检索结果-内蒙古大学图书馆

基于离散SNP位点解析青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)对水温和盐度的适应性

基因组学与应用生物学 2023年第1期42卷 25-33页

作者：罗慧匡箴罗颖祁洪芳方弟安中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 青海湖裸鲤救护中心青海省青海湖裸鲤繁育与保护重点实验室西宁810016

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态... 详细信息

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点筛选,探讨其可能受到自然选择作用的相关SNP位点,并对离散SNP位点所在contigs进行序列比对及功能注释。研究共得到1 566个高度变异的适应性离散SNP位点。NR(non-redundant protein sequences)注释显示,相似比例序列所占比例最高的前两个物种分别是鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)和鲤(Cyprinus carpio)。GO注释分析发现,注释到细胞过程、代谢过程和结合的contigs较多。KEGG注释分析显示,注释到代谢通路和神经活性配体-受体相互作用通路的contigs最多,其中,注释到代谢通路的基因包括ctu1、cps1、gba2、fasn和plcg1等,推测这些基因与青海湖裸鲤的本地适应性相关。研究结果证明青海湖裸鲤可能形成了与温度、盐度等环境因子相关的本地适应性机制,研究结果为进一步深入探讨青海湖裸鲤的本地适应性机制提供了技术方法和数据支撑。

关键词：青海湖裸鲤基因分型测序离散SNP位点功能注释本地适应性

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

长江安庆段刀鲚的线虫感染现状及时间特征

引用

大连海洋大学学报 2022年第3期37卷 464-470页

作者：代培郭琦田佳丽马凤娇王银平刘凯中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 江苏省淡水水产研究所江苏南京210017 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081

为掌握长江刀鲚Coilia nasus感染线虫的现状,于2018年4—7月在长江安庆段进行72 d的调查,共采集1658尾样本。结果表明:刀鲚的线虫感染率为96.32%,平均感染强度为(10.69±9.67)条/尾,平均感染丰度为(10.16±9.67)条/尾;感染的刀... 详细信息

为掌握长江刀鲚Coilia nasus感染线虫的现状,于2018年4—7月在长江安庆段进行72 d的调查,共采集1658尾样本。结果表明:刀鲚的线虫感染率为96.32%,平均感染强度为(10.69±9.67)条/尾,平均感染丰度为(10.16±9.67)条/尾;感染的刀鲚中,52.53%的个体感染线虫数量为1~9条,感染数量大于30条的个体较少,仅占3.93%;线虫寄生于刀鲚腹腔内壁及各脏器,胃、幽门盲囊和肠道内及表面均有寄生,性腺和肝脏表面有附着或嵌入组织内,各部位线虫寄生数量以肠道和幽门盲囊最多,占比分别为41.26%和31.15%;线虫抽样鉴定结果显示,刀鲚共感染线虫2属6种,其中异尖属线虫2种,宫脂属4种,优势种为派氏异尖线虫Anisakis simples;不同规格刀鲚的感染强度有所差异,感染强度随刀鲚体长增加呈先升高后降低的趋势,其中,280~300 mm体长组感染率最高,260~279 mm体长组平均感染强度和感染丰度最高;调查期间,随着时间的推移,刀鲚的线虫感染指标呈先升高后降低趋势,其中6月上半月感染情况最严重。研究表明,刀鲚感染的线虫均为海水性寄生虫,感染情况较为严重,线虫的寄生对刀鲚肝脏等寄生部位产生了机械损伤,刀鲚感染线虫的情况与其规格和洄游时间有一定的相关性。

关键词：刀鲚线虫感染现状长江

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

壳聚糖和纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果

引用

湖南农业大学学报（自然科学版） 2022年第2期48卷 242-250页

作者：周春妙肖锦程于俊杰张明胤宋长友唐永凯南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214128 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214081 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

选取0.5、1.0、2.0 mg/L的壳聚糖和25、50、100 mg/L的纳米碳铜分别加至铜绿微囊藻液中,检测藻液中藻细胞浓度和叶绿素a质量浓度,探讨壳聚糖和纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果;比较100 mg/L纳米碳铜与100、500 mg/L硫酸铜在除藻过程中... 详细信息

选取0.5、1.0、2.0 mg/L的壳聚糖和25、50、100 mg/L的纳米碳铜分别加至铜绿微囊藻液中,检测藻液中藻细胞浓度和叶绿素a质量浓度,探讨壳聚糖和纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果;比较100 mg/L纳米碳铜与100、500 mg/L硫酸铜在除藻过程中藻液的pH值、溶解氧、铜离子的残留量,进一步验证纳米碳铜对铜绿微囊藻的抑制效果。结果表明:壳聚糖抑藻效果不明显;质量浓度为100 mg/L的纳米碳铜则具有明显的抑藻效果,144、360、480 h时,添加100 mg/L纳米碳铜组的藻细胞浓度显著低于其他组的,且72~480 h时,其藻细胞浓度随培养时间的增加而显著降低;48~240 h时,添加100 mg/L纳米碳铜组的藻液叶绿素a质量浓度和铜离子残留量均显著低于添加100、500 mg/L硫酸铜组的,且pH值变动小。这表明100 mg/L纳米碳铜可有效抑制铜绿微囊藻,且水体中铜离子的残留量较少,pH值变动小,可广泛用于水产养殖中。

关键词：铜绿微囊藻壳聚糖纳米碳铜硫酸铜叶绿素a 抑制效果铜离子残留 pH值溶解氧

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

鱼类雷帕霉素靶蛋白信号通路生物学功能的研究进展

引用

动物营养学报 2021年第10期33卷 5486-5496页

作者：吴龙华梁化亮戈贤平任鸣春南京农业大学无锡渔业学院无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

雷帕霉素靶蛋白(TOR)信号通路是营养、化学和运动等因素导致细胞生长和分化的一个关键信号通路。本文介绍了到目前为止TOR信号通路的生物学功能以及其在水产动物中的研究进展,主要包括TOR信号通路对蛋白质合成代谢、糖代谢、脂代谢、摄... 详细信息

雷帕霉素靶蛋白(TOR)信号通路是营养、化学和运动等因素导致细胞生长和分化的一个关键信号通路。本文介绍了到目前为止TOR信号通路的生物学功能以及其在水产动物中的研究进展,主要包括TOR信号通路对蛋白质合成代谢、糖代谢、脂代谢、摄食调控以及机体免疫、抗氧化调控的影响,同时阐述了胰岛素抵抗机制及精氨酸对团头鲂免疫与抗氧化信号通路的调控机制,以为进一步全面研究TOR信号通路在水产动物中的应用提供参考。

关键词：鱼类 TOR 雷帕霉素免疫代谢摄食调控

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

哈尼梯田稻-渔共作模式下杂交黄颡鱼肠道微生物研究

引用

水生生物学报 2021年第6期45卷 1232-1242页

作者：朱昊俊强俊徐钢春陶易凡包景文徐跑南京农业大学无锡渔业学院无锡214128 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

为了探究哈尼梯田稻-鱼共作综合种养模式(稻渔组,DY组)和传统池塘养殖模式(池塘组,CT组)下杂交黄颡鱼(Tachysurus fulvidraco♀×Pseudobagrus vachellii♂)肠道微生物结构变化,试验采用16S rDNA测序技术对不同养殖模式下黄颡鱼肠... 详细信息

为了探究哈尼梯田稻-鱼共作综合种养模式(稻渔组,DY组)和传统池塘养殖模式(池塘组,CT组)下杂交黄颡鱼(Tachysurus fulvidraco♀×Pseudobagrus vachellii♂)肠道微生物结构变化,试验采用16S rDNA测序技术对不同养殖模式下黄颡鱼肠道微生物进行分析。测序结果显示,CT组和DY组优势菌门均为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和梭杆菌门(Fusobacteria)。和CT组相比,在门水平上DY组厚壁菌门和拟杆菌门相对丰度显著上升,而变形菌门相对丰度显著下降。在属水平上DY组梭状芽孢杆菌属、Romboutsia属、Paludibacter属、Epulopiscium属和拟杆菌属相对丰度显著上升,而邻单胞菌属丰度显著下降。不同的养殖模式没有显著影响黄颡鱼肠道微生物的丰富度(Richness),但DY组拥有更高的微生物均匀度(Evenness)。BugBase表型预测结果如下,CT组革兰氏阴性菌,兼性厌氧菌丰度更高,DY组则革兰氏阳性菌,厌氧菌丰度更高。同时DY组肠道菌群相较于CT组具有更低的潜在致病性和生物膜形成能力。DY组黄颡鱼肠道微生物多样性更高,稳定性更好,对疾病的抵抗力可能更强。水稻-黄颡鱼新型稻渔综合种养模式具有更佳的经济和生态效应。

关键词：哈尼梯田稻-鱼综合种养杂交黄颡鱼肠道微生物

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

我国克氏原螯虾种苗产业发展现状

引用

江苏农业科学 2022年第9期50卷 1-6页

作者：刘国锋徐增洪徐跑何俊水燕张宪中中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 江苏省无锡市水产技术推广总站江苏无锡214101

当前我国克氏原螯虾产业的快速发展对提高渔民收入、促进养殖技术升级、农民脱贫致富等均具有重要的现实意义。而种苗质量与市场供应能力与养殖业发展规模不匹配已成为当前限制克氏原螯虾产业规模扩增的瓶颈。针对这一现象,从我国克氏... 详细信息

当前我国克氏原螯虾产业的快速发展对提高渔民收入、促进养殖技术升级、农民脱贫致富等均具有重要的现实意义。而种苗质量与市场供应能力与养殖业发展规模不匹配已成为当前限制克氏原螯虾产业规模扩增的瓶颈。针对这一现象,从我国克氏原螯虾种质资源现状、种苗资源的供给能力、种苗生产现状和生产模式进行概述和探讨。同时,提出应对养殖规模扩增的现实要求,种苗产业应从加强种质资源保护、改善养殖环境、转变养殖理念、升级换代育苗技术等多方面发力;政府、科研单位和企业应加强合作,形成产学研协同发展的商业化育种体系,加快克氏原螯虾工厂化高效育苗技术研发,提高秋苗和早春苗的供给能力,进而实现根据生产需要“全天候”的供苗能力,为我国克氏原螯虾产业可持续健康发展提供技术支撑和物质保障。

关键词：克氏原螯虾产业发展现状种苗繁育技术水产养殖

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

几种放射孢子虫的形态特征和分子鉴定

引用

水生生物学报 2021年第2期45卷 446-454页

作者：高志鹏杨坤陈凯习丙文谢骏南京农业大学无锡渔业学院无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081

为阐明黏孢子虫病的传播途径,在2018—2019年期间作者调查了异育银鲫养殖池塘,从底栖寡毛类苏氏尾鳃蚓中共检测出10种放射孢子虫。基于形态特征鉴定,10种放射孢子虫分别属于6个集合类群,其中雷氏放射孢子虫1种、桔瓣放射孢子虫2种、新... 详细信息

为阐明黏孢子虫病的传播途径,在2018—2019年期间作者调查了异育银鲫养殖池塘,从底栖寡毛类苏氏尾鳃蚓中共检测出10种放射孢子虫。基于形态特征鉴定,10种放射孢子虫分别属于6个集合类群,其中雷氏放射孢子虫1种、桔瓣放射孢子虫2种、新放射孢子虫2种、三突放射孢子虫2种、棘放射孢子虫2种和匈牙利放射孢子虫1种;这些物种中有4种与作者实验室前期描述种类一致,5种为新发现的物种。研究描述了其形态特征并通过SSU rDNA序列比对分析对应的黏孢子虫种类。结果表明新发现的Triactinomyxon HZ和DF与文献中同类群的Triactinomyxon CZ(GenBank登录号JX477771)序列相似性最高(93.39%和94.48%),Echinactinomyxon LY1与金鱼肌肉寄生Myxobolus lentisuturalis(GenBank登录号AY119688)相似性最高(96.88%),Echinactinomyxon type LY2与Hungactinomyxon(GenBank登录号AY779062)相似性最高(97.86%),Neoactinomyxum type LY与文献报道的Thelohanellus sp.(GenBank登录号MK412938)相似性最高(92.48%)。文章报道的Hungactinomyxon DF与匈牙利发现的Hungactinomyxon(GenBank登录号AY779062)序列相似度达99.41%—99.64%,为同一物种。系统发育分析表明文章所报道的Triactinomyxon HZ和DF与鱼体寄生四极虫亲缘关系较近;Hungactinomyxon DF和Echinactinomyxon LY1及LY2与碘泡虫属亲缘关系较近;Neoactinomyxum LY与单极虫聚为一支。研究新报道的放射孢子虫进一步丰富了对养殖环境中黏孢子虫多样性的认识,为开展黏孢子虫病生态防控奠定基础。

关键词：放射孢子虫异育银鲫 SSU rDNA 系统发育分析

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

哈尼梯田稻鲤共作与单养模式下福瑞鲤肠道菌群结构比较研究

引用

微生物学报 2022年第4期62卷 1473-1484页

作者：聂志娟徐钢春邵乃麟王保战高建操徐跑何健南京农业大学生命科学学院农业农村部农业环境微生物工程重点开放实验室江苏南京210095 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214128

【目的】分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征。【方法】通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异。【结果】梯田稻鲤组(RCIC)、传... 详细信息

【目的】分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征。【方法】通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异。【结果】梯田稻鲤组(RCIC)、传统池鲤组(YPIC)和水泥池鲤组(HPIC)分别获得了2345、238和118个OTU。RCIC组的Sobs指数及PD指数最高,显著高于YPIC组(P<0.05),极其显著高于HPIC组(P<0.01);池塘单养模式下,两组之间多样性指数也存在显著差异,YPIC组大于HPIC组(P<0.05)。含量大于10%优势菌门:RCIC组主要为变形菌门(39.39%)、梭杆菌门(38.55%)和厚壁菌门(15.4%);YPIC组为变形菌门(21.87%)、梭杆菌门(58.27%);HPIC组为变形菌门(46.63%)、梭杆菌门(53.14%)。变形菌和梭杆菌为3组福瑞鲤肠道样品的优势菌群,其中的鲸杆菌属(Cetobacterium)、气单胞菌属(Aeromonas)为核心优势菌属。LEfSe线性判别分析(LDA>3)显示17个具有差异的标记菌属,其中Romboutsia、Clostridium_sensu_stricto_1、Enterobacter、Paraclostridium、Methylobacterium、norank_f__norank_o__Chloroplast、Edwardsiella、Epulopiscium为RCIC组具有的差异标记菌属。【结论】不同养殖模式的福瑞鲤既有固有菌群,也塑造差异显著的肠道菌群组成结构。稻梯田鲤肠道菌群丰富度和多样性显著增加,且具有更多的有益差异标记菌属,获得更健康的肠道菌群群落特征。

关键词：哈尼梯田稻-鲤综合种养菌群结构肠道高通量测序

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

鳙体型差异个体转录组与miRNA的联合分析

引用

水产学报 2025年第1期49卷 53-65页

作者：邓玉婕朱文彬傅建军罗明坤王兰梅梁政远董在杰上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室无锡瑞顺水产养殖科技有限公司

[目的]探究影响鳙体型差异的分子机制。[方法]本实验以正常鳙个体(CK组)和缩骨鳙个体(PG组)为研究对象,进行转录组和miRNA测序分析。[结果]共获得25 327个Unigenes和8 325个miRNA,鉴定到930个差异表达基因(DEGs)和146个差异表达miRNA (D... 详细信息

[目的]探究影响鳙体型差异的分子机制。[方法]本实验以正常鳙个体(CK组)和缩骨鳙个体(PG组)为研究对象,进行转录组和miRNA测序分析。[结果]共获得25 327个Unigenes和8 325个miRNA,鉴定到930个差异表达基因(DEGs)和146个差异表达miRNA (DEMs),包括473个上调和457个下调基因,44个上调和102个下调miRNA。对DEGs和DEMs的靶基因联合分析,获得了140个重复基因,功能富集到细胞周期(ko04110)、DNA复制(ko03030)、黏着斑(ko04510)和ECM受体相互作用(ko04512)等信号通路。其中,鉴定到如exo1、mcm4、ccna2、smc2和ccna2等16个参与骨骼形成发育的基因,推测可能与鳙的体型差异形成有关。此外,通过mRNA-miRNA网络互作分析,挖掘到如apob、tgfbr2a和col2a1b等基因,miR-34a-5p、miR-252a和miR-6 547-5p等miRNAs;分析上述基因可能在调控和维持鳙的体型中发挥作用。实时荧光定量PCR(qPCR)实验发现,表达差异趋势与RNA-Seq和sRNA-Seq数据结果一致。[结论]研究发现的DEGs、DEMs和富集到的代谢通路可能与鳙的缩骨体型差异存在关联,实验结果可为后续深入揭示鳙影响体型差异的分子机制提供基础数据。

关键词：鳙体型骨骼发育差异表达基因差异表达miRNA

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

MRFs家族基因多态性与尼罗罗非鱼成鱼生长性状的关联性分析

引用

农业生物技术学报 2025年第5期 1073-1089页

作者：张士彪陈炳霖邹芝英肖炜祝璟琳喻杰李大宇杨弘南京农业大学无锡渔业学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室

肌肉重是反应鱼类生长性能的主要性状，肌源性调节因子(myogenic regulatory factors, MRFs)家族基因对肌肉的生成和发育具有重要作用。为探究MRFs家族基因多态性与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)成鱼阶段生长性状的相关性，对MRFs... 详细信息

肌肉重是反应鱼类生长性能的主要性状，肌源性调节因子(myogenic regulatory factors, MRFs)家族基因对肌肉的生成和发育具有重要作用。为探究MRFs家族基因多态性与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)成鱼阶段生长性状的相关性，对MRFs家族基因生肌调节因子5 (myogenic factor 5, myf5)、myf6、生肌决定因子1 (myogenic determination gene 1, myod1)、myod2、肌细胞生成素(myogenin, myog)编码区进行PCR扩增和多重序列对比，从这5个基因中共筛查到26个SNPs位点，其中myf5包含7个位点，myf6包含8个位点，myod1包含6个位点，myod2包含2个位点，myog包含3个位点。位点与生长性状之间的关联性分析结果显示，myf5的N7 (C2543T)位点与体重显著相关(P<0.05),myf6的N9 (A11440G)位点与体重、全长、体长和头长显著相关(P<0.05)，其他基因上未发现与生长性状显著相关的位点。通过双倍型与生长性状的关联性分析，在myf5基因上发现了3个与体厚显著相关的双倍型(P<0.05)，在myf6基因上发现了4个与生长性状显著相关的双倍型(P<0.05)，在其他基因上没有发现与生长性状显著相关的双倍型。以上结果提高了分子标记的应用潜力，获得了2个可作为尼罗罗非鱼成鱼阶段辅助育种的候选标记，为尼罗罗非鱼育种和品质提升工作提供理论依据。

关键词：尼罗罗非鱼多生长阶段肌源性调节因子(MRFs)家族基因生长性状分子标记

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：