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江苏省遗传学会2016年学术研讨会

作者：李玮王德荣蒋伟胡大棒高海林耿金鹏裔传灯扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室扬州225009

水稻粒宽是影响籽粒粒形的重要因素之一，也是一个与水稻产量和稻米品质密切相关的重要性状。基于基因GS5 序列分析的基础上，我们对该基因的第2 外显子的ACC/CTA 和第9 外显子A/C 的两个变异位点分别开发了功能标记，并将其用于294 份... 详细信息

水稻粒宽是影响籽粒粒形的重要因素之一，也是一个与水稻产量和稻米品质密切相关的重要性状。基于基因GS5 序列分析的基础上，我们对该基因的第2 外显子的ACC/CTA 和第9 外显子A/C 的两个变异位点分别开发了功能标记，并将其用于294 份水稻微核心种质和2007-2013 年江苏省审定的65 份粳稻品种的基因型鉴定。

关键词：水稻粒形基因GS5 功能标记单倍型

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水稻单株有效穗数QTL qPN1的功能研究

水稻单株有效穗数QTL qPN1的功能研究

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江苏省遗传学会2016年学术研讨会

作者：顾后文裘实缪军陶亚军刘雁华周勇梁国华扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室扬州225009

水稻是世界上重要的粮食作物之一，提高粮食产量对保障我国粮食安全具有战略意义。水稻理想株型是高产形成的基础，而分蘖和单株穗数是水稻关键的农艺性状，同时也是理性株型的重要组成部分。单株穗数主要由分蘖数决定。目前，关于水稻... 详细信息

水稻是世界上重要的粮食作物之一，提高粮食产量对保障我国粮食安全具有战略意义。水稻理想株型是高产形成的基础，而分蘖和单株穗数是水稻关键的农艺性状，同时也是理性株型的重要组成部分。单株穗数主要由分蘖数决定。目前，关于水稻分蘖相关基因的克隆主要还是以突变体为材料，相关QTLs 的克隆还很少。

关键词：水稻单株有效穗数数量性状位点基因克隆基因分析

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利用SSR标记鉴定江苏水稻品种真实性的研究

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金陵科技学院学报 2016年第2期32卷 62-66页

作者：杨华高鹏陈良叶凯毛从亚何金龙汤义华陈国斌陈宗祥左示敏江苏省种子管理站江苏南京210036 扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/教育部植物功能基因组学重点实验室江苏扬州225009

利用93个SSR标记对2015年江苏水稻种子市场中的355份抽检样品的真实性进行鉴定,与标准样品间存在2个及以上位点差异的占比31.55%。发现与标样不存在或仅存在1个位点差异的抽检样品,其与标样在农艺性状上不存在差异;而存在2个及以上位点... 详细信息

利用93个SSR标记对2015年江苏水稻种子市场中的355份抽检样品的真实性进行鉴定,与标准样品间存在2个及以上位点差异的占比31.55%。发现与标样不存在或仅存在1个位点差异的抽检样品,其与标样在农艺性状上不存在差异;而存在2个及以上位点差异的抽检样品中,随着差异位点数增多,差异明显增多。判定64个抽检样品的真实性存在问题,占抽样品种的18.03%。发现单独使用农业行业标准中的或之前报道的SSR标记,均不能完全鉴别江苏水稻种子市场中的假冒套牌品种,而采用2套标记整合后的93个标记则可完全鉴别。

关键词： SSR标记水稻品种鉴定农艺性状

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小麦地方品种黄方柱中赤霉病主效抗性位点Fhb1的精细定位

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麦类作物学报 2015年第12期35卷 1639-1645页

作者：董晶晶钱丹李磊李长成顾世梁李韬扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室江苏扬州225009

位于小麦3BS染色体上的赤霉病抗性主效基因Fhb1的效应较大而且比较稳定,是培育抗赤霉病品种最常用和最可靠的位点。我国小麦地方品种黄方柱(HFZ)高抗赤霉病且在3BS染色体上携带Fhb1基因。本研究对HFZ/Wheaton重组自交系(RIL)群体的Fhb1... 详细信息

位于小麦3BS染色体上的赤霉病抗性主效基因Fhb1的效应较大而且比较稳定,是培育抗赤霉病品种最常用和最可靠的位点。我国小麦地方品种黄方柱(HFZ)高抗赤霉病且在3BS染色体上携带Fhb1基因。本研究对HFZ/Wheaton重组自交系(RIL)群体的Fhb1位点进行分子标记检测,筛选到两个杂合子株系,并对这两个杂合子株系连续自交3代,衍生出2个次级分离群体(L30和L112),将这两个次级分离群体在扬州大学农学院试验田种植,并在扬花期进行单花滴注接种鉴定赤霉病,调查这两个群体中各株系的病小穗数、病小穗率、病粒数和病粒率。结果表明,L30和L112两个群体的病小穗数和病小穗率均显著正相关,病粒数和病粒率均显著正相关。同时依据小麦3B染色体参考序列开发了7个新的多态性标记,分别是X1550、X2214、X2300、X2357、X2455、X2460和X2467。用这些多态性分子标记进行基因型检测,在目标位点发现5个交换株系,根据基因型和病小穗率,进一步将Fhb1定位在分子标记X2214与X2357之间,在ctg0954b上这两个分子标记之间的物理距离约为143kb,NCBI预测该区间有3个候选基因,但是FGENESH在相同区段预测了29个基因,说明目标区段所具有的基因数目很可能多于3个,但少于29个。

关键词：小麦次级群体赤霉病 Fhb1 精细定位

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玉米ZmSSIV基因的序列变异及其对淀粉理化特性的影响

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2015年第3期36卷 54-61页

作者：徐暑晖杨泽峰扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/教育部植物功能基因组学重点实验室江苏扬州225009

玉米淀粉合成酶IV(ZmSSIV)基因编码淀粉生物合成途径中一个至关重要的合成酶。为检测ZmSSIV基因序列变异对玉米淀粉品质的影响,对80份玉米自交系中的该基因进行了目标序列重测序,并分别用快速黏度分析仪和差示扫描量热仪测定淀粉的7个... 详细信息

玉米淀粉合成酶IV(ZmSSIV)基因编码淀粉生物合成途径中一个至关重要的合成酶。为检测ZmSSIV基因序列变异对玉米淀粉品质的影响,对80份玉米自交系中的该基因进行了目标序列重测序,并分别用快速黏度分析仪和差示扫描量热仪测定淀粉的7个糊化特性和4个热力学特性。在玉米的ZmSSIV基因的全长序列中共检测到175个变异,包括150个SNP和25个InDel。尽管内含子具有更高的序列变异频率,编码区的变异依然可以将该基因划分成8种单倍型,并且编码6种不同的ZmSSIV蛋白质。进一步对ZmSSIV基因的序列变异与玉米淀粉的糊化和热力学特性进行了关联分析,结果发现编码区中的2个非同义突变与峰值黏度(PV)、低谷黏度(TV)、衰减值(BD)、峰值温度(Tp)、起始温度(To)和终止温度(Tc)等6个淀粉理化特性存在显著关联。这表明,玉米ZmSSIV基因不仅存在丰富的变异,而且其变异与淀粉理化特性存在显著关联。

关键词：玉米淀粉糊化和热力学特性 ZmSSIV基因序列变异关联分析

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小麦赤霉病主效抗性位点Fhb1近等基因系成熟籽粒对禾谷镰刀菌感染响应的比较

小麦赤霉病主效抗性位点Fhb1近等基因系成熟籽粒对禾谷镰刀菌感染...

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第七届全国小麦遗传育种学术研讨会

作者：李长成孙发宇樊沭君李韬扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培养点/粮食作物现代产业技术协同创新中心/教育部植物功能基因组学重点实验室

赤霉病是主要由禾谷镰刀菌引起的在世界范围内流行的小麦的主要病害之一,可导致小麦重大产量损失和品质下降.小麦赤霉病抗性类型有5 种,其中Type Ⅱ 为扩展抗性,一般以病小穗率作为度量指标;Type Ⅲ为籽粒抗性,一般以籽粒感染率为度量指标.

关键词：

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玉米快速叶绿素荧光参数候选基因挖掘

玉米快速叶绿素荧光参数候选基因挖掘

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第一届全国玉米生物学学术研讨会

作者：秦秋霞吴菲菲印志同邓德祥扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室

快速叶绿素荧光测定技术是国际上近年来发展起来的一项测定光合作用光反应光能利用效率的新技术。基于OJIP曲线的叶绿素荧光参数,反映了光系统原初光化学反应及光合器官结构和状态的变化。我们前期以242份玉米重组自交家系为材料,在3个... 详细信息

快速叶绿素荧光测定技术是国际上近年来发展起来的一项测定光合作用光反应光能利用效率的新技术。基于OJIP曲线的叶绿素荧光参数,反映了光系统原初光化学反应及光合器官结构和状态的变化。我们前期以242份玉米重组自交家系为材料,在3个大田条件下测定了灌浆期ABS/CSo(单位面积内吸收的光能的总量)、TRo/CSo(单位面积内捕获的光能总量)、ETo/CSo(单位面积内电子传递的量子产额)、RC/CSo(单位面积内反应中心的数量)、Pics(以单位面积为基础的性能指数)等5个快速叶绿素荧光参数,检测到多个主效QTL(Euphytica,2013,Publishedonline,DOI 10.1007/S10681-015-1380-9)。本研究以华中农业大学严建兵教授提供的含有400余份自交系的玉米自然群体为材料,在4个大田条件下于灌浆期测定上述5个参数,利用自然群体的56万个SNP标记信息以及软件TASSEL中的混合线性模型程序进行全基因组关联分析,检测到3个调控叶绿素荧光参数的关键基因组区段,分别位于2、5、9号染色体上,并通过生物信息学分析,获得6个候选基因。

关键词：玉米快速叶绿素荧光参数 QTL 关联分析候选基因

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玉米RUBISCO活化酶基因的EQTL分析

玉米RUBISCO活化酶基因的EQTL分析

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江苏省遗传学会2015年学术研讨会

作者：孙倩印志同邓德祥徐辰武扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室

Rubisco 是光合作用限速酶，但其催化活性较低，必须在其活化酶(RCA)催化下才具有较高活性。我们前期从玉米中克隆到2 个RCA 基因，分别命名为ZmRCAα 和ZmRCAβ;在123 份具有广泛遗传变异的玉米自交系中，它们在灌浆期的表达水平与玉... 详细信息

Rubisco 是光合作用限速酶，但其催化活性较低，必须在其活化酶(RCA)催化下才具有较高活性。我们前期从玉米中克隆到2 个RCA 基因，分别命名为ZmRCAα 和ZmRCAβ;在123 份具有广泛遗传变异的玉米自交系中，它们在灌浆期的表达水平与玉米产量呈显著正相关，其中ZmRCAβ 与产量相关系数高于ZmRCAα 和3 个C4 高光效基因。

关键词：玉米(Zea mays L.) Rubisco活化酶基因表达数量性状位点(eQTL)

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核质互作QTL定位方法及在玉米遗传育种中的应用

核质互作QTL定位方法及在玉米遗传育种中的应用

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第一届全国玉米生物学学术研讨会

作者：杨泽峰汤在祥徐辰武扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室

当前对复杂性状的遗传基础研究主要是进行QTL分析,然而目前的QTL分析策略仅有细胞核内基因的遗传差异,没有引入细胞质背景的差异,因而无法同时分析控制复杂性状的细胞质效应和核内基因/QTL效应,更无法解析核内基因/QTL和细胞质的互作效... 详细信息

当前对复杂性状的遗传基础研究主要是进行QTL分析,然而目前的QTL分析策略仅有细胞核内基因的遗传差异,没有引入细胞质背景的差异,因而无法同时分析控制复杂性状的细胞质效应和核内基因/QTL效应,更无法解析核内基因/QTL和细胞质的互作效应。我们首次提出核质互作QTL分析思想,即将双亲杂

关键词：细胞质效应复杂性状 QTL 玉米遗传育种定位方法

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玉米快速叶绿素荧光参数候选基因挖掘

玉米快速叶绿素荧光参数候选基因挖掘

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江苏省遗传学会2015年学术研讨会

玉米是世界上重要的谷类作物，其产量居世界粮食作物首位。提高玉米种植密度对玉米产量具有重要影响，但密植会导致玉米棒三叶相互遮荫、光照不足，提高植株光能利用率是密植条件下玉米产量进一步提高的关键。基于OJIP曲线的叶绿素荧光... 详细信息

玉米是世界上重要的谷类作物，其产量居世界粮食作物首位。提高玉米种植密度对玉米产量具有重要影响，但密植会导致玉米棒三叶相互遮荫、光照不足，提高植株光能利用率是密植条件下玉米产量进一步提高的关键。基于OJIP曲线的叶绿素荧光参数，反映了光系统原初光化学反应及光合器官结构和状态的变化。

关键词：玉米快速叶绿素荧光参数 QTL 关联分析候选基因

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