目的综合分析溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)相关scRNA-seq和RNA-seq数据集,探讨UC缓解期脾虚湿困证与活动期湿热阻滞证间的潜在分子机制,并挖掘潜在干预中药。方法运用差异基因表达分析和韦恩图鉴定出UC缓解期脾虚湿困证和活动期湿热阻滞证相关基因及两者间的对话基因。通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)及Spearman相关性分析深入探讨对话基因参与的生物过程及潜在功能。通过单细胞转录组分析探讨UC缓解期与活动期的差异情况及对话基因在其中的作用。基于循环算法构建UC缓解期脾虚湿困证向活动期湿热阻滞证发生发展的风险预测模型。运用外部数据集、动物实验与实时定量聚合酶链反应(realtime quantitative polymerase chain reaction,RT-PCR)进一步验证对话基因的表达情况。借助SoFDA数据库构建“基因-中医症状/现代医学症状”网络;借助TCMIP和COREMINE数据库预测对话基因的潜在靶向中药。结果鉴定出31个UC缓解期脾虚湿困证相关基因,其主要富集在代谢相关途径;鉴定出160个UC活动期湿热阻滞证相关基因,其主要富集在炎症免疫相关途径。鉴定出22个UC缓解期脾虚湿困证与活动期湿热阻滞证之间的对话基因,上调对话基因与炎症免疫相关途径呈显著相关性,下调对话基因与代谢途径呈显著相关性。单细胞转录组分析显示,相比于正常对照及UC缓解期,UC活动期中B细胞占比上调;B细胞在UC活动期湿热阻滞证中作用贡献较大,而在UC缓解期脾虚湿困证中的作用贡献较小;UC活动期B细胞的受体信号通路活性明显高于UC缓解期;上调的对话基因CD55在B细胞中表达水平较高,CD55+B细胞与CD55−B细胞之间存在差异的细胞通讯及细胞代谢水平。6个风险预测基因(CD55、PCSK1、SERPING1、ACAT1、SLC26A2、HMGCS2)可以较为准确预测UC缓解期脾虚湿困证向UC活动期湿热阻滞证发展,动物实验及RT-PCR验证了其表达水平。通过数据库检索得到人参、黄芪、枸杞子等45味潜在靶向中药。结论鉴定出22个关键对话基因,它们可能通过影响炎症免疫和代谢相关途径诱导UC缓解期脾虚湿困证向UC活动期湿热阻滞证发展。B细胞在UC缓解期脾虚湿困证向活动期湿热阻滞证发生发展过程中发挥重要作用。CD55可能通过影响炎症免疫和代谢相关途径,促进B细胞活性,从而促进UC缓解期脾虚湿困证向活动期湿热阻滞证发展。22个关键对话基因与UC相关中医症状和现代医学症状关联密切。
该研究参考核心指标集研制规范(core outcome set standards for development,COS-STAD),旨在构建中医药治疗单纯性肥胖临床研究(core outcome set,COS)。全面检索中英文数据库,收集中医药治疗单纯性肥胖的随机对照试验(RCT)与系统...
详细信息
该研究参考核心指标集研制规范(core outcome set standards for development,COS-STAD),旨在构建中医药治疗单纯性肥胖临床研究(core outcome set,COS)。全面检索中英文数据库,收集中医药治疗单纯性肥胖的随机对照试验(RCT)与系统评价中报告的结局指标;通过患者半结构化访谈和临床医生开放式问卷调查,获取补充结局指标,并将所有指标合并整理形成原始指标池,经工作组讨论后形成初步指标清单;与临床医生、方法学专家及患者进行两轮德尔菲问卷调查,对各指标的重要性进行评分;召开共识会议建立中医药治疗单纯性肥胖临床研究COS。结果纳入221篇RCTs和12篇系统评价,整理并结合补充指标后形成原始指标池,包含141个结局指标。经过咨询小组会议讨论,确定初步指标清单33个,分为9个指标域;通过两轮德尔菲调查及共识会议,最终确定中医药治疗单纯性肥胖临床研究COS,包含8个结局指标[中医证候积分、体质量指数(BMI)、腰臀比、腰围、内脏脂肪指数、体脂率、生活质量、安全性指标],分为4个指标域(中医相关指标、人体测量学指标、生活质量相关指标、安全性评价指标)。该研究初步构建了中医药治疗单纯性肥胖临床研究COS,有利于减少同类临床研究结局指标选择和报告的异质性,提高研究结果的可比性与合并分析的可行性,为临床实践提供更高水平的证据支持。
暂无评论