RNA结合蛋白(RBPs)在细胞中广泛存在,在多种生物学过程中发挥着重要作用。紫外交联和蛋白质免疫共沉淀(UV cross-linking and immunoprecipitation,CLIP)技术是一种用于鉴定蛋白质直接结合RNA的技术。随着高通量测序技术的发展,CLIP技...
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RNA结合蛋白(RBPs)在细胞中广泛存在,在多种生物学过程中发挥着重要作用。紫外交联和蛋白质免疫共沉淀(UV cross-linking and immunoprecipitation,CLIP)技术是一种用于鉴定蛋白质直接结合RNA的技术。随着高通量测序技术的发展,CLIP技术已成为鉴定RNA结合蛋白所结合的具体RNA种类和序列的关键方法。为了满足不断增长的科研需求,CLIP技术经历了多次改进,衍生出多种版本,如HITS-CLIP、PAR-CLIP和iCLIP等。日益完善的CLIP技术在揭示新型蛋白质-RNA相互作用、解析RNA修饰和调控机制等方面具有重要价值,在RNA生物学研究中不可或缺。本文详细回顾了这些技术的演进与创新,比较了它们的优势与局限性,探讨了近年来CLIP技术在非经典蛋白质-RNA相互作用的研究中的应用,并展望了CLIP技术在未来RNA生物学中的创新应用与发展方向。
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