检索结果-内蒙古大学图书馆

生物工程学报 2008年第3期24卷 500-503页

作者：陈丹丹何南海张名昌厦门大学生命科学学院厦门361005 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物工程重点实验室厦门361005

SKPI(shrimp Kunitz-type protease inhibitor)是日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)体内的一个小分子多肽,含有一个Kunitz型结构域,属于丝氨酸蛋白酶抑制剂。目前已知丝氨酸蛋白酶抑制剂在节肢动物免疫系统中起着非常重要的作用,为了... 详细信息

SKPI(shrimp Kunitz-type protease inhibitor)是日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)体内的一个小分子多肽,含有一个Kunitz型结构域,属于丝氨酸蛋白酶抑制剂。目前已知丝氨酸蛋白酶抑制剂在节肢动物免疫系统中起着非常重要的作用,为了了解SKPI在对虾天然免疫系统中的作用,首先对其进行了重组表达。从日本囊对虾肝胰腺中扩增skpi的cDNA片段,插入改造后的pPIC9K酵母表达载体,获得的重组质粒转化至毕赤酵母GS115进行表达。由于改造的pPIC9K载体加入了6-His标签,因此利用Ni Sepharose High Performance对SKPI进行了高效纯化。初步的活性研究表明,重组表达的SKPI能特异性地抑制胰蛋白酶的水解活性。

关键词：日本囊对虾 Kunitz型蛋白酶抑制剂毕赤酵母胰蛋白酶

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不动杆菌生物乳化剂活性成分研究

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应用与环境生物学报 2008年第4期14卷 553-557页

作者：李晴邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005 厦门大学生命科学学院福建厦门361005

通过乳化活性分析、化学成分分析和相关基因的分析,对3株海洋来源的不动杆菌分离株和2种不动杆菌模式菌的生物乳化剂产生能力和活性成分进行了分析,结果表明,这些菌都能产生生物乳化剂.通过PCR检测,其中只有深海菌株wp02421编码与乳化剂... 详细信息

通过乳化活性分析、化学成分分析和相关基因的分析,对3株海洋来源的不动杆菌分离株和2种不动杆菌模式菌的生物乳化剂产生能力和活性成分进行了分析,结果表明,这些菌都能产生生物乳化剂.通过PCR检测,其中只有深海菌株wp02421编码与乳化剂Emulsan产生密切相关的酯酶基因.气质联用仪证明该菌所产的乳化剂含有脂肪酸组分,主要是正十六烷酸和正十八烷酸,表明菌株wp02421产生的乳化剂与Emulsan类似,糖脂是主要活性成分之一.此外,通过PCR检测,证明了5株不动杆菌全部编码外膜蛋白A基因(ompA).它们的氨基酸序列与Acinetobacter radioresistens KA53的乳化剂Alasan中的主要活性蛋白AlnA的同源性为71.26%～80.23%.以上结果表明,5株菌的生物乳化剂中都可能含有AlnA的乳化蛋白,而菌株wp02421同时还产类似Emulsan的糖脂.

关键词：不动杆菌生物乳化剂酯酶外膜蛋白A Alasan

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厦门近海海水中多环芳烃降解菌的原位富集与降解菌多样性

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微生物学报 2010年第10期50卷 1392-1398页

作者：陈亮董纯明何进邵宗泽华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室武汉430070 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

【目的】为了分析厦门近海原位海水中多环芳烃降解菌的多样性。【方法】将涂有菲的聚氯乙烯(PVC)板悬挂在厦门国际邮轮码头的海水中,进行菲降解菌的原位富集。利用变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)和16S ... 详细信息

【目的】为了分析厦门近海原位海水中多环芳烃降解菌的多样性。【方法】将涂有菲的聚氯乙烯(PVC)板悬挂在厦门国际邮轮码头的海水中,进行菲降解菌的原位富集。利用变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)和16S rRNA基因文库两种方法分析了在PVC板表面富集微生物的菌群结构。之后,在实验室模拟原位条件下,对PVC板表面富集的菲降解菌群进行进一步富集、分离和初步鉴定。【结果】PVC板在海水中浸没6 d后,16S rRNA基因文库分析表明,在涂菲的PVC板表面富集的菌群中解环菌属(Cycloclasticus)对应的克隆子占文库总克隆子的50%;在未涂菲的PVC板表面吸附的菌群中红杆菌科(Rhodobacteraceae)为优势菌,其对应的克隆子占文库总克隆子的47%;而解环菌属的克隆子只占文库总克隆子的2%。DGGE的分析结果也证明解环菌是菲原位富集降解菌群中的优势菌。实验室进一步富集后,从该菌群中分离鉴定出14株细菌,其中一株新鞘氨醇杆菌B14(Novosphingobium sp.B14)具有菲降解能力。但是,解环菌未能获得纯培养。【结论】菲原位富集发现,厦门近海水体中解环菌是多环芳烃的主要降解菌。

关键词：厦门近海多环芳烃解环菌生物降解原位富集

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南极耐冷Pseudomonas sp.7323低温脂肪酶的性质及基因克隆

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中国生物化学与分子生物学报 2007年第4期23卷 271-277页

作者：王水琦曾润颖张金伟漳州职业技术学院福建漳州363000 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

南极微生物是筛选低温酶的良好来源,但尚未得到充分的研究与开发.低温脂肪酶具有广阔的应用前景,其基因结构特征也具有重要的研究意义.本文对南极微生物开展了低温脂肪酶产生菌的筛选、基因克隆及特征分析.采用功能筛选的方法,从南极普... 详细信息

南极微生物是筛选低温酶的良好来源,但尚未得到充分的研究与开发.低温脂肪酶具有广阔的应用前景,其基因结构特征也具有重要的研究意义.本文对南极微生物开展了低温脂肪酶产生菌的筛选、基因克隆及特征分析.采用功能筛选的方法,从南极普里兹湾深海沉积物中获得一株产低温脂肪酶的菌株7323,其最适温度和最高生长温度分别为20℃和30℃,属于耐冷菌.16S rDNA序列分析表明,该菌属于假单胞菌属(Pseudomonas).通过设计引物扩增出的脂肪酶基因全长为1 854 bp,该基因编码一个由617氨基酸、分子量预计为64 466的蛋白质.氨基酸序列分析表明,该酶与***48的脂肪酶有89%的相似性,在催化区和C末端信号肽中存在高度保守的序列.纯化后的酶学性质研究表明,该脂肪酶的最适温度为35℃,最适pH值为9.0,为碱性低温酶.

关键词：南极耐冷菌假单胞菌低温脂肪酶

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对虾白斑综合症病毒vp15基因的RNA干扰研究

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台湾海峡 2012年第1期31卷 47-52页

作者：张衡谷力杨丰国家海洋局第三海洋研究所、生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

VP15是对虾白斑综合症病毒(WSSV)的一种核衣壳蛋白,以往的研究表明VP15属DNA结合蛋白,具有潜在的浓缩包装病毒基因组的功能.利用RNAi技术将vp15基因沉默,来研究vp15基因沉默后对WSSV增殖及结构的影响.体外合成了vp15基因的特异双链RNA(v... 详细信息

VP15是对虾白斑综合症病毒(WSSV)的一种核衣壳蛋白,以往的研究表明VP15属DNA结合蛋白,具有潜在的浓缩包装病毒基因组的功能.利用RNAi技术将vp15基因沉默,来研究vp15基因沉默后对WSSV增殖及结构的影响.体外合成了vp15基因的特异双链RNA(vp15-dsRNA)和非特异双链RNA(gfp-dsRNA),分别与WSSV混合共注射淡水原克氏螯虾.在感染后24、36、48 h,每个实验组分别取病虾步足肌肉,样品用Trizol试剂盒提取RNA用于RT-PCR检测、用病毒检测试剂盒提取DNA模板用于荧光定量PCR分析.另外每组随机选取1只虾,取中肠,用于树脂包埋组织超薄切片分析.逆转录PCR分析结果显示vp15-dsRNA能特异性敲除vp15基因转录表达,实时荧光定量PCR分析结果显示vp15-dsRNA干扰vp15基因的表达能有效抑制WSSV病毒粒子的增值.此外,利用树脂包埋组织超薄切片电子显微镜技术观察发现vp15基因被干扰后病毒粒子数量上明显降低并且引起病毒粒子包装异常.通过vp15基因特异dsRNA干扰,有效抑制了WSSV病毒增殖,此外进一步阐明VP15蛋白的功能及其在病毒组装方面的重要作用,对进一步了解病毒组装以及病毒防治具有重要的意义.

关键词：海洋生物学对虾白斑综合症 DNA结合蛋白 vp15基因 RNA干扰

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微生物核糖体工程研究进展

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微生物学报 2009年第8期49卷 981-986页

作者：谢庶洁肖静徐俊国家海洋局生物遗传资源重点实验室第三海洋研究所厦门361005 厦门大学生命科学学院厦门361005

微生物获得特定类型的抗性突变,不仅反映了其核糖体或RNA多聚酶上相关靶位点结构的改变,也对突变菌株次级代谢产物(抗生素等)的生物合成能力产生深刻影响,因此筛选抗性突变株可作为微生物推理选育的途径之一。"核糖体工程"是... 详细信息

微生物获得特定类型的抗性突变,不仅反映了其核糖体或RNA多聚酶上相关靶位点结构的改变,也对突变菌株次级代谢产物(抗生素等)的生物合成能力产生深刻影响,因此筛选抗性突变株可作为微生物推理选育的途径之一。"核糖体工程"是利用微生物的各类抗性突变为筛选标记,高效获得次生代谢产物合成能力提高的突变株的推理育种新方法。本文综述了微生物"核糖体工程"的概念、各类突变的作用机理,并着重介绍组合抗性突变在提高出发菌株次级代谢产物产量方面的应用。

关键词：核糖体工程抗生素抗性次级代谢微生物育种

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西太平洋“暖池”深海沉积物中异化型亚硫酸盐还原酶基因多样性分析

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海洋学报 2009年第4期31卷 78-86页

作者：杨宁赵晶王玉桥曾润颖国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005 厦门大学海洋与环境学院海洋技术与工程系福建厦门361005

提取西太平洋"暖池"区深海沉积物样品总DNA,利用异化型亚硫酸盐还原酶(DSR)和甲基辅酶M还原酶(MCR)基因的特异引物,采用PCR-RFLP方法对沉积物样品中这两类功能基因多样性进行研究。该沉积物中的dsrAB基因分别来源于δ-变形菌... 详细信息

提取西太平洋"暖池"区深海沉积物样品总DNA,利用异化型亚硫酸盐还原酶(DSR)和甲基辅酶M还原酶(MCR)基因的特异引物,采用PCR-RFLP方法对沉积物样品中这两类功能基因多样性进行研究。该沉积物中的dsrAB基因分别来源于δ-变形菌中的6个属,其中最多的是脱硫弧菌属和脱硫杆状菌属;mcrA基因均来源于产甲烷古菌,其中主要是甲烷微菌。这些基因在系统发育树上都处于相对独立的分支。此外,还有较多的dsrAB,mcrA基因来源于未知的新属或新种。这些结果表明该海区沉积物中由微生物参与的硫和甲烷循环比较活跃,而且其中可能存在多种新的代谢途径。

关键词：西太平洋“暖池” 深海沉积物异化型亚硫酸盐还原酶

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超临界流体色谱法分析非对映异构体d4T-5'-N-磷酰化苯丙氨酸甲酯

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分析化学 2012年第8期40卷 1159-1163页

作者：陈伟珠许鹏翔易瑞灶赵玉芬厦门大学化学化工学院化学系化学生物学福建省重点实验室国家海洋局第三海洋研究所

采用超临界CO2流体色谱技术,分析d4T-5’-N-磷酰化苯丙氨酸甲酯手性磷的非对映异构体。色谱柱为Hpersil ODS2(250 mm×4.6 mm,5μm),流动相为夹带改性剂甲醇、乙醇和异丙醇的超临界CO2流体。以容量因子、选择性和分离度为指标,考察... 详细信息

采用超临界CO2流体色谱技术,分析d4T-5’-N-磷酰化苯丙氨酸甲酯手性磷的非对映异构体。色谱柱为Hpersil ODS2(250 mm×4.6 mm,5μm),流动相为夹带改性剂甲醇、乙醇和异丙醇的超临界CO2流体。以容量因子、选择性和分离度为指标,考察改性剂、背压和柱温对分离的影响。在甲醇、乙醇和异丙醇3种改性剂中,甲醇为最好的改性剂,其中在7%甲醇改性剂下,该化合物的分离度可达到3.35。在7%甲醇改性剂条件下,考察了压力(10～20 MPa)和温度(303.15～318.15 K)的影响。在优化的分离条件(改性剂为7%甲醇,流速为2 mL/min,柱温为308.15 K,背压为15 M Pa)下,d4T-5’-N-磷酰化苯丙氨酸甲酯的两种非对映异构体完全达到基线分离,分离时间约15 min。

关键词：超临界二氧化碳流体色谱非对映体分离 d4T-5’-N-磷酰化苯丙氨酸甲酯

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台湾南湾区秋末冬初海樽类的种类组成和数量分布

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海洋通报 2003年第6期22卷 9-16页

作者：张金标黄将修连光山国家海洋局海洋大气化学与全球变化重点实验室国家海洋局第三海洋研究所福建厦门361005 台湾海洋大学海洋生物研究所台湾基隆20224

根据 2001 年 11 月 2—3 日和 12 月 8—10 日在台湾南湾 12 个测站分别用 2 种圆锥形浮游生物网 (长180 cm，网口直径 45 cm，网目 333 μm 或 200 μm) 采集表层和底层的浮游动物样品，分析了南湾浮游海樽类的种类组成和数量分布，... 详细信息

根据 2001 年 11 月 2—3 日和 12 月 8—10 日在台湾南湾 12 个测站分别用 2 种圆锥形浮游生物网 (长180 cm，网口直径 45 cm，网目 333 μm 或 200 μm) 采集表层和底层的浮游动物样品，分析了南湾浮游海樽类的种类组成和数量分布，共鉴定海樽类 16 种，其中 7 种为台湾周围海域新记录。东方双尾纽鳃樽和小齿海樽为优势种。南湾海樽类的种类数及个体数量均以 12 月多于 11 月。讨论了水文条件与海樽类时空分布的关系，认为外海高盐水团是南湾冬季海樽类生态特征的主要制约因子。典型的高温高盐种大西洋火体虫、长吻纽鳃樽、安纽鳃樽、多手纽鳃樽、韦氏纽鳃樽、羽环纽鳃樽和斑点纽鳃樽等可以作为外海高温高盐水入侵南湾的指标种。与邻近海域比较，秋冬季南湾与台湾岛以东海域海樽类的区系特征比与台湾海峡和南海北部更加相似。

关键词：海樽类被囊动物种类组成数量分布台湾省南湾

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分子信标探针用于PCR检测对虾白斑杆状病毒

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生物化学与生物物理进展 2000年第3期27卷 277-280页

作者：章晓波徐洵李庆阁徐丽美 *** 中国科学技术大学生命科学学院合肥230026 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物工程重点实验室厦门361005 厦门大学生物系厦门361005

将对虾白斑杆状病毒的一段特异性DNA设计成分子信标探针 ,用于该病毒的PCR检测 .温度与荧光强度之间的关系表明 ,所设计探针的发夹既可以形成也可以打开 ,符合PCR对分子信标探针的要求 .结果表明 ,在PCR同时加入分子信标探针不影响PCR扩... 详细信息

将对虾白斑杆状病毒的一段特异性DNA设计成分子信标探针 ,用于该病毒的PCR检测 .温度与荧光强度之间的关系表明 ,所设计探针的发夹既可以形成也可以打开 ,符合PCR对分子信标探针的要求 .结果表明 ,在PCR同时加入分子信标探针不影响PCR扩增 ,分子信标探针只能与目的DNA杂交 ,具有较高的特异性 .随着PCR循环数的增加以及含目的DNA的质粒拷贝数的增加。

关键词：对虾白斑杆状病毒 PCR 分子信标探针

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