检索结果-内蒙古大学图书馆

世界最新医学信息文摘 2018年第61期 15-16页

作者：杨海秀许艳军尚德思哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)从不同层面调控基因的表达水平,广泛的参与了肿瘤的发生发展过程。本研究从系统生物学的角度,大规模整合lncRNA-mRNA的调控关系,同时结合癌症相关的lncRNA表达信息以及通路的拓扑结构信息,精... 详细信息

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)从不同层面调控基因的表达水平,广泛的参与了肿瘤的发生发展过程。本研究从系统生物学的角度,大规模整合lncRNA-mRNA的调控关系,同时结合癌症相关的lncRNA表达信息以及通路的拓扑结构信息,精确定位lncRNA调控的癌症风险通路。并将该方法分别应用于一套乳腺癌数据以及一套结直肠癌数据,识别的显著风险通路大部分通过基因通路富集分析方法得到了验证。此外该方法特异识别的显著风险通路经文献证实与癌症相关,表明基于lncRNA识别癌症风险通路是有效的,可以作为基因通路富集分析方法的补充,为lncRNA在癌症中的调控机制研究提供新的思路。

关键词：长链非编码RNA 通路癌症

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多发性硬化外周全血mRNA差异表达的来源及其特异性分析

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国际免疫学杂志 2017年第5期40卷 485-488页

作者：王雯郭有李兆瀛敬佳关庆洲孙博哈尔滨医科大学神经生物学教研室 150081 福建医科大学生物信息学系福州350108

目的探究多发性硬化外周全血mRNA差异表达的来源及其特异性。方法利用外周全血mRNA表达谱数据，分别筛选多发性硬化和炎症性疾病（感染性休克、肺结核）患者相对正常人群的差异表达基因并进行比较。筛选正常外周血中髓系相对淋巴系... 详细信息

目的探究多发性硬化外周全血mRNA差异表达的来源及其特异性。方法利用外周全血mRNA表达谱数据，分别筛选多发性硬化和炎症性疾病（感染性休克、肺结核）患者相对正常人群的差异表达基因并进行比较。筛选正常外周血中髓系相对淋巴系细胞的差异表达基因，并与多发性硬化患者相对正常人群的差异表达基因作比较。结果比较多发性硬化患者与两种炎症性疾病（感染性休克、肺结核）患者相对正常人群的差异表达基因，发现交叠基因上/下调方向的一致性分别为91.32%（P〈0.05），93.23%（P〈0.05）。比较多发性硬化患者相对正常人群的差异表达基因及正常人群髓系相对淋巴系细胞的差异表达基因，发现交叠基因上/下调方向的一致性为96.82%（P〈0.05）。结论多发性硬化患者相对于正常人群的差异表达基因与炎症性疾病患者相对正常人群的差异表达基因高度一致，同时与髓系相对淋巴系细胞的差异表达基因同样高度一致。上述结果表明多发性硬化患者外周全血中观察到的基因表达的改变可能是由于髓系/淋巴系细胞构成比例改变所致，是非特异的炎症性改变。

关键词：多发性硬化炎症性疾病差异表达基因

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基于学科竞赛的医学创新型人才培养模式探索与实践

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双语学习 2018年第9期 11-11页

作者：王宏李勇常志强何月涵哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院

为进一步发挥学科竞赛在创新人才培养中的重要作用,全面提高人才培养能力,推进产学协同育人向纵深发展,中国高等教育学会《高校竞赛评估与管理体系研究》专家工作组负责研制和发布了学科竞赛排行榜,并撰写出版《全国普通高校竞赛白皮书... 详细信息

为进一步发挥学科竞赛在创新人才培养中的重要作用,全面提高人才培养能力,推进产学协同育人向纵深发展,中国高等教育学会《高校竞赛评估与管理体系研究》专家工作组负责研制和发布了学科竞赛排行榜,并撰写出版《全国普通高校竞赛白皮书》。连续推出2012-2016年和2013-2017年两轮中国高等学校学科竞赛榜单,在国内各大高校中引起了较大反响。学科竞赛为高等医学教育带来了新的机遇与挑战,如何顺应新时代教育理念,在医学院校开展丰富的学科竞赛,为培养医学创新型人才提供助力,是当下高等医学教育工作者值得深入思考的问题。

关键词：学科竞赛创新人才培养教学改革

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转化医学视域下的本科基础医学教学改革初探

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中国高等医学教育 2017年第9期 26-27页

作者：马宁杨琳丽张艳芬王乐天乔瑜韩冬王璐晶高旭哈尔滨医科大学基础医学院哈尔滨医科大学高教研究与教学质量评估中心哈尔滨医科大学附属第二医院哈尔滨医科大学生物信息与技术学院黑龙江哈尔滨150081

临床医学发展不仅有赖于经验的传承,更得益于临床与基础的密切合作。医学生需要通过一定科研工作熟悉科学研究的基本流程及其在医学中的应用,即研究生培养阶段。如何在本科阶段基础医学教学中融入"转化医学"理念,强调基础研... 详细信息

临床医学发展不仅有赖于经验的传承,更得益于临床与基础的密切合作。医学生需要通过一定科研工作熟悉科学研究的基本流程及其在医学中的应用,即研究生培养阶段。如何在本科阶段基础医学教学中融入"转化医学"理念,强调基础研究与临床实践的结合,培养医学生辩证思考能力、创新能力是当今基础医学教育培养未来医学人才不可忽视的重要内容,也是基础医学教改活动的课题之一。

关键词：本科教学转化医学教学改革创新能力科研思维

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药物组学信息学教学模式的探讨

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新教育时代电子杂志（学生版） 2018年第46期 252-252页

作者：王理赵红颖徐英岐哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨 150086

复杂疾病是当前危害人类健康的主要因素,也是现代生物医学和药学的主要研究的对象.随着现代生物医学检测技术的不断发展,生物医学数据资源持续爆炸式增长,整合利用多层次生物医药数据资源,建立并完善药物组学信息学教学模式,为人类重大... 详细信息

复杂疾病是当前危害人类健康的主要因素,也是现代生物医学和药学的主要研究的对象.随着现代生物医学检测技术的不断发展,生物医学数据资源持续爆炸式增长,整合利用多层次生物医药数据资源,建立并完善药物组学信息学教学模式,为人类重大复杂疾病的分子诊断、药物靶标筛选、新药研发及精准医疗提供重要的理论基础.

关键词：药物组学信息学教学模式生物医药

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测控通信网络可生存性建模与分析

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哈尔滨商业大学学报（自然科学版） 2017年第6期33卷 715-719页

作者：于金涛叶伟哈尔滨商业大学计算机信息与工程学院哈尔滨150028 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院哈尔滨150080

测控通信系统是地面指控中心与深空探测器联系的纽带,为了保证探测任务的顺利完成,测控通信网络中使用了大量冗余设备,但不必要的设备冗余不仅不会增加网络的可靠性反而会使网络结构更加复杂,增加后期维护成本,造成资源浪费.针对深空测... 详细信息

测控通信系统是地面指控中心与深空探测器联系的纽带,为了保证探测任务的顺利完成,测控通信网络中使用了大量冗余设备,但不必要的设备冗余不仅不会增加网络的可靠性反而会使网络结构更加复杂,增加后期维护成本,造成资源浪费.针对深空测控通信网络提出一种基于韧性度的可生存性研究方法,同时在计算韧性度时使用了模拟退火粒子群算法并对其进行优化,降低了韧性度计算时的时间复杂度.通过对两种基本网络和一种深空探测信息网络进行仿真,验证了分析方法的有效性.

关键词：可生存性测控通信网络韧性度割点模拟退火粒子群优化算法

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血清miR-34a表达水平预测乳腺癌新辅助化疗疗效

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解剖科学进展 2017年第5期23卷 467-470,474页

作者：何春波宿菲齐秀英游凯刘利华张雅芳张建国刘宝全哈尔滨医科大学附属第四医院放化疗科黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学解剖学教研室黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学附属第二医院乳腺外科黑龙江哈尔滨150081 西藏藏医学院现代医药学教研室西藏拉萨850000

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与... 详细信息

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与化疗响应的关系被分析。结果血清miR-34a的表达水平在乳腺癌患者化疗开始前显著高于健康志愿者。在治疗有效组和无效组,血清miR-34a的表达水平在化疗开始前,两周期结束时和化疗结束时均无显著差异。而血清miR-34a表达水平的变化是与治疗反应显著相关的。在治疗有效组,患者的血清miR-34a水平在化疗第二周期后和化疗结束时均低于化疗开始前(P=0.023和P=0.036),而无效组无显著变化。ROC曲线显示血清miR-34a表达水平的变化能准确地预测新辅助化疗的疗效。结论血清miR-34a是一个新的、非侵入性的生物标记物,能够准确地预测乳腺癌新辅助化疗的疗效。

关键词：乳腺癌新辅助化疗血清miR-34a

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Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌癌微转移预测及铂类耐药预测双联标志

Ⅰ-Ⅱ期肺腺癌癌微转移预测及铂类耐药预测双联标志

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2017年中国肿瘤标志物学术大会暨第十一届肿瘤标志物青年科学家论坛

作者：戚丽霜李天浩石根根李昕王佳圣李颖郭政哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院福建医科大学基础医学院生物信息学系与消化道恶性肿瘤教育部重点实验室

目的:针对基因表达检测值变异高、存在批次效应并难以标准化等问题,本研究利用肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)样本内基因表达相对大小关系(秩次关系),识别个体化多级预后预测标志,可先预测I-II期LUAD患者是否存在微转移风险(即术后... 详细信息

目的:针对基因表达检测值变异高、存在批次效应并难以标准化等问题,本研究利用肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)样本内基因表达相对大小关系(秩次关系),识别个体化多级预后预测标志,可先预测I-II期LUAD患者是否存在微转移风险(即术后复发风险),再预测存在微转移风险的患者是否对铂类耐药。方法:利用单纯接受手术切除治疗的I-II期LUAD样本,识别一组基因对,根据其在样本内基因表达的大小关系可预测术后复发风险与生存预后(1级标志)。然后,在术后接受铂类辅助化疗的I-II期LUAD样本中,先利用1级预后标志识别术后复发高风险患者的样本;再利用这些可能存在微转移的样本,识别一组铂类耐药预测基因对标志(2级标志)。结果:识别出一组包含9对基因的预测术后复发及死亡风险的1级预后标志(9-GPS)(图1A),其预后能力在两套芯片平台检测的样本及一套RNA-sequencing平台检测的样本中得到了验证(图1B)。然后,在接受了术后铂类联合辅助化疗的LUAD数据中,利用1级预后标志识别术后复发高风险患者的样本,并利用这些可能存在微转移的样本识别出一组包含三个基因对的铂类耐药预测标志(3-GPS,分类规则同9-GPS)。在一套独立的整合验证数据集中,该标志能够有效预测接受铂类化疗治疗患者是否能够受益于铂类化疗(图1C)。最后,将9-GPS及3-GPS耦联应用于TCGA多维组学数据中,发现九个拷贝数区域的扩增或缺失频率均在对铂类敏感组中显著高(Fisher检验,FDR<0.05),提示敏感患者的基因组更倾向不稳定。结论:该基于基因表达秩次关系的双联标志不受实验批次影响,能够个体化预测I-II期LUAD患者术后复发风险(微转移)及对铂类辅助化疗的敏感性。图1.肺腺癌复发风险及铂类药效预测标志。A. 9-GPS的风险分类规则。当一个样本(黄色示例)内9对基因中,超过5个基因对的秩次关系投票其为高风险,则该样本(n=7)被预测为高风险,反之为低风险。B. 9-GPS在两套芯片平台及一套RNA-sequencing平台检测数据中预测复发风险及整体生存时间的能力。C. 3-GPS在一套验证整合数据集中预测样本能否受益于铂类化疗的能力。

关键词：铂类耐药复发风险术后复发微转移肺腺癌

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基于教学科研一体化的R语言程序设计在医学专业教学模式探索研究

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课程教育研究 2017年第3期 23-24页

作者：赵红颖王理李晶肖云哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨 150086 黑龙江中医药大学附属第一医院黑龙江哈尔滨 150040

随着新一代测序科技的飞速发展,大规模多维组学医学大数据不断涌现,使得医学院校医学相关专业的学生在大规模的海量数据的数据处理、分析和理解,从复杂的数据中提取关键的信息等方面面临着巨大的挑战.R语言程序设计作为数据分析和可视...

随着新一代测序科技的飞速发展,大规模多维组学医学大数据不断涌现,使得医学院校医学相关专业的学生在大规模的海量数据的数据处理、分析和理解,从复杂的数据中提取关键的信息等方面面临着巨大的挑战.R语言程序设计作为数据分析和可视化于一体的开源软件,其强大的交互式数据分析并集成大量的数据包,为医学专业学生的数据处理、统计分析和数据可视化提供了强有力的工具.因此,医学专业学生掌握R语言程序设计的基本数据结构之外,培养学生应用计算机语言解决医学相关的实际问题显得尤为重要.基于教学科研一体化的R语言程序设计教学模式的研究,目的是培养学生灵活地运用计算机程序设计语言解决医学专业相关的实际问题.

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基于微课的情境教学模式在生物信息学专业英语教学中的应用

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课程教育研究 2017年第1期 23-24页

作者：王理李晶赵红颖哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨 150086 黑龙江中医药大学附属第一医院黑龙江哈尔滨 150040

随着大数据时代的到来,生物信息学的研究方法及成果在生命科学类研究以及临床实际治疗过程中尤为重要.生物信息学作为当前高新学科之一,近些年在国际杂志上发表的高影响力学术论文日益增多.生物信息学专业英语的教学目的主要是为了帮助...

随着大数据时代的到来,生物信息学的研究方法及成果在生命科学类研究以及临床实际治疗过程中尤为重要.生物信息学作为当前高新学科之一,近些年在国际杂志上发表的高影响力学术论文日益增多.生物信息学专业英语的教学目的主要是为了帮助学生熟练掌握生物信息专业词汇及习惯用法,使得学生具备正确、轻松地阅读、理解生物信息学专业英文科技文献的能力,熟练掌握生物信息学专业论文的写作方法与模式.相比日常英语来讲,专业英语词汇及用法相对比较晦涩,难以记忆和运用.因此,本文通过分析了当前生物信息学专业英语课程教学现状,结合学生自身的需要及特点,以情境教学模式作为核心的教学方式,调动学生学习热情从而提高教学质量,推进传统教学模式改革.

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