦为枢机,本文旨在从“肾精为体、三焦为用”的角度诠释MSCs系统的理论内涵,MSCs的形... 详细信息

肾与三焦在结构与功能上密不可分,故此提出“肾-三焦”可能是间充质干细胞(MSCs)系统的本质,“肾-三焦”是对MSCs系统中医属性的探讨,以肾为本源、三焦为枢机,本文旨在从“肾精为体、三焦为用”的角度诠释MSCs系统的理论内涵,MSCs的形态与分布及发挥功能的物质、途径、功能均可在“肾-三焦”系统中得以体现,并通过中医药理论为指导,运用MSCs的现代研究技术,在COVID-19等难治性疾病的应用中取得了较好的效果,对中西医研究的结合进行了初步探索。

关键词：间充质干细胞肾精三焦气化

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