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3 篇
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学科分类号
2 篇
理学
1 篇
生物学
1 篇
生态学
2 篇
农学
2 篇
林学
1 篇
工学
1 篇
林业工程
主题
1 篇
多态性
1 篇
its-rpl16序列
1 篇
引物筛选
1 篇
金合欢属
1 篇
est-ssr
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转录组
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系统发育树
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皂荚
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体系优化
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正交设计
1 篇
matk序列
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国槐
1 篇
通用性
1 篇
毛细管电泳
1 篇
亲缘关系
机构
1 篇
国家林木遗传育种...
1 篇
安徽农业大学
1 篇
中国林业科学研究...
1 篇
国家林木遗传育种...
作者
3 篇
郑勇奇
1 篇
于雪丹
1 篇
程蓓蓓
1 篇
邢俊连
1 篇
黄平
1 篇
宗亦臣
1 篇
孟艳琼
1 篇
林富荣
1 篇
孙荣喜
语言
3 篇
中文
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"机构=中国林业科学研究院林业研究所/国家林木遗传育种重点实验室/国家林业局植物新品种分子测试实验室/国家林业局林木培育重点实验室"
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皂荚EST-SSR
分子
标记开发与分析评价
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植物
遗传
资源学报
2017年 第1期18卷 148-154页
作者:
林富荣
邢俊连
孟艳琼
黄平
郑勇奇
中国林业科学研究院林业研究所/国家林木遗传育种重点实验室/国家林业局植物新品种分子测试实验室/国家林业局林木培育重点实验室
北京100091
安徽农业大学林学与园林学院
合肥230036
本
研究
旨在开发皂荚EST-SSR
分子
标记,为今后皂荚种质资源评价与分析提供基础。首先通过对已公布的皂荚转录组数据进行拼接得到41003个Unigenes,总长度70.4 Mb,平均长度1716 bp,N50为2533 bp。进一步在7009个Unigenes中检测到8494个EST-...
详细信息
本
研究
旨在开发皂荚EST-SSR
分子
标记,为今后皂荚种质资源评价与分析提供基础。首先通过对已公布的皂荚转录组数据进行拼接得到41003个Unigenes,总长度70.4 Mb,平均长度1716 bp,N50为2533 bp。进一步在7009个Unigenes中检测到8494个EST-SSR位点,其中1200条Unigenes含有2个及以上的SSR位点,复合型SSRs有369个。针对
所
有EST-SSR位点设计得到6494条特异性引物,随机挑选60个位点进行试验验证与分析,其中44对引物可扩增出特异性片段,17对具有多态性,PIC值范围为0.195~0.742,均值为0.501,且大部分多态性位点位于UTR区域。通过对皂荚近缘种进行跨种PCR扩增试验,结果显示在开发的44对有效引物中,9个近缘种美国皂荚、日本皂荚、绒毛皂荚、滇皂荚、华南皂荚、小果皂荚、野皂荚、肥皂荚和美国肥皂荚分别有32、31、23、24、7、40、25、18和18对引物可获得有效扩增片段,说明EST-SSR标记在皂荚近缘种之间具有良好的通用性。
研究
表明利用转录组数据挖掘的EST-SSR位点具有扩增稳定、多态性良好、近缘种间通用等优点,是
林木
物种开发
分子
标记的有效途径之一。
关键词:
皂荚
转录组
EST-SSR
多态性
通用性
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中国
广义金合欢属
植物
亲缘关系的
分子
分析
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林业科学研究
2015年 第2期28卷 158-165页
作者:
程蓓蓓
于雪丹
郑勇奇
国家林木遗传育种重点实验室
中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室国家林业局植物新品种分子测试实验室北京100091
通过ITS-rpl16序列和mat K序列的
分子
分析,对
中国
现有金合欢属的各亚属间的亲缘关系进行了
研究
,结果表明:我国现有广义金合欢属的14个种大致被聚为相思亚属、皮刺亚属和金合欢亚属3大类,原产
中国
的3种皮刺亚属的种聚成1支,表明印度金合...
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通过ITS-rpl16序列和mat K序列的
分子
分析,对
中国
现有金合欢属的各亚属间的亲缘关系进行了
研究
,结果表明:我国现有广义金合欢属的14个种大致被聚为相思亚属、皮刺亚属和金合欢亚属3大类,原产
中国
的3种皮刺亚属的种聚成1支,表明印度金合欢和羽叶金合欢关系更近,二者再与儿茶形成姐妹类群。基于选自美洲、非洲、澳大利亚和
中国
乡土种(印度金合欢、羽叶金合欢和儿茶)共40个金合欢属种和1个外类群的mat K序列建立的系统发育树表明:皮刺亚属和相思亚属的亲缘性关系比与金合欢亚属的亲缘关系更近,相思亚属和金合欢亚属均是单系类群,而皮刺亚属属于并系类群;
中国
的几个乡土种都与非洲一些种的亲缘关系较近,聚为1支。
关键词:
金合欢属
亲缘关系
ITS-rpl16序列
matK序列
系统发育树
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国槐SRAP-PCR反应体系优化及引物筛选
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广西
林业科学
2014年 第4期43卷 343-350页
作者:
孙荣喜
宗亦臣
郑勇奇
国家林木遗传育种重点试验室
国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所国家林业局植物新品种分子测试实验室北京100091
为建立国槐(Sophora japonica)最佳SRAP-PCR反应体系,采用正交试验设计L16(45)对影响PCR体系的5个因素(模板浓度、引物浓度、Mg2+浓度、Taq聚合酶和d NTP用量)4个水平进行了优化,确定了国槐的最优SRAP-PCR反应体系:Taq聚合酶1.5 U,d NTP...
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为建立国槐(Sophora japonica)最佳SRAP-PCR反应体系,采用正交试验设计L16(45)对影响PCR体系的5个因素(模板浓度、引物浓度、Mg2+浓度、Taq聚合酶和d NTP用量)4个水平进行了优化,确定了国槐的最优SRAP-PCR反应体系:Taq聚合酶1.5 U,d NTPs 0.30 mmol/L,模板DNA 90 ng,Mg2+2.0 mmol/L,引物0.3μmol/L,dd H2O补至20μL。各因素对PCR反应的影响从大到小依次为:Taq聚合酶>d NTPs>模板DNA>Mg2+>引物。基于最佳SRAP体系,采用4个
品种
对120对引物进行筛选,共获得12对多态性好的引物组合。随机抽取两对引物基于毛细管电泳技术对此体系进行稳定性检验,扩增条带清晰、稳定、多态性高。该体系的建立以及筛选的引物组合为为进一步利用SRAP技术对国槐的
遗传
多样性、
品种
鉴定等方面的
研究
奠定基础。
关键词:
国槐
体系优化
引物筛选
毛细管电泳
正交设计
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