检索结果-内蒙古大学图书馆

植物研究 2025年第1期45卷 3-14页

作者：梅曼王晨璨蔺宏霞张玉倩丁文静赵媛媛北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 北京林业大学生物科学与技术学院林木遗传育种全国重点实验室北京100083 北京林业大学树木与基因编辑研究院北京100083 北京林业大学林木育种与生态修复国家工程研究中心北京100083 河北省农林科学院植物保护研究所保定071000

空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中编... 详细信息

空间转录组(spatial transcriptomics,ST)是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,利用该技术解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着,使得在mRNA样品处理和后续测序过程中编码和获取位置信息成为可能。与传统的转录组技术相比,空间转录组技术能获得细胞在组织原位环境下真实的基因表达特征,以及与微环境的关系,为基因表达提供高精度、高分辨率原位的空间信息。近年来,空间转录组技术取得了重要进展,检测的细胞通量、转录本数量和质量不断提高,空间定位信息更加准确全面,并已在拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)、杨树(Populus)等植物中展开研究。该文阐述了空间转录组技术在植物动态发育轨迹、不同组织和细胞类型差异分析、解码植物与微生物群相互作用等研究中的成功应用,讨论了空间转录组测序在植物组织原位测序中存在的问题和挑战,揭示了其在植物研究中的巨大潜力,为相关领域的进一步研究和应用提供了新的视角。

关键词：空间转录组技术空间分布模式发育谱系细胞类型鉴定细胞间相互作用

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毛乌素沙地生物结皮覆盖土壤中微生物残体碳贡献及其影响因素

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土壤学报 2025年

作者：孟延荣白存琳赵广伟牛向雯佘维维张宇清秦树高杨婧姜雅文黎明杰冯薇北京林业大学水土保持学院宁夏盐池毛乌素沙地生态系统国家定位观测研究站宁夏哈巴湖国家级自然保护区管理局北京林业大学水土保持国家林业和草原局重点实验室北京林业大学林业生态工程教育部工程中心北京林业大学林木资源高效生产全国重点实验室林木育种与生态修复国家工程研究中心

生物结皮作为荒漠生态系统重要的地表覆被物，可通过多种途径增加土壤有机碳（Soil organic carbon，SOC）固存。然而，有关生物结皮覆盖下微生物残体碳（Microbial necromass carbon，MNC）对SOC的贡献及影响因素仍不清楚。以毛乌素沙... 详细信息

生物结皮作为荒漠生态系统重要的地表覆被物，可通过多种途径增加土壤有机碳（Soil organic carbon，SOC）固存。然而，有关生物结皮覆盖下微生物残体碳（Microbial necromass carbon，MNC）对SOC的贡献及影响因素仍不清楚。以毛乌素沙地广泛分布的藻、地衣与苔藓结皮为研究对象，采集不同类型结皮的结皮层与层下0～5 cm土壤样品，分析土壤氨基糖含量和土壤理化性质，探究三类生物结皮覆盖土壤中MNC变化及其驱动因素。结果显示：（1）藻、地衣与苔藓结皮层土壤中MNC对SOC贡献分别约为57.7%、47.9%和22.5%，结皮层下土壤中分别约为40.7%、40.2%和28.5%；（2）真菌残体碳（Fungal necromass carbon，FNC）对SOC平均贡献（28.4%±10.7%）显著高于细菌残体碳（Bacterial necromass carbon，BNC）（11.2%±4.8%）；（3）FNC和BNC对颗粒有机碳的显著性高于矿物结合态有机碳；（4）FNC、BNC与氮含量（铵态氮、硝态氮及全氮）、SOC呈显著正相关，与土壤pH、交换性钙离子、土壤含水量呈显著负相关。综上所述，MNC对SOC的贡献度随藻、地衣、苔藓结皮逐渐降低，且主要贡献于活性碳库，FNC对SOC的贡献占据主导地位。土壤中的氮含量、SOC、pH、交换性钙离子和含水量对MNC的积累与分解具有显著影响。研究结果有助于促进对生物结皮覆盖土壤中微生物介导的土壤碳循环与碳固持机制的深入认识，并为荒漠区碳管理策略的制定提供科学依据。

关键词：生物结皮微生物残体碳颗粒有机碳矿物结合态有机碳氮含量毛乌素沙地

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芽孢杆菌接种剂量对花棒和柠条幼苗生长的影响

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应用与环境生物学报 2025年第4期 582-593页

作者：黄焜王雨高广磊张英丁国栋曹红雨北京林业大学水土保持学院林木资源高效生产全国重点实验室宁夏盐池毛乌素沙地生态系统国家定位观测研究站北京林业大学林业生态工程教育部工程研究中心北京林业大学水土保持国家林业和草原局重点实验室

芽孢杆菌（Bacillus）菌剂可形成土壤微生物膜，显著提高土壤抗风蚀能力，但其对风沙区植被恢复的影响尚不明确.采用盆栽试验，分析使用不同菌剂施用量（0、1、3、5、7、10 g/kg）和施用方式（喷施、混施）施用芽孢杆菌混合菌剂对典型... 详细信息

芽孢杆菌（Bacillus）菌剂可形成土壤微生物膜，显著提高土壤抗风蚀能力，但其对风沙区植被恢复的影响尚不明确.采用盆栽试验，分析使用不同菌剂施用量（0、1、3、5、7、10 g/kg）和施用方式（喷施、混施）施用芽孢杆菌混合菌剂对典型沙生植物花棒（Corethrodendron scoparium）和柠条（Caragana korshinskii）幼苗光合作用和荧光特性的影响.结果显示，芽孢杆菌菌剂能有效胶结、改良风沙土，土壤固结层厚度、硬度较未施加菌剂分别提升32.23%-131.11%和79.94%-138.22%，土壤脲酶和蔗糖酶含量也显著提升，在防风固沙的同时改善风沙土性质；1-3g/kg施用范围内芽孢杆菌菌剂对植物光合作用和荧光特性产生随菌剂施用量增加而增加的促进作用，在3-10 g/kg施用范围内促进作用随菌剂施用量增加而逐渐减少；花棒和柠条的菌剂最佳施用量分别为3 g/kg和1 g/kg；不同施用方式之间无显著差异.本研究表明施用适量芽孢杆菌菌剂所产生的土壤微生物膜能够促进花棒和柠条幼苗生长.（图7参40）

关键词：芽孢杆菌菌剂土壤微生物膜花棒柠条光合作用叶绿素荧光

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菊属植物PIN基因家族的鉴定及生物信息学分析

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浙江大学学报(农业与生命科学版) 2025年第1期51卷 39-53页

作者：刘波刘欣宇李骏倬武晓云卢敏王佳颖戴思兰北京林业大学园林学院城乡生态环境北京实验室/花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室/国家花卉工程技术研究中心北京100083

PIN蛋白家族是生长素外排载体,负责将生长素从细胞内向细胞外运输,这一过程对于植物体内生长素的分布和浓度梯度的建立至关重要。本研究采用生物信息学手段,在5个菊属植物中鉴定出113个PIN基因家族成员,并深入分析了它们的蛋白理化性质... 详细信息

PIN蛋白家族是生长素外排载体,负责将生长素从细胞内向细胞外运输,这一过程对于植物体内生长素的分布和浓度梯度的建立至关重要。本研究采用生物信息学手段,在5个菊属植物中鉴定出113个PIN基因家族成员,并深入分析了它们的蛋白理化性质,揭示了这些成员在物理和化学特性上的多样性。通过构建系统进化树发现,PIN基因被分为6个不同的分支,且亲缘关系相近的成员在保守基序和保守结构域上具有相似性,暗示它们可能具有相似或相关的功能。染色体定位和共线性分析进一步展示了PIN基因在菊属植物中的分布模式,以及它们在基因组中的复制和重排事件。此外,启动子顺式作用元件分析显示,PIN基因的启动子区域富含与生长发育、激素信号传导和逆境响应相关的调控元件,表明PIN基因可能在植物生长发育和环境适应过程中受到多种信号的调控。基因表达分析发现,PIN基因在菊花不同器官中具有特异性表达模式。本研究结果为后续探究菊属植物中PIN基因的功能奠定了理论基础。

关键词： PIN基因家族菊属植物生物信息学分析

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林龄和生态位对樟子松人工林地下真菌群落构建的影响

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植物生态学报 2025年

作者：赵珮杉高广磊丁国栋张英北京林业大学水土保持学院宁夏盐池毛乌素沙地生态系统国家定位观测研究站林木资源高效生产全国重点实验室北京林业大学林业生态工程教育部工程研究中心北京林业大学水土保持国家林业和草原局重点实验室

樟子松(Pinus sylvestris var. mongolica)是北方风沙区生态环境建设中重要的常绿乔木树种。该研究旨在揭示樟子松人工林地下真菌群落构建模式,以期深化对“樟子松-真菌”互馈调节关系的理解,并为樟子松人工林可持续经营管理提供微生物... 详细信息

樟子松(Pinus sylvestris var. mongolica)是北方风沙区生态环境建设中重要的常绿乔木树种。该研究旨在揭示樟子松人工林地下真菌群落构建模式,以期深化对“樟子松-真菌”互馈调节关系的理解,并为樟子松人工林可持续经营管理提供微生物视角下的理论基础。该研究以呼伦贝尔沙地不同林龄(26 a、37 a和46 a)樟子松人工林为研究对象,探究其不同生态位(根系、根际土壤和非根际土壤)下真菌多样性和群落组成时空动态特征,并阐明其构建模式。主要结果有:(1)林龄和生态位对樟子松人工林地下真菌多样性有显著影响。地下真菌群落物种丰富度和多样性指数均值排序为46 a> 26 a> 37 a,随林龄增加群落间相异性逐渐增加;地下真菌群落物种丰富度、多样性指数和相异性指数均呈现非根际土壤真菌(NRhSF)>根际土壤真菌(Rh SF)>根内真菌(RAF)。(2)樟子松人工林地下真菌属于14门592属。26 a、37 a和46 a人工林地下真菌分别包含3、1和5个丰富属,均具有内生真菌或外生菌根真菌的共生能力;RAF、RhSF和NRhSF分别包含3、8和5个丰富属,被孢霉门(Mortierellomycota)和腐生营养型真菌占比逐渐增加。(3)樟子松人工林地下真菌主要构建过程为扩散限制(63.54%),其次是生态漂变(22.06%)和同质选择(12.90%)。林龄与地下真菌群落结构呈显著正相关关系;影响RAF、RhSF和NRh SF的主要土壤因子分别为土壤全磷含量(RAF)、全氮含量和全磷含量(Rh SF)以及土壤有机质含量(NRh SF)。研究结果表明,樟子松人工林地下真菌多样性和群落组成在不同林龄和不同生态位存在时空异质性,随机性过程主要由扩散限制主导影响着这些群落,确定性过程是宿主选择和环境过滤共同作用的结果。

关键词：樟子松植物-微生物互作林龄生态位真菌功能

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单叶蔷薇GRAS转录因子家族鉴定及表达分析

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生物技术通报 2025年第1期41卷 210-220页

作者：孔青洋张晓龙李娜张晨洁张雪云于超张启翔罗乐北京林业大学园林学院城乡生态环境北京实验室、花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室、教育部园林环境工程研究中心、林木花卉遗传育种教育部重点实验室林木资源高效生产全国重点实验室、国家花卉工程技术研究中心北京100083

【目的】对单叶蔷薇(Rosa persica)GRAS基因家族成员进行鉴定及功能分析,为单叶蔷薇GRAS基因家族功能研究及育种应用奠定理论基础。【方法】以单叶蔷薇基因组为研究对象,对单叶蔷薇GRAS基因家族进行成员鉴定、结构分析、进化分析、顺式... 详细信息

【目的】对单叶蔷薇(Rosa persica)GRAS基因家族成员进行鉴定及功能分析,为单叶蔷薇GRAS基因家族功能研究及育种应用奠定理论基础。【方法】以单叶蔷薇基因组为研究对象,对单叶蔷薇GRAS基因家族进行成员鉴定、结构分析、进化分析、顺式作用元件分析、GRAS蛋白二级结构、三级结构预测,结合转录组对组织部位、不同水平干旱和低温胁迫环境中基因表达进行分析。【结果】鉴定出42个GRAS基因家族成员,分布在7条不同的染色体上;42个RbGRAS基因可分为9个亚族;基因结构分析表明RbGRAS基因具有保守的N端,而C端在结构上较多变;对基因家族成员共线性分析显示,有4对片段重复基因和4对串联重复基因;顺式作用元件分析发现,单叶蔷薇GRAS基因家族中含有丰富的激素应答元件和胁迫响应元件;RbGRAS蛋白二级预测结构以α-螺旋以及无规则卷曲为主,三级预测结果显示蛋白组成相似;组织特异性表达分析结果显示GRAS基因主要在根系和茎组织中表达,在花中表达量较低;RbGRAS基因在干旱和低温胁迫中也存在基因特异性表达。【结论】鉴定得到42个RbGRAS家族成员,均含有逆境相关作用元件,RbGRAS27和RbGRAS41分别对干旱和低温胁迫积极响应。

关键词：单叶蔷薇 GRAS基因家族生物信息学分析表达分析干旱胁迫低温胁迫

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不同密度油松林地土壤水碳分布特征及其耦合关系

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应用生态学报 2025年第1期36卷 50-58页

作者：郭艳杰毕华兴赵丹阳刘泽晖林丹丹韩金丹黄浩博北京林业大学北京100083 林木资源高效生产全国重点实验室北京100083 山西吉县森林生态系统国家野外科学观测研究站北京100083 水土保持国家林业和草原局重点实验室/北京市水土保持工程技术研究中心/林业生态工程教育部工程研究中心(北京林业大学) 北京100083

本研究以晋西黄土区1000、1800、2700、3600和4500株·hm^(-2)5个林分密度的油松人工林为对象,测定0~5 m土层土壤总碳、有机碳、无机碳和土壤水分含量,分析不同土壤层次土壤水、碳对林分密度的响应,并利用改进的耦合协调度模型,量... 详细信息

本研究以晋西黄土区1000、1800、2700、3600和4500株·hm^(-2)5个林分密度的油松人工林为对象,测定0~5 m土层土壤总碳、有机碳、无机碳和土壤水分含量,分析不同土壤层次土壤水、碳对林分密度的响应,并利用改进的耦合协调度模型,量化水碳权衡/协同强度对林分密度的响应。结果表明:土壤有机碳含量呈现表聚性(0~20 cm),之后随着土壤深度而逐渐减少;土壤无机碳随土壤深度呈先增加后减少趋势,但整体变化不显著。随林分密度的增大,土壤有机碳含量逐渐增加,而土壤无机碳呈先增后减趋势,密度拐点为2549株·hm^(-2)。土壤水分随林分密度呈现先减少后增加的趋势,密度拐点为3268株·hm^(-2)。土壤总碳与水分以及有机碳与水分的耦合协调度均随林分密度增加而先降低后升高,在1000~1800株·hm^(-2)密度区间处于协同发展水平,在1800~3600株·hm^(-2)区间处于过渡调和水平,在3600~4500株·hm^(-2)处于协同发展水平,即呈“协同-权衡-协同”的变化。土壤无机碳与土壤水分的耦合协调度随林分密度增加而降低,在1000~2700株·hm^(-2)密度区间处于协同发展水平,在2700~4500株·hm^(-2)区间处于过渡调和水平,即呈“协同-权衡”的变化。油松林林分密度小于1800株·hm^(-2)时,可减少林木耗水量并增加碳汇,实现土壤固碳与水源涵养的协同发展。

关键词：林分密度水碳耦合权衡与协同晋西黄土区

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紫薇和福建紫薇杂交群体株型性状遗传分析

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福建农业学报 2025年第2期40卷 123-131页

作者：江欣蔚黄佳玉徐玉申梦娇蔡明潘会堂北京林业大学园林学院/林木资源高效生产全国重点实验室/花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室/国家花卉工程技术研究中心/城乡生态环境北京实验室北京100083

【目的】探讨福建紫薇(Lagerstroemia limii)改良紫薇乔木性状的潜力。【方法】以福建紫薇与灌木型紫薇品种‘千层绯雪’为亲本构建正、反交群体,采用相关性分析、主基因+多基因混合遗传模型对一年生杂交后代的株高、地径、一级分枝点... 详细信息

【目的】探讨福建紫薇(Lagerstroemia limii)改良紫薇乔木性状的潜力。【方法】以福建紫薇与灌木型紫薇品种‘千层绯雪’为亲本构建正、反交群体,采用相关性分析、主基因+多基因混合遗传模型对一年生杂交后代的株高、地径、一级分枝点高度、一级分枝数等7个性状进行分析。【结果】(1)杂交后代的株高在1.50~24.5 cm,地径0.30~4.44 mm,一级分枝点高度0.50~6.20 cm,一级分枝数0~4个,多数性状基本呈正态分布,后代中存在潜在的乔木型种质。(2)7个性状的变异系数范围在31.72%~240.42%,变异程度最大的是千层绯雪×福建紫薇群体的一级分枝数,最小的是该群体的一级分枝点高度。福建紫薇×‘千层绯雪’群体的一级分枝点高度、开张角度、侧枝GSA的变异系数比‘千层绯雪’×福建紫薇群体更大,且福建紫薇×‘千层绯雪’群体更倾向表现出植株高、地径粗、分枝数量多,说明福建紫薇作为母本时杂交后代有更丰富的株型变异。(3)相关性分析表明,株高与地径、一级分枝数与开张角度、开张角度与侧枝GSA呈极显著正相关。(4)株高、地径、开张角的最适模型为2MGAD,侧枝GSA、一级分枝点高度的最适模型为2MG-EA。【结论】福建紫薇是培育生长量大、基部不分枝、主干明显的紫薇品种的优良材料,为乔木型紫薇的培育提供依据。

关键词：紫薇远缘杂交株型遗传分析

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梅花肉桂醇脱氢酶基因的鉴定和功能分析

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植物遗传资源学报 2025年第2期26卷 356-368页

作者：刘巳塬罗瑜杭邓思航陈赟包菲北京林业大学园林学院/花卉种质资源创新与分子育种北京市重点实验室/国家花卉工程技术研究中心/城乡生态环境北京实验室北京100083

梅花(Prunus mume Siebold&Zucc.)品种丰富,花香香型多样,其中肉桂醇和乙酸肉桂酯是梅花粉色花品种特有的花香成分。在植物体内,肉桂醛在肉桂醇脱氢酶(CAD)的催化下还原生成肉桂醇,肉桂醇又在乙酰转移酶的催化下生成乙酸肉桂酯。因... 详细信息

梅花(Prunus mume Siebold&Zucc.)品种丰富,花香香型多样,其中肉桂醇和乙酸肉桂酯是梅花粉色花品种特有的花香成分。在植物体内,肉桂醛在肉桂醇脱氢酶(CAD)的催化下还原生成肉桂醇,肉桂醇又在乙酰转移酶的催化下生成乙酸肉桂酯。因此,肉桂醇不仅是梅花重要的特征花香成分,还是合成乙酸肉桂酯的重要前体。本研究基于梅花二代基因组数据鉴定了56个PmCAD同源基因,发现梅花PmCAD家族成员可分为5个亚组,第Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ亚组的蛋白保守基序组成较相似,与第Ⅳ和Ⅴ亚组的差别较大,推测它们之间可能存在功能分化。染色体片段复制和串联复制是PmCAD在基因组中复制进化的两种形式。梅花PmCAD基因启动子区域广泛存在脱落酸、茉莉酸甲酯、水杨酸响应元件和分生组织表达相关元件,推测PmCAD基因主要参与梅花的生长发育和抗逆响应。分析与多物种来源CAD蛋白共建树,结果表明位于第Ⅲ亚组的3个PmCAD可能参与梅花花香合成过程。不同组织器官热图分析表明这3个PmCAD基因都在花器官中表达。基因相对表达量分析发现它们在花开放不同阶段的表达规律不同,在花开放后表达水平较高。体外酶活试验验证了这3个PmCAD都具有肉桂醇脱氢酶活性,因此认为它们共同参与梅花重要花香成分肉桂醇的合成。亚细胞定位分析发现它们在细胞内的分布存在差异,推测它们可能在细胞的不同部位发挥作用。本研究揭示了梅花PmCAD基因的进化和功能分化,为梅花重要花香成分的合成研究奠定了理论基础和为花香分子育种提供了理论依据。

关键词：梅花花香肉桂醇 CAD 基因家族表达模式酶活性

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早实核桃坚果表型和内在品质的关联分析及模型构建

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南京林业大学学报(自然科学版) 2025年第1期49卷 119-127页

作者：李洋张赟齐温玥张绥林陈永浩齐建勋张俊佩侯智霞林木资源高效生产国家重点实验室省部共建森林培育与保护教育部重点实验室北京林业大学林木遗传育种国家重点实验室国家林业和草原局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京市农林科学院林业果树研究所农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室北京市落叶果树工程技术研究中心新疆农业大学园艺学院

【目的】果实表型性状和内在品质间存在关联性。明确早实胡桃(核桃，Juglans regia)内、外在品质关系并构建关联模型，为通过表型性状初步判别果实内在品质提供依据。【方法】以北京市农林科学院核桃选种圃的早实核桃优株为研究对象，... 详细信息

【目的】果实表型性状和内在品质间存在关联性。明确早实胡桃(核桃，Juglans regia)内、外在品质关系并构建关联模型，为通过表型性状初步判别果实内在品质提供依据。【方法】以北京市农林科学院核桃选种圃的早实核桃优株为研究对象，在成熟期对坚果的9个表型性状和4个内在品质指标分别进行了测定，分析各性状的变异系数，并进行方差和相关性分析，最终通过拟合验证得到适宜的关联模型。【结果】(1)坚果13个指标的变异均达到极显著水平(P<0.01),变异系数为5.43%～28.63%,除球形度、几何平均直径、出仁率、含油率和蛋白质外，其余指标的变异系数均达到10%;(2)坚果品质指标间存在相关性。含油率与出仁率的关系最密切，与可溶性糖含量也呈极显著正相关，与淀粉、蛋白质含量关系均不显著；蛋白质、可溶性糖含量与坚果表型性状的关系类似，表现为与坚果大小、干质量及体积出仁率密切相关，与前两者呈极显著负相关，与后者呈极显著正相关，蛋白质、可溶性糖含量均与淀粉含量呈极显著负相关；淀粉含量和坚果大小、干质量呈极显著正相关，而与体积出仁率呈极显著负相关；(3)基于坚果表型性状和内在品质的相关性构建了回归模型，含油率与出仁率呈线性模型关系，可溶性糖含量与体积出仁率呈抛物线关系，淀粉含量与坚果体积呈线性模型关系，蛋白质含量与几何平均直径呈线性模型关系。通过拟合验证，模型预测值与实际值差值位于95%一致性界限(95%LOA)内的点均占总体的95%以上，模型表现出较好的拟合性。【结论】基于坚果表型与内在品质的密切关系构建了较为可靠的回归模型，通过坚果表型可初步判别内在品质优劣，用于适宜品种(系)的初步筛选。

关键词：胡桃(核桃) 表型性状内在品质品种(系)筛选模型拟合

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