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黑龙江畜牧兽医 2019年第21期 18-21,28,176页

作者：海丽丽李婷婷刘博毛伟曹金山内蒙古农业大学兽医学院呼和浩特010018 农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018

为了探讨TLR4与大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织中前列腺素E2(PGE2)蓄积的相关性,试验分别用1×10-5 mol/L和1×10-6 mol/L的TLR4抑制剂处理体外培养的大肠杆菌DH5α感受态细胞和大肠杆菌突变株JE5505(脂蛋白缺失菌)感染的奶牛... 详细信息

为了探讨TLR4与大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织中前列腺素E2(PGE2)蓄积的相关性,试验分别用1×10-5 mol/L和1×10-6 mol/L的TLR4抑制剂处理体外培养的大肠杆菌DH5α感受态细胞和大肠杆菌突变株JE5505(脂蛋白缺失菌)感染的奶牛子宫内膜组织,用实时荧光定量PCR方法检测组织中COX-2和mPGES-1 mRNA的表达,用ELISA法检测组织上清液中PGE2的分泌情况。结果表明:大肠杆菌DH5α感受态细胞和大肠杆菌突变株JE5505感染的奶牛子宫内膜组织中COX-2和mPGES-1 mRNA的表达量及组织上清液中PGE2的分泌量明显升高,而TLR4抑制剂能明显降低大肠杆菌DH5α感受态细胞和大肠杆菌突变株JE5505感染的奶牛子宫内膜组织中COX-2和mPGES-1 mRNA的表达量及组织上清液中PGE2的分泌量。说明TLR4可调控大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织中炎症介质PGE2的分泌。

关键词：大肠杆菌 TLR4 PGE2 COX-2 mPGES-1 奶牛子宫内膜组织炎症

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EP2受体介导大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织损伤机制研究

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黑龙江畜牧兽医 2019年第23期 11-14,17,167,168页

作者：张超王灵芮毛伟刘博曹金山内蒙古农业大学兽医学院呼和浩特010018 农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018

为了探索EP2受体是否参与调节大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织损伤,试验以体外培养的奶牛子宫内膜组织为研究对象,采用实时荧光定量PCR、免疫荧光和H.E.染色等方法对EP2受体激动剂处理的大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织中损伤因子HMGB-1... 详细信息

为了探索EP2受体是否参与调节大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织损伤,试验以体外培养的奶牛子宫内膜组织为研究对象,采用实时荧光定量PCR、免疫荧光和H.E.染色等方法对EP2受体激动剂处理的大肠杆菌感染的奶牛子宫内膜组织中损伤因子HMGB-1和HABP1的表达以及子宫内膜组织损伤情况进行了研究。结果表明:与空白对照组相比,用大肠杆菌处理后可极显著上调奶牛子宫内膜组织中HMGB-1和HABP1 mRNA及蛋白的表达,而用大肠杆菌和EP2受体激动剂共同处理组织后HMGB-1和HABP1 mRNA及蛋白的表达进一步升高。用大肠杆菌处理的子宫内膜组织上皮细胞部分脱落,腺细胞崩解、坏死,腺体轮廓不清晰;而用大肠杆菌和EP2受体激动剂共同处理时,子宫内膜组织损伤情况进一步加强,上皮细胞完全脱落,腺体崩解融合更加严重。说明EP2受体能够介导大肠杆菌引起的奶牛子宫内膜组织损伤。

关键词：奶牛子宫内膜组织大肠杆菌 EP2受体高迁移率蛋白B-1 透明质酸损伤

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斯氏副柔线虫SHR基因表达载体的构建及生物信息学分析

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中国农业大学学报 2019年第6期24卷 116-123页

作者：赵学亮王姝懿呼和巴特尔冯陈晨孙柯王文龙内蒙古农业大学兽医学院/农村农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区综合疾病预防控制中心呼和浩特010031

为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行... 详细信息

为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行生物信息学分析。结果表明:克隆获得SHR基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点为6.09,无信号肽和跨膜区;磷酸化预测含有29个磷酸化位点;结构分析发现,α-螺旋构成二级结构的主要成分,亲水性氨基酸比例超过60%;抗原表位预测表明,SHR蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白。推测SHR有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原。

关键词：原核表达载体 SHR基因抗原表位生物信息学

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布鲁菌疫苗株A19全基因组测序及功能分析

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中国兽医学报 2019年第9期39卷 1770-1775页

作者：王姝懿赵学亮孙珂呼和巴特尔王文龙内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区综合疾病预防控制中心内蒙古呼和浩特010031

采用Illumina Hiseq和PacBio测序技术对布鲁菌A19进行全基因组测序,并进行GO注释、VFDB注释、ARDB注释、CRISPR以及基因岛预测等生物信息学分析。结果显示:A19全基因组大小为3.28 Mb,GC含量分布未见异常,含1个CRISPR和16个基因岛,通过G... 详细信息

采用Illumina Hiseq和PacBio测序技术对布鲁菌A19进行全基因组测序,并进行GO注释、VFDB注释、ARDB注释、CRISPR以及基因岛预测等生物信息学分析。结果显示:A19全基因组大小为3.28 Mb,GC含量分布未见异常,含1个CRISPR和16个基因岛,通过GO数据库注释发现,参与生物学途径的基因5 311个、细胞组份基因有3 350个、分子功能基因有3 078个;通过VFDB注释发现,与毒力相关的基因82个,主要包括脂多糖(LPS)、纤连结合蛋白、virB四型分泌系统等毒力相关因子;通过ARDB数据库注释发现,与耐药相关的基因1个,该基因的表达产物通过影响焦磷酸异构酶的表达,从而产生对抗生素的耐药。本试验通过A19全基因组测序,为布鲁菌病的治疗和致病机制的研究及疫苗的开发奠定了基础。

关键词：布鲁菌布鲁菌疫苗株A19 全基因组测序功能分析

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骆驼锥虫病研究现状

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动物医学进展 2019年第6期40卷 102-106页

作者：苏日娜哈斯苏荣内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古骆驼研究院内蒙古阿拉善盟巴丹吉林镇737300

锥虫病是世界卫生组织认定的由锥虫引发的主要的人畜共患原虫病之一。在我国流行的主要是骆驼、马、牛等家畜的伊氏锥虫病。骆驼锥虫病可造成骆驼日渐消瘦、心肌衰竭甚至死亡,随着疾病的蔓延会造成较大的经济损失。通常使用苏拉明、贝... 详细信息

锥虫病是世界卫生组织认定的由锥虫引发的主要的人畜共患原虫病之一。在我国流行的主要是骆驼、马、牛等家畜的伊氏锥虫病。骆驼锥虫病可造成骆驼日渐消瘦、心肌衰竭甚至死亡,随着疾病的蔓延会造成较大的经济损失。通常使用苏拉明、贝尼尔、安锥赛等药物可达到防治该病的目的。为了让更多的人们较为系统地了解和有效防治骆驼锥虫病,从骆驼锥虫病的病原体特征、流行病学、临床症状、病理变化和防治措施等方面进行了综述。此外,对骆驼锥虫病的防治提出了新的方法和思路,为骆驼锥虫病的诊断、治疗及预防提供参考。

关键词：骆驼伊氏锥虫防治

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布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析

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中国人兽共患病学报 2019年第11期35卷 1002-1008页

作者：王姝懿赵学亮孙柯呼和巴特尔王文龙内蒙古农业大学兽医学院/农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区综合疾病预防控制中心呼和浩特010031

目的探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究。方法采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank上的8株菌进行比较基因组学解析。A19基因组3286167 bp,预测3371个基... 详细信息

目的探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究。方法采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank上的8株菌进行比较基因组学解析。A19基因组3286167 bp,预测3371个基因,GC含量57.25%。通过注释COG库,对应基因有2560个,将其归入22类COG中;根据比对KEGG库,得到2544个基因,共参与33类代谢通路。结果综合两个数据库结果发现,大多数A19预测基因中的基因功能主要与膜运输、氨基酸转运及碳水化合物代谢有关。结论通过分析发现,A19和猪羊牛种布鲁氏菌之间存在一定差异,并找出牛种毒力基因。本实验通过测序A19全基因组,为布鲁菌疫苗的研究提供思路。

关键词：布鲁氏菌布鲁菌疫苗株A19 全基因组测序比较基因组学研究

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绵羊捻转血矛线虫流行病学调查及耐药性检测

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家畜生态学报 2019年第11期40卷 70-72页

作者：赵学亮额叶勒德格海鹰米其德孙柯吕旭王文龙内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古鄂尔多斯市乌审旗动物疫病控制中心内蒙古鄂尔多斯017300

为调查乌审旗地区捻转血矛线虫感染及耐药性情况,通过粪便中虫卵定性定量及剖检法对乌审旗不同地区的绵羊进行捻转血矛线虫感染情况调查,并开展了驱虫效果比较试验。结果表明,该地区绵羊捻转血矛线虫病流行比较严重,平均感染率和平均感... 详细信息

为调查乌审旗地区捻转血矛线虫感染及耐药性情况,通过粪便中虫卵定性定量及剖检法对乌审旗不同地区的绵羊进行捻转血矛线虫感染情况调查,并开展了驱虫效果比较试验。结果表明,该地区绵羊捻转血矛线虫病流行比较严重,平均感染率和平均感染强度分别为89%和416.92×200个/g,捻转血矛线虫对伊维菌素注射剂和阿苯达唑片剂产生了严重的耐药性。

关键词：绵羊捻转血矛线虫耐药性检测

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麝科动物的起源进化与遗传多样性研究进展

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家畜生态学报 2019年第8期40卷 8-13页

作者：肖宇辰伊丽孟根达来哈斯苏荣内蒙古农业大学食品科学与工程学院/乳品生物技术与工程教育部重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古医科大学附属医院内蒙古呼和浩特010050 内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古呼和浩特010018

对麝科动物的分子遗传学研究不仅可加深人们对麝科起源及物种形成的认识,而且对麝科动物群体遗传多样性的保护具有重要意义。随着现代高通量测序技术及分子遗传学、生物信息学的迅速发展,人们对麝科起源与进化进行了较为系统的研究,取... 详细信息

对麝科动物的分子遗传学研究不仅可加深人们对麝科起源及物种形成的认识,而且对麝科动物群体遗传多样性的保护具有重要意义。随着现代高通量测序技术及分子遗传学、生物信息学的迅速发展,人们对麝科起源与进化进行了较为系统的研究,取得了可喜成果。文章就近年来国内外对麝科动物的起源进化和遗传多样性研究进展进行回顾,揭示麝科动物的演化史,利用分子遗传标记、基因组学、转录组学等先进技术,研究麝科动物的遗传多样性以及麝香分泌相关机制或功能基因,并对未来麝科动物起源进化以及遗传多样性研究趋势进行了展望。

关键词：麝起源进化遗传多样性转录组基因组

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猪传染性胃肠炎病毒RT-PCR检测方法的建立及应用

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动物医学进展 2019年第9期40卷 29-33页

作者：杜雅楠李静刘艳成杜鹏包福祥内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古呼和浩特010018 兴安盟动物疫病预防控制中心内蒙古乌兰浩特137400

为建立一种操作简便、准确率高的检测方法,对内蒙古地区猪传染性胃肠炎流行情况进行调查,参考GenBank中收录的猪传染性胃肠炎病毒的N基因序列,设计合成了一对特异性引物,针对该基因建立了TGEV的RT-PCR检测方法。应用建立的RT-PCR方法对... 详细信息

为建立一种操作简便、准确率高的检测方法,对内蒙古地区猪传染性胃肠炎流行情况进行调查,参考GenBank中收录的猪传染性胃肠炎病毒的N基因序列,设计合成了一对特异性引物,针对该基因建立了TGEV的RT-PCR检测方法。应用建立的RT-PCR方法对从内蒙古地区7个盟市采集的204份猪腹泻样品进行了TGEV检测。结果显示,受检的204份样品中有24份样品呈现TGEV阳性,阳性率为11.76%。其中从赤峰市采集的样品TGEV阳性率最高,为20.83%;不同类型样品TGEV的检出率也有差异,其中肛门拭子的检出率最高(15.56%),其次是肠道样品(12.00%),粪便样品的检出率最低(7.87%)。表明所建立的RT-PCR检测方法灵敏度高、特异性强,可用于猪传染性胃肠炎病毒的快速检测。

关键词：猪传染性胃肠炎病毒反转录-聚合酶链反应检测

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基于比较基因组学分析的方法定位及注释双峰驼MHC基因

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中国农业科学 2018年第18期51卷 3591-3599页

作者：支立康额尔敦木图安希文王超王瑞包花尔王秀珍内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室

【目的】定位并注释双峰驼主要组织相容性复合体（major histocompatibility complex,MHC）基因序列,为进一步研究双峰驼MHC基因提供科学依据。【方法】运用比较基因组学方法,提取人类MHC（HLA）基因编码序列和牛MHC（BoLA）基因编码序... 详细信息

【目的】定位并注释双峰驼主要组织相容性复合体（major histocompatibility complex,MHC）基因序列,为进一步研究双峰驼MHC基因提供科学依据。【方法】运用比较基因组学方法,提取人类MHC（HLA）基因编码序列和牛MHC（BoLA）基因编码序列并分别与双峰驼转录本进行blastn基因序列比对,识别出相似度较高的scaffolds,通过分析HLA、BoLA基因序列比对在这些scaffolds上的位置顺序,对多条scaffolds进行拼接,得到双峰驼MHC的Pseudo chromosome;再分别提取HLA、BoLA全基因组序列与双峰驼已拼接的scaffolds进行基因组共线性分析,利用lastz建立起的Pseudo chromosome与HLA、BoLA全基因组序列的线性关系判断筛选出的scaffolds是否准确;然后通过分析MHC基因在两物种间的线性关系,在双峰驼参考基因组中提取出MHC基因序列,并对这些序列进行基因注释;最后根据得到的双峰驼MHC基因绘制系统进化树,研究其基因间的进化关系。【结果】通过对HLA、BoLA基因编码序列与双峰驼转录本用blastn进行序列比对,识别出了相似度较高的3条scaffolds,即NW011511766.1（全长4.1M）、NW011515227.1（全长1.2M）和NW011514613.1（全长15K）,对其拼接得到双峰驼MHC的Pseudo chromosome;利用lastz共线性分析,识别出HLA基因序列和BoLA基因序列并比对出其在双峰驼MHC基因的共线性区域。该区域与拼接得到的Pseudo chromosome一致,证明筛选出的scaffolds是准确的。并且发现Class-Ⅰ类和Class-Ⅲ类基因集中分布在NW011515227.1上,而Class-Ⅱ类基因集中分布在NW011511766.1和NW011514613.1上,进一步分析得知Class-Ⅱ类基因主要分布在NW011511766.1的3.5—4.1M的位置;将存在共线性区域的序列提取出来,与比对到双峰驼上的MHC基因的编码序列进行blat分析,结果在双峰驼基因组中共识别出24个与牛BoLA基因高度相似的基因,其中Ⅰ类基因1个,Ⅱ类10个,Ⅲ类基因13个。对双峰驼这24个MHC基因进行信息注释并绘制系统进化树,结果显示注释的Class-Ⅰ类和Class-Ⅱ类基因在同一分支。【结论】通过比较基因组学方法定位并注释了双峰驼的MHC基因,将双峰驼MHC基因序列定位到了3条scaffolds上,找到并注释了24个MHC基因,绘制了双峰驼MHC的Pseudo chromosome,为进一步研究双峰驼MHC基因奠定了理论基础。

关键词：双峰驼 MHC CBLA BoLA HLA 比较基因组学

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