检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2021年第4期38卷 493-497页

作者：李称张秋菊孙琳丛雨欣赵敏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的验证ESPCA模型降维及变量选择的效果优于SPCA;利用ESPCA模型分析结肠癌基因数据,寻找不同主成分的通路信息,筛选结肠癌的差异基因。方法模拟实验比较ESPCA模型与SPCA的降维及变量选择能力,通过灵敏度、特异度、准确度评价其变量筛... 详细信息

目的验证ESPCA模型降维及变量选择的效果优于SPCA;利用ESPCA模型分析结肠癌基因数据,寻找不同主成分的通路信息,筛选结肠癌的差异基因。方法模拟实验比较ESPCA模型与SPCA的降维及变量选择能力,通过灵敏度、特异度、准确度评价其变量筛选效果;收集TCGA结肠癌基因数据,利用ESPCA模型对结肠癌基因数据进行降维及变量筛选。结果模拟实验获得的ESPCA模型具有较高的灵敏度、特异度和准确度,降维及变量选择效果优于SPCA。结肠癌数据分析结果显示:降维后ESPCA模型第一主成分中基因与18条GO-BP通路及7条KEGG通路有关,ESPCA模型第二主成分中基因与19条GO-BP通路有关;根据度中心性及中介中心性对主成分基因排序筛选出6个差异基因:MYC、CD44、PKM、FBL、PSMA7、RPS2,经GSE137327数据集验证具有较高的AUC值。结论ESPCA模型在降维过程中既考虑数据本身信息,又考虑了生物网络信息,具有良好的降维及变量选择效果。结肠癌数据分析中ESPCA第一主成分中基因参与癌症相关的通路;ESPCA第二主成分中基因参与的通路与免疫相关;通路中基因参与癌症的发生发展过程、可能通过免疫反应相关通路调节结肠癌的发生发展过程;获得的6个结肠癌差异基因可为研究疾病发生机制和鉴别诊断提供依据。

关键词：边组稀疏主成分分析高维组学降维方法变量选择

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疾病治疗质量综合评价的维度融合方法研究

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中国卫生统计 2022年第1期39卷 157-160页

作者：栗景坤包晓蔷李习王超刘梦洋田园刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

治疗质量是指在现有医疗环境和资源的情况下,不增加病人经济负担,利用循证医学验证的有效治疗方法制定的最合理诊疗式,其本身是一个不可直接测量的变量^([1])。进行医院的治疗质量综合评价,需要考虑疾病诊疗的全部过程,如检查、手术、... 详细信息

治疗质量是指在现有医疗环境和资源的情况下,不增加病人经济负担,利用循证医学验证的有效治疗方法制定的最合理诊疗式,其本身是一个不可直接测量的变量^([1])。进行医院的治疗质量综合评价,需要考虑疾病诊疗的全部过程,如检查、手术、功能评价和结局等^([2]);其中涉及多个治疗维度及相应评价指标^([3]),为获得客观、全面且具有代表性的治疗质量,需要将多个维度的治疗质量进行合理融合获得综合评价结果,确定维度间权重成为获得综合治疗质量的关键。

关键词：治疗质量循证医学疾病诊疗质量综合评价功能评价疾病治疗融合方法直接测量

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基于网络解卷积和网络沉默算法的高维数据网络优化策略与比较

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中国卫生统计 2019年第1期36卷 68-70,74页

作者：荣志炜王文杰李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的根据组学数据构建网络存在间接边的问题,对此可通过适当的算法进行优化。本文使用DREAM5平台的网络数据,对网络解卷积方法(ND)和网络沉默(Silencing)两种网络优化算法的效果进行比较,提供合适的网络构建策略。方法分别使用7种方法... 详细信息

目的根据组学数据构建网络存在间接边的问题,对此可通过适当的算法进行优化。本文使用DREAM5平台的网络数据,对网络解卷积方法(ND)和网络沉默(Silencing)两种网络优化算法的效果进行比较,提供合适的网络构建策略。方法分别使用7种方法构建网络,然后使用ND和Silencing算法对网络优化,再通过ROC-PR曲线的评分对其效果进行比较,最后用网络结构分析方法评价去除间接效应的能力。结果两种方法对大多数网络都有较好的优化能力,能够很好地去除间接效应;相对而言,ND方法略优于Silencing方法。结论使用RF+ND和CLR+Silencing方法构建网络是两种较好的网络构建策略。

关键词：基因调控网络网络优化网络解卷积网络沉默

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基于增强子调控化疗相关基因的结直肠癌分型研究

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中国卫生统计 2024年第1期41卷 45-48,52页

作者：田伟严光灿张秋菊刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的利用增强子RNA调控的化疗相关基因对结直肠癌患者进行分型,为精准医疗提供依据。方法通过TCGA、 GEO数据库获取结直肠癌患者基因表达数据,筛选增强子调控的化疗相关基因,利用非负矩阵分解方法进行直肠癌患者分型,并在独立数据集... 详细信息

目的利用增强子RNA调控的化疗相关基因对结直肠癌患者进行分型,为精准医疗提供依据。方法通过TCGA、 GEO数据库获取结直肠癌患者基因表达数据,筛选增强子调控的化疗相关基因,利用非负矩阵分解方法进行直肠癌患者分型,并在独立数据集中验证分型结果的稳定性。通过生存分析、 GSVA、 SubMap方法,比较各亚型患者在生存结局、代谢通路活性、免疫浸润细胞浸润等方面的差异。收集结直肠癌新辅助化疗患者血浆,检测血浆蛋白表达量,分析增强子RNA(eRNA)调控基因与结果化疗敏感性的相关性。结果本研究收集了581人的TCGA基因表达数据,筛选50个eRNA调控的化疗相关基因,通过非负矩阵分解获得三个结直肠癌亚型:eRNA1、 eRNA2、 eRNA3, GEO验证集的分型结果与TCGA基因表达数据一致,均分为3个亚型。生存分析、代谢通路分析、免疫浸润分析提示:eRNA2,生存结局最差、 32个代谢相关通路异常激活、免疫浸润程度明显偏低。在蛋白水平上,eRNA调控基因与化疗敏感性存在关联性。结论在缺乏有效结直肠癌临床分型的前提下,本研究通过eRNA调控的化疗相关靶基因可以进行结直肠癌稳定有效的分型;各亚型在生存结局、免疫细胞浸润、代谢相关通路研究中的差异,可为临床个体化治疗提供指导,并为相关机制研究指供线索。

关键词：结直肠癌增强子RNA 化疗代谢通路

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病例组合对医生治疗质量排名可靠性的影响研究

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中国卫生统计 2022年第6期39卷 855-858页

作者：刘梦洋王永晨侯爽田园安宁张丽媛魏丽刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的利用乳腺癌治疗质量评价指标中的结局指标及综合得分,分析病例组合对医生治疗质量排序影响,探讨有效的治疗质量排序方法,为医生绩效考核及职称评定提供参考。方法收集浸润性乳腺癌病例数据,计算乳腺癌术后复发率,利用9个治疗质量评... 详细信息

目的利用乳腺癌治疗质量评价指标中的结局指标及综合得分,分析病例组合对医生治疗质量排序影响,探讨有效的治疗质量排序方法,为医生绩效考核及职称评定提供参考。方法收集浸润性乳腺癌病例数据,计算乳腺癌术后复发率,利用9个治疗质量评价指标计算治疗质量综合得分,建立固定效应模型和随机效应模型,分别进行调整和未调整病例组合的logistic回归分析,估计医生治疗质量的固定效应和随机效应,依次进行排序并计算排名可靠性。结果本研究共收集18位医生,1197例治疗患者,乳腺癌术后平均复发率为5%,治疗质量综合得分均值为0.5689。经病例组合因素校正后,医生治疗质量排序发生变化,固定效应模型和随机效应模型的估计系数减小;术后复发率的固定效应模型排序上升率为44.44%,随机效应模型的排序上升率为33.33%,综合得分的固定效应模型排序上升率为38.89%,随机效应模型中排序上升率为27.78%。术后复发率的排名可靠性为0.6078,综合得分的排名可靠性为0.7001。结论在乳腺癌治疗质量评价中,病例组合因素不可忽略,需利用模型进行病例组合校正,可以更公平地比较医生治疗质量的差异;本研究提示选择治疗质量综合得分进行医生治疗质量排序,且医生治疗的患者例数越多,结果越稳定、可靠性更好。

关键词：治疗质量病例组合乳腺癌随机效应

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基于倾向性评分探讨睡眠时相提前综合征与2型糖尿病的关系

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中华疾病控制杂志 2023年第1期27卷 53-59页

作者：高绒绒高倩王彤山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001

目的探讨睡眠时相提前综合征(advanced sleep phase syndrome,ASPS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)间的关联性,为深入理解睡眠的健康效应及预防和干预T2DM提供理论依据。方法本研究数据来源于美国国家健康和营养调查(Natio... 详细信息

目的探讨睡眠时相提前综合征(advanced sleep phase syndrome,ASPS)和2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)间的关联性,为深入理解睡眠的健康效应及预防和干预T2DM提供理论依据。方法本研究数据来源于美国国家健康和营养调查(National Health and Nutrition Examination Survey,NHANES)(2017―2018年)数据库。ASPS由工作日的就寝时间和晨起时间定义。T2DM根据服用降糖药物来定义。使用基于倾向性评分的逆概率加权法(inverse probability treatment weight,IPTW)和重叠加权法(overlap weights,OW)尽可能地控制潜在混杂变量后,分析ASPS和T2DM的关联性。结果共有6048名研究对象被纳入研究,其中759人患有T2DM,411人被诊断为ASPS,分别占12.5%、6.8%。T2DM在ASPS组中的患病率比非ASPS组高(20.0%vs.12.0%,t=21.295,P<0.001)。IPTW控制潜在混杂后,分析显示ASPS组患T2DM的风险是非ASPS组的1.540倍(OR=1.540,95%CI:1.184~2.002,P=0.001);OW进一步完全均衡协变量后,分析显示二者差异有统计学意义(OR=1.362,95%CI:1.078~1.722,P=0.001)。结论ASPS是T2DM独立风险因素,提示睡眠问题的管理在T2DM的防制中具有重要意义。

关键词：睡眠时相提前综合征 2型糖尿病逆概率加权重叠加权

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临床试验中安慰剂的使用和设置问题

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中华医学杂志 2008年第28期88卷 2012-2014页

作者：武振宇李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

为保证临床试验的科学性和有效性，通常采用随机、双盲、安慰剂对照的方法，并视其为标准方法。由于临床试验的受试对象是人而不是动物，并且安慰剂效应的本质毕竟是通过无直接药理学作用的物质或改变治疗过程中的氛围达到一定的效果，... 详细信息

为保证临床试验的科学性和有效性，通常采用随机、双盲、安慰剂对照的方法，并视其为标准方法。由于临床试验的受试对象是人而不是动物，并且安慰剂效应的本质毕竟是通过无直接药理学作用的物质或改变治疗过程中的氛围达到一定的效果，如何在保证受试者权益的前提下尽可能实现试验的科学性，长期以来一直是一个广为关注和争论的问题。

关键词：安慰剂对照临床试验设置药理学作用安慰剂效应受试者权益标准方法受试对象

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基于CRM-TE模型的抗肿瘤药物最适剂量估计方法

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中国卫生统计 2023年第2期40卷 195-198页

作者：周克强李爽徐佳钦李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose... 详细信息

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose,RP2D)。方法基于连续重评估模型(continual reassessment model,CRM)对药物的剂量-毒性和剂量-疗效曲线分别进行估计,并根据给出的权衡函数选择最适剂量。结果本文提出最适剂量估计方法与目前现有的同类型方法相比,能够在保证安全性的前提下,同时综合考虑不同剂量下的疗效,使选择的RP2D更为合理。结论本文为药物临床试验最适推荐剂量提供了一种新的方法,对于抗肿瘤等药物剂量探索具有一定的实用价值。

关键词：临床试验最适剂量权衡函数

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生存质量资料的统计分析方法

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中华预防医学杂志 1996年第3期30卷 172-174页

作者：万崇华方积乾中山医科大学卫生统计学教研室

生存质量资料的统计分析方法万崇华方积乾随着健康观念和医学模式的转变，以及人们生活水平的提高，生存质量的研究越来越受重视，并得到了广泛的应用。相应地产生了大量的生存质量资料。生存质量资料具有不同于一般资料的特点：①生存... 详细信息

生存质量资料的统计分析方法万崇华方积乾随着健康观念和医学模式的转变，以及人们生活水平的提高，生存质量的研究越来越受重视，并得到了广泛的应用。相应地产生了大量的生存质量资料。生存质量资料具有不同于一般资料的特点：①生存质量是难以直接观察的主观构造，需通...

关键词：生存质量统计分析

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Specter聚类方法在单细胞RNA测序数据分析中的应用

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中国卫生统计 2023年第3期40卷 354-357,362页

作者：何佳王文杰张刘超李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的研究Specter聚类的原理和方法,探讨其适用条件,并将其应用于卵巢癌单细胞测序(scRNA-seq)数据的聚类分析,标记得到的细胞亚群。方法通过模拟试验和实际单细胞RNA数据分析,对Specter聚类和较常用的其他三种方法进行比较,并用ARI和NM... 详细信息

目的研究Specter聚类的原理和方法,探讨其适用条件,并将其应用于卵巢癌单细胞测序(scRNA-seq)数据的聚类分析,标记得到的细胞亚群。方法通过模拟试验和实际单细胞RNA数据分析,对Specter聚类和较常用的其他三种方法进行比较,并用ARI和NMI两种评价指标的总得分进行评价。结果模拟试验显示,在设定的条件下,Specter聚类性能均优于其他三种方法;实例数据结果也表明,Specter聚类能够得到合理的细胞亚群。结论Specter聚类方法降低了参数敏感性,提高了聚类的准确性,具有研究价值和应用价值。

关键词： Specter scRNA-seq 聚类细胞亚群

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