检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2021年第1期38卷 21-24页

作者：卢娅欣黄月李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的探讨XGBoost算法在二分类高维非平衡数据中的分类判别效果。方法通过模拟实验及真实代谢组学数据分析,对XGBoost、随机森林、支持向量机、随机欠采样以及随机梯度提升树共五种方法进行比较。结果模拟实验显示,XGBoost算法在数据非... 详细信息

目的探讨XGBoost算法在二分类高维非平衡数据中的分类判别效果。方法通过模拟实验及真实代谢组学数据分析,对XGBoost、随机森林、支持向量机、随机欠采样以及随机梯度提升树共五种方法进行比较。结果模拟实验显示,XGBoost算法在数据非平衡较明显时,在各种实验条件下均优于或不劣于其他四种算法,在数据类别趋于平衡的情况下也同样具有较好的分类效果,且对噪声变量具有一定的抗干扰能力。实例分析显示,与其他四种算法相比,XGBoost算法的分类性能最优,且在保证分类效果的基础上具有更快的运算速度。结论 XGBoost算法适用于非平衡高维数据的判别分析,值得研究。

关键词：极端梯度提升算法高维组学数据分类判别

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基于lncRNA-mRNA共表达网络筛选胃癌分期相关的lncRNA

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中国卫生统计 2021年第5期38卷 665-669页

作者：丛雨欣张秋菊田伟张奇李称赵敏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的构建lncRNA-mRNA共表达网络,探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系,为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法利用TCGA数据库,收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据;采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因... 详细信息

目的构建lncRNA-mRNA共表达网络,探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系,为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法利用TCGA数据库,收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据;采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因共表达网络分析(WGCNA)相结合的方法,构建lncRNA-mRNA共表达网络模块,结合临床信息筛选与胃癌分期相关的模块;采用Kruskal-Wallis秩和检验筛选模块内胃癌不同分期差异表达的lncRNA。结果获得286例胃癌组织和30例癌旁对照组织样本的RNA-seq数据;eQTL分析得到5118对顺式作用和1 953 109对反式作用lncRNA-mRNA;2 999个lncRNA和3 884个mRNA纳入WGCNA,产生25个共表达模块,其中与胃癌分期高度相关的模块有3个;模块midnightblue、orange内18个枢纽lncRNA中有14个lncRNA在胃癌不同分期差异表达。结论本研究筛选出14个与胃癌分期相关的lncRNA,这14个lncRNA可能通过调控mRNA的表达影响胃癌的进展,分析其对应的网络调控关系,为研究lncRNA-mRNA调控机制及探索胃癌治疗靶点提供了参考和方向。

关键词：胃癌 eQTL 加权基因共表达网络 lncRNA mRNA

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基于网络解卷积和网络沉默算法的高维数据网络优化策略与比较

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中国卫生统计 2019年第1期36卷 68-70,74页

作者：荣志炜王文杰李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的根据组学数据构建网络存在间接边的问题,对此可通过适当的算法进行优化。本文使用DREAM5平台的网络数据,对网络解卷积方法(ND)和网络沉默(Silencing)两种网络优化算法的效果进行比较,提供合适的网络构建策略。方法分别使用7种方法... 详细信息

目的根据组学数据构建网络存在间接边的问题,对此可通过适当的算法进行优化。本文使用DREAM5平台的网络数据,对网络解卷积方法(ND)和网络沉默(Silencing)两种网络优化算法的效果进行比较,提供合适的网络构建策略。方法分别使用7种方法构建网络,然后使用ND和Silencing算法对网络优化,再通过ROC-PR曲线的评分对其效果进行比较,最后用网络结构分析方法评价去除间接效应的能力。结果两种方法对大多数网络都有较好的优化能力,能够很好地去除间接效应;相对而言,ND方法略优于Silencing方法。结论使用RF+ND和CLR+Silencing方法构建网络是两种较好的网络构建策略。

关键词：基因调控网络网络优化网络解卷积网络沉默

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基于CRM-TE模型的抗肿瘤药物最适剂量估计方法

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中国卫生统计 2023年第2期40卷 195-198页

作者：周克强李爽徐佳钦李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose... 详细信息

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose,RP2D)。方法基于连续重评估模型(continual reassessment model,CRM)对药物的剂量-毒性和剂量-疗效曲线分别进行估计,并根据给出的权衡函数选择最适剂量。结果本文提出最适剂量估计方法与目前现有的同类型方法相比,能够在保证安全性的前提下,同时综合考虑不同剂量下的疗效,使选择的RP2D更为合理。结论本文为药物临床试验最适推荐剂量提供了一种新的方法,对于抗肿瘤等药物剂量探索具有一定的实用价值。

关键词：临床试验最适剂量权衡函数

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疾病治疗质量综合评价的维度融合方法研究

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中国卫生统计 2022年第1期39卷 157-160页

作者：栗景坤包晓蔷李习王超刘梦洋田园刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

治疗质量是指在现有医疗环境和资源的情况下,不增加病人经济负担,利用循证医学验证的有效治疗方法制定的最合理诊疗式,其本身是一个不可直接测量的变量^([1])。进行医院的治疗质量综合评价,需要考虑疾病诊疗的全部过程,如检查、手术、... 详细信息

治疗质量是指在现有医疗环境和资源的情况下,不增加病人经济负担,利用循证医学验证的有效治疗方法制定的最合理诊疗式,其本身是一个不可直接测量的变量^([1])。进行医院的治疗质量综合评价,需要考虑疾病诊疗的全部过程,如检查、手术、功能评价和结局等^([2]);其中涉及多个治疗维度及相应评价指标^([3]),为获得客观、全面且具有代表性的治疗质量,需要将多个维度的治疗质量进行合理融合获得综合评价结果,确定维度间权重成为获得综合治疗质量的关键。

关键词：治疗质量循证医学疾病诊疗质量综合评价功能评价疾病治疗融合方法直接测量

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Specter聚类方法在单细胞RNA测序数据分析中的应用

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中国卫生统计 2023年第3期40卷 354-357,362页

作者：何佳王文杰张刘超李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的研究Specter聚类的原理和方法,探讨其适用条件,并将其应用于卵巢癌单细胞测序(scRNA-seq)数据的聚类分析,标记得到的细胞亚群。方法通过模拟试验和实际单细胞RNA数据分析,对Specter聚类和较常用的其他三种方法进行比较,并用ARI和NM... 详细信息

目的研究Specter聚类的原理和方法,探讨其适用条件,并将其应用于卵巢癌单细胞测序(scRNA-seq)数据的聚类分析,标记得到的细胞亚群。方法通过模拟试验和实际单细胞RNA数据分析,对Specter聚类和较常用的其他三种方法进行比较,并用ARI和NMI两种评价指标的总得分进行评价。结果模拟试验显示,在设定的条件下,Specter聚类性能均优于其他三种方法;实例数据结果也表明,Specter聚类能够得到合理的细胞亚群。结论Specter聚类方法降低了参数敏感性,提高了聚类的准确性,具有研究价值和应用价值。

关键词： Specter scRNA-seq 聚类细胞亚群

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临床试验中安慰剂的使用和设置问题

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中华医学杂志 2008年第28期88卷 2012-2014页

作者：武振宇李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

为保证临床试验的科学性和有效性，通常采用随机、双盲、安慰剂对照的方法，并视其为标准方法。由于临床试验的受试对象是人而不是动物，并且安慰剂效应的本质毕竟是通过无直接药理学作用的物质或改变治疗过程中的氛围达到一定的效果，... 详细信息

为保证临床试验的科学性和有效性，通常采用随机、双盲、安慰剂对照的方法，并视其为标准方法。由于临床试验的受试对象是人而不是动物，并且安慰剂效应的本质毕竟是通过无直接药理学作用的物质或改变治疗过程中的氛围达到一定的效果，如何在保证受试者权益的前提下尽可能实现试验的科学性，长期以来一直是一个广为关注和争论的问题。

关键词：安慰剂对照临床试验设置药理学作用安慰剂效应受试者权益标准方法受试对象

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病例组合对医生治疗质量排名可靠性的影响研究

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中国卫生统计 2022年第6期39卷 855-858页

作者：刘梦洋王永晨侯爽田园安宁张丽媛魏丽刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的利用乳腺癌治疗质量评价指标中的结局指标及综合得分,分析病例组合对医生治疗质量排序影响,探讨有效的治疗质量排序方法,为医生绩效考核及职称评定提供参考。方法收集浸润性乳腺癌病例数据,计算乳腺癌术后复发率,利用9个治疗质量评... 详细信息

目的利用乳腺癌治疗质量评价指标中的结局指标及综合得分,分析病例组合对医生治疗质量排序影响,探讨有效的治疗质量排序方法,为医生绩效考核及职称评定提供参考。方法收集浸润性乳腺癌病例数据,计算乳腺癌术后复发率,利用9个治疗质量评价指标计算治疗质量综合得分,建立固定效应模型和随机效应模型,分别进行调整和未调整病例组合的logistic回归分析,估计医生治疗质量的固定效应和随机效应,依次进行排序并计算排名可靠性。结果本研究共收集18位医生,1197例治疗患者,乳腺癌术后平均复发率为5%,治疗质量综合得分均值为0.5689。经病例组合因素校正后,医生治疗质量排序发生变化,固定效应模型和随机效应模型的估计系数减小;术后复发率的固定效应模型排序上升率为44.44%,随机效应模型的排序上升率为33.33%,综合得分的固定效应模型排序上升率为38.89%,随机效应模型中排序上升率为27.78%。术后复发率的排名可靠性为0.6078,综合得分的排名可靠性为0.7001。结论在乳腺癌治疗质量评价中,病例组合因素不可忽略,需利用模型进行病例组合校正,可以更公平地比较医生治疗质量的差异;本研究提示选择治疗质量综合得分进行医生治疗质量排序,且医生治疗的患者例数越多,结果越稳定、可靠性更好。

关键词：治疗质量病例组合乳腺癌随机效应

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论文中常见统计学问题的分析——定量资料的一般性统计分析

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中国地方病学杂志 2004年第4期23卷 380-382页

作者：刘艳方庆伟隋虹李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150001

定量资料的一般性统计分析中比较常用的方法就是t检验、方差分析与秩和检验,看起来简单,却容易出错。在分析时须考虑资料的设计类型,不要把t检验当成“万能工具”。只有结合实际,正确选择统计分析方法,才能得出令人信服的结论。

关键词：论文统计学统计分析 t检验方差分析秩和检验

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随机森林回归分析方法在代谢组学批次效应移除中的应用

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中国卫生统计 2020年第5期37卷 667-671页

作者：谭起龙邓魁李康李贞子哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的通过随机森林回归(random forest,RF)方法提取不同批次间质控(quality control,QC)样本数据的批次特征,从而移除代谢组研究样本数据的批次效应,提高统计分析方法的分类识别能力。方法利用心血管疾病的代谢组质控样本在检测过程中产... 详细信息

目的通过随机森林回归(random forest,RF)方法提取不同批次间质控(quality control,QC)样本数据的批次特征,从而移除代谢组研究样本数据的批次效应,提高统计分析方法的分类识别能力。方法利用心血管疾病的代谢组质控样本在检测过程中产生的系统误差,通过随机森林回归方法获得质控样本质谱数据的系统误差特征,从而移除研究样本数据中存在的批次效应。对校正后的质谱数据用可视化方法和定量度量指标进行评价,再用统计方法筛选差异变量和建立判别模型,评价移除效果。结果经过QC-RF回归方法移除批次效应后的质谱数据分类判别效果明显优于使用QC-LOESS方法、ComBat方法和原始数据得到的结果。结论对于代谢组学质谱数据,QC-RF回归方法能够移除批次效应,提高数据的有效性和稳定性,具有实际应用价值。

关键词：代谢组学质谱数据批次效应随机森林回归

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