检索结果-内蒙古大学图书馆

中华实验和临床病毒学杂志 2022年第2期36卷 141-149页

作者：江洁赵林清穆敏王文洋徐瑾蔡亮谢正德朱贞张燕周杉杉冯意毛乃颖国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所麻疹室北京102206 首都儿科研究所病毒研究室北京100020 安徽理工大学医学院免疫学教研室淮南232001 河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所郑州450016 湖南省疾病预防控制中心微生物检验科长沙410005 首都医科大学附属北京儿童医院北京市儿科研究所感染与病毒研究室北京100045

目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3,HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、... 详细信息

目的基于血凝素-神经氨酸酶蛋白(hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因分析我国流行人副流感病毒3型(human parainfluenza virus 3,HPIV3)的基因变异规律和进化特征。方法采用多重荧光PCR方法对2007—2020年5个省市(北京、浙江、安徽、河南、湖南)急性呼吸道感染病例的咽拭子标本进行常见病原体核酸筛查,对HPIV3阳性标本进行HN基因序列测定,与GenBank数据库的国外和我国10个省的HPIV3流行代表株HN基因序列进行比对,应用多种生物信息学方法开展分子进化分析。结果本研究期间从5个省市共获得49株HPIV3的HN基因序列,核苷酸同源性在96.6%~100%之间,其中48株为C3基因亚型,1株为C5基因亚型。系统进化分析显示,我国12个省市在2003—2020年间存在C1、C3和C5基因亚型的毒株共流行,毒株间核苷酸和氨基酸同源性分别为95.4%~99.8%和97.9%~100%,其中C3是我国的优势流行基因亚型,分属于C3a、C3b、C3c、C3e和C3f进化分支,以C3f的传播范围和流行时间最为广泛。对C3基因亚型的进化分析显示,其最近共同祖先形成时间(tMRCA)可追溯到1990年,有效群体规模在2002—2010年间逐渐扩张而后趋于平稳;C3各进化分支HPIV3的HN基因进化速率在3.69×10^(-4)~5.82×10^(-4)替换/位点/年之间;C3基因亚型毒株HN蛋白共享N308、N351、N485和N523潜在N-糖基化位点,选择压力以负向选择为主。结论C3基因亚型是我国的本土优势HPIV3流行型别,形成了广泛传播和持续流行态势,并在流行过程中形成多个进化分支共同循环。

关键词：人副流感病毒3型血凝素-神经氨酸酶蛋白基因特征贝叶斯进化分析

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呼吸道病原体多重核酸扩增在老年患者呼吸系统感染检测中的应用

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中华实验和临床病毒学杂志 2020年第3期34卷 299-303页

作者：宋国威潘婧梁芸马学军万玲玲李玉雪李立新石家庄市第一医院检验科 050000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的了解多重RT-PCR方法检测13种常见呼吸道感染病原体,在老年患者呼吸系统感染病原体检测中的应用价值。方法317例2016年6月至2017年5月在石家庄市第一医院老年科就诊的具有呼吸系统感染症状的老年患者,年龄60~98岁,采集其抽吸痰液,提... 详细信息

目的了解多重RT-PCR方法检测13种常见呼吸道感染病原体,在老年患者呼吸系统感染病原体检测中的应用价值。方法317例2016年6月至2017年5月在石家庄市第一医院老年科就诊的具有呼吸系统感染症状的老年患者,年龄60~98岁,采集其抽吸痰液,提取病毒DNA/RNA,利用多重RT-PCR技术扩增,通过毛细管电泳,同时检测13种呼吸道病原体;并以直接测序方法和荧光实时PCR法为标准,评价该试剂的临床性能。结果使用直接测序和荧光实时PCR结果为参照,多重RT-PCR技术的准确性为99.93%(95%CI:99.79%~99.98%),阳性预测值为99.24%(95%CI:97.78%~99.74%),阴性预测值为100%(95%CI:99.9%~100%),Cohen’skappa值为0.9958(95%CI:0.9652~1.026)。在317例老年患者中,呼吸道病原阳性检出率为75.7%(240/317),其中甲型流感病毒最高,为20.2%(64/317),主要为H3亚型(70.3%(45/64);其次为鼻病毒、腺病毒、肺炎支原体和乙型流感病毒,检出率分别为15.5%(49/317)、13.6%(43/317)、11.0%(35/317)和10.1%(32/317)。此外,同时检出2种以及2种以上病原体的老年患者为81例,检出率为25.6%(81/317)。结论多重RT-PCR方法能满足临床对呼吸道病原体检测的需求,并为老年患者呼吸系统感染的防治提供有效的临床资料。

关键词：呼吸道感染毛细管电泳老年患者逆转录聚合酶链反应

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江西省2010年柯萨奇病毒A组24型变异株的全基因组序列分析

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病毒学报 2021年第1期37卷 89-96页

作者：李俊含张勇冀天娇李婕熊英祝双利王东艳韩振志肖金波司芬芬许文波严冬梅国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000 吉林省长春市南关区疾病预防控制中心长春130022 北京核工业医院(房山院区) 北京102413 江西省疾病预防控制中心南昌330029

急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体。本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的... 详细信息

急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体。本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的CV-A24v,采用特异性引物扩增并测定其全基因组序列。对该10条CV-A24v的全基因组序列进行系统发育分析以及重组分析,计算本研究测定的江西10条以及GenBank中所有22条CV-A24v的全基因组序列的氨基酸置换熵值,并预测其正向选择位点。结果表明,在江西10条CV-A24v基因组序列中未检测到重组。基于全基因组序列构建的最大似然树表明江西10株CV-A24v属于GIV基因型,且分处于两条传播链。对上述32条CV-A24v序列的氨基酸置换熵值计算,共得到25个易突变位点(熵值>0.6),易突变概率最高的区段为2A区。基于Datamonkey中FUBAR和FEL模型分析,发现位于结构蛋白VP2区的234位氨基酸为两种模型共同获得的CV-A24v的正向选择位点。本研究分析了江西10株CV-A24v的全基因组序列特征,为CV-A24v引起的AHC防控工作提供了基础资料。

关键词：柯萨奇病毒A组24型变异株(CV-A24v) 急性出血性结膜炎(AHC) 全基因组选择压力

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北美洲流行汉坦病毒多重荧光定量RT⁃PCR检测方法的建立

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病毒学报 2020年第4期36卷 617-623页

作者：李乃哲李阿茜李建东李德新梁米芳王世文中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心北京100049

为了建立牛轭湖病毒(Bayou virus,BAYV)、纽约病毒(New York virus,NYV)、厄尼诺洛峡谷病毒(El Moro Canyon virus,ELMCV)以及岛景病毒(Isla Vista virus,ISLAV)四种病毒快速筛查、诊断的核酸检测技术,本研究选用上述四种病毒的N蛋白基... 详细信息

为了建立牛轭湖病毒(Bayou virus,BAYV)、纽约病毒(New York virus,NYV)、厄尼诺洛峡谷病毒(El Moro Canyon virus,ELMCV)以及岛景病毒(Isla Vista virus,ISLAV)四种病毒快速筛查、诊断的核酸检测技术,本研究选用上述四种病毒的N蛋白基因作为靶标区域设计四组特异性引物探针,建立四重实时荧光定量RT-PCR检测方法。用四种病毒体外转录RNA进行灵敏度和重复性验证,并使用其他病毒细胞培养物及体外转录RNA进行特异性验证。结果显示,四重实时荧光定量PCR扩增效率均可达到95%以上,四种病毒体外转录RNA灵敏度介于1~10拷贝/μL,与单重检测方法无明显差异,且与其他病毒无交叉反应。稳定性评价结果显示,批内、批间变异系数均在3%以内。本研究所建立的检测方法具有良好的敏感性、特异性和重复性,可用于相关样本的诊断与筛查。

关键词：四重实时荧光定量RT-PCR 牛轭湖病毒(BAYV) 纽约病毒(NYV) 厄尼诺洛峡谷病毒(ELMCV) 岛景病毒(ISLAV)

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学生结核病传播特点:一项12年的全人群前瞻性分子流行病学研究

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中华结核和呼吸杂志 2023年第1期46卷 19-26页

作者：李蒙郭明成邱勇张书张泽军陈闯高谦复旦大学基础医学院教育部、国家卫生健康委员会、中国医学科学院医学分子病毒学重点实验室上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032 四川省广安市武胜县疾病预防控制中心结核病防治科广安638401 四川省疾病预防控制中心结核病预防控制所成都610041

目的利用在四川省武胜县开展的一项前瞻性结核病分子流行病学研究的数据,从全人群的角度分析学生结核病的传播。方法2009年7月1日至2020年12月31日,收集武胜县培养阳性肺结核患者的菌株进行全基因组测序,以菌株之间相差≤12单核苷酸多态... 详细信息

目的利用在四川省武胜县开展的一项前瞻性结核病分子流行病学研究的数据,从全人群的角度分析学生结核病的传播。方法2009年7月1日至2020年12月31日,收集武胜县培养阳性肺结核患者的菌株进行全基因组测序,以菌株之间相差≤12单核苷酸多态性(SNP)判断簇菌株;使用logistic回归分析学生肺结核患者(简称学生患者)的成簇风险;对成簇患者进行流行病学调查以明确流行病学联系;基于全基因组测序数据和患者确诊时间,使用phybreak方法推断簇病例的传播方向。结果研究期间武胜县培养阳性患者共计1289例,其中7.6%(98/1289)为学生。学生患者中71.4%(70/98)是高中生,高三学生的比例为45.9%(45/98),初一和高一新生的比例为16.3%(16/98)。学生患者的成簇率为59.2%(58/98),其成簇风险是非学生患者的4.54倍(95%CI:2.44~8.45)。在涉及学生患者的传播事件中,33.3%(11/33)是学生之间的传播,66.7%(22/33)是学生与非学生之间的传播;学生与非学生之间的传播事件中只有5次(22.7%,5/22)是发生在家庭,其余的17次(77.3%,17/22)均发生在家庭外;学生患者之间的确诊间隔时间为1.3(0.4,2.7)年,学生与非学生之间的确诊间隔时间为5.3(1.9,6.8)年,两者差异有统计学意义(Z=2.86,P=0.004)。结论学生结核病主要是近期传播导致的;大部分的传播发生在学生和非学生之间,且主要发生在家庭外;学校结核病筛查策略显著缩短了患者发现时间;学校结核病防控必须与社区防控策略相结合才能取得理想的效果。

关键词：结核病分子流行病学基因组学生传播

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2019年辽宁省水痘-带状疱疹病毒基因特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2021年第1期35卷 57-61页

作者：郭宏郝爽扈瑞平王艳许松涛内蒙古医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室呼和浩特010110 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 辽宁省疾病预防控制中心免疫规划所沈阳110005

目的分析2019年辽宁省收集到的水痘-带状疱疹病毒(VZV)基因特征。方法采集辽宁省2019年疑似水痘或带状疱疹患者的疱疹液样本共32份。采用实时荧光定量聚合酶链反应筛查疑似样本,通过检测分析阳性样本的三个开放阅读框(ORF)即ORF22、ORF3... 详细信息

目的分析2019年辽宁省收集到的水痘-带状疱疹病毒(VZV)基因特征。方法采集辽宁省2019年疑似水痘或带状疱疹患者的疱疹液样本共32份。采用实时荧光定量聚合酶链反应筛查疑似样本,通过检测分析阳性样本的三个开放阅读框(ORF)即ORF22、ORF38和ORF62上的单核苷酸多态性(SNP)位点,整理样本及序列资料并对基因序列对比分析,确定病毒株基因型别,进行疫苗株与野毒株鉴别。结果32份疑似水痘或带状疱疹患者样本中,27份为VZV阳性,均为野毒株属Clade2遗传支,核苷酸与氨基酸的同源性分别为98.85%~100%和96.9%~100%。其中LN-14在37990位点发生A→G碱基突变,并且有1例疫苗突破病例。结论2019年辽宁省流行的VZV基因型均属Clade2野毒株。

关键词：水痘-带状疱疹病毒基因型野毒株疫苗株

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基于三种试剂盒分析新型冠状病毒特异性抗体的动态变化

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病毒学报 2020年第3期36卷 343-347页

作者：姜中毅毛乃颖朱贞张燕崔爱利汪鹏徐丛杉董茂星王雪莹于德山许文波甘肃省疾病预防控制中心兰州73000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

为了解新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发病后血清中新型冠状病毒(SARS-CoV-2)特异性抗体的动态变化,本研究使用三种不同检测原理的SARS-CoV-2抗体检测试剂盒,对来自甘肃省33例核酸检测阳性的COVID-19确诊病例的58份血清标本,分别进行了病... 详细信息

为了解新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发病后血清中新型冠状病毒(SARS-CoV-2)特异性抗体的动态变化,本研究使用三种不同检测原理的SARS-CoV-2抗体检测试剂盒,对来自甘肃省33例核酸检测阳性的COVID-19确诊病例的58份血清标本,分别进行了病毒特异性抗体(IgM、IgG和总抗体)的检测。结果显示,COVID-19发病后IgM、IgG和总抗体阳性率随发病时间的推移而逐渐上升:发病早期3d以内,三种试剂盒检测病毒特异性抗体阳性率在13.6%~31.8%之间;发病4~7d时,阳性率在36.4%~45.5%之间;发病8~14d时,阳性率在55.6%~77.8%之间;而发病15d以上时,阳性率达到100%。此外,本研究使用三种试剂盒检测了健康人血清标本,检测特异性在99%~100%之间。统计学分析结果显示,三种检测试剂盒的检测结果差异无显著性(P>0.05)。综上所述,三种SARS-CoV-2抗体检测试剂盒均具有较好的敏感性和特异性,可用于COVID-19疑似病例在核酸检测阴性时的辅助诊断;本研究初步获得的SARS-CoV-2特异性抗体动态变化特征可为COVID-19血清流行病学调查和无症状感染者研究提供重要的基础依据。

关键词：新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 血清学检测抗体动态变化

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A组P型牛轮状病毒VP8*蛋白多糖结合特异性研究

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国际病毒学杂志 2021年第2期28卷 103-107页

作者：苏韫曦党蕾李丹地孙晓曼郑贵森甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的研究A组P[15]型轮状病毒VP8*蛋白的多糖结合特异性。方法利用大肠杆菌表达系统制备A组P[15]型牛轮状病毒毒株的VP8*蛋白,通过寡糖结合实验、生物膜层干涉实验及血凝等方法研究其与不同糖的结合。结果A组P[15]型牛轮状病毒VP8*蛋白结... 详细信息

目的研究A组P[15]型轮状病毒VP8*蛋白的多糖结合特异性。方法利用大肠杆菌表达系统制备A组P[15]型牛轮状病毒毒株的VP8*蛋白,通过寡糖结合实验、生物膜层干涉实验及血凝等方法研究其与不同糖的结合。结果A组P[15]型牛轮状病毒VP8*蛋白结合Neu5Ac和Neu5Gc唾液酸,与α2,3和α2,6方式连接的唾液酸糖也有较好的结合。此外,P[15]VP8*蛋白可以凝集人和动物的红细胞。结论唾液酸可能是A组P[15]型轮状病毒的糖受体。与猴P[3]、猪P[7]轮状病毒相似,牛P[15]VP8*蛋白与唾液酸结合,并且序列和结构分析显示它们具有相同的糖结合位点。

关键词： A组轮状病毒 VP8*蛋白唾液酸寡糖结合血凝

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口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq对儿童保护效果和安全性的Meta分析

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国际病毒学杂志 2021年第2期28卷 93-97页

作者：魏宇航王明雯毛彤瑶王萌璇孙晓曼章青王宏庞立丽李丹地甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的评价口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq对儿童轮状病毒胃肠炎的保护效果和安全性。方法检索2006年至2020年公开发表的符合入选标准的有关口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq的文献,共纳入了13455名研究对象,使用RevMan 5.3软件进行统计分... 详细信息

目的评价口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq对儿童轮状病毒胃肠炎的保护效果和安全性。方法检索2006年至2020年公开发表的符合入选标准的有关口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq的文献,共纳入了13455名研究对象,使用RevMan 5.3软件进行统计分析。结果RotaTeq对轮状病毒胃肠炎、严重轮状病毒胃肠炎的保护率分别为VERVGE=70%(95%CI:0.65~0.73)、VESRVGE=94%(95%CI:0.75~0.99),疫苗组合计不良反应发生率为5.13%;对照组合计不良反应发生率为5.38%。结论在低死亡率地区口服RotaTeq预防任意严重程度轮状病毒胃肠炎安全有效,对重症轮状病毒胃肠炎保护效果更好。

关键词：口服轮状病毒减毒活疫苗 RotaTeq 保护效果安全性 Meta分析

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柯萨奇病毒B组5型基因分型标准的研究

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国际病毒学杂志 2022年第6期29卷 455-460页

作者：何云杨倩严冬梅祝双利冀天娇卫海燕魏雷雷樊欢路环环肖金波赵鹤鹤王雯慧郭琴邢薇佳张勇山东第一医科大学山东省医学科学院济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家脊髓灰质炎实验室、国家卫生健康委员会生物安全重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 河南省疾病控制预防中心郑州450016 吉林省疾病预防控制中心、吉林省公共卫生研究院长春130062 江苏疾病控制预防中心南京210009

目的依据肠道病毒分子分型的基本原则(基于VP1区全长核苷酸序列差异界值15%~25%),科学建立柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)的分子分型标准。方法本研究依托中国手足口病实验室网络,将来自中国大陆2001—2021年间分离出的69株C... 详细信息

目的依据肠道病毒分子分型的基本原则(基于VP1区全长核苷酸序列差异界值15%~25%),科学建立柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)的分子分型标准。方法本研究依托中国手足口病实验室网络,将来自中国大陆2001—2021年间分离出的69株CVB5采用逆转录-聚合酶链反应扩增全长VP1编码区,并进行核苷酸序列测定和分析;同时下载并筛选GenBank中截至2022年2月16日的742条CVB5全长VP1编码区核苷酸序列(849个核苷酸)。使用MEGA 7.0软件进行序列比对及构建基于最大似然法的基因进化树,自展值设定为1000,进行CVB5分子分型标准的研究。结果69株中国大陆CVB5分离株与CVB5原型株(Faulkner株)核苷酸和氨基酸的相似性分别为77.3%~81.6%和93.2%~95.3%。系统进化树显示,全球CVB5可分为4个不同分支,分支内核苷酸的平均差异范围在7.3%~13.4%,氨基酸的平均差异范围在1.9%~3.3%,分支间核苷酸的平均差异范围在17.0%~22.3%,氨基酸的平均差异范围为4.2%~4.9%。根据上述分子分型标准,将全球CVB5划分为A、B、C、D四个基因型。A基因型和C基因型CVB5可能在进化过程中已消失,不再流行,而B基因型和D基因型CVB5目前在全球呈现共流行趋势。中国大陆流行的CVB5主要为D基因型,少部分为B基因型。结论本研究建立了CVB5的分子分型的标准,并根据该标准将全球CVB5划分为4个基因型,对进一步了解CVB5的遗传变异变迁规律和进行分子溯源具有重要意义。

关键词：柯萨奇病毒B组5型分子分型 VP1区分型标准手足口病

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