检索结果-内蒙古大学图书馆

病毒学报 2022年第5期38卷 1108-1116页

作者：黄淑芬张薇陈美钟郭雪祝双利李彩霞曾汉日方苓张勇郑焕英邓小玲南方医科大学公共卫生学院广州510515 广东省疾病预防控制中心广东新发突发传染病防治工作站广州511430 世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021... 详细信息

埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021年广州市生活污水EV监测获得的E11分离株进行VP1区基因扩增及测序,结合2019年广东省发生的两起E11新生儿感染事件及部分散发病例中获得的E11分离株,与全球E11参考株进行序列相似性分析和系统发生学分析。结果显示,2009-2021年生活污水EV监测中E11分离株的核苷酸及氨基酸相似性分别为72.8%~99.3%和84.5%~99.6%。监测发现,广州市2018-2019年在污水中检出大量E11,与两起新生儿感染事件及散发病例的分离株核苷酸相似性高达96.2%~99.2%,但序列间仍存在差异,两起新生儿感染及散发病例感染的毒株为不同来源。通过系统进化树分析发现,2018-2019年污水E11分离株及两起新生儿感染与散发病例E11亲缘关系较近,分子分型结果均为E11 D5基因型。2017年及以前的污水分离株以A1基因型为主,但也有C3和D5基因型,2018年开始则以D5基因型为主,与同时期EV感染病例基因型结果一致。而在2021年污水中则发现了E11 E基因型,但广州暂未有该基因型的感染病例报道,仍需持续进行病例和环境监测。结果表明,生活污水监测能够及时反映EV在环境和人群中的循环动态变化,对EV引起的相关疾病起到预测预警作用。

关键词：埃可病毒11型污水监测基因特征循环动态变化

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埃可病毒11型感染RD细胞的转录组学分析及PLK1对其感染影响的初步探究

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中华实验和临床病毒学杂志 2021年第6期35卷 605-611页

作者：张国艳李冀琛张珂艺孙强张勇武桂珍中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206 潍坊医学院 261053

目的探究埃可病毒11型(echovirus 11,E11)感染人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma cells,RD)后细胞内宿主因子在转录水平上的变化,初步了解Polo样激酶1(polo-like kinase 1,PLK1)对E11复制的影响及可能的分子机制。方法利用转录... 详细信息

目的探究埃可病毒11型(echovirus 11,E11)感染人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma cells,RD)后细胞内宿主因子在转录水平上的变化,初步了解Polo样激酶1(polo-like kinase 1,PLK1)对E11复制的影响及可能的分子机制。方法利用转录组测序(RNA-Seq技术)对E11感染RD细胞组和RD细胞对照组进行差异表达基因分析。使用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析显著差异表达基因,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time PCR,qPCR)对代表性差异基因的表达水平进行验证,并初步探究抑制PLK1对E11复制的影响。结果E11感染RD细胞后,共鉴定出3726个差异表达基因,感染组(感染后12 h、24 h和48 h)共同显著差异表达基因484个,这些显著差异表达基因主要富集在免疫反应、细胞内信号转导、转录因子活性、序列特异性DNA结合、蛋白激酶活性、核、膜的组成成分、PI3K-Akt信号通路等。使用qPCR对6个靶基因(CXCL14、IFITM1、OAS1、SAMD9、MX1和PLK1)的表达情况进行验证,均与RNA-Seq结果一致,其中CXCL14、IFITM1、OAS1、SAMD9、MX1表达上调倍数在1.2~104.97倍之间,PLK1表达下调倍数在0.99~5.79倍之间。抑制PLK1后,E11复制能力增加。结论炎症反应、PI3K-Akt、MAPK等通路可能在E11感染抗病毒免疫过程中发挥重要作用,此外,宿主因子PLK1可能通过调节细胞周期在E11感染中起到关键作用。

关键词：埃可病毒11型转录组分析 Polo样激酶1 差异表达基因宿主因子

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2013-2019年全国手足口病ECHO-9的分子流行病学研究

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病毒学报 2021年第1期37卷 115-122页

作者：司芬芬卫海燕关路媛冀天娇王东艳张勇祝双利宋洋韩振志李俊含许文波严冬梅国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 河南省疾病预防控制中心郑州450016 陕西省疾病预防控制中心西安710054 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000

埃可病毒9型(Echovirus 9,ECHO-9)是引起无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)和手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)暴发流行的重要病原体,但目前全球关于ECHO-9分子流行病学研究仍比较匮乏,ECHO-9基于VP1全长的基因分型结果尚未明确。本研究依托国家HFMD监测网络,2013-2019年在中国大陆共分离到15株ECHO-9毒株,对其进行VP1区全长序列测定和分析,并与GenBank中下载的全部112条ECHO-9VP1区全长序列共同构建系统发育进化树。结果显示,全球ECHO-9分为A-G七个基因型,其中C、D和F基因型可被进一步划分为C1-C2,D1-D4和F1-F2基因亚型。各洲之间优势基因型别有显著差异,亚洲和欧洲分别以D和C基因型为绝对优势基因型。中国大陆ECHO-9优势基因型别为D基因型,但其优势基因亚型随时间推移有明显转变。2000-2005年,中国大陆ECHO-9全部为D1基因亚型,2006年开始出现D1、D2和D3基因亚型的共同流行,2010年后D1和D2基因亚型消失,D3成为中国大陆绝对优势基因型别。本研究测定的15株ECHO-9分离自2013-2019年,其中14株属于D3基因亚型,1株江西ECHO-9为C2基因亚型,推测其可能来源于境外。本研究建立了全球ECHO-9基于VP1全长的基因分型方法,揭示了ECHO-9在全国及全球范围的分子流行特征。

关键词：埃可病毒9型(ECHO-9) 无菌性脑膜炎(AM) 手足口病(HFMD) 基因分型分子流行病学

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2020年西藏自治区0~5岁健康儿童肠道病毒的流行和分布

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国际病毒学杂志 2023年第3期30卷 181-186页

作者：彭措次仁刘莹李冀琛顿珠多吉索朗德吉罗央措丛如意杨婷婷王琴代国龙旦增曲扎肖金波孙强许文波张勇红梅西藏自治区疾病预防控制中心微生物检验所拉萨850002 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家脊髓灰质炎实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250024

目的研究中国西藏自治区2020年0~5岁健康儿童中人肠道病毒的流行和分布。方法粪便标本取自2020年中国西藏自治区574名0~5岁的健康儿童。使用实时荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测粪便标本中的肠道病毒核酸。对肠道... 详细信息

目的研究中国西藏自治区2020年0~5岁健康儿童中人肠道病毒的流行和分布。方法粪便标本取自2020年中国西藏自治区574名0~5岁的健康儿童。使用实时荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测粪便标本中的肠道病毒核酸。对肠道病毒核酸阳性的标本,采用逆转录PCR扩增肠道病毒VP1区并进行序列测定和分析,根据测定的序列进行肠道病毒分子分型。结果574例样本中检出肠道病毒(enterovirus,EV)核酸阳性89份(15.98%),EV-B检出最多,检出率为10.98%,EV-A和EV-C检出率分别为3.66%和0.87%,未发现EV-D。共鉴定出17种血清型,主要血清型为E11(7.67%),其次为EV-A71(1.74%)。各年龄组感染率存在一定的差异,呈现为随着年龄的增大感染率逐渐降低的现象,0岁和1岁组感染率分别为23.4%和25.0%,而在5岁组感染率降为最低,仅为5.8%。结论西藏自治区健康儿童粪便样本EV病原谱中以EV-B为主。序列分析提示了西藏自治区EV流行的广泛性及多样性,以EV-A71和E11为代表的几种EV型别在西藏自治区相对常见,有导致较严重疾病的潜力,需要进行更加严格的监测。

关键词：西藏自治区健康儿童肠道病毒型别分布

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2020年西藏自治区0~5岁健康儿童携带埃可病毒11型的基因特征分析

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国际病毒学杂志 2023年第3期30卷 187-191页

作者：红梅刘莹顿珠多吉李冀琛索朗德吉罗央措杨婷婷丛如意肖金波王琴代国龙旦增曲扎孙强许文波张勇彭措次仁西藏自治区疾病预防控制中心微生物检验所拉萨850002 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家脊髓灰质炎实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250024

目的本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型(echovirus11,E11)的基因特征进行研究,掌握肠道病毒的流行情况,填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康... 详细信息

目的本研究旨在通过对2020年西藏自治区5岁以下健康儿童中携带埃可病毒11型(echovirus11,E11)的基因特征进行研究,掌握肠道病毒的流行情况,填补西藏自治区关于E11基因特征研究的空白。方法收集2020年在中国西藏自治区内采集的0~5岁健康儿童的粪便标本,通过病毒分离和肠道病毒分子定型方法,对阳性病毒分离物进行肠道病毒血清型鉴定,并对鉴定结果为E11的病毒分离物进行全长VP1区扩增及核苷酸序列测定和分析。使用MEGA软件构建基因进化树(最大似然法),与中国其他省份E11和全球E11进行遗传进化分析。结果574份粪便标本中分离到89株肠道病毒分离株,其中E11有44株,是主要的血清型,VP1区核苷酸序列之间的相似性为96.4%~100%,在系统发育树上呈现为多个传播链,但均属于D5基因亚型,且与我国2017年后其它省份E11流行株聚为一簇。结论本研究获得了我国西藏自治区流行的E11的基因特征的基本信息,并了解了全球E11的基因型分布。

关键词：西藏自治区埃可病毒11型基因特征

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江西省2010年柯萨奇病毒A组24型变异株的全基因组序列分析

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病毒学报 2021年第1期37卷 89-96页

作者：李俊含张勇冀天娇李婕熊英祝双利王东艳韩振志肖金波司芬芬许文波严冬梅国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000 吉林省长春市南关区疾病预防控制中心长春130022 北京核工业医院(房山院区) 北京102413 江西省疾病预防控制中心南昌330029

急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体。本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的... 详细信息

急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体。本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的CV-A24v,采用特异性引物扩增并测定其全基因组序列。对该10条CV-A24v的全基因组序列进行系统发育分析以及重组分析,计算本研究测定的江西10条以及GenBank中所有22条CV-A24v的全基因组序列的氨基酸置换熵值,并预测其正向选择位点。结果表明,在江西10条CV-A24v基因组序列中未检测到重组。基于全基因组序列构建的最大似然树表明江西10株CV-A24v属于GIV基因型,且分处于两条传播链。对上述32条CV-A24v序列的氨基酸置换熵值计算,共得到25个易突变位点(熵值>0.6),易突变概率最高的区段为2A区。基于Datamonkey中FUBAR和FEL模型分析,发现位于结构蛋白VP2区的234位氨基酸为两种模型共同获得的CV-A24v的正向选择位点。本研究分析了江西10株CV-A24v的全基因组序列特征,为CV-A24v引起的AHC防控工作提供了基础资料。

关键词：柯萨奇病毒A组24型变异株(CV-A24v) 急性出血性结膜炎(AHC) 全基因组选择压力

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中国CVA6 D3基因亚型B细胞抗原表位氨基酸差异分析及VLPs初步制备

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国际病毒学杂志 2022年第6期29卷 449-454页

作者：李晓亮王聪聪王蕊李冀琛宋洋路环环肖金波刘莹宋敬东刘一志张勇孙强徐希柱山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250024 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室、国家卫生健康委员会生物安全重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 潍坊医学院基础医学院 261053

目的分析中国流行的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)D3基因亚型中的D3a和D3b分支序列结构蛋白B细胞抗原表位氨基酸差异性来优化设计CVA6病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)疫苗。方法对GenBank下载的含有P1区核苷酸CVA6序列,... 详细信息

目的分析中国流行的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)D3基因亚型中的D3a和D3b分支序列结构蛋白B细胞抗原表位氨基酸差异性来优化设计CVA6病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)疫苗。方法对GenBank下载的含有P1区核苷酸CVA6序列,使用MEGA.11.0软件基于VP1序列采用最大似然法构建进化树划分基因型及亚型。采用在线工具WebLogo并结合CVA6 B细胞抗原表位研究的相关文献,对D3a和D3b分支序列VP1-VP3区B细胞抗原表位氨基酸差异性分析,为筛选疫苗候选株进行CVA6 VLP的制备。结果D3a与D3b分支序列在VP1 N末端P27位点分别是天冬酰胺(96.2%)和丝氨酸(92.9%);在VP3 N末端P60位点为甘氨酸(98.8%)和丝氨酸(60.0%)。基于上述差异性选择具有D3a(VP3-N-P60)和D3b(VP1-N-P27)两分支序列共有的B细胞抗原表位D3a-JX2018(GenBank accession number:MN845862)作为疫苗候选株,并成功制备了CVA6 VLP。结论本研究为疫苗候选株的选择提供了新的思路,为日后CVA6 VLPs疫苗和免疫诊断试剂的研发提供了基础。

关键词：柯萨奇病毒A6型基因亚型氨基酸差异 B细胞抗原表位病毒样颗粒疫苗

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2023年福建省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析

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病毒学报 2025年第2期 301-309页

作者：周蕾朱颖冀天娇杨倩刘娜祝双利肖金波于力恒郭琴刘莹李冀琛栗凡肖梦怡张勇何文祥严冬梅国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室福建省疾病预防控制中心达州中医药职业学院沈阳医学院山东第一医科大学山东省医学科学院

本研究利用国家疾病监测信息管理系统，对2023年福建省急性出血性结膜炎（Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC）的暴发进行了描述性流行病学分析，并采集40份AHC患者眼结膜拭子进行病原学鉴定和基因进化分析。结果显示，福建省2023年... 详细信息

本研究利用国家疾病监测信息管理系统，对2023年福建省急性出血性结膜炎（Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC）的暴发进行了描述性流行病学分析，并采集40份AHC患者眼结膜拭子进行病原学鉴定和基因进化分析。结果显示，福建省2023年AHC报告病例数6024例，发病率14.38/10万。5-14岁的发病儿童占发病总数的59.8%，学生、农民和幼托儿童为主要发病人群占比84.7%。40份拭子分离到26株柯萨奇病毒A组24型变异株（Coxsackievirus A24 variant,CVA24v）。基于3C和VP1区域的基因进化树表明福建26株CVA24v属于GⅣ基因型。3株福建CVA24v的全基因组序列结果显示其在5’UTR区和3C区与EV-C96存在重组。

关键词：急性出血性结膜炎柯萨奇病毒A组24型变异株基因进化分析重组

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柯萨奇病毒B组5型基因分型标准的研究

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国际病毒学杂志 2022年第6期29卷 455-460页

作者：何云杨倩严冬梅祝双利冀天娇卫海燕魏雷雷樊欢路环环肖金波赵鹤鹤王雯慧郭琴邢薇佳张勇山东第一医科大学山东省医学科学院济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室、国家卫生健康委员会生物安全重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 河南省疾病控制预防中心郑州450016 吉林省疾病预防控制中心、吉林省公共卫生研究院长春130062 江苏疾病控制预防中心南京210009

目的依据肠道病毒分子分型的基本原则(基于VP1区全长核苷酸序列差异界值15%~25%),科学建立柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)的分子分型标准。方法本研究依托中国手足口病实验室网络,将来自中国大陆2001—2021年间分离出的69株C... 详细信息

目的依据肠道病毒分子分型的基本原则(基于VP1区全长核苷酸序列差异界值15%~25%),科学建立柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)的分子分型标准。方法本研究依托中国手足口病实验室网络,将来自中国大陆2001—2021年间分离出的69株CVB5采用逆转录-聚合酶链反应扩增全长VP1编码区,并进行核苷酸序列测定和分析;同时下载并筛选GenBank中截至2022年2月16日的742条CVB5全长VP1编码区核苷酸序列(849个核苷酸)。使用MEGA 7.0软件进行序列比对及构建基于最大似然法的基因进化树,自展值设定为1000,进行CVB5分子分型标准的研究。结果69株中国大陆CVB5分离株与CVB5原型株(Faulkner株)核苷酸和氨基酸的相似性分别为77.3%~81.6%和93.2%~95.3%。系统进化树显示,全球CVB5可分为4个不同分支,分支内核苷酸的平均差异范围在7.3%~13.4%,氨基酸的平均差异范围在1.9%~3.3%,分支间核苷酸的平均差异范围在17.0%~22.3%,氨基酸的平均差异范围为4.2%~4.9%。根据上述分子分型标准,将全球CVB5划分为A、B、C、D四个基因型。A基因型和C基因型CVB5可能在进化过程中已消失,不再流行,而B基因型和D基因型CVB5目前在全球呈现共流行趋势。中国大陆流行的CVB5主要为D基因型,少部分为B基因型。结论本研究建立了CVB5的分子分型的标准,并根据该标准将全球CVB5划分为4个基因型,对进一步了解CVB5的遗传变异变迁规律和进行分子溯源具有重要意义。

关键词：柯萨奇病毒B组5型分子分型 VP1区分型标准手足口病

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2017-2018重庆市手足口病病原谱及主要病原体基因特征分析

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国际病毒学杂志 2023年第5期30卷 393-399页

作者：王雯慧王江峡许红梅张勇孙强何云郭琴王晓艺路环环肖金波赵鹤鹤韩振志严冬梅许文波冀天娇张乐山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室、国家卫生健康委员会生物安全重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 重庆医科大学附属儿童医院感染科、国家儿童健康与疾病临床医学研究中心儿童发育疾病研究教育部重点实验室、儿科学重庆市重点实验室、儿童感染免疫重庆市重点实验室、认知发育与学习记忆障碍转化医学重庆市重点实验室、重庆市干细胞治疗工程技术研究中心、儿童营养与健康重庆市重点实验室 400014 安徽理工大学医学院淮南232001

目的分析2017—2018年重庆地区手足口病病原谱及其主要病原体的基因特征。方法选择重庆市儿童医院作为研究对象,收集并整理该院区2017—2018年1071例诊断为手足口病患者的核酸检测信息,其中810份已明确了肠道病毒血清型,剩余175份血清... 详细信息

目的分析2017—2018年重庆地区手足口病病原谱及其主要病原体的基因特征。方法选择重庆市儿童医院作为研究对象,收集并整理该院区2017—2018年1071例诊断为手足口病患者的核酸检测信息,其中810份已明确了肠道病毒血清型,剩余175份血清型待鉴定,另有86份肠道病毒为阴性。通过病毒分离、核酸浓缩及基因测序等方法对上述261份样本进行鉴定,获得该地区手足口病完整的病原谱。使用MEGA 7.0软件构建四种主要病原体的系统进化树,进行基因特征的研究。结果通过改良的鉴定方法,261份标本中,除3份被鉴定为人副肠孤病毒(Human parechovirus,HPeV)外,其余258份样本均为肠道病毒阳性。其中CVA6(coxsackievirus A6)血清型占比最多,其次为EV-A71(enterovirus A71)另有CVA16(coxsackievirus A16)和CVA10(coxsackievirus A10)以及其他肠道病毒共计13种血清型。系统进化结果显示,重庆市CVA6血清型均为D3a基因亚型,EV-A71、CVA10和CVA16的优势基因亚型分别为C4a,C2b和B1b,这四种优势基因型与全国其他地区的基因型共同循环进化。结论本研究通过优化鉴定方法,提高了肠道病毒的检出率,进一步明确了重庆地区手足口病病原谱构成,CVA6是该地区2017—2018年手足口病的主要病原体,其次是EV-A71,同时这两种血清型也是导致重庆地区重症手足口病主要的病原体。

关键词：手足口病病原谱 VP1基因

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