检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2024年第1期41卷 45-48,52页

作者：田伟严光灿张秋菊刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的利用增强子RNA调控的化疗相关基因对结直肠癌患者进行分型,为精准医疗提供依据。方法通过TCGA、 GEO数据库获取结直肠癌患者基因表达数据,筛选增强子调控的化疗相关基因,利用非负矩阵分解方法进行直肠癌患者分型,并在独立数据集... 详细信息

目的利用增强子RNA调控的化疗相关基因对结直肠癌患者进行分型,为精准医疗提供依据。方法通过TCGA、 GEO数据库获取结直肠癌患者基因表达数据,筛选增强子调控的化疗相关基因,利用非负矩阵分解方法进行直肠癌患者分型,并在独立数据集中验证分型结果的稳定性。通过生存分析、 GSVA、 SubMap方法,比较各亚型患者在生存结局、代谢通路活性、免疫浸润细胞浸润等方面的差异。收集结直肠癌新辅助化疗患者血浆,检测血浆蛋白表达量,分析增强子RNA(eRNA)调控基因与结果化疗敏感性的相关性。结果本研究收集了581人的TCGA基因表达数据,筛选50个eRNA调控的化疗相关基因,通过非负矩阵分解获得三个结直肠癌亚型:eRNA1、 eRNA2、 eRNA3, GEO验证集的分型结果与TCGA基因表达数据一致,均分为3个亚型。生存分析、代谢通路分析、免疫浸润分析提示:eRNA2,生存结局最差、 32个代谢相关通路异常激活、免疫浸润程度明显偏低。在蛋白水平上,eRNA调控基因与化疗敏感性存在关联性。结论在缺乏有效结直肠癌临床分型的前提下,本研究通过eRNA调控的化疗相关靶基因可以进行结直肠癌稳定有效的分型;各亚型在生存结局、免疫细胞浸润、代谢相关通路研究中的差异,可为临床个体化治疗提供指导,并为相关机制研究指供线索。

关键词：结直肠癌增强子RNA 化疗代谢通路

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于蛋白质组学的胃腺癌患者预后标志物筛选

引用

中国卫生统计 2025年第1期42卷 18-25,32页

作者：刘佳璐韩鑫浩魏孝礼陈璐程丽霞陈英东王文晗张秋菊哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院消化内科

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并... 详细信息

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并计算风险评分,根据风险评分结果将患者划分为高风险组和低风险组开展生存分析。同时绘制风险评分的ROC曲线、蛋白质热图等,用以评估这些蛋白质的预测能力。然后,将风险评分与患者其他临床表型数据结合,进行多因素回归分析,建立预后模型,并绘制列线图。通过C-index指标、ROC曲线、决策曲线等评估预后模型建立的准确性。进行GO富集分析与KEGG富集分析,探索相关蛋白所参与的生物学过程。结果通过单因素Cox分析及LASSO-Cox分析筛选出15个差异蛋白质(CKIT、CHK1、CLAUDIN7、COLLAGENVI、DVL3、EGFR_pY1173、ERALPHA_pS11、NFKBP65_pS536、SYK、ETS1、MYOSINIIA_pS1943、P21、P90RSK、RAPTOR、XBP1),用于计算蛋白质风险评分。通过多因素回归分析,筛选出年龄、性别、M分期、N分期、风险评分这5种因素,构建预后模型。生存分析结果认为,蛋白质风险评分划分的高低风险组之间的总生存率有显著差异(P<0.0001)。列线图可以用来预测患者3年、5年的生存率,并认为具有较好的预测价值(C-index=0.7257)。ROC曲线显示模型在预测中表现出稳定的灵敏度和特异度(AUC=0.77和0.86)。结论胃腺癌预后相关蛋白质的预测模型可用来预测患者的临床预后,研究结果可为个性化治疗和管理提供参考。

关键词：胃腺癌预测模型预后

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

变异系数加权组合赋权模型的乳腺癌治疗质量维度融合及评价

引用

中国卫生统计 2023年第5期40卷 646-650页

作者：安宁栗景坤刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计教研室 150081

目的基于两参数项目反应模型计算乳腺癌各维度治疗质量,利用变异系数加权组合赋权模型进行维度赋权,加权计算乳腺癌维度融合的综合治疗质量,为改善治疗质量提供依据。方法选择不同维度乳腺癌治疗质量的评价指标,收集医院乳腺癌患者的病... 详细信息

目的基于两参数项目反应模型计算乳腺癌各维度治疗质量,利用变异系数加权组合赋权模型进行维度赋权,加权计算乳腺癌维度融合的综合治疗质量,为改善治疗质量提供依据。方法选择不同维度乳腺癌治疗质量的评价指标,收集医院乳腺癌患者的病历数据,利用两参数logistic项目反应模型计算各维度治疗质量;利用序关系分析法(garbage-first,G1法)计算主观权重、余弦夹角法计算客观权重、将主客观权重纳入变异系数加权组合赋权模型获得组合权重;加权计算维度融合后的综合治疗质量并进行评价。结果选择三个维度的9个乳腺癌治疗质量评价指标,三个维度分别为功能评价、治疗方法及术前检查,收集9家医院3669例患者的完整病历信息。计算获得医院的各维度治疗质量:功能评价维度最高得分为1.0317,治疗方法维度最高得分为0.9232,术前检查维度最高得分为1.2001。G1法算得三个维度的主观权重分别为0.5364、0.2980和0.1656;余弦夹角法算得客观权重分别为:0.5220、0.3554和0.5868。利用变异系数加权组合赋权模型获得各维度组合权重:第9家医院的功能评价维度最大组合权重为0.5293,第5家医院的治疗方法维度最大组合权重为0.3209,第1家医院的术前检查维度最大组合权重为0.3857。加权计算融合后的综合治疗质量:排名前三的医院分别为第1家,第7家和第9家医院,综合得分分别为1.04220,1.0371和1.0157。结论研究提示组合权重法能在主客观权重出现极值时获得更稳定的权重,使融合后的治疗质量排名更合理;功能评价维度对综合治疗质量的影响较大,提高功能评价维度的使用率有利于改善乳腺癌的治疗质量。

关键词：治疗质量评价项目反应模型维度融合

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于TransUNet改进的多任务模型在直肠癌新辅助治疗中的应用

引用

中国卫生统计 2025年第1期42卷 2-6页

作者：尹淑文丁志鹏李岩高国闳程丽霞陈英东王文晗张秋菊周洋哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院影像中心

目的本研究基于深度学习方法对分割模型TransUNet做部分改进,构建既可分割又可预测分类的多任务模型,并应用于直肠癌新辅助治疗患者敏感人群识别的核磁图像中。方法多任务模型在TransUNet基础上添加分类结构,具体为全连接层(输入为512,... 详细信息

目的本研究基于深度学习方法对分割模型TransUNet做部分改进,构建既可分割又可预测分类的多任务模型,并应用于直肠癌新辅助治疗患者敏感人群识别的核磁图像中。方法多任务模型在TransUNet基础上添加分类结构,具体为全连接层(输入为512,输出为256)、ReLU激活函数、全连接层(输入为256,输出为3),实现三分类结局的预测,即疾病稳定(stable disease,SD),部分反应(partial response,PR)和完全反应(complete response,CR)。以2015—2017年哈尔滨医科大学附属肿瘤医院收治的71名直肠癌患者新辅助化疗前的3D核磁图像提取为2D图像作为研究数据,采用Dice系数和豪斯多夫距离评价分割效果,准确率、micro-precision、micro-recall和micro-F1 score评价分类效果。结果模型训练了100个轮次,分割任务在测试集上的平均Dice系数和平均豪斯多夫距离分别为0.851和10.806,分类任务从切片角度,测试集上的准确率、micro-precision、micro-recall和micro-F1 score均为0.615,从患者角度,四个指标均为0.857。结论分割任务效果良好,分类任务以切片为单位,效果一般,以患者为单位,考虑到结局为三分类,尚且可以接受。该多任务模型有潜力用于临床进行辅助诊断。

关键词：深度学习多任务学习结直肠癌新辅助治疗

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于CRM-TE模型的抗肿瘤药物最适剂量估计方法

引用

中国卫生统计 2023年第2期40卷 195-198页

作者：周克强李爽徐佳钦李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose... 详细信息

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose,RP2D)。方法基于连续重评估模型(continual reassessment model,CRM)对药物的剂量-毒性和剂量-疗效曲线分别进行估计,并根据给出的权衡函数选择最适剂量。结果本文提出最适剂量估计方法与目前现有的同类型方法相比,能够在保证安全性的前提下,同时综合考虑不同剂量下的疗效,使选择的RP2D更为合理。结论本文为药物临床试验最适推荐剂量提供了一种新的方法,对于抗肿瘤等药物剂量探索具有一定的实用价值。

关键词：临床试验最适剂量权衡函数

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

Specter聚类方法在单细胞RNA测序数据分析中的应用

引用

中国卫生统计 2023年第3期40卷 354-357,362页

作者：何佳王文杰张刘超李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的研究Specter聚类的原理和方法,探讨其适用条件,并将其应用于卵巢癌单细胞测序(scRNA-seq)数据的聚类分析,标记得到的细胞亚群。方法通过模拟试验和实际单细胞RNA数据分析,对Specter聚类和较常用的其他三种方法进行比较,并用ARI和NM... 详细信息

目的研究Specter聚类的原理和方法,探讨其适用条件,并将其应用于卵巢癌单细胞测序(scRNA-seq)数据的聚类分析,标记得到的细胞亚群。方法通过模拟试验和实际单细胞RNA数据分析,对Specter聚类和较常用的其他三种方法进行比较,并用ARI和NMI两种评价指标的总得分进行评价。结果模拟试验显示,在设定的条件下,Specter聚类性能均优于其他三种方法;实例数据结果也表明,Specter聚类能够得到合理的细胞亚群。结论Specter聚类方法降低了参数敏感性,提高了聚类的准确性,具有研究价值和应用价值。

关键词： Specter scRNA-seq 聚类细胞亚群

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

疾病治疗质量纵向综合评价模型的构建及在CIS中的应用

引用

中国卫生统计 2024年第5期41卷 662-666,670页

作者：于磊刘梦洋王超栗景坤刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 吉林医药学院流行病与卫生统计学教研室

目的构建疾病治疗质量纵向综合评价模型,应用模型评价急性缺血性脑卒中(cerebral ischemic stroke,CIS)的治疗质量。方法潜变量测量模型联合多项式和多水平回归,建立疾病治疗质量纵向综合评价模型,利用马尔科夫蒙特卡洛(Markov Chain Mo... 详细信息

目的构建疾病治疗质量纵向综合评价模型,应用模型评价急性缺血性脑卒中(cerebral ischemic stroke,CIS)的治疗质量。方法潜变量测量模型联合多项式和多水平回归,建立疾病治疗质量纵向综合评价模型,利用马尔科夫蒙特卡洛(Markov Chain Monte Carlo,MCMC)方法进行参数估计。模拟研究确定模型的适用条件,通过均方根误差(root mean square error,RMSE)和秩相关系数评价模型参数估计的准确性,并与潜变量增长曲线模型(latent growth curve model,LGCM)进行效果比较。结果构建可用于评价疾病治疗质量纵向变化、趋势变化及协变量影响的综合模型。模拟研究结果:评价对象数对模型效果影响较小,观测时间数6个、评价指标数20个时,模型可获得评价对象不同时间点治疗质量及变化趋势。治疗质量估计值与真值的秩相关系数均值为0.8128,高于LGCM的0.7610,协变量回归系数估计值与真值的RMSE均值为0.3756,低于LGCM的0.448;观测时间数及评价指标数越多,纵向综合评价模型效果越准确,且始终高于LGCM。应用结果:2011年到2016年,医院CIS平均治疗质量综合得分增加了0.9256,二级和三级医院分别增加了0.9432和1.321,教学和非教学医院分别增加了1.4904和1.1155。结论纵向综合评价模型可以全面合理评价疾病治疗质量及其纵向变化,分析评价对象的差异对变化趋势的影响。我国CIS治疗质量总体向好,变化趋势受医院等级及教学状态影响,研究结果可为后续有针对性的治疗质量干预措施制定及治疗质量的持续改善提供参考。

关键词：治疗质量评价纵向研究综合评价模型急性缺血性脑卒中

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于工具变量Probit模型的AMI治疗过程质量对再入院的影响研究

引用

中国卫生统计 2023年第2期40卷 183-186页

作者：张丽媛侯爽刘美娜哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081

目的分析急性心肌梗死(acute myocardial infarction, AMI)患者治疗过程质量评价指标对患者再入院的影响,为提高治疗过程质量、改善患者结局提供依据。方法收集某医院2014年12月-2016年12月期间急性心肌梗死患者;选取到达医院10min内... 详细信息

目的分析急性心肌梗死(acute myocardial infarction, AMI)患者治疗过程质量评价指标对患者再入院的影响,为提高治疗过程质量、改善患者结局提供依据。方法收集某医院2014年12月-2016年12月期间急性心肌梗死患者;选取到达医院10min内心电图检查、冠脉造影等7个治疗过程指标,计算指标使用率;利用Probit回归与工具变量Probit模型分析治疗过程评价指标对再入院的影响。结果纳入4317例急性心肌梗死患者,其中245例出院后再次住院,再入院率为5.68%。治疗过程指标为:到达医院10min内心电图检查、冠脉造影检查、入院24h内β受体阻滞剂、住院期间氯吡格雷的使用、到达医院30min内溶栓治疗、入院90min内PCI和入院24h内阿司匹林,其使用率分别为99.68%、82.99%、44.49%、97.29%、0.07%、63.99%和98.34%。Probit回归分析显示,接受冠脉造影检查(OR=0.778,95%CI=0.661~0.917)和入院90min内PCI治疗(OR=0.808,95%CI=0.689~0.950)的患者再入院风险较未接受患者降低;住院期间氯吡格雷的使用与再入院成正比且差异有统计学意义(OR=1.354,95%CI=1.023~1.428)。工具变量Probit模型分析显示,治疗过程指标中到达医院30min内溶栓治疗、入院24h内β受体阻滞剂、住院期间氯吡格雷的使用、入院24h内阿司匹林具有内生性,接受相对未接受4种药物治疗的患者再入院风险降低;OR值分别为:OR=0.4(95%CI:0.163~0.984)、OR=0.103(95%CI:0.011~0.939)、OR=0.729(95%CI:0.536~0.992)、OR=0.286(95%CI:0.084~0.977)。结论在急性心肌梗死患者的治疗过程中,可以通过提高冠脉造影、入院90min内PCI、到达医院30min内溶栓治疗、入院24h内β受体阻滞剂、住院期间氯吡格雷、入院24h内阿司匹林的使用,从而改善治疗过程质量、降低再入院风险。

关键词：急性心肌梗死评价指标治疗过程质量工具变量

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

生命八要素评分与心血管代谢疾病发病风险相关性的城乡差异

引用

中国循环杂志 2025年第3期40卷 269-276页

作者：陈占超刘岩房绍红田伟王善杰于波哈尔滨医科大学附属第二医院心内科心肌缺血教育部重点实验室寒地心血管病全国重点实验室哈尔滨150086 佳木斯大学公共卫生学院流行病学与生物统计学系佳木斯154007 哈尔滨医科大学公共卫生学院流行病学与生物统计教研室哈尔滨150086

目的:探讨中国成年人生命八要素(LE8)评分与心血管代谢疾病(CMD)发病风险相关性的城乡差异。方法:选取2009~2015年中国健康与营养调查(CHNS)队列18岁以上无CMD的成年人4719名,其中城市地区1909名,农村地区2810名。根据LE8评分的三分位... 详细信息

目的:探讨中国成年人生命八要素(LE8)评分与心血管代谢疾病(CMD)发病风险相关性的城乡差异。方法:选取2009~2015年中国健康与营养调查(CHNS)队列18岁以上无CMD的成年人4719名,其中城市地区1909名,农村地区2810名。根据LE8评分的三分位数将研究对象分为较低组(<67.5分)、中等组(67.5~77.5分)和较高组(>77.5分)。城市地区的较低组、中等组、较高组分别为780例、564例、565例,农村地区的较低组、中等组、较高组分别为838例、934例、1038例。主要结局为随访期间新诊断的糖尿病、脑卒中和(或)心肌梗死。采用Cox比例风险回归模型分析LE8与新发CMD风险相关性的城乡差异。结果:LE8评分总分农村地区略高于城市地区(72.9分vs.70.2分,P<0.01)。平均随访(5.86±0.74)年期间,新发CMD176例,其中城市地区67例,农村地区109例。多因素Cox分析显示,在完全调整模型中,相对于城市地区的较高组,农村地区的较低组(HR=1.65,95%CI:1.27~2.15,P=0.001)新发CMD风险增加最多,其次是城市地区的较低组(HR=1.49,95%CI:1.01~2.21,P=0.046)、农村地区的中等组(HR=1.42,95%CI:1.06~1.90,P=0.020)和农村地区的较高组(HR=1.16,95%CI:1.01~1.33,P=0.032)。多变量Cox回归结果显示,城市地区中,与LE8各指标≥70分人群相比,<70分的体重指数(BMI)评分(HR=2.70,95%CI:1.51~4.84,P<0.01)、血糖评分(HR=2.09,95%CI:1.24~3.51,P<0.01)、血压评分(HR=3.73,95%CI:1.69~8.24,P<0.01)增加新发CMD风险;在农村地区中,与≥70分人群相比,<70分的BMI评分(HR=3.92,95%CI:2.43~6.30,P<0.01)、非高密度脂蛋白胆固醇(non-HDL-C)评分(HR=2.96,95%CI:1.94~4.52,P<0.01)、血糖评分(HR=2.59,95%CI:1.71~3.94,P<0.01)和血压评分(HR=1.85,95%CI:1.18~2.92,P<0.01)增加新发CMD风险。<70分的BMI、血糖、non-HDL-C评分相关的CMD发病风险,在农村地区高于城市地区。结论:尽管农村地区LE8评分略高于城市地区,但较低LE8评分相关的CMD发病风险在农村地区尤其显著。加强农村地区居民心血管健康水平监测和一级预防,对降低我国CMD负担有重要意义。

关键词：心血管健康生命八要素心血管代谢疾病队列研究

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于sigFeature方法的小麦不耐受患者差异蛋白筛选及通路研究

引用

中国卫生统计 2022年第3期39卷 329-334页

作者：赵敏张薇孙琳王玉鹏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白... 详细信息

目的应用蛋白质组学技术,基于sigFeature变量筛选方法,获得小麦不耐受患者血清差异表达蛋白;利用富集分析获得差异蛋白生物学解释,为小麦不耐受发病机制的研究提供依据。方法收集小麦不耐受患者和对照组血清样本;应用TMT标记定量蛋白质组学技术获得蛋白表达数据、sigFeature方法筛选差异表达蛋白;进行差异蛋白GO功能注释和KEGG富集分析,外部数据集进行差异蛋白验证。结果 TMT技术鉴定蛋白849个,sigFeature筛选获得差异蛋白22个。富集分析结果:GO富集分析发现差异蛋白参与血小板脱颗粒、急性期反应等生物学过程;KEGG富集分析发现差异蛋白参与补体与凝血级联通路。外部验证结果:ITIH2蛋白的ROC曲线下面积最大,AUC值为0.8673。结论补体系统抑制和脂质代谢过程的改变是小麦不耐受发生的重要环节;ITIH2蛋白可能是小麦不耐受的关键蛋白;本研究从人体血清蛋白质组学的角度,为探究小麦不耐受的发生和调控机制提供依据。

关键词：小麦不耐受差异表达蛋白变量筛选

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：