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2015第十一届全国中西医结合灾害医学大会、江苏省中西医结合学会第二届灾害医学学术会议、中华卫生应急电子杂志第二届编委会会议暨2015江苏国际医疗器械科技博览会

作者：张腾飞冯凯岳茂兴周钢桥王志富郑琦涵翟芸史卫海张红星安徽医科大学解放军306临床学院解放军306医院特种医学实验中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室江苏大学附属常州市武进人民医院

目的:探讨白介素33(IL-33,interleukin-33)基因单核苷酸多态性(SNP,single nucleotidepo]ymorphism)与脓毒症发生风险及疾病严重程度的关联性。方法:采用病例-对照研究设计,标签SNP(tagging SNP,tagSNP)策略,应用美国Sequenom公司开发的MassARRAY时间飞行质谱技术完成对IL-33基因的标签SNPs分型。采用Logistic回归分析,校正性别、年龄、吸烟和饮酒、APACHEⅡ评分、慢性病状态和脓毒症病因等混杂因素的影响后,评价IL-33单核苷酸多态性与脓毒症的发生风险,以及脓毒症继发的严重脓毒症、脓毒症休克、死亡等表型的相关性。结果:在所选的7个IL-33标签SNPs(rs10118795,rs16924159,rs1891385,rs2210463,rs72614079,rs76864631,rs7849201)中,rs76864631不符合Hardy-Weinberg平衡定律,其余6个多态位点及单体型与脓毒症的发生风险和疾病的严重程度均无明显相关性。结论:在中国人群,IL-33基因多态性在脓毒症的发生、发展和病程转归中可能不发挥重要作用。

关键词：白介素严重程度基因单核苷酸多态性严重脓毒症多器官功能障碍综合征关联研究易感性中国人群

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放线菌蛋白质组学研究进展

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生物工程学报 2014年第7期30卷 1044-1058页

作者：张瑶徐平李文均陶勇中国科学院微生物研究所北京100101 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心北京102206 云南大学云南省微生物研究所西南微生物多样性教育部重点实验室云南昆明650091

蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,蛋白质组学旨在阐明生物体全部或部分蛋白质在生命活动中的作用和功能。随着组学理论基础和技术方法的逐渐成熟,蛋白质组学的研究被提高到了前所未有的高度。放线菌与人类的生产和生... 详细信息

蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,蛋白质组学旨在阐明生物体全部或部分蛋白质在生命活动中的作用和功能。随着组学理论基础和技术方法的逐渐成熟,蛋白质组学的研究被提高到了前所未有的高度。放线菌与人类的生产和生活关系极为紧密,是产生抗生素和酶制剂的主要来源。近130多年的放线菌系统学研究和2001年模式菌株的全基因组测序,为功能基因组研究奠定了基础。与先前的基因组学和转录组学相比,放线菌蛋白质组学能更直接、更准确地解释生命现象,得到了快速发展,并受到研究者的高度关注。近年来放线菌蛋白质组学的研究主要包括复杂形态分化和发育过程、非凡的环境适应能力、与植物共生固氮、代谢机理及特殊功能、病原放线菌致病性和筛查天然产物等几个方向,为进一步促进放线菌蛋白质组学发展奠定了基础。

关键词：放线菌蛋白质组学双向电泳质谱机理

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肝脏细胞在生物活性物质代谢调控中的协作作用

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中国科学：生命科学 2014年第2期44卷 175-184页

作者：李严严郝运伟姜颖贺福初军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 清华大学生命科学学院北京100086

肝实质细胞和非实质细胞是肝脏功能的物质和结构基础.肝实质细胞是肝脏的主要细胞类型之一,承担和执行肝脏代谢、信号转导、解毒和稳态调节等多种功能.而非实质细胞也必不可少,主要包括星型细胞、肝窦内皮细胞、枯否细胞、自然杀伤细胞... 详细信息

肝实质细胞和非实质细胞是肝脏功能的物质和结构基础.肝实质细胞是肝脏的主要细胞类型之一,承担和执行肝脏代谢、信号转导、解毒和稳态调节等多种功能.而非实质细胞也必不可少,主要包括星型细胞、肝窦内皮细胞、枯否细胞、自然杀伤细胞和隐窝细胞等,具有物质和信号转运、吞噬、抗原提呈、免疫耐受等功能.目前,有关肝脏生理功能和病理机制的研究主要集中在组织、细胞和差异分子的水平,单细胞的生理和病理功能研究也越来越深入,而肝脏细胞协作的研究比较少,系统性总结也鲜有报道.本文从肝脏细胞相互协作的角度,对肝脏的生理功能及病理机制进行探讨,为全面了解肝细胞生理功能及肝脏疾病的致病机理提供参考.

关键词：肝实质细胞非实质细胞肝细胞协作代谢调控

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一个中国遗传性血色病家系致病基因的突变分析

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遗传 2014年第11期36卷 1152-1158页

作者：李元丰张红星张海涛彭晓波白丽丽贺福初邱泽武周钢桥中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 蛋白质药物国家工程研究中心北京102206 国家蛋白质科学中心(北京) 北京102206 中国人民解放军第三〇七医院中毒救治科北京100071

遗传性血色病(Hereditary hemochromatosis,HHC)是一种罕见的常染色体隐性遗传病。本课题组招募了一个HHC的近亲婚配家系,包括一名患HHC的先证者以及同一代的4名不患HHC的成员。通过对该HHC先证者进行全外显子组测序,在目前已知的与遗... 详细信息

遗传性血色病(Hereditary hemochromatosis,HHC)是一种罕见的常染色体隐性遗传病。本课题组招募了一个HHC的近亲婚配家系,包括一名患HHC的先证者以及同一代的4名不患HHC的成员。通过对该HHC先证者进行全外显子组测序,在目前已知的与遗传性血色病相关的5个基因(HAMP、HJV、TFR2、FPN和HFE)中,发现在铁调素调节蛋白(Hemojuvelin,HJV)的编码基因HJV上存在两个纯合突变(c.G18C和***962_963AA)。其中,前者能够引起HJV蛋白发生p.Q6H的改变,但该突变的危害性较小,可能与血色病的发病无关;后者能够引起HJV蛋白发生p.C321X的改变,从而翻译出缺失糖基磷脂肌醇锚定结构域的截短型HJV蛋白。除了HJV基因上的纯合突变外,该先证者还携带了其他12个纯合突变,但这些突变的危害性均不强且其所在基因的功能与铁代谢无关。本实验室内部测序数据显示,在一般中国人群中不存在p.C321X突变,提示HJV基因上的p.C321X纯合突变可能是该HHC患者的致病性突变。与此相一致的是,4名不患HHC的家系成员中该位点为野生型纯合子或杂合子,均非p.C321X纯合子。文章首次报道了HJV p.C321X纯合突变可导致HHC,该结果将有助于遗传性血色病的基因诊断和产前咨询。

关键词：遗传性血色病 HJV基因全外显子组测序

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树突状细胞对Th17细胞分化的调节作用

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细胞与分子免疫学杂志 2014年第2期30卷 216-219页

作者：杨造鹏唐丽北京大学生命科学学院北京100871 蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京102206

树突状细胞(DC)作为最主要的抗原提呈细胞(APC),是连接先天免疫和继发免疫的桥梁。在病原微生物的刺激下,APC会将抗原提呈给T细胞,进而引起初始T细胞的活化并分化成为不同的效应细胞。Th17是CD4辅助性T细胞的一个亚群,在机体抗感染和自... 详细信息

树突状细胞(DC)作为最主要的抗原提呈细胞(APC),是连接先天免疫和继发免疫的桥梁。在病原微生物的刺激下,APC会将抗原提呈给T细胞,进而引起初始T细胞的活化并分化成为不同的效应细胞。Th17是CD4辅助性T细胞的一个亚群,在机体抗感染和自身免疫性疾病中发挥重要作用。Th17细胞的分化过程主要受来自APC(外源信号)和T细胞自身内源信号的调控,其中外源信号主要包括DC上的各类受体以及胞内的节点分子所介导的信号。本文主要概述了树突状细胞所介导的信号是如何影响Th17细胞的分化。

关键词：树突状细胞 Th17 分化

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中国人群白介素33基因单核苷酸多态性与脓毒症易感性及严重程度的关联研究

中国人群白介素33基因单核苷酸多态性与脓毒症易感性及严重程度的...

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2015第十一届全国中西医结合灾害医学大会暨江苏省中西医结合学会第二届灾害医学学术会议

作者：张腾飞冯凯岳茂兴周钢桥王志富郑琦涵翟芸史卫海张红星安徽医科大学解放军306临床学院安徽医科大学解放军306临床学院解放军306医院特种医学实验中心解放军306医院特种医学实验中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室江苏大学附属常州市武进人民医院

目的:探讨白介素33(IL-33,interleukin-33)基因单核苷酸多态性(SNP,single nucleotide polymorphism)与脓毒症发生风险及疾病严重程度的关联性. 方法:采用病例-对照研究设计,标签SNP(tagging SNP,tagSNP)策略,应用美国Sequenom公司开发的MassARRAY时间飞行质谱技术完成对IL-33基因的标签SNPs分型.采用Logistic回归分析,校正性别、年龄、吸烟和饮酒、APACHEⅡ评分、慢性病状态和脓毒症病因等混杂因素的影响后,评价IL-33单核苷酸多态性与脓毒症的发生风险,以及脓毒症继发的严重脓毒症、脓毒症休克、死亡等表型的相关性. 结果:在所选的7个IL-33标签SNPs(rs1O118795,rs16924159,rs1891385,rs2210463,rs72614079,rs76864631,rs7849201)中,rs76864631不符合Hardy-Weinberg平衡定律,其余6个多态位点及单体型与脓毒症的发生风险和疾病的严重程度均无明显相关性. 结论:在中国人群,IL-33基因多态性在脓毒症的发生、发展和病程转归中可能不发挥重要作用.

关键词：脓毒症发病机制白介素33 基因多态性

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不同转移潜能的肝癌细胞系定量磷酸化蛋白质组学研究

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安徽医科大学学报 2014年第11期49卷 1595-1599页

作者：衣泰龙田苗苗翟琳辉徐忠伟杨晓明徐平安徽医科大学研究生院合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

目的研究具有不同侵袭转移能力的肝癌细胞系的磷酸化蛋白质组的动态变化。方法首先用含有重稳定同位素标记的精氨酸和赖氨酸的培养基对MHCC97-L进行重稳定同位素标记氨基酸的细胞培养(SILAC);用含有轻稳定同位素标记的精氨酸和赖氨酸的... 详细信息

目的研究具有不同侵袭转移能力的肝癌细胞系的磷酸化蛋白质组的动态变化。方法首先用含有重稳定同位素标记的精氨酸和赖氨酸的培养基对MHCC97-L进行重稳定同位素标记氨基酸的细胞培养(SILAC);用含有轻稳定同位素标记的精氨酸和赖氨酸的培养基对MHCC97-H进行SILAC标记。将完成标记的两种肝癌细胞系的蛋白质按照1∶1混合,并用trypsin进行溶液消化;对消化得到的肽段进行除盐,并通过固相金属离子亲和色谱(IMAC)的方法进行磷酸化肽段的富集。磷酸化肽段通过质谱进行检测,并通过MaxQuant进行鉴定和定量。最后通过Z检验进行统计学分析,并对差异调控的磷酸化肽对应的蛋白质进行基因本体(GO)分析和STRING网络分析。结果最终鉴定了918个磷酸化肽段,其中806个磷酸化肽段的磷酸化位点可以定位和定量。通过Z检验,共得到了91个磷酸化修饰水平发生变化的肽段,对应25个磷酸化蛋白质。通过对这25个蛋白质进行GO分析发现,细胞骨架重塑过程中的蛋白质在MHCC97-L和MHCC97-H中磷酸化修饰形式严重失调。通过STRING分析发现,NES和PRKCA处于网络的重要节点位置。结论细胞骨架重塑这一生物学过程与肝癌侵袭转移能力密切相关;参与细胞骨架重塑的NES蛋白和参与MAPK信号通路和黏合斑信号通路的PRKCA蛋白磷酸化修饰水平的变化是影响低转移潜能MHCC97-L细胞向高转移潜能细胞MHCC97-H变化的重要调控机制。

关键词：定量磷酸化蛋白质组学 SILAC 固相金属离子亲和色谱肝细胞癌侵袭转移

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常见妇科肿瘤患者血清中唾液酸化糖蛋白标志物的筛选分析

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安徽医科大学学报 2014年第11期49卷 1689-1692页

作者：肖超强裴丽丽何为安徽医科大学军事医学科学院放射与辐射研究所合肥230032 蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心与军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京102206

建立一个用于血清中唾液酸化蛋白通量化分析的策略,首先去除血清中高丰度的白蛋白和IgG蛋白,然后用黑接骨木凝集素(SNA)选择性地富集血清中的唾液酸化糖蛋白,通过同位素标记相对与绝对定量技术(iTRAQ)并结合纳升级液相色谱和串联质谱技... 详细信息

建立一个用于血清中唾液酸化蛋白通量化分析的策略,首先去除血清中高丰度的白蛋白和IgG蛋白,然后用黑接骨木凝集素(SNA)选择性地富集血清中的唾液酸化糖蛋白,通过同位素标记相对与绝对定量技术(iTRAQ)并结合纳升级液相色谱和串联质谱技术对蛋白进行分离鉴定。并将其应用于常见妇科肿瘤标志物的研究,共鉴定到169个糖蛋白,与健康对照组相比,乳腺癌病例组共鉴定到11个差异表达蛋白,宫颈癌病例组共鉴定到8个差异表达蛋白,卵巢癌病例组共鉴定到19个差异蛋白。

关键词：定量蛋白质组学唾液酸化糖蛋白质谱妇科肿瘤

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血清多肽SPG01、SPG03、SPG04检测鼻咽癌放疗敏感性的初步研究

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药物生物技术 2014年第4期21卷 329-333页

作者：侯利平宋纯艳孙云波陶亚岚傅海媛杨保安郑俊杰夏云飞甄蓓魏开华北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京102206 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京100850 中南大学药学院湖南长沙410013 中山大学肿瘤防治中心广东广州510060 北京正旦国际科技有限责任公司北京102206

应用血清多肽SPG01、SPG03、SPG04的多抗（PcAb）酶联免疫吸附方法（ELISA）,用于鼻咽癌放疗敏感性的检测。以碳二亚胺偶联法制备多肽免疫抗原,免疫动物制备兔血清多抗,用Protein A亲和层析法纯化多抗,选择3种多抗的工作滴度,应用多抗EL... 详细信息

应用血清多肽SPG01、SPG03、SPG04的多抗（PcAb）酶联免疫吸附方法（ELISA）,用于鼻咽癌放疗敏感性的检测。以碳二亚胺偶联法制备多肽免疫抗原,免疫动物制备兔血清多抗,用Protein A亲和层析法纯化多抗,选择3种多抗的工作滴度,应用多抗ELISA法检测63份鼻咽癌血清样本。紫外（UV）和聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）联合监测表明多肽偶联到BSA（牛血清白蛋白）上;动物免疫获得3种兔血清多克隆抗体各40 mL;纯化后的多抗纯度在90%以上,效价均在1∶100 000以上;3种多抗的检测滴度分别为1∶20 000,1∶100 000,1∶10 000;间接ELISA最低检测限为0.03μg/mL,相对标准偏差（RSD）为5.6%。t检验分析3种多肽区分鼻咽癌放疗敏感组与不敏感组,均呈显著差异（P〈0.000 1）。ROC曲线表明,3种多肽检测鼻咽癌放疗敏感性的特异性在90%以上,灵敏度为73%~93%。3种多肽标志物均能显著区分鼻咽癌放疗敏感组与不敏感组,所应用的多抗ELISA方法检测鼻咽癌放疗敏感性特异性好,灵敏度高,可用于鼻咽癌个体化治疗的放疗敏感性辅助诊断。

关键词：血清多肽鼻咽癌多抗酶联免疫吸附方法碳二亚胺偶联放疗敏感性

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利用串联质谱鉴定氨基酸突变的生物信息学算法

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中国科学：生命科学 2014年第11期44卷 1113-1124页

作者：余庆吴松锋马洁朱云平舒坤贤重庆邮电大学生物信息学研究所重庆400065 北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京100850

氨基酸突变能够改变蛋白的结构和功能,影响生物体的生命过程.基于串联质谱的鸟枪法蛋白质组学是目前大规模研究蛋白质组学的主要方法,但是现有的质谱数据鉴定流程为了提高鉴定结果的灵敏度往往会有意压缩数据库中的氨基酸突变信息.因此... 详细信息

氨基酸突变能够改变蛋白的结构和功能,影响生物体的生命过程.基于串联质谱的鸟枪法蛋白质组学是目前大规模研究蛋白质组学的主要方法,但是现有的质谱数据鉴定流程为了提高鉴定结果的灵敏度往往会有意压缩数据库中的氨基酸突变信息.因此,如何挖掘数据中的氨基酸突变信息成为当前质谱数据鉴定的一个重要部分.当前应用于氨基酸突变鉴定的串联质谱鉴定方法大致可以分为3大类:基于序列数据库搜索的方法、基于序列标签搜索的算法以及基于图谱库搜索的算法.本文首先详细介绍了这3种氨基酸突变鉴定算法,并分析了各种方法的特点和不足,然后介绍了氨基酸突变鉴定的研究现状和发展方向.随着基于串联质谱的蛋白质组学的不断发展,蛋白序列中的氨基酸突变信息将被更好地解析出来,从而得以深入探讨由氨基酸突变引起的蛋白结构和功能改变,为揭示氨基酸突变的生物学意义奠定基础.

关键词：氨基酸突变串联质谱鸟枪法蛋白质组学氨基酸突变鉴定

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