基于网络药理和分子对接技术研究樱桃李多酚(Prunus cerasifera Ehrhart polyphenols,PEP)抗2型糖尿病(diabetes mellitus type 2,T2DM)的潜在作用机制。通过查阅文献搜集樱桃李多酚的活性成分;利用PubChem、Sea和SwissTargetPre...
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基于网络药理和分子对接技术研究樱桃李多酚(Prunus cerasifera Ehrhart polyphenols,PEP)抗2型糖尿病(diabetes mellitus type 2,T2DM)的潜在作用机制。通过查阅文献搜集樱桃李多酚的活性成分;利用PubChem、Sea和SwissTargetPrediction数据库获取樱桃李多酚活性成分的靶点蛋白,GeneCards和OMIM数据库检索T2DM的疾病靶点。利用String数据库构建蛋白质互作(protein-protein interaction,PPI)网络并进行拓扑学分析。利用DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。利用Cytoscape 3.9.1软件构建“活性成分-核心靶点-通路”网络。使用AutoDock Vina 1.1.2和PyMol 2.5.4软件计算结合能并进行分子对接可视化。结果表明,筛选得到樱桃李多酚的24种活性成分及对应的HRAS、VEGFA等13个核心靶点;GO分析其主要涉及的生物过程包括丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)级联的正向调节、蛋白质磷酸化的正调节和基因表达的负调控等;KEGG富集分析主要涉及MAPK信号通路、糖尿病并发症中的高级糖基化终末产物-受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路和缺氧诱导因子1(hypoxia-inducible factor 1,HIF-1)信号通路等。综上,樱桃李多酚中的多种活性成分可通过多靶点、多通路发挥抗T2DM的作用。
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