检索结果-内蒙古大学图书馆

中国科学：生命科学 2014年第11期44卷 1113-1124页

作者：余庆吴松锋马洁朱云平舒坤贤重庆邮电大学生物信息学研究所重庆400065 北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京100850

氨基酸突变能够改变蛋白的结构和功能,影响生物体的生命过程.基于串联质谱的鸟枪法蛋白质组学是目前大规模研究蛋白质组学的主要方法,但是现有的质谱数据鉴定流程为了提高鉴定结果的灵敏度往往会有意压缩数据库中的氨基酸突变信息.因此... 详细信息

氨基酸突变能够改变蛋白的结构和功能,影响生物体的生命过程.基于串联质谱的鸟枪法蛋白质组学是目前大规模研究蛋白质组学的主要方法,但是现有的质谱数据鉴定流程为了提高鉴定结果的灵敏度往往会有意压缩数据库中的氨基酸突变信息.因此,如何挖掘数据中的氨基酸突变信息成为当前质谱数据鉴定的一个重要部分.当前应用于氨基酸突变鉴定的串联质谱鉴定方法大致可以分为3大类:基于序列数据库搜索的方法、基于序列标签搜索的算法以及基于图谱库搜索的算法.本文首先详细介绍了这3种氨基酸突变鉴定算法,并分析了各种方法的特点和不足,然后介绍了氨基酸突变鉴定的研究现状和发展方向.随着基于串联质谱的蛋白质组学的不断发展,蛋白序列中的氨基酸突变信息将被更好地解析出来,从而得以深入探讨由氨基酸突变引起的蛋白结构和功能改变,为揭示氨基酸突变的生物学意义奠定基础.

关键词：氨基酸突变串联质谱鸟枪法蛋白质组学氨基酸突变鉴定

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不同品系小鼠在禁食和(或)禁水情况下血糖变化特点的比较分析

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军事医学 2014年第7期38卷 532-534页

作者：王瑞雪李伟光杨柳张成岗广西医科大学南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

目的比较不同品系小鼠在禁食和(或)禁水情况下的血糖变化特点,为研究不同品系动物血糖代谢水平的差异提供参考依据。方法选择C57BL/6J小鼠、BALB/c小鼠、ICR小鼠作为研究对象,进行禁食和(或)禁水胁迫压力测试,分为正常进食进水组、禁食... 详细信息

目的比较不同品系小鼠在禁食和(或)禁水情况下的血糖变化特点,为研究不同品系动物血糖代谢水平的差异提供参考依据。方法选择C57BL/6J小鼠、BALB/c小鼠、ICR小鼠作为研究对象,进行禁食和(或)禁水胁迫压力测试,分为正常进食进水组、禁食不禁水组、禁水不禁食组和禁食禁水组共4组,测定胁迫压力后12 h内血糖的变化。结果与结论 3种品系小鼠血糖变化趋势有所差异,其中C57BL/6J小鼠整体血糖浓度高于BALB/c和ICR小鼠,BALB/c小鼠的血糖变化相对较为平稳,而ICR小鼠的血糖变化幅度最大。结果提示在进行血糖代谢相关研究中,需同时考虑不同品系动物血糖代谢能力差异,从而选择合适的动物进行研究并对数据进行合理分析和解释。

关键词：小鼠血糖禁水禁食

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利用2,3,5-三苯基氯化四氮唑(TTC)测定细胞活力的方法与应用

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军事医学 2014年第5期38卷 388-391页

作者：何国维李伟光王瑞雪张成岗广西医科大学南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

目的：利用细胞内脱氢酶对2，3，5-三苯基氯化四氮唑（TTC）的催化作用建立比目前常用的3-（4，5-二甲基-2-噻唑）-2，5-二苯基溴化四氮唑（噻唑蓝，MTT）法更可靠的测定细胞活力的方法。方法使用不同浓度的TTC溶液测定细胞活力，并确定... 详细信息

目的：利用细胞内脱氢酶对2，3，5-三苯基氯化四氮唑（TTC）的催化作用建立比目前常用的3-（4，5-二甲基-2-噻唑）-2，5-二苯基溴化四氮唑（噻唑蓝，MTT）法更可靠的测定细胞活力的方法。方法使用不同浓度的TTC溶液测定细胞活力，并确定TTC的有效浓度范围。在计算所测定值与细胞数量函数关系的基础上，通过与传统测定细胞活力的MTT法进行比较，分析该方法的可行性。结果0．5％～1．0％浓度范围内的TTC溶液可用来测定细胞活力，测定值与细胞数量之间存在线性关系，与MTT法得到的结果基本一致，可避免MTT法测定过程中来自于细胞培养体系中其他抗氧化物质的非特异性干扰。结论 TTC可用于测定细胞活力，可替代常规的MTT法，具有操作简便，费用经济，结果可靠等优点。

关键词：细胞活力 TTC MTT 测定 2,3,5-三苯基氯化四氮唑

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代谢光反应交联技术在生物大分子相互作用研究中的应用

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生命的化学 2014年第6期34卷 779-786页

作者：王明超应万涛钱小红蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京102206

具备光反应交联活性的苯甲酮基团、叠氮苯基团以及双吖丙啶基团被广泛应用于对糖、氨基酸等代谢底物的修饰。利用生物自身的代谢机制,引入带有光反应交联基团的底物类似物,可以实现生物大分子间相互作用的原位、实时研究,从而获得更为... 详细信息

具备光反应交联活性的苯甲酮基团、叠氮苯基团以及双吖丙啶基团被广泛应用于对糖、氨基酸等代谢底物的修饰。利用生物自身的代谢机制,引入带有光反应交联基团的底物类似物,可以实现生物大分子间相互作用的原位、实时研究,从而获得更为准确的相互作用复合物的信息。本文将综述代谢光反应交联技术在聚糖-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用研究中的应用进展。

关键词：代谢引入光反应交联基团光反应交联糖类似物光反应交联氨基酸类似物

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大规模酵母双杂交技术的发展及其在蛋白质相互作用组学中的应用

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生命科学 2014年第4期26卷 423-429页

作者：刘禹辰贺福初王建军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室蛋白质药物国家工程研究中心

酵母双杂交技术作为研究蛋白质相互作用的主要方法,在规模化蛋白质相互作用研究中占据举足轻重的地位。虽然蛋白质相互作用的数据逐年递增,但是还远不能满足"大数据"的实际需求。为了使蛋白质相互作用组学研究更加高效、快捷... 详细信息

酵母双杂交技术作为研究蛋白质相互作用的主要方法,在规模化蛋白质相互作用研究中占据举足轻重的地位。虽然蛋白质相互作用的数据逐年递增,但是还远不能满足"大数据"的实际需求。为了使蛋白质相互作用组学研究更加高效、快捷、准确,以及使酵母双杂交适用于全基因组规模筛选和蛋白质相互作用数据高度覆盖的研究需求,近年来对酵母双杂交技术进行了一系列的改进和发展。综述了近年来在规模化蛋白质相互作用组学研究中,酵母双杂交技术的最新改进和发展。

关键词：大规模酵母双杂交蛋白质相互作用组学

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血清多肽SPG01、SPG03、SPG04检测鼻咽癌放疗敏感性的初步研究

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药物生物技术 2014年第4期21卷 329-333页

作者：侯利平宋纯艳孙云波陶亚岚傅海媛杨保安郑俊杰夏云飞甄蓓魏开华北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京102206 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京100850 中南大学药学院湖南长沙410013 中山大学肿瘤防治中心广东广州510060 北京正旦国际科技有限责任公司北京102206

应用血清多肽SPG01、SPG03、SPG04的多抗（PcAb）酶联免疫吸附方法（ELISA）,用于鼻咽癌放疗敏感性的检测。以碳二亚胺偶联法制备多肽免疫抗原,免疫动物制备兔血清多抗,用Protein A亲和层析法纯化多抗,选择3种多抗的工作滴度,应用多抗EL... 详细信息

应用血清多肽SPG01、SPG03、SPG04的多抗（PcAb）酶联免疫吸附方法（ELISA）,用于鼻咽癌放疗敏感性的检测。以碳二亚胺偶联法制备多肽免疫抗原,免疫动物制备兔血清多抗,用Protein A亲和层析法纯化多抗,选择3种多抗的工作滴度,应用多抗ELISA法检测63份鼻咽癌血清样本。紫外（UV）和聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）联合监测表明多肽偶联到BSA（牛血清白蛋白）上;动物免疫获得3种兔血清多克隆抗体各40 mL;纯化后的多抗纯度在90%以上,效价均在1∶100 000以上;3种多抗的检测滴度分别为1∶20 000,1∶100 000,1∶10 000;间接ELISA最低检测限为0.03μg/mL,相对标准偏差（RSD）为5.6%。t检验分析3种多肽区分鼻咽癌放疗敏感组与不敏感组,均呈显著差异（P〈0.000 1）。ROC曲线表明,3种多肽检测鼻咽癌放疗敏感性的特异性在90%以上,灵敏度为73%~93%。3种多肽标志物均能显著区分鼻咽癌放疗敏感组与不敏感组,所应用的多抗ELISA方法检测鼻咽癌放疗敏感性特异性好,灵敏度高,可用于鼻咽癌个体化治疗的放疗敏感性辅助诊断。

关键词：血清多肽鼻咽癌多抗酶联免疫吸附方法碳二亚胺偶联放疗敏感性

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利用GEO公共数据集分析CHAF1A在肿瘤中的表达及临床意义

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肿瘤 2014年第7期34卷 642-650页

作者：李雪玲丁明彦孙荣泽王琪曲川孟冉冉周光明丁千山日照市人民医院理疗科山东日照276800 日照市岚山区人民医院药剂科山东日照276807 武汉大学第一临床学院武汉大学人民医院肝胆腔镜外科军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室湖北武汉430060

目的 :研究染色体组装因子1单位A(chromatin assembly factor 1,subunit A,CHAF1A)在人体多种肿瘤中的表达情况,探讨CHAF1A与肝细胞癌、乳腺癌和肺癌临床病理特征的关系,并评价检测CHAF1A表达对肝细胞癌、乳腺癌和肺癌预后评估的意义。... 详细信息

目的 :研究染色体组装因子1单位A(chromatin assembly factor 1,subunit A,CHAF1A)在人体多种肿瘤中的表达情况,探讨CHAF1A与肝细胞癌、乳腺癌和肺癌临床病理特征的关系,并评价检测CHAF1A表达对肝细胞癌、乳腺癌和肺癌预后评估的意义。方法 :从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)网站收集与CHAF1A表达及人类肿瘤相关的基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)公共数据集,下载这些肿瘤样本表达谱资料及其对应的临床信息。采用χ2检验分析CHAF1A表达与肿瘤患者临床病理指标的相关性,Kaplan-Meier法进行总生存和无复发生存期分析。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法分析预测受CHAF1A调控的相关基因。结果 :CHAF1A在肝细胞癌、结直肠癌、食管癌、肺癌、卵巢癌、黑素瘤、鼻咽癌和胃癌中均高表达(P<0.05)。CHAF1A表达与乳腺癌患者的p53基因缺失、p53基因突变、雌激素受体表达、孕激素受体表达以及Elston组织学分级密切相关(P<0.05),与肺癌患者的年龄、性别、T分期、淋巴结浸润和远端转移密切相关(P<0.05),而在肝细胞癌、乳腺癌和肺癌中与患者手术预后相关(P<0.05)。CHAF1A可能调控与细胞周期调控、DNA复制以及细胞骨架调节相关的基因集。结论 :CHAF1A在多种肿瘤中高表达,推测其可以作为潜在的判断肿瘤患者预后的标志物以及治疗肿瘤的靶标。

关键词：肿瘤数据库,蛋白质染色体蛋白质类,非组蛋白基因表达 CHAF1A

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游离脂肪酸抑制TRAIL诱导的活化肝星状细胞凋亡

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肝脏 2014年第2期19卷 104-107页

作者：胡彬王赫徐会王钧毅赵娜杨俊涛蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心国家蛋白质科学中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质药物国家工程研究中心北京102206

目的鉴定游离脂肪酸(free fatty acids,FFA)对肝星状细胞(HSC)凋亡的影响。方法体外培养活化人HSC LX-2,加入FFA处理后,TRAIL诱导凋亡,通过流式细胞术检测细胞凋亡情况。通过caspase-3活性检测试剂盒检测细胞内caspase-3的活化情况,通过... 详细信息

目的鉴定游离脂肪酸(free fatty acids,FFA)对肝星状细胞(HSC)凋亡的影响。方法体外培养活化人HSC LX-2,加入FFA处理后,TRAIL诱导凋亡,通过流式细胞术检测细胞凋亡情况。通过caspase-3活性检测试剂盒检测细胞内caspase-3的活化情况,通过Q-PCR检测细胞内凋亡相关基因的表达情况。结果 FFA能够抑制TRAIL诱导的活化LX-2细胞凋亡,降低细胞内caspase-3的活性,Q-PCR的分析表明,FFA能够影响细胞内凋亡相关基因BAX的表达,下调死亡受体TRAIL-R2和FAS的表达。结论体外FFA处理,能够抑制活化HSC的凋亡。

关键词：游离脂肪酸肝星形细胞肝纤维化

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金属元素标记结合毛细管液相色谱-质谱用于蛋白质N-末端肽的鉴定及相对定量新方法研究

金属元素标记结合毛细管液相色谱-质谱用于蛋白质N-末端肽的鉴定...

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第十届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会

作者：张养军颜辉郝斐然李佳斌李楠楠田芳李贤玉钱小红军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室

N-末端区域是蛋白质及多肽的重要结构和功能部位,包含许多有价值的生物学信息,对末端肽的鉴定对蛋白质的生物学功能研究具有重要意义。例如,N-末端氨基酸类型可影响蛋白质的半衰期(N端规则,the N-end rule)[1],而末端修饰对其生物学功... 详细信息

N-末端区域是蛋白质及多肽的重要结构和功能部位,包含许多有价值的生物学信息,对末端肽的鉴定对蛋白质的生物学功能研究具有重要意义。例如,N-末端氨基酸类型可影响蛋白质的半衰期(N端规则,the N-end rule)[1],而末端修饰对其生物学功能产生巨大的影响[2]。通过对

关键词：金属标记化学修饰 N-末端肽蛋白质组学

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糖型特异性的糖蛋白质组学研究

糖型特异性的糖蛋白质组学研究

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第三届中国计算蛋白质组学研讨会

作者：应万涛蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所

糖基化修饰执行重要生物学功能.N-糖链加工过程.糖型修饰与重要生理与病理进程相关.Galectins通过与复合糖作用调控信号传递.Galectins通过与复合糖作用调控信号传递.

关键词：

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