检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2021年第4期38卷 493-497页

作者：李称张秋菊孙琳丛雨欣赵敏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的验证ESPCA模型降维及变量选择的效果优于SPCA;利用ESPCA模型分析结肠癌基因数据,寻找不同主成分的通路信息,筛选结肠癌的差异基因。方法模拟实验比较ESPCA模型与SPCA的降维及变量选择能力,通过灵敏度、特异度、准确度评价其变量筛... 详细信息

目的验证ESPCA模型降维及变量选择的效果优于SPCA;利用ESPCA模型分析结肠癌基因数据,寻找不同主成分的通路信息,筛选结肠癌的差异基因。方法模拟实验比较ESPCA模型与SPCA的降维及变量选择能力,通过灵敏度、特异度、准确度评价其变量筛选效果;收集TCGA结肠癌基因数据,利用ESPCA模型对结肠癌基因数据进行降维及变量筛选。结果模拟实验获得的ESPCA模型具有较高的灵敏度、特异度和准确度,降维及变量选择效果优于SPCA。结肠癌数据分析结果显示:降维后ESPCA模型第一主成分中基因与18条GO-BP通路及7条KEGG通路有关,ESPCA模型第二主成分中基因与19条GO-BP通路有关;根据度中心性及中介中心性对主成分基因排序筛选出6个差异基因:MYC、CD44、PKM、FBL、PSMA7、RPS2,经GSE137327数据集验证具有较高的AUC值。结论ESPCA模型在降维过程中既考虑数据本身信息,又考虑了生物网络信息,具有良好的降维及变量选择效果。结肠癌数据分析中ESPCA第一主成分中基因参与癌症相关的通路;ESPCA第二主成分中基因参与的通路与免疫相关;通路中基因参与癌症的发生发展过程、可能通过免疫反应相关通路调节结肠癌的发生发展过程;获得的6个结肠癌差异基因可为研究疾病发生机制和鉴别诊断提供依据。

关键词：边组稀疏主成分分析高维组学降维方法变量选择

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基于网络解卷积和网络沉默算法的高维数据网络优化策略与比较

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中国卫生统计 2019年第1期36卷 68-70,74页

作者：荣志炜王文杰李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的根据组学数据构建网络存在间接边的问题,对此可通过适当的算法进行优化。本文使用DREAM5平台的网络数据,对网络解卷积方法(ND)和网络沉默(Silencing)两种网络优化算法的效果进行比较,提供合适的网络构建策略。方法分别使用7种方法... 详细信息

目的根据组学数据构建网络存在间接边的问题,对此可通过适当的算法进行优化。本文使用DREAM5平台的网络数据,对网络解卷积方法(ND)和网络沉默(Silencing)两种网络优化算法的效果进行比较,提供合适的网络构建策略。方法分别使用7种方法构建网络,然后使用ND和Silencing算法对网络优化,再通过ROC-PR曲线的评分对其效果进行比较,最后用网络结构分析方法评价去除间接效应的能力。结果两种方法对大多数网络都有较好的优化能力,能够很好地去除间接效应;相对而言,ND方法略优于Silencing方法。结论使用RF+ND和CLR+Silencing方法构建网络是两种较好的网络构建策略。

关键词：基因调控网络网络优化网络解卷积网络沉默

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中国中老年人群多维健康贫困时空跃迁全景测度研究

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中国公共卫生 2023年第6期39卷 707-712页

作者：赖勇强李叶吴群红田雨露刘馨蔚张曦宇张晨溪李红雨哈尔滨医科大学卫生管理学院卫生政策与医院管理研究中心哈尔滨150076 哈尔滨医科大学社会医学教研室哈尔滨150076

目的了解中国中老年人群多维健康贫困指数的时空分布格局,为中老年人群多维健康贫困的精准消除提供循证依据。方法收集2011、2013、2015和2018年中国健康与养老追踪调查(CHARLS)中37296户中国家庭≥45岁中老年人群的个人基本信息、家庭... 详细信息

目的了解中国中老年人群多维健康贫困指数的时空分布格局,为中老年人群多维健康贫困的精准消除提供循证依据。方法收集2011、2013、2015和2018年中国健康与养老追踪调查(CHARLS)中37296户中国家庭≥45岁中老年人群的个人基本信息、家庭结构和经济支持、健康状况、医疗服务利用和医疗保险、收入和消费等相关数据,采用课题组构建的健康贫困评价指标体系及多维健康贫困测度指数创新性地以健康权利、健康能力和健康风险三大维度测算2011—2018年中国中老年人群多维健康贫困指数并进行地区分解测度,分析中老年人群多维健康贫困指数的时空分布格局。结果中国中老年人群2011、2013、2015、2018年的健康贫困指数和发生率分别为0.320和69.7%、0.326和69.0%、0.349和71.9%、0.291和63.0%,2011—2018年中老年人群健康权利、健康能力和健康风险的贡献度均值分别为0.143、0.450和0.416;基于多维健康贫困指数地区分解测度结果显示,2011年健康贫困最严重的地区为贵州(0.365)、甘肃(0.364)、新疆(0.395)、四川(0.377)、安徽(0.402)和吉林(0.413)6个省(自治区),2013年健康贫困最严重的地区为云南(0.359)、青海(0.361)、内蒙古(0.381)、四川(0.378)、安徽(0.389)和贵州(0.402)6个省(自治区),2015年健康贫困最严重的地区为云南(0.395)、新疆(0.388)、青海(0.448)、四川(0.406)、内蒙古(0.390)、安徽(0.388)、重庆(0.391)、贵州(0.373)、天津(0.370)、黑龙江(0.366)、广西(0.362)、山东(0.362)、江西(0.359)、吉林(0.355)、福建(0.351)和辽宁(0.350)16个省(自治区、直辖市),2018年健康贫困最严重的地区为四川(0.352)、贵州(0.352)和云南(0.351)3个省份。结论中国中老年人群2011—2018年的健康贫困指数和发生率总体上均有所下降,西南地区始终是多维健康贫困最为严重的地区,已陷入整体性的多维健康贫困。

关键词：多维健康贫困指数时空分布格局中老年人群中国

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基于lncRNA-mRNA共表达网络筛选胃癌分期相关的lncRNA

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中国卫生统计 2021年第5期38卷 665-669页

作者：丛雨欣张秋菊田伟张奇李称赵敏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的构建lncRNA-mRNA共表达网络,探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系,为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法利用TCGA数据库,收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据;采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因... 详细信息

目的构建lncRNA-mRNA共表达网络,探索与胃癌分期相关的lncRNA及其调控关系,为研究胃癌的进展机制及寻找胃癌治疗的潜在靶点提供依据。方法利用TCGA数据库,收集胃癌RNA-seq数据及临床信息数据;采用表达数量性状位点(eQTL)分析与加权基因共表达网络分析(WGCNA)相结合的方法,构建lncRNA-mRNA共表达网络模块,结合临床信息筛选与胃癌分期相关的模块;采用Kruskal-Wallis秩和检验筛选模块内胃癌不同分期差异表达的lncRNA。结果获得286例胃癌组织和30例癌旁对照组织样本的RNA-seq数据;eQTL分析得到5118对顺式作用和1 953 109对反式作用lncRNA-mRNA;2 999个lncRNA和3 884个mRNA纳入WGCNA,产生25个共表达模块,其中与胃癌分期高度相关的模块有3个;模块midnightblue、orange内18个枢纽lncRNA中有14个lncRNA在胃癌不同分期差异表达。结论本研究筛选出14个与胃癌分期相关的lncRNA,这14个lncRNA可能通过调控mRNA的表达影响胃癌的进展,分析其对应的网络调控关系,为研究lncRNA-mRNA调控机制及探索胃癌治疗靶点提供了参考和方向。

关键词：胃癌 eQTL 加权基因共表达网络 lncRNA mRNA

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基于CRM-TE模型的抗肿瘤药物最适剂量估计方法

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中国卫生统计 2023年第2期40卷 195-198页

作者：周克强李爽徐佳钦李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose... 详细信息

目的研究一种新的抗肿瘤药物剂量探索模型(continual reassessment method based on toxicity and efficacy,CRM-TE),这种模型可以在I期临床试验中同时考虑毒性和疗效的药物作用,给II期临床试验推荐最适剂量(recommend the optimal dose,RP2D)。方法基于连续重评估模型(continual reassessment model,CRM)对药物的剂量-毒性和剂量-疗效曲线分别进行估计,并根据给出的权衡函数选择最适剂量。结果本文提出最适剂量估计方法与目前现有的同类型方法相比,能够在保证安全性的前提下,同时综合考虑不同剂量下的疗效,使选择的RP2D更为合理。结论本文为药物临床试验最适推荐剂量提供了一种新的方法,对于抗肿瘤等药物剂量探索具有一定的实用价值。

关键词：临床试验最适剂量权衡函数

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基于联合稀疏典型相关的泛癌CNVs与mRNA联合分析

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中国卫生统计 2020年第5期37卷 687-690页

作者：侯小文张秋菊田伟李称丛雨欣赵敏刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

目的利用联合稀疏典型相关方法进行泛癌拷贝数变异(CNVs)与mRNA数据融合分析,探讨拷贝数对基因表达的影响,识别分子机制的同质性和特异性,为癌症的分子机制研究提供依据。方法通过联合稀疏典型相关方法进行泛癌CNVs和mRNA数据融合分析,... 详细信息

目的利用联合稀疏典型相关方法进行泛癌拷贝数变异(CNVs)与mRNA数据融合分析,探讨拷贝数对基因表达的影响,识别分子机制的同质性和特异性,为癌症的分子机制研究提供依据。方法通过联合稀疏典型相关方法进行泛癌CNVs和mRNA数据融合分析,提取泛癌中共存CNVs及其相关的mRNA建立相关模块;在此基础上利用联合稀疏精确矩阵估计算法筛选具有直接关系的CNVs-mRNA对,并分析CNVs与不同肿瘤分期的相关性。结果提取的相关模块中CNVs和mRNA变量数分别为195和177个,其中13个mRNA存在于全部癌症,38个mRNA特异性存在于单一癌症中;共筛选出16对具有直接相关关系的CNVs-mRNA对,包括11个CNVs位点,对应基因EYA2、NNAT已在多种癌症中被发现;相关性检验显示全部11个基因拷贝数与结肠癌的T、N期,肾透明细胞癌的T、M期,浸润性乳腺癌的T期相关。结论CNVs-mRNA相关关系在泛癌间存在同质性和特异性,同质性关系可用于识别泛癌药物作用靶点,特异性关系可以为研究癌症遗传变异对基因表达的特异性影响提供线索;CNVs-mRNA直接相关对中部分基因拷贝数与肿瘤分期相关,相应CNVs可能对基因表达有较强影响。

关键词：联合稀疏典型相关联合稀疏精确矩阵估计泛癌拷贝数变异 mRNA

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疾病治疗质量综合评价的维度融合方法研究

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中国卫生统计 2022年第1期39卷 157-160页

作者：栗景坤包晓蔷李习王超刘梦洋田园刘美娜哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

治疗质量是指在现有医疗环境和资源的情况下,不增加病人经济负担,利用循证医学验证的有效治疗方法制定的最合理诊疗式,其本身是一个不可直接测量的变量^([1])。进行医院的治疗质量综合评价,需要考虑疾病诊疗的全部过程,如检查、手术、... 详细信息

治疗质量是指在现有医疗环境和资源的情况下,不增加病人经济负担,利用循证医学验证的有效治疗方法制定的最合理诊疗式,其本身是一个不可直接测量的变量^([1])。进行医院的治疗质量综合评价,需要考虑疾病诊疗的全部过程,如检查、手术、功能评价和结局等^([2]);其中涉及多个治疗维度及相应评价指标^([3]),为获得客观、全面且具有代表性的治疗质量,需要将多个维度的治疗质量进行合理融合获得综合评价结果,确定维度间权重成为获得综合治疗质量的关键。

关键词：治疗质量循证医学疾病诊疗质量综合评价功能评价疾病治疗融合方法直接测量

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临床试验中安慰剂的使用和设置问题

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中华医学杂志 2008年第28期88卷 2012-2014页

作者：武振宇李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081

为保证临床试验的科学性和有效性，通常采用随机、双盲、安慰剂对照的方法，并视其为标准方法。由于临床试验的受试对象是人而不是动物，并且安慰剂效应的本质毕竟是通过无直接药理学作用的物质或改变治疗过程中的氛围达到一定的效果，... 详细信息

为保证临床试验的科学性和有效性，通常采用随机、双盲、安慰剂对照的方法，并视其为标准方法。由于临床试验的受试对象是人而不是动物，并且安慰剂效应的本质毕竟是通过无直接药理学作用的物质或改变治疗过程中的氛围达到一定的效果，如何在保证受试者权益的前提下尽可能实现试验的科学性，长期以来一直是一个广为关注和争论的问题。

关键词：安慰剂对照临床试验设置药理学作用安慰剂效应受试者权益标准方法受试对象

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胎鼠表皮干细胞的体外分离培养及rAAV_2/eGFP转染的研究

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解剖学报 2007年第5期38卷 610-613页

作者：张喜梅郭筠秋金连弘哈尔滨医科大学组织学与胚胎学教研室哈尔滨150086

目的对表皮干细胞(ESCs)进行分离培养和鉴定,利用携带绿色荧光蛋白(eGFP)基因的重组腺相关病毒(rAAV)转染表皮干细胞,探索不同滴度rAAV2/eGFP的转染效率。方法1.获取胎鼠表皮单细胞悬液。2.利用层黏连蛋白(laminin)和Ⅳ型胶原(Collagen... 详细信息

目的对表皮干细胞(ESCs)进行分离培养和鉴定,利用携带绿色荧光蛋白(eGFP)基因的重组腺相关病毒(rAAV)转染表皮干细胞,探索不同滴度rAAV2/eGFP的转染效率。方法1.获取胎鼠表皮单细胞悬液。2.利用层黏连蛋白(laminin)和Ⅳ型胶原(CollagenⅣ)筛选ESCs,在体外进行培养和鉴定。3.将ESCs按5×104个/孔接种入24孔培养板中,按照不同的病毒基因数与转染细胞数之比(MOI)加入所需rAAV2/eGFP病毒,计数绿色荧光细胞数目,并计算转染效率。结果***对Laminin和CollagenⅣ的吸附性很好,克隆形成率较高。2.对ESCs进行β1整合素(Integrinβ1)单抗、角蛋白19(Keration 19,K19)单抗的免疫细胞化学染色,均呈阳性表达。3.利用rAAV/eGFP病毒体外转染ESCs,可稳定表达eGFP。结论用Laminin和CollagenⅣ快速黏附法可从胎鼠皮肤分离和富集ESCs。

关键词：皮肤干细胞免疫细胞化学基因转染大鼠

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论文中常见统计学问题的分析——定量资料的一般性统计分析

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中国地方病学杂志 2004年第4期23卷 380-382页

作者：刘艳方庆伟隋虹李康哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150001

定量资料的一般性统计分析中比较常用的方法就是t检验、方差分析与秩和检验,看起来简单,却容易出错。在分析时须考虑资料的设计类型,不要把t检验当成“万能工具”。只有结合实际,正确选择统计分析方法,才能得出令人信服的结论。

关键词：论文统计学统计分析 t检验方差分析秩和检验

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