检索结果-内蒙古大学图书馆

江西省2010年柯萨奇病毒A组24型变异株的全基因组序列分析

病毒学报 2021年第1期37卷 89-96页

作者：李俊含张勇冀天娇李婕熊英祝双利王东艳韩振志肖金波司芬芬许文波严冬梅国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000 吉林省长春市南关区疾病预防控制中心长春130022 北京核工业医院(房山院区) 北京102413 江西省疾病预防控制中心南昌330029

急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体。本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的... 详细信息

急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体。本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的CV-A24v,采用特异性引物扩增并测定其全基因组序列。对该10条CV-A24v的全基因组序列进行系统发育分析以及重组分析,计算本研究测定的江西10条以及GenBank中所有22条CV-A24v的全基因组序列的氨基酸置换熵值,并预测其正向选择位点。结果表明,在江西10条CV-A24v基因组序列中未检测到重组。基于全基因组序列构建的最大似然树表明江西10株CV-A24v属于GIV基因型,且分处于两条传播链。对上述32条CV-A24v序列的氨基酸置换熵值计算,共得到25个易突变位点(熵值>0.6),易突变概率最高的区段为2A区。基于Datamonkey中FUBAR和FEL模型分析,发现位于结构蛋白VP2区的234位氨基酸为两种模型共同获得的CV-A24v的正向选择位点。本研究分析了江西10株CV-A24v的全基因组序列特征,为CV-A24v引起的AHC防控工作提供了基础资料。

关键词：柯萨奇病毒A组24型变异株(CV-A24v) 急性出血性结膜炎(AHC) 全基因组选择压力

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

带状疱疹流行病学及疫苗的研究进展

引用

病毒学报 2020年第1期36卷 109-114页

作者：闵小雨许松涛许文波安徽理工大学淮南232001 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

带状疱疹(Herpes zoster,HZ)是由潜伏的水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)重新激活引起的感染性皮肤病,好发于中老年人,常表现为沿感觉神经支配的区域形成单侧皮疹,并伴有神经病理性疼痛。随着我国人口老龄化趋势日益加重... 详细信息

带状疱疹(Herpes zoster,HZ)是由潜伏的水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)重新激活引起的感染性皮肤病,好发于中老年人,常表现为沿感觉神经支配的区域形成单侧皮疹,并伴有神经病理性疼痛。随着我国人口老龄化趋势日益加重,带状疱疹的发病率呈显著上升趋势,带状疱疹的防治已经成为重要的公共卫生问题,接种带状疱疹疫苗来防止该病发生是最为行之有效的手段。本文将对带状疱疹的流行病学以及对已上市带状疱疹疫苗的有效性、安全性和成本效益等方面作一综述,为我国带状疱疹疫苗的研制以及带状疱疹的预防提供参考。

关键词：带状疱疹(HZ) 疫苗流行病学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

呼吸道病原体多重核酸扩增在老年患者呼吸系统感染检测中的应用

引用

中华实验和临床病毒学杂志 2020年第3期34卷 299-303页

作者：宋国威潘婧梁芸马学军万玲玲李玉雪李立新石家庄市第一医院检验科 050000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的了解多重RT-PCR方法检测13种常见呼吸道感染病原体,在老年患者呼吸系统感染病原体检测中的应用价值。方法317例2016年6月至2017年5月在石家庄市第一医院老年科就诊的具有呼吸系统感染症状的老年患者,年龄60~98岁,采集其抽吸痰液,提... 详细信息

目的了解多重RT-PCR方法检测13种常见呼吸道感染病原体,在老年患者呼吸系统感染病原体检测中的应用价值。方法317例2016年6月至2017年5月在石家庄市第一医院老年科就诊的具有呼吸系统感染症状的老年患者,年龄60~98岁,采集其抽吸痰液,提取病毒DNA/RNA,利用多重RT-PCR技术扩增,通过毛细管电泳,同时检测13种呼吸道病原体;并以直接测序方法和荧光实时PCR法为标准,评价该试剂的临床性能。结果使用直接测序和荧光实时PCR结果为参照,多重RT-PCR技术的准确性为99.93%(95%CI:99.79%~99.98%),阳性预测值为99.24%(95%CI:97.78%~99.74%),阴性预测值为100%(95%CI:99.9%~100%),Cohen’skappa值为0.9958(95%CI:0.9652~1.026)。在317例老年患者中,呼吸道病原阳性检出率为75.7%(240/317),其中甲型流感病毒最高,为20.2%(64/317),主要为H3亚型(70.3%(45/64);其次为鼻病毒、腺病毒、肺炎支原体和乙型流感病毒,检出率分别为15.5%(49/317)、13.6%(43/317)、11.0%(35/317)和10.1%(32/317)。此外,同时检出2种以及2种以上病原体的老年患者为81例,检出率为25.6%(81/317)。结论多重RT-PCR方法能满足临床对呼吸道病原体检测的需求,并为老年患者呼吸系统感染的防治提供有效的临床资料。

关键词：呼吸道感染毛细管电泳老年患者逆转录聚合酶链反应

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

丙型肝炎病毒核酸检测技术研究进展

引用

中华实验和临床病毒学杂志 2020年第1期34卷 97-101页

作者：白雪丁徐进杰申辛欣戎秀格马学军华北理工大学唐山063000 烟台市疾病预防控制中心 264003 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 唐山工人医院 063000

丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)在全球感染超过2亿人,发病率不断上升,给资源贫乏的国家造成沉重的经济负担。有效的HCV诊断对治疗选择和治疗监测有指导意义。HCV感染检测技术包括血清学检测和核酸检测。血清学检测主要用于HCV感... 详细信息

丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)在全球感染超过2亿人,发病率不断上升,给资源贫乏的国家造成沉重的经济负担。有效的HCV诊断对治疗选择和治疗监测有指导意义。HCV感染检测技术包括血清学检测和核酸检测。血清学检测主要用于HCV感染筛查,操作简便,但窗口期长,不能判断病毒活动期或是既往感染。核酸检测灵敏度高,线性范围广,是确定病毒感染的直接证据。传统的变温核酸扩增技术已广泛应用于临床实验室。等温核酸扩增技术的发展克服了传统核酸扩增技术的局限性,可作为现场即时检验(point-of-care testing,POCT)的工具,能够满足我国基层医疗卫生机构乃至非洲和东南亚等HCV流行率高的低资源地区的需求。本文综述了HCV核酸检测技术的研究进展并展望了其发展趋势。

关键词：丙型肝炎病毒核酸检测等温核酸扩增技术

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

北美洲流行汉坦病毒多重荧光定量RT⁃PCR检测方法的建立

引用

病毒学报 2020年第4期36卷 617-623页

作者：李乃哲李阿茜李建东李德新梁米芳王世文中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心北京100049

为了建立牛轭湖病毒(Bayou virus,BAYV)、纽约病毒(New York virus,NYV)、厄尼诺洛峡谷病毒(El Moro Canyon virus,ELMCV)以及岛景病毒(Isla Vista virus,ISLAV)四种病毒快速筛查、诊断的核酸检测技术,本研究选用上述四种病毒的N蛋白基... 详细信息

为了建立牛轭湖病毒(Bayou virus,BAYV)、纽约病毒(New York virus,NYV)、厄尼诺洛峡谷病毒(El Moro Canyon virus,ELMCV)以及岛景病毒(Isla Vista virus,ISLAV)四种病毒快速筛查、诊断的核酸检测技术,本研究选用上述四种病毒的N蛋白基因作为靶标区域设计四组特异性引物探针,建立四重实时荧光定量RT-PCR检测方法。用四种病毒体外转录RNA进行灵敏度和重复性验证,并使用其他病毒细胞培养物及体外转录RNA进行特异性验证。结果显示,四重实时荧光定量PCR扩增效率均可达到95%以上,四种病毒体外转录RNA灵敏度介于1~10拷贝/μL,与单重检测方法无明显差异,且与其他病毒无交叉反应。稳定性评价结果显示,批内、批间变异系数均在3%以内。本研究所建立的检测方法具有良好的敏感性、特异性和重复性,可用于相关样本的诊断与筛查。

关键词：四重实时荧光定量RT-PCR 牛轭湖病毒(BAYV) 纽约病毒(NYV) 厄尼诺洛峡谷病毒(ELMCV) 岛景病毒(ISLAV)

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

中国部分地区猪胆汁戊型肝炎病毒基因型和中和抗原位点变异研究

引用

中国疫苗和免疫 2020年第2期26卷 131-135,154页

作者：尹文娇韩雅琳刘宏图姜法春曹经瑗毕胜利国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院山东青岛266033

目的调查猪胆汁戊型肝炎病毒(HEV)携带率、基因型和中和抗原位点变异。方法在中国4个地区屠宰场采集成年商品猪的胆汁标本,采用real-time RT-PCR检测HEV RNA;采用巢式RT-PCR扩增HEV ORF2区部分基因片段,进行基因分型和中和抗原位点氨基... 详细信息

目的调查猪胆汁戊型肝炎病毒(HEV)携带率、基因型和中和抗原位点变异。方法在中国4个地区屠宰场采集成年商品猪的胆汁标本,采用real-time RT-PCR检测HEV RNA;采用巢式RT-PCR扩增HEV ORF2区部分基因片段,进行基因分型和中和抗原位点氨基酸序列分析。结果猪胆汁标本HEV RNA总阳性率为8.6%(46/532),4个地区阳性率在3.0%-12.5%之间。19株HEV基因分型成功,均为基因4型,其中11株HEV基因亚型分型成功,均为4a亚型。在该11株HEV的21个中和抗原位点中,2株HEV在ORF2区分别发生第487位氨基酸突变(Ser487Tyr)和第564位氨基酸突变(Thr564Pro)。结论中国部分地区猪胆汁HEV携带率较高,为中国人群中优势流行的基因4型,且部分中和抗原位点发生突变;应加强猪群HEV的持续监测。

关键词：戊型肝炎病毒基因型中和抗原位点变异猪胆汁

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

柯萨奇病毒B组5型基因分型标准的研究

引用

国际病毒学杂志 2022年第6期29卷 455-460页

作者：何云杨倩严冬梅祝双利冀天娇卫海燕魏雷雷樊欢路环环肖金波赵鹤鹤王雯慧郭琴邢薇佳张勇山东第一医科大学山东省医学科学院济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室、国家卫生健康委员会生物安全重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 河南省疾病控制预防中心郑州450016 吉林省疾病预防控制中心、吉林省公共卫生研究院长春130062 江苏疾病控制预防中心南京210009

目的依据肠道病毒分子分型的基本原则(基于VP1区全长核苷酸序列差异界值15%~25%),科学建立柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)的分子分型标准。方法本研究依托中国手足口病实验室网络,将来自中国大陆2001—2021年间分离出的69株C... 详细信息

目的依据肠道病毒分子分型的基本原则(基于VP1区全长核苷酸序列差异界值15%~25%),科学建立柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)的分子分型标准。方法本研究依托中国手足口病实验室网络,将来自中国大陆2001—2021年间分离出的69株CVB5采用逆转录-聚合酶链反应扩增全长VP1编码区,并进行核苷酸序列测定和分析;同时下载并筛选GenBank中截至2022年2月16日的742条CVB5全长VP1编码区核苷酸序列(849个核苷酸)。使用MEGA 7.0软件进行序列比对及构建基于最大似然法的基因进化树,自展值设定为1000,进行CVB5分子分型标准的研究。结果69株中国大陆CVB5分离株与CVB5原型株(Faulkner株)核苷酸和氨基酸的相似性分别为77.3%~81.6%和93.2%~95.3%。系统进化树显示,全球CVB5可分为4个不同分支,分支内核苷酸的平均差异范围在7.3%~13.4%,氨基酸的平均差异范围在1.9%~3.3%,分支间核苷酸的平均差异范围在17.0%~22.3%,氨基酸的平均差异范围为4.2%~4.9%。根据上述分子分型标准,将全球CVB5划分为A、B、C、D四个基因型。A基因型和C基因型CVB5可能在进化过程中已消失,不再流行,而B基因型和D基因型CVB5目前在全球呈现共流行趋势。中国大陆流行的CVB5主要为D基因型,少部分为B基因型。结论本研究建立了CVB5的分子分型的标准,并根据该标准将全球CVB5划分为4个基因型,对进一步了解CVB5的遗传变异变迁规律和进行分子溯源具有重要意义。

关键词：柯萨奇病毒B组5型分子分型 VP1区分型标准手足口病

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

应用中断时间序列分析评价高通量测序技术对临床病毒学的影响

引用

中华实验和临床病毒学杂志 2020年第1期34卷 23-28页

作者：李洋张益于石成何小周杨梦婕王佶金承刚马学军王琦琦国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国疾病预防控制中心流行病学办公室北京102206 北京师范大学社会发展与公共政策学院 100875 中国科学院生物安全大科学中心武汉430071

目的评估全球范围内大规模高通量测序技术的应用对临床病毒学的定量影响。方法分别收集美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)2000-2018年如下记录:每年新增全基因组病毒记录数量;每年新增病毒发现... 详细信息

目的评估全球范围内大规模高通量测序技术的应用对临床病毒学的定量影响。方法分别收集美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)2000-2018年如下记录:每年新增全基因组病毒记录数量;每年新增病毒发现文章数量;每年新增病毒准种文章数量;每年新增病毒感染基因标志物文章数量。然后应用中断时间序列法分析上述记录的变化趋势。结果自2008年全球测序中心开始从Sanger法转向使用高通量测序技术以来,各记录每年新增数量分别是使用之前的3.755倍,2.760倍,6.195倍以及3.885倍。各记录长期变化趋势如下:全基因组病毒记录数量每年新增1639.991条(P<0.001);病毒发现文章数量每年新增83.091篇(P<0.001);病毒准种文章数量每年新增2.509篇(P<0.001);病毒感染基因标志物基因感染签名文章每年新增30.836篇(P<0.001)。结论2008年全球测序中心开始应用高通量测序技术,测序成本不断降低,使得高通量测序技术在临床病毒学的应用中日益丰富,对临床病毒学的发展产生了积极深远的影响。

关键词：中断时间序列设计项目评价高通量测序临床病毒学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

埃可病毒11型利用双受体CD55和FcRn侵染细胞的分子结构基础

引用

科学通报 2020年第1期65卷 67-79页

作者：牛胜刘闯刘聪聪刘升宋洋张勇田文霞赵欣王培毅高福山西农业大学动物科技学院太谷030801 中国科学院微生物研究所中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室北京100101 南方科技大学冷冻电镜中心生物系深圳518055 中国科学院流感研究与预警中心北京100101 中国科学技术大学生命科学学院合肥230026 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206

埃可病毒11型属于小RNA病毒科,肠道病毒属,是B族肠道病毒中的一个重要血清型.埃可病毒11型可导致儿童和青少年脑炎和脑膜炎等疾病,在婴儿和新生儿中导致重症感染甚至致命的病例也时有报道.此外,埃可病毒11型还多次在新生儿和婴幼儿群体... 详细信息

埃可病毒11型属于小RNA病毒科,肠道病毒属,是B族肠道病毒中的一个重要血清型.埃可病毒11型可导致儿童和青少年脑炎和脑膜炎等疾病,在婴儿和新生儿中导致重症感染甚至致命的病例也时有报道.此外,埃可病毒11型还多次在新生儿和婴幼儿群体中引起暴发性感染,如2019年中国广东省发生的院内感染暴发事件,造成了19例新生儿的感染和5例死亡,严重威胁人类健康和公共卫生安全.CD55是20世纪90年代初发现的部分埃可病毒的吸附受体,该受体可以帮助病毒吸附在细胞表面,但并不能介导病毒完成完整的入侵过程.我们在2019年的研究中,发现了人新生儿Fc受体(neonatal Fc receptor,FcRn)是B族肠道病毒的通用脱衣壳受体,并以埃可病毒6型为例解析了病毒入侵机制.本研究利用冷冻电子显微镜技术,解析了埃可病毒11型在入侵过程中不同pH条件下各阶段的病毒颗粒结构,以及病毒与两受体的复合物,共10个原子或近原子水平高分辨率冷冻电子显微镜结构,并结合表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)和脂质体模拟试验等分子水平试验,系统地阐述了埃可病毒11型利用CD55和FcRn"双受体系统"入侵细胞的分子机制.埃可病毒11型利用其VP2、VP3结构域与吸附受体CD55的3、4两个短同源重复(short consensus repeat,SCR)结构域结合,结合后病毒颗粒不发生变构.病毒与脱衣壳受体Fc Rn结合之后,开始发生变构,并可在脂质体膜的辅助作用下释放遗传物质完成脱衣壳.与埃可病毒6型不同的是,埃可病毒11型结合FcRn之后在中性条件下即可起始变构.本项研究解析了重要病原埃可病毒11型侵染细胞的分子结构基础,并进一步完善了非囊膜病毒的"双受体"入侵模型.

关键词：埃可病毒11型肠道病毒冷冻电子显微镜入侵双受体系统 CD55 FcRn

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

中国CVA6 D3基因亚型B细胞抗原表位氨基酸差异分析及VLPs初步制备

引用

国际病毒学杂志 2022年第6期29卷 449-454页

作者：李晓亮王聪聪王蕊李冀琛宋洋路环环肖金波刘莹宋敬东刘一志张勇孙强徐希柱山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250024 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室、国家卫生健康委员会生物安全重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 潍坊医学院基础医学院 261053

目的分析中国流行的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)D3基因亚型中的D3a和D3b分支序列结构蛋白B细胞抗原表位氨基酸差异性来优化设计CVA6病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)疫苗。方法对GenBank下载的含有P1区核苷酸CVA6序列,... 详细信息

目的分析中国流行的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)D3基因亚型中的D3a和D3b分支序列结构蛋白B细胞抗原表位氨基酸差异性来优化设计CVA6病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)疫苗。方法对GenBank下载的含有P1区核苷酸CVA6序列,使用MEGA.11.0软件基于VP1序列采用最大似然法构建进化树划分基因型及亚型。采用在线工具WebLogo并结合CVA6 B细胞抗原表位研究的相关文献,对D3a和D3b分支序列VP1-VP3区B细胞抗原表位氨基酸差异性分析,为筛选疫苗候选株进行CVA6 VLP的制备。结果D3a与D3b分支序列在VP1 N末端P27位点分别是天冬酰胺(96.2%)和丝氨酸(92.9%);在VP3 N末端P60位点为甘氨酸(98.8%)和丝氨酸(60.0%)。基于上述差异性选择具有D3a(VP3-N-P60)和D3b(VP1-N-P27)两分支序列共有的B细胞抗原表位D3a-JX2018(GenBank accession number:MN845862)作为疫苗候选株,并成功制备了CVA6 VLP。结论本研究为疫苗候选株的选择提供了新的思路,为日后CVA6 VLPs疫苗和免疫诊断试剂的研发提供了基础。

关键词：柯萨奇病毒A6型基因亚型氨基酸差异 B细胞抗原表位病毒样颗粒疫苗

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：