检索结果-内蒙古大学图书馆

林业科学研究 2020年第1期33卷 144-151页

作者：朱礼明黎梦娟张景波杨秀艳成铁龙南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 中国林业科学研究院沙漠林业实验中心内蒙古磴口015200 中国林业科学研究院国家林业和草原局盐碱地研究中心北京100091

[目的]为了解西伯利亚白刺(Nitraria sibirica Pall)基本基因组信息,如基因组大小、复杂程度等特征。[方法](1)以西伯利亚白刺的幼苗嫩叶为材料,以番茄为标定,用解离液mG解离叶片后,经流式细胞仪检测细胞悬液,收集细胞并计算西伯利亚白... 详细信息

[目的]为了解西伯利亚白刺(Nitraria sibirica Pall)基本基因组信息,如基因组大小、复杂程度等特征。[方法](1)以西伯利亚白刺的幼苗嫩叶为材料,以番茄为标定,用解离液mG解离叶片后,经流式细胞仪检测细胞悬液,收集细胞并计算西伯利亚白刺的C值。(2)通过构建小片段文库,进行Illumina HiSeq测序并分析测序结果,预估其基因组大小、GC含量、杂合率、重复序列比例等,使用MISA脚本对过滤后数据进行SSR位点分析。[结果]西伯利亚白刺预估全基因组大小为526.30 Mbp,基因组GC含量为36.78%,基因组杂合率为0.90%,重复序列比例为55.39%.对测序数据进行SSR位点标记,共得到521125个SSR位点,其中,单核昔酸重复为342883个,占总SSR位点的65.80%。[结论]由各项分析指标推测西伯利亚白刺为复杂基因组,可以采用二代Illumina与三代PacBio测序辅以Hi-C技术联合分析,有利于西伯利亚白刺基因组的组装及基因图谱的获取。

关键词：西伯利亚白刺流式细胞术基因组大小 GC含量 SSR标记

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基于RAD-seq技术的鹅掌楸基因组SNP标记开发

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南京林业大学学报(自然科学版) 2019年第4期43卷 1-7页

作者：陆叶龙晓飞王鹏凯陈金慧施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学南方现代林业协同创新中心苏州农业职业技术学院

【目的】开发大量可靠的SNP标记,为鹅掌楸高密度遗传连锁图谱的构建和基于基因组的林木选择育种提供分子基础。【方法】从北美鹅掌楸NK基因型为母本、鹅掌楸LS基因型为父本的F1代杂交群体中,选取198株个体为作图群体。用限制性内切酶Eco... 详细信息

【目的】开发大量可靠的SNP标记,为鹅掌楸高密度遗传连锁图谱的构建和基于基因组的林木选择育种提供分子基础。【方法】从北美鹅掌楸NK基因型为母本、鹅掌楸LS基因型为父本的F1代杂交群体中,选取198株个体为作图群体。用限制性内切酶EcoR I对包括2个亲本和198个子代在内的200个单株的基因组DNA进行酶切,构建RAD(restriction-site associated DNA)文库并进行RAD-seq测序。采用读长为91 bp的双末端测序。2个亲本的平均测序深度为2×,198个子代的平均测序深度为0.8×,平均产量为1.94 Gb,共获得约387.21 Gb数据。用Stacks软件将每个样品的RAD-reads作生物信息学分析,对候选位点进行卡方检验和缺失率检验,再将符合孟德尔遗传的标记及与之相对应的RAD-tag序列和鹅掌楸参考基因组序列进行比对。最后,从本研究开发的SNP标记中选取27个候选SNP位点,设计引物,对随机挑选的16个F1代进行PCR扩增并将结果进行测序,同时验证SNP的有效性。【结果】从候选群体中共鉴定到22 019个SNP位点,符合孟德尔遗传规律的标记为4 233个,最终获得3 501个候选SNP标记。SNP验证中,共有293个SNP标记完成测序并能判读结果,所有位点都为SNP位点,共有194(66.2%)个SNP变异类型得到了验证。【结论】基于RAD-seq技术和鹅掌楸参考基因组序列为基础的策略,能够作为一种快速有效的手段,实现大规模的分子标记开发,可用于鹅掌楸等林木的高密度遗传图谱的构建。

关键词：北美鹅掌楸鹅掌楸限制性位点关联DNA测序(RAD-seq)技术 SNP标记遗传连锁图谱

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植物RNA-介导的表观跨代遗传

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分子植物育种 2019年第9期17卷 2850-2854页

作者：甄艳殷梓苡施季森南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

环境胁迫反应的跨代遗传研究与日俱增。其中跨代表观遗传是DNA遗传状态的改变可传给下一代,但DNA序列没有改变。植物遗传信息的表观跨代传递可以依赖RNA的RNA聚合酶扩增sRNA (small RNA)的信息进行传递。植物体内存在着一类sRNAs可以调... 详细信息

环境胁迫反应的跨代遗传研究与日俱增。其中跨代表观遗传是DNA遗传状态的改变可传给下一代,但DNA序列没有改变。植物遗传信息的表观跨代传递可以依赖RNA的RNA聚合酶扩增sRNA (small RNA)的信息进行传递。植物体内存在着一类sRNAs可以调控特定的基因,可在组织间移动,并具有从亲代传递给子代的能力。这些sRNA在维持环境诱导的基因沉默从一代传递给下一代方面具有一定潜力。sRNA的跨代遗传效应可能成为"开关"或是内部自我约束的定时器,使生物体能够调整反应并使其适应环境。本研究着重综述了植物的sRNA特性,sRNA的流动性,RNA介导的跨代遗传及植物遗传胁迫反应。

关键词：跨代遗传 sRNA 基因沉默

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幼树阶段杉木不同无性系生长与形态性状分析

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中南林业科技大学学报 2019年第3期39卷 34-39页

作者：孙云李鑫李勇叶代全施季森边黎明南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 福建省洋口国有林场福建顺昌353200

杉木是我国南方最重要的造林树种之一,在木材安全重大战略中具有举足轻重的地位。株型是决定杉木产量的核心要素,掌握理想株型的性状组成对提高杉木产量具有重要的意义。本研究对来自福建省洋口国有林场的14个杉木组培无性系造林后3 a... 详细信息

杉木是我国南方最重要的造林树种之一,在木材安全重大战略中具有举足轻重的地位。株型是决定杉木产量的核心要素,掌握理想株型的性状组成对提高杉木产量具有重要的意义。本研究对来自福建省洋口国有林场的14个杉木组培无性系造林后3 a内生长量和造林后第2年的形态指标进行比较与分析,研究试验林分郁闭前幼树阶段的形态与和生长特点以及它们之间的关系,为杉木理想型无性系的选择和不同株型的定向培育方法提供理论依据。结果表明:1)造林后1至3年林分树高的平均值分别为1.00、2.52和3.87 m,第3年的胸径平均值为4.76 cm,无性系的树高生长变异系数随着生长时间的增长呈下降的趋势,不同无性系的生长量之间存在极显著的差异;其中除020在高生长上优势明显外,054、061、063和023在3 a内的树高和胸径生长均具有较大的优势。2)造林后第2年坐生密度、冠幅、枝盘数、当年生节间距离、一级侧枝数和年盘二级分枝数的平均值分别为63.58片、176.1 cm、6.11、21.76 cm、21.02和19.88,且不同无性系之间存在极显著的差异;说明杉木株型之间的差异较大。3)通过聚类分析将无性系063、054及061归为浓密型杉木,无性系047、148、023及049归为稀疏型。4)生长与形态之间的相关性分析表明浓密型杉木的生长量更大,根据以上的分析初步认定,在生长初期,杉木的理想株型具有枝条浓密和冠幅宽大的特点。

关键词：杉木无性系形态特征生长性状理想株型福建省顺昌县

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杂交鹅掌楸体胚再生植株淹水胁迫下叶片超微结构及光合特性变化

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林业科学 2018年第3期54卷 19-28页

作者：周艳威陈金慧鲁路成铁龙杨立明施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 南京林业大学生物与环境学院南京210037

【目的】研究不同淹水胁迫处理时间下杂交鹅掌楸植株表型、叶绿体超微结构及光合特性的响应变化,揭示杂交鹅掌楸在淹水胁迫下的响应机制,为其栽培管理和多涝害地区的应用推广提供理论依据。【方法】以无菌培养条件下3~5个叶片的杂交鹅... 详细信息

【目的】研究不同淹水胁迫处理时间下杂交鹅掌楸植株表型、叶绿体超微结构及光合特性的响应变化,揭示杂交鹅掌楸在淹水胁迫下的响应机制,为其栽培管理和多涝害地区的应用推广提供理论依据。【方法】以无菌培养条件下3~5个叶片的杂交鹅掌楸体胚再生植株为研究对象,采用无菌水完全淹没植株的方法模拟水淹灾害,以正常培养条件为对照,研究不同淹水胁迫处理时间(1、3、5、7和7天后恢复处理2天)下杂交鹅掌楸植株表型、光合特性的响应变化以及对叶绿体超微结构的影响。【结果】1)在不同时间的淹水胁迫处理中,杂交鹅掌楸体胚植株受涝害的程度随着淹水时间的延长而明显加重;植株叶片从基部开始卷曲、黄化甚至脱落,但顶芽无明显变化,这可能是杂交鹅掌楸在淹水胁迫中启动相应保护机制以应对淹水胁迫环境。2)淹水胁迫处理过程中叶绿体肿胀变形,膜系统严重损伤,甚至降解,基粒和基质片层堆叠紊乱,淀粉粒不断积累,嗜锇颗粒电子密度增大,胁迫后期出现聚集现象,说明淹水胁迫导致杂交鹅掌楸叶绿体超微结构严重破坏。3)淹水胁迫处理过程中净光合速率、气孔导度和蒸腾速率呈明显下降趋势,而细胞间CO_2浓度呈缓慢上升趋势;光系统Ⅱ的光合电子传递速率、光化学淬灭系数、最大光化学效率和光化学实际量子产量均呈现显著下降趋势,淹水7天并恢复处理2天后光合作用特性参数出现一定程度的恢复,这表明淹水胁迫使杂交鹅掌楸关闭了与外界进行气体交换的气孔通道,并对光系统Ⅱ活性中心造成严重损伤。【结论】长时间淹水胁迫可引起杂交鹅掌楸叶绿体超微结构的破坏,进而损伤光系统Ⅱ反应中心,进而光能转换效率降低,造成叶片光合作用能力降低,最终严重影响植株生长发育。因此,在杂交鹅掌楸的栽培管理中土壤水分含量不宜长期过高。

关键词：杂交鹅掌楸体胚再生植株淹水胁迫超微结构光合特性

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杉木嫁接植株胸径和木材弹性模量变异分析

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森林与环境学报 2019年第1期39卷 102-106页

作者：边黎明叶代全陈松黄金华施季森南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037 福建省洋口国有林场福建顺昌353200

以从杉木第2代种质资源库中复选的182个精选基因型为材料,采用新西兰Fibre-gen的Director ST 300活立木力学性质测定仪,测定了不同声波在精选树无性系嫁接分株的活立木中弹性模量的传播速度,评价精选树嫁接无性系间16年生时的胸径与和... 详细信息

以从杉木第2代种质资源库中复选的182个精选基因型为材料,采用新西兰Fibre-gen的Director ST 300活立木力学性质测定仪,测定了不同声波在精选树无性系嫁接分株的活立木中弹性模量的传播速度,评价精选树嫁接无性系间16年生时的胸径与和弹性模量的遗传变异。结果表明:杉木精选树嫁接无性系间16年生时,胸径性状的平均值为22.34 cm,表型变异系数和遗传变异系数分别为22.16%和11.43%,重复力为0.27 (P <0.001);弹性模量的平均值为3.87 GPa,表型变异系数和遗传变异系数分别为14.99%和11.08%,重复力为0.55(P<0.001);胸径与弹性模量之间的表型和遗传相关性不显著,可以同时进行遗传改良。51个嫁接无性系原株的胸径和弹性模量遗传值均为正值,占参试无性系的28%。其中,精选树原株选自第2代育种群体的半同胞子代测定林的有32株,全同胞子代的有12株;原株来自无性系测定林的有7株,其中福建、浙江、湖南各2株,贵州1株。

关键词：杉木精选树胸径弹性模量遗传变异

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根癌农杆菌介导遗传转化烟草‘NC89’效率的影响因素（英文）

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南京林业大学学报(自然科学版) 2018年第1期42卷 27-34页

作者： MALEKI Samaneh Sadat MOHAMMADI Kourosh 季孔庶南方现代林业协同创新中心南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室

【目的】通过农杆菌介导将PBI121:CslA1基因转入烟草‘NC89’,研究遗传转化的影响因素,旨在提高转化效率,优化相关技术。【方法】通过培养基的筛选在MS培养基+6-BA(2.0 mg/L)+NAA(1.0 mg/L)获得了大量的幼苗,以其作为转基因受体材料,通... 详细信息

【目的】通过农杆菌介导将PBI121:CslA1基因转入烟草‘NC89’,研究遗传转化的影响因素,旨在提高转化效率,优化相关技术。【方法】通过培养基的筛选在MS培养基+6-BA(2.0 mg/L)+NAA(1.0 mg/L)获得了大量的幼苗,以其作为转基因受体材料,通过控制农杆菌浓度、预培养时间、农杆菌侵染时间、共培养时间等条件,进行含卡那选择性培养基的筛选,获得转基因壮苗。【结果】最佳的转基因植株培养方法为:共培养2 d以后,农杆菌的浓度D600为0.7,农杆菌诱导20 min,培养基的卡那质量浓度为100 mg/m L;暗培养4 d易于提高再生率,更换选择性培养基后暗培养7 d,更容易缩短愈伤诱导的时间。用RT-PCR和Southern杂交进一步验证和分析了转基因的结果。【结论】通过优化转基因的各环节条件,实现烟草的过量表达,提高了转基因的效率。研究结果可为农杆菌介导转化法在烟草及其相关植物的遗传转化应用提供参考。

关键词：遗传转化烟草农杆菌介导高效

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植物应答非生物胁迫信号传导研究进展

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分子植物育种 2018年第2期16卷 614-625页

作者：刘铃武小龙诸葛强南京林业大学南方现代林业协同创新中心林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

植物作为固着型的生物必须承受并处理一定程度下的非生物胁迫,如土壤盐渍、干旱和极端温度等,植物主要是基于消耗能量的蛋白激酶感知这些胁迫信号,经胁迫信号传导网络传导到细胞内并重新编码信号网络组成部分的表达与活性,从而达到适应... 详细信息

植物作为固着型的生物必须承受并处理一定程度下的非生物胁迫,如土壤盐渍、干旱和极端温度等,植物主要是基于消耗能量的蛋白激酶感知这些胁迫信号,经胁迫信号传导网络传导到细胞内并重新编码信号网络组成部分的表达与活性,从而达到适应胁迫环境的目的。胁迫条件下产生的信号是通过一系列的转录因子、启动子及蛋白互作来调节一些特定的靶标蛋白,这些靶标蛋白在离子运输、水分运输、代谢、基因重编表达所形成的离子与水分平衡以及细胞稳定等方面发挥着至关重要的作用。植物通过胁迫信号的传导和应答获得抗逆性的增强。

关键词：非生物胁迫信号传导感受器植物激素抗逆性

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珍珠黄杨矮化基因BsGAI2的克隆及功能分析

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植物遗传资源学报 2018年第1期19卷 150-156页

作者：黄昊宫铭张金凤季孔庶南京林业大学南方现代林业协同创新中心/林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

GA信号转导途径或生物合成受阻是导致植物矮化的重要因素,而DELLA蛋白是GA信号传导通路中一类重要的负调节因子。本研究利用同源克隆和RACE技术,从珍珠黄杨中克隆得到BsGAI2基因的c DNA序列,全长为2305 bp,包括1836 bp完整的ORF。实时... 详细信息

GA信号转导途径或生物合成受阻是导致植物矮化的重要因素,而DELLA蛋白是GA信号传导通路中一类重要的负调节因子。本研究利用同源克隆和RACE技术,从珍珠黄杨中克隆得到BsGAI2基因的c DNA序列,全长为2305 bp,包括1836 bp完整的ORF。实时荧光定量表达分析表明,BsGAI2基因在珍珠黄杨茎中表达量最高,在根中表达量最低;BsGAI2转基因烟草呈明显矮化,节间变短,长势较慢,延迟开花等特征。利用GFP荧光检测方法鉴定转化型烟草,发现转化苗的叶、茎中均有荧光信号,并且茎木质部有明亮富集的荧光信号。这些结果均表明BsGAI2基因可能在珍珠黄杨茎节间缩短导致矮化的过程中扮演重要角色。本研究分析了BsGAI2基因编码蛋白的理化性质和功能鉴定,为今后进一步研究BsGAI2基因及DELLA蛋白家族的功能提供了理论依据。

关键词：珍珠黄杨 BsGAI2基因 DELLA蛋白功能分析

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适合杨树叶片蛋白质组学样品制备方法的比较（英文）

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南京林业大学学报(自然科学版) 2018年第2期42卷 33-39页

作者：甄艳郑秀化施季森南方现代林业协同创新中心林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学林学院

【目的】为了提高植物叶片中低丰度蛋白质的检测效率,建立有效的杨树叶片蛋白质组学分析的蛋白质提取方法。【方法】利用三氯乙酸-丙酮结合PEG分级提取方法和SDS-酚结合PEG分级提取方法对杨树叶片蛋白质进行提取,并采用SDS-PAGE和双向... 详细信息

【目的】为了提高植物叶片中低丰度蛋白质的检测效率,建立有效的杨树叶片蛋白质组学分析的蛋白质提取方法。【方法】利用三氯乙酸-丙酮结合PEG分级提取方法和SDS-酚结合PEG分级提取方法对杨树叶片蛋白质进行提取,并采用SDS-PAGE和双向凝胶电泳(2-DE)对提取结果进行评价。【结果】SDS-PAGE实验结果显示,三氯乙酸-丙酮结合PEG方法优于SDS-酚结合PEG分级方法。三氯乙酸-丙酮结合PEG分级和非结合PEG分级提取蛋白质的双向电泳结果表明,PEG分级能有效地去除高丰度蛋白质Rubisco,提高低丰度蛋白质的检测。三氯乙酸-丙酮结合PEG分级法检测的蛋白质比非结合PEG分级法多90个蛋白质点。【结论】以LTQ-Orbitrap XL分析三氯乙酸-丙酮结合PEG分级分离的一些蛋白质显示,三氯乙酸-丙酮结合PEG分级对于2-DE和MS鉴定低丰度蛋白质是一种有效的分离方法。

关键词：核酮糖-1,5-二磷酸羧化-加氧酶聚乙二醇分级杨树叶片双向电泳

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