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中国气象学会2007年年会

作者：殷实王炜罡葛茂发中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京分子科学国家实验室

黑碳气溶胶由于其对大气辐射平衡及气候的影响而受到高度重视,碘化学则是大气化学中十分重要的研究领域。然而对于卤素化合物尤其含碘化合物与黑碳气溶胶表面相互作用的研究还少有报道。本文首次研究了烷基碘(CH3I、C2H5I、i?C3H7I)在... 详细信息

黑碳气溶胶由于其对大气辐射平衡及气候的影响而受到高度重视,碘化学则是大气化学中十分重要的研究领域。然而对于卤素化合物尤其含碘化合物与黑碳气溶胶表面相互作用的研究还少有报道。本文首次研究了烷基碘(CH3I、C2H5I、i?C3H7I)在黑碳表面的吸附,并得到298K下,CH3I(2-4Torr)在黑碳表面的吸附系数为(1.03±0.15)×10-2;而C2H5I、i?C3H7I与黑碳表面相互作用使黑碳表面发生钝化,吸附系数与暴露时间相关,在黑碳表面的初始吸附系数分别为(2.3±0.9)×10-2,(9.5±3.8)×10-2。

关键词：非均相过程流动管烷基碘黑碳大气化学

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烷基碘在黑碳表面的吸附研究

烷基碘在黑碳表面的吸附研究

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2007年中国气象学会年会

作者：殷实王炜罡葛茂发北京分子科学国家实验室，北京，100080 中国科学院化学研究所，分子动态与稳态结构国家重点实验室

黑碳气溶胶由于其对大气辐射平衡及气候的影响而受到高度重视，碘化学则是大气化学中十分重要的研究领域。然而对于卤素化合物尤其含碘化合物与黑碳气溶胶表面相互作用的研究还少有报道。本文首次研究了烷基碘(CH3I、C2H5I、i-C3H7I)在... 详细信息

黑碳气溶胶由于其对大气辐射平衡及气候的影响而受到高度重视，碘化学则是大气化学中十分重要的研究领域。然而对于卤素化合物尤其含碘化合物与黑碳气溶胶表面相互作用的研究还少有报道。本文首次研究了烷基碘(CH3I、C2H5I、i-C3H7I)在黑碳表面的吸附，并得到298K下，CH3I(2-4 Torr)在黑碳表面的吸附系数为(1.03士0.15)×10<'-2：而C2H5I、i-C3H7I与黑碳表面相互作用使黑碳表面发生钝化，吸附系数与暴露时间相关，在黑碳表面的初始吸附系数分别为(2.3±0.9)×10<'-2，(9.5±3.8)×10<'-2。

关键词：烷基碘黑碳表面大气化学气溶胶

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以G-四链体为靶标的抗肿瘤药物虚拟筛选、分子机理及生物活性研究

以G-四链体为靶标的抗肿瘤药物虚拟筛选、分子机理及生物活性研究

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第三届国际理论化学、分子模拟和生命科学研讨会暨第三届北京宏剑公司用户大会

作者：李骞李旭东向俊峰孙红霞张虹刘岩周秋菊唐亚林徐筱杰北京分子科学国家实验室分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院化学研究所北京100080 北京大学化学与分子工程学院

真核生物染色体末端存在端粒结构,人体端粒DNA 由5'-TTAGGG-3'重复单元组成，在生理条件下可通过鸟嘌呤碱基间的Hoogsteen 氢键形成G-四链体。研究表明,正常体细胞中通常无端粒酶的表达,而85％以上的肿瘤细胞中端粒酶表达呈阳性... 详细信息

真核生物染色体末端存在端粒结构,人体端粒DNA 由5'-TTAGGG-3'重复单元组成，在生理条件下可通过鸟嘌呤碱基间的Hoogsteen 氢键形成G-四链体。研究表明,正常体细胞中通常无端粒酶的表达,而85％以上的肿瘤细胞中端粒酶表达呈阳性,这说明端粒酶与细胞的恶性转化及维持分裂增殖可能具有密切的关系。G-四链体结构能够有效抑制端粒酶的活性,由此,以G-四链体为靶点来寻求能够诱导、稳定或识别四链体结构的小分子是当前研究开发抗肿瘤药物的重要途径和热点研究领域之一。文献报道蒽醌类化合物能够通过稳定G-四链体结构从而抑制肿瘤细胞增值,本文根据已知分子结构与生物活性的38个1,4-二取代蒽醌类化合物的细胞活性数据,通过分子模拟技术,建立了以G-四链体为靶标的抗肿瘤药效团模型。模型中含有两个氢键受体,两个疏水中心和一个正电中心。此模型具有较好的相关性(训练集抗肿瘤细胞增值IC50 预测值与实验值线性相关系数为0.86)。我们应用此模型在中草药三维结构数据库中进行虚拟筛选(数据库中的每个分子最多有100个构象可供选择),在筛选结果中选择了15个化合物为研究对象,通过光谱/波谱学分析、端粒重复扩增实验和抗肿瘤细胞增殖实验进行了分子机理和生物活性研究,研究表明平面型分子主要作用在G-四链体顶部的平坦区域,而链状分子主要是镶嵌在G-四链体侧面的沟槽中,化合物能够显著稳定G-四链体结构,本研究工作基于生物靶分子的识别,发展了一种发现和设计抗肿瘤先导分子结构的方法:通过能识别和稳定G-四链体的分子及其衍生物的细胞活性数据,构建药效团模型,在化合物库中进行虚拟筛选,由分子对接初步确定结合模式,利用分子动力学模拟预测活性,再结合三维构效关系进一步提出分子结构的改造方案,从而可以获得高活性的抗肿瘤化合物的结构,为新型抗肿瘤药物的研发提供基础。

关键词： G-四链体分子模拟抗肿瘤药物虚拟筛选生物活性

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LFMO和NBO的定域性和作用能解析

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高等学校化学学报 2006年第1期27卷 96-99页

作者：刘向文包鹏虞忠衡中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

为分析苯并分子C12H6的垂直共振能(VRE),建立了定域片断分子轨道(LFMO)和自然键轨道(NBO)两种基组,并在两种基组之上进行NBO能量分析和Morokum a能量分解.在NBO能量分析中,两种基组的VRE都是稳定的;而在Morokum a能量分解中,VRE的稳定... 详细信息

为分析苯并分子C12H6的垂直共振能(VRE),建立了定域片断分子轨道(LFMO)和自然键轨道(NBO)两种基组,并在两种基组之上进行NBO能量分析和Morokum a能量分解.在NBO能量分析中,两种基组的VRE都是稳定的;而在Morokum a能量分解中,VRE的稳定性取决于基组.在NBO能量分析中,Fock矩阵的一次性对角化忽视了σ体系和π体系之间的电子耦合作用.故NBO基组和NBO能量分析方法在计算VRE时似乎都不合理.

关键词：自然键轨道定域片断分子轨道一次性对角化 Morokuma能量分解垂直共振能

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DFT能量分解和氮苄叉基苯胺分子π电子离域能的研究

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高等学校化学学报 2006年第8期27卷 1526-1529页

作者：马艳平包鹏虞忠衡中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

为了探索密度泛函理论(DFT)方法中氮苄叉基苯胺分子π电子离域的本质,介绍了将非平面分子氮苄叉基苯胺分子的DFT能量分成π和σ的方法,并将π和σ电子能量分成单电子能部分:动能ΔEKπ(θ),ΔEKσ(θ)和位能ΔEPπ(θ),ΔEPσ(θ);双电... 详细信息

为了探索密度泛函理论(DFT)方法中氮苄叉基苯胺分子π电子离域的本质,介绍了将非平面分子氮苄叉基苯胺分子的DFT能量分成π和σ的方法,并将π和σ电子能量分成单电子能部分:动能ΔEKπ(θ),ΔEKσ(θ)和位能ΔEPπ(θ),ΔEPσ(θ);双电子相互作用部分:库仑作用ΔEπJπ(θ),ΔEσJσ(θ),ΔEπJσ(θ)和交换相关作用ΔEπXπC(θ),ΔEσXCσ(Δ)以及ΔEπXCσ(θ),分析了垂直离域能ΔEV的稳定性及π电子离域对π和σ体系的影响.在B3LYP/6-31G*,6-311G*,6-31G(2d),6-311G(2d)水平下的计算结果表明,与经典观点不同,π电子的离域是失稳定的,且平面时失稳定性最强;分析各个能量分量表明,在π电子的离域过程中,π和σ体系均对基组较敏感,π体系本身单电子能的影响大于σ体系,π电子离域对双电子部分作用的影响主要体现在π-σ的耦合作用上.

关键词：密度泛函能量分解 π电子离域氮苄叉基苯胺

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氮苄叉基苯胺分子的平面扭曲驱动力的DFT研究

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化学学报 2006年第13期64卷 1304-1308页

作者：马艳平包鹏虞忠衡中国科学院化学研究所分子动态稳态国家重点实验室北京100080

为了探索DFT方法中氮苄叉基苯胺分子的扭曲驱动力,通过把非平面氮苄叉基苯胺(NBA)分子的DFT能量分成π和σ的方法,分析了垂直离域能?EV(θ)及σ-π轨道作用能?Eσπ(θ)的失稳定性,并讨论了在扭曲过程中它们所起的作用.在B3LYP/6-31G*,6... 详细信息

为了探索DFT方法中氮苄叉基苯胺分子的扭曲驱动力,通过把非平面氮苄叉基苯胺(NBA)分子的DFT能量分成π和σ的方法,分析了垂直离域能?EV(θ)及σ-π轨道作用能?Eσπ(θ)的失稳定性,并讨论了在扭曲过程中它们所起的作用.在B3LYP/6-31G*,6-311G*,6-31G(2d),6-311G(2d)水平下的计算结果显示:与经典观点不同,π电子的离域是失稳定的,且平面时失稳定性最强,是分子扭曲的动力;但σ-π轨道作用也是失稳定的,随着扭角的增大其失稳定性增强,是分子扭曲的阻力.NBA分子的大扭角构象,是包含π-π,σ-π轨道作用在内的各种电子相互作用共同作用的结果.

关键词：能量分解密度泛函理论垂直离域能 δ-π轨道作用能氮苄又基苯胺

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假根羽藻(Bryopsis corticulans)LHCⅡ的聚集态对Chl a电子激发态性质的影响

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科学通报 2006年第9期51卷 1027-1033页

作者：左萍陈晖吴义室沈世华王鹏艾希成张建平李良璧匡廷云中国科学院化学研究所分子科学中心分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080 中国科学院植物研究所光合作用与环境分子生理学重点实验室北京100093

采用稳态吸收、荧光和皮秒时间分辨荧光光谱手段研究了假根羽藻(Bryopsis corticulans)捕光色素-蛋白复合物LHCⅡ(light-harvesting complexⅡ)的单体、三聚体和寡聚体中叶绿素(Chl)a的电子激发态性质．稳态光谱结果表明：选择性激发Chl... 详细信息

采用稳态吸收、荧光和皮秒时间分辨荧光光谱手段研究了假根羽藻(Bryopsis corticulans)捕光色素-蛋白复合物LHCⅡ(light-harvesting complexⅡ)的单体、三聚体和寡聚体中叶绿素(Chl)a的电子激发态性质．稳态光谱结果表明：选择性激发Chla或Chlb时,LHCⅡ寡聚体中Chla的荧光强度减弱并非由Chlb→Chla传能效率的降低造成,主要是由聚集体内激发态Chla的快速猝灭机制引起的．时间分辨荧光动力学分析表明：不同聚集态LHCⅡ中Chla的荧光动力学遵从双指数衰减行为,长寿命组分(4．1～4．7ns)来源于LHCⅡ中Chla的荧光发射；短寿命组分(135-540ps)归属为组成聚集体的蛋白单体内Chla分子间的激发态能量平衡过程,该能量平衡过程的时间尺度因LHCⅡ的聚集程度不同而异,在寡聚体(135ps)中比在单体(540ps)和三聚体(520ps)中的平衡显著加快．上述结果表明,LHCⅡ的三聚体向PSⅡ反应中心传能的本领最强,而寡聚体则具有较强的猝灭LHCⅡ内Chla电子激发态的能力,这可能是一种通过LHCⅡ分子结构的转换来实现光保护功能的机制．

关键词：捕光色素-蛋白复合物时间分辨荧光能量传递假根羽藻(Bryopsis corticulans)

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七叶一枝花中薯蓣皂苷的分离及结构鉴定研究

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分析科学学报 2006年第5期22卷 563-566页

作者：崔艳张秀凤刘扬严宝珍北京化工大学理学院北京100029 中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室北京100080

本文利用高效液相色谱-串联质谱联用方法研究了七叶一枝花中的薯蓣皂苷。实验采用高效液相色谱分离了七叶一枝花中的3种薯蓣皂苷;通过与电喷雾质谱联用获得了这几种化合物的分子量信息;再用MS/MS获得了这几种化合物进一步的结构信息。... 详细信息

本文利用高效液相色谱-串联质谱联用方法研究了七叶一枝花中的薯蓣皂苷。实验采用高效液相色谱分离了七叶一枝花中的3种薯蓣皂苷;通过与电喷雾质谱联用获得了这几种化合物的分子量信息;再用MS/MS获得了这几种化合物进一步的结构信息。采用此方法可快速分析鉴定从七叶一枝花中分离得到的薯蓣皂苷。

关键词：七叶一枝花甾体皂苷薯蓣皂苷高效液相色谱-串联质谱

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CINO和NSCl离子解离过程研究

CINO和NSCl离子解离过程研究

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第十四届全国分子光谱学术会议

作者：姚立葛茂发中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室

结合紫外光电子能谱-飞行时间质谱和量子化学计算研究了NXCl（X=O,S）离子的解离。在紫外光辐射电离后,ClNO+直接发生Cl—N键的断裂;而NSCl+除了发生S-Cl键的直接断裂,还发生异构化反应,生成更稳定的异构体SNCl+。实验结果表明,作者研... 详细信息

结合紫外光电子能谱-飞行时间质谱和量子化学计算研究了NXCl（X=O,S）离子的解离。在紫外光辐射电离后,ClNO+直接发生Cl—N键的断裂;而NSCl+除了发生S-Cl键的直接断裂,还发生异构化反应,生成更稳定的异构体SNCl+。实验结果表明,作者研制的紫外光电子能谱-飞行时间质谱可以作为研究气相瞬态物种的有力手段。

关键词： CINO NSCl 紫外光电子能谱-飞行时间质谱离子解离

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RSSR热解的紫外光电子能谱研究

RSSR热解的紫外光电子能谱研究

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第十四届全国分子光谱学术会议

作者：姚立葛茂发中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室中国科学院化学研究所分子动态与稳态结构国家重点实验室

利用紫外光电子能谱研究了RSSR的热解过程。对于R=CH3,CH3CH2,（CH3）2CH的分子,通过分子筛的热解可以产生稳定的RS自由基。但对于R=（CH3）3C,实验结果表明C-S键比S-S键更容易发生断裂,形成异裂产物。

关键词： RSSR 紫外光电子能谱热解

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