检索结果-内蒙古大学图书馆

生物信息学 2013年第3期11卷 201-208页

作者：谢雨琇宋成义何庆玲周家庆冯晓军李庆平高波王霄燕江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009

猪卵泡抑素基因(Follistatin,FS)具有调控动物生殖活动和肌肉生长的生物功能,但对猪的研究报道很少。本研究克隆了猪卵泡抑素基因两种接拼形式、比较分析其蛋白结构特征、进化关系和组织表达特性。研究结果表明,通过两对引物成功克隆了... 详细信息

猪卵泡抑素基因(Follistatin,FS)具有调控动物生殖活动和肌肉生长的生物功能,但对猪的研究报道很少。本研究克隆了猪卵泡抑素基因两种接拼形式、比较分析其蛋白结构特征、进化关系和组织表达特性。研究结果表明,通过两对引物成功克隆了猪卵泡抑素基因的1045bp(FS-L)和964bp(FS-S)的两种接拼形式;与Genbank中的序列比对表明FS-L和FS-S的CDS序列与人、牛、家鼠、沟鼠、斑马鱼的卵泡抑素基因序列相似性在80%以上。对两种蛋白质结构域的比较发现,FS-S蛋白相比FS-L蛋白而言缺失了一个FS结构域。同源性分析表明,猪与牛的亲缘关系较近,与人、小鼠、沟鼠和斑马鱼的关系相对较远。组织表达分析表明,两种拼接形式在梅山猪不同组织中的表达存在差异,FS-L基因在梅山猪肌肉及生殖系统等组织中均有表达,而FS-S基因则主要在生殖系统中表达。表明FS-L在肌肉生长中发挥作用,而FS-S主要调控动物的生殖功能。

关键词：猪卵泡抑素克隆表达生物信息学

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Characteristics of Deposition of Inosine Monophosphate(IMP) and Intramuscular Fat(IMF) in Muscles of Jinghai Yellow Chicken and Its Crossbreeds

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Agricultural Science & Technology 2013年第1期14卷 144-148,154页

作者：谢恺舟李爱华孙瑛瑛陈学森黄玉萍张小杰赵敏张跟喜戴国俊王金玉扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009

[Objective] This study aimed to investigate the characteristics of deposition of inosine monophosphate （IMP） and intramuscular fat （IMF） in muscles of Jinghai yellow chickens and its crossbred.[Method] The characteristics of IMP and IMF deposition of 112-day-old Jinghai yellow chickens （J×J） and its two different 70-day- old crossbreeds （J×B and B×B） were analyzed. The IMP content in breast muscle and leg muscle were determined by HPLC. [Result] The contents of IMP and cor- rected inosine monophosphate （IMPc） in breast muscle were significantly or ex- tremely significantly higher than that in leg muscle of the chickens in the three groups whether in male or female chickens （P〈0.05 or P〈0.01）. There were no sig- nificant difference in the contents of IMP and IMPc between hens and roosters （P〉 0.05）. The fresh degree of breast muscle and leg muscle was 96,11%-98.16% and 87.22%-93.07%, respectively. And the fresh degree of breast muscle was higher than that of leg muscle. In the three groups, the IMF content in leg muscle was significantly higher than that in breast muscle whether in male or female chickens （P〈0.05）. The contents of IMF in breast muscle and leg muscle were 0.36%-0.75% and 1.84%-2.38%, respectively. The iMP content in breast muscle of chickens in Bx J group was extremely significantly higher than that in breast muscle of chickens in JxJ group （P〈0.01）, but the contents of IMPc and iMF of breast muscle and leg muscle of the chickens in the three groups had no significant difference （P〉0.05）. [Conclusion] To sum up, the freshness and flavor significantly differ between the breast muscle and leg muscle of chickens, but show no significant difference among the three groups.

关键词： Crossbred combinations Muscles Inosine monophosphate （IMP） lintra- muscular fat （IMF） Deposition Jinghai yellow chicken

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Zyxin基因真核表达载体的构建及检测

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江苏农业学报 2013年第4期29卷 822-825页

作者：孙明明戴国俊孙大辉林雨鑫张跟喜谢恺舟张佳琦张敏宇施会强王金玉扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009 江苏京海禽业集团有限公司江苏海门226103

为了研究联蛋白基因(Zyxin)功能,对Zyxin基因进行了真核表达载体的构建,并对其进行鉴定。用全基因合成的方法得到Zyxin目的基因,将目的基因与pEX-6载体分别进行酶切,然后进行连接,连接产物转化到感受态大肠杆菌。挑取克隆,经质粒DNA抽... 详细信息

为了研究联蛋白基因(Zyxin)功能,对Zyxin基因进行了真核表达载体的构建,并对其进行鉴定。用全基因合成的方法得到Zyxin目的基因,将目的基因与pEX-6载体分别进行酶切,然后进行连接,连接产物转化到感受态大肠杆菌。挑取克隆,经质粒DNA抽提和酶切,琼脂糖凝胶电泳和测序,对克隆片段进行鉴定。将重组质粒pEX-6-Zyxin瞬时转染293T细胞。结果显示:电泳、双酶切和测序结果与预期结果相符。转染48 h后观察到红色荧光,用实时荧光定量PCR检测转染后48 h和72 h Zyxin基因mRNA水平有较高表达。表明成功构建了鸡Zyxin真核表达载体,为进一步研究该基因功能奠定了基础。

关键词： Zyxin 基因真核载体表达

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皖系长毛兔不同周龄Wnt10b、SFRP2基因在皮肤中的表达规律

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中国畜牧杂志 2013年第13期49卷 4-8页

作者：孙露露石福岳秦立志万小颖赵辉玲吴信生江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009 扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 安徽省农科院畜牧兽医研究所安徽合肥230031

本研究以被毛长度和被毛密度差异较大的皖系长毛兔(毛用型)和新西兰白兔(肉用型)为实验材料,采用Agilent公司家兔全基因组表达谱芯片筛选差异基因,根据芯片结果,挑出3个与家兔毛纤维生长发育相关的差异基因。实时荧光定量RT-PCR初步验证... 详细信息

本研究以被毛长度和被毛密度差异较大的皖系长毛兔(毛用型)和新西兰白兔(肉用型)为实验材料,采用Agilent公司家兔全基因组表达谱芯片筛选差异基因,根据芯片结果,挑出3个与家兔毛纤维生长发育相关的差异基因。实时荧光定量RT-PCR初步验证Wnt10b、Shh、SFRP2基因,检测结果与表达谱芯片结果一致。随后为研究差异表达基因在皖系长毛兔中的表达规律,分别选择一个上调基因(Wnt10b基因)和下调基因(SFRP2基因),采用实时荧光定量RT-PCR法研究Wnt10b、SFRP2基因在皖系长毛兔中的表达规律,进一步验证Wnt10b、SFRP2基因与家兔毛纤维生长发育相关。结果表明:Wnt10b基因在皖系长毛兔毛生长周期中起到一定的调节作用,能够通过诱发毛囊的再生而促进毛的生长发育;SFRP2基因在皖系长毛兔毛生长旺盛期表达量相对较低,在毛生长结束期表达量相对较高,因此SFRP2基因在皖系长毛兔毛生长周期中起到抑制毛生长的作用。

关键词：皮肤表达谱芯片实时荧光定量PCR 家兔

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鸭TLR4基因可变剪接体的克隆、鉴定及组织表达分析

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畜牧兽医学报 2013年第5期44卷 697-702页

作者：黄正洋陈阳李欣钰甄霆张扬徐琪段修军赵文明陈国宏江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州225009 江西农业大学动物科学技术学院南昌330045 国家水禽种质资源基因库泰州225300

本研究旨在克隆、鉴定鸭TLR4基因的可变剪接体,并对TLR4基因的可变剪接体表达规律进行分析。根据GenBank中鸭TLR4基因的mRNA序列(登录号:JN048668)设计引物,利用RT-PCR扩增鸭CDS区,以获取TLR4可变剪接体;并通过构建雏鸭PolyI:C感染模型... 详细信息

本研究旨在克隆、鉴定鸭TLR4基因的可变剪接体,并对TLR4基因的可变剪接体表达规律进行分析。根据GenBank中鸭TLR4基因的mRNA序列(登录号:JN048668)设计引物,利用RT-PCR扩增鸭CDS区,以获取TLR4可变剪接体;并通过构建雏鸭PolyI:C感染模型,利用qRT-PCR检测TLR4可变剪接体的时空表达变化。结果,获得一种鸭TLR4基因新的可变剪接体(TLR4-b),并鉴定其剪接形式为跨内含子剪接。组织表达分析表明,TLR4基因的表达主要以野生型(TLR4-a)为主,且在PolyI:C等抗原刺激后,肺、脾脏等组织中TLR4-a mRNA表达量总体表现为先上升,后下降,而TLR4-b表达变化不大。本研究成功克隆并鉴定了鸭TLR4基因新的可变剪接体,在正常情况下TLR4-a表达量显著高于TLR4-b,在PolyI:C感染下,TLR4-a表现为先上升,后下降。研究结果初步揭示了鸭TLR4基因可变剪接体的结构,且其功能主要取决于TLR4-a。

关键词：鸭 TLR4 可变剪接体表达分析

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兔IL-10基因的克隆及生物信息学分析

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上海畜牧兽医通讯 2013年第4期 2-5页

作者：万小颖沈杰施丽娟王文洲秦立志吴信生扬州大学动物科学与技术学院扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室扬州225009

本研究对兔IL-10基因序列进行克隆并进行生物信息学分析,旨在为该基因的深入研究提供依据。结果表明,兔与其他哺乳动物的IL-10基因在CDS和氨基酸序列上相似性都较高;与鸡和斑马鱼的CDS序列没有同源性,且氨基酸序列同源性很低。对兔IL-1... 详细信息

本研究对兔IL-10基因序列进行克隆并进行生物信息学分析,旨在为该基因的深入研究提供依据。结果表明,兔与其他哺乳动物的IL-10基因在CDS和氨基酸序列上相似性都较高;与鸡和斑马鱼的CDS序列没有同源性,且氨基酸序列同源性很低。对兔IL-10蛋白的软件预测分析表明,该蛋白是一种不稳定的疏水性分泌蛋白,富含磷酸化位点,有8个优势B细胞抗原表位。本研究为该基因的深入研究以及探明IL-10的合成分泌机制和网络调控机理提供了理论依据。

关键词： IL-10基因相似性软件预测

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miR-192和miR-215在梅山猪不同组织中的表达及其靶基因分析

miR-192和miR-215在梅山猪不同组织中的表达及其靶基因分析

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中国畜牧兽医学会2013年学术年会

作者：王瑾刘颖董文华訾臣吴圣龙包文斌扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室

引言课题组运用高通量测序技术在抵抗型和敏感型断奶仔猪全同胞配对组的十二指肠中筛选出差异极显著的miRNA——miR-192和miR-215,本研究进一步分析这两种miRNA在梅山猪11个组织中的相对表达情况,并对它们的靶基因进行初步预测及分析,... 详细信息

引言课题组运用高通量测序技术在抵抗型和敏感型断奶仔猪全同胞配对组的十二指肠中筛选出差异极显著的miRNA——miR-192和miR-215,本研究进一步分析这两种miRNA在梅山猪11个组织中的相对表达情况,并对它们的靶基因进行初步预测及分析,为进一步阐明miR-192和miR-215的生物学功能及其与F18大肠杆菌抗性间的关系提供参考。材料方法试验所用6头35日龄梅山猪选自昆山市梅山猪保种有限公司,屠宰后立即采集心、肝、脾、肺、肾、胃、肌肉、胸腺、淋巴、十二指肠和空肠的组织样,提取各组织总RNA并稀释至2 ng/μL。以U6为内参,在mirbase上查找U6、miR-192和miR-215的成熟体序列,定制相应的反转录试剂盒及定量试剂盒。结果与讨论miR-192在肝、肾、十二指肠和空肠中表达量较高,在胃和肌肉中表达量次之,在心、脾、肺、胸腺和淋巴中表达量较低;miR-215在肾、十二指肠和空肠中表达量较高,在肝中表达量次之,在心、脾、肺、胃、肌肉、胸腺和淋巴中表达量较低。搜索TargetScan数据库得到miRNA与靶基因间的关系,将所得靶基因与本课题组前期表达谱芯片上的差异基因取交集进行进一步筛选后得到miR-192及miR-215调控的靶基因,均为ALCAM、DLG5、FRMD4B、MIPOL1和ZFHX3。miR-192和miR-215二者同源,均为肿瘤抑制因子,它们共同的靶基因DLG5等在维持人类肠道上皮细胞结构完整性和炎症性肠炎的发生中发挥了重要的遗传效应,结合本研究结果及生物信息学分析表明,miR-192和miR-215在断奶仔猪F18大肠杆菌抗性过程中发挥了重要的调控作用。因此,构建miR-192和miR-215及其靶基因的调控网络,进一步分析关键靶基因的功能,对于阐明这两种miRNA及其关键靶基因在梅山断奶仔猪F18大肠杆菌抗性的调控和分子机制具有重要的作用。

关键词： miR-192 miR-215 梅山猪组织靶基因

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大白猪MUC4基因A243G位点作为抗性遗传标记的可行性分析

大白猪MUC4基因A243G位点作为抗性遗传标记的可行性分析

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中国畜牧兽医学会2013年学术年会

作者：苏先敏赵乔辉朱世平訾臣包文斌吴圣龙扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室

引言MUC4基因最有可能作为F4ab/F4ac受体基因的候选基因。鉴于前期研究显示MUC4基因第17内含子A243G位点与ETEC F4ac抗性/易感性显著相关,本研究以大白猪为研究对象,分析该位点与一般抗病力指标和部分重要经济性状的关系,探讨将该酶切... 详细信息

引言MUC4基因最有可能作为F4ab/F4ac受体基因的候选基因。鉴于前期研究显示MUC4基因第17内含子A243G位点与ETEC F4ac抗性/易感性显著相关,本研究以大白猪为研究对象,分析该位点与一般抗病力指标和部分重要经济性状的关系,探讨将该酶切位点标记运用于大白猪抗病育种实践的可行性,为今后有效遗传标记的确定和标记辅助选择提供依据和参考。材料方法大白猪138头采自常州康乐农牧有限公司,利用PCR-RFLP的方法分析A243G位点多态性。利用Procarta immunoassay kit测定35日龄断奶仔猪血清中8个重要细胞因子(IFN-γ、IL-1β、IL-4、IL-6、IL-8、IL-10、TGF-β和TNF-α)的水平。测定试验猪的生长速度(换算成100kg体重日龄)、背膘厚、眼肌厚以及第1至4胎次的总产仔数、产活仔数和断奶仔猪数。利用SPSS16.0软件分析基因型与重要经济性状的关系。结果与讨论本试验在大白猪群体中检测到2种等位基因,共3种基因型,且A为优势等位基因。大白猪MUC4基因A243G位点多态性与细胞因子水平的关联分析结果表明,GG基因型的IL-8、IL-10水平显著高于AA和AG(P<0.05),说明GG基因型个体可能具有更强的抗病能力;GG基因型的100kg体重日龄显著高于AA和AG(P<0.05),说明GG基因型个体育肥期生长速度较慢;3种基因型对应的其他细胞因子水平、背膘厚、眼肌厚以及第1至4胎次繁殖性能间差异不显著(P>0.05),提示针对大白猪群体MUC4基因HhaI酶切位点的分子选育会在一定程度上提高机体的抗病能力,不会对机体其它细胞因子调控的一般抗病力、瘦肉率和繁殖性能产生显著的影响,但是可能会在一定程度上影响群体的生长速度。

关键词：大白猪 MUC4基因免疫指标经济性状

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卡尼鄂拉蜂zinc transporter 7-like基因表达水平变化研究

卡尼鄂拉蜂zinc transporter 7-like基因表达水平变化研究

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第十届海峡两岸蜜蜂与蜂产品学术研讨会暨首届全国蜂产业高峰论坛

作者：沈杰刘振国沈芳吉挺扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州 225009

本研究旨在克隆卡尼鄂拉蜂锌转运蛋白-7相似基因(Zinc Transporter 7-like,ZnT-7-1ike),制备ZnT-7-1ike多克隆抗体,了解该基因在卡尼鄂拉蜂王浆腺中不同时期的差异表达情况。运用RT-PCR法从卡尼鄂拉蜂王浆腺总RNA中扩增ZnT-7-1ike基因,... 详细信息

本研究旨在克隆卡尼鄂拉蜂锌转运蛋白-7相似基因(Zinc Transporter 7-like,ZnT-7-1ike),制备ZnT-7-1ike多克隆抗体,了解该基因在卡尼鄂拉蜂王浆腺中不同时期的差异表达情况。运用RT-PCR法从卡尼鄂拉蜂王浆腺总RNA中扩增ZnT-7-1ike基因,经过生物信息学分析,为避开跨膜结构的干扰,选择克隆其部分序列(273bp)作为多肽免疫序列。将其亚克隆入原核表达载体pGEX-4T-1,转入大肠杆菌BL21 (DE3)中诱导表达获得融合蛋白,然后将融合蛋白纯化后免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体,分别用间接ELISA和Western Blot检测抗体的效价和特异性,最后采用实时荧光定量RT-PCR以及Western Blot技术检测该基因在不同日龄王浆腺中的相对表达量。结果,克隆得到卡尼鄂拉蜂ZnT-7-1ike基因,大小为1065 bp；SDS-PAGE电泳结果显示融合蛋白成功表达；制备的多克隆抗体效价高达1：64 000,且具有很高的特异性：该基因在卡尼鄂拉蜂5个日龄中的转录情况存在较大差异,表现为3日龄最高,12日龄最低；ZnT-7-1ike蛋白表达与转录水平基本一致。成功克隆了卡尼鄂拉蜂ZnT-7-1ike基因,制备了兔抗蜂ZnT-7-1ike多克隆抗体,并在转录和翻译两个水平上测定了ZnT-7-1ike在卡尼鄂拉蜂王浆腺中不同时期的相对表达量,为深入研究卡尼鄂拉蜂ZnT-7-1ike基因的功能奠定了基础。

关键词：锌转运蛋白-7相似基因克隆抗体制备差异表达

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肌肉生长抑制素基因5′调控区的多态性对边鸡生长和繁殖性状的遗传效应

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中国家禽 2013年第2期35卷 11-14页

作者：刘艳纽广林张跟喜张丽丁馥香王金玉江苏省江都畜牧兽医站江苏扬州225200 扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009 山西省农业科学院畜牧兽医研究所山西太原030032

本研究采用PCR-SSCP技术检测边鸡肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因5′调控区的单核苷酸多态性,并与边鸡的生长和繁殖性状进行关联分析。结果表明:在MSTN基因5′调控区检测到2个突变(A326G、C334G);6～8周龄,KK型的体重显著高于JJ和JL... 详细信息

本研究采用PCR-SSCP技术检测边鸡肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因5′调控区的单核苷酸多态性,并与边鸡的生长和繁殖性状进行关联分析。结果表明:在MSTN基因5′调控区检测到2个突变(A326G、C334G);6～8周龄,KK型的体重显著高于JJ和JL型(P<0.05);14周龄,KK和LL型的体重显著高于JL型(P<0.05);16周龄,KK型的体重显著高于JJ、JK和JL型(P<0.05);18周龄,KK型的体重极显著高于JL型(P<0.01),显著高于JJ和JK型(P<0.05),LL型的体重显著高于JL型(P<0.05),KK型的开产体重显著高于JJ和JL型(P<0.05);不同基因型对其余4个繁殖性状(开产日龄、开产蛋重、300日龄产蛋数以及300日龄蛋重)均无显著影响。结果提示,MSTN基因可能是影响边鸡生长性状的一个主要候选基因。

关键词：边鸡肌肉生长抑制素基因 PCR—SSCP 生长性状繁殖性状

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