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福建农林大学学报（自然科学版） 2022年第6期51卷 730-736页

作者：洪涌林金纶钟雪萌朱胜男王玉洁肖清铁郑新宇林瑞余福建农林大学生命科学学院福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建福州350002 福建农林大学作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建福州350002

为筛选出不同镉耐性的水稻品种,收集了238份我国南方4省主栽的水稻种质资源.通过分析不同浓度镉处理的种子萌发及幼苗生长指标,发现镉污染显著抑制水稻种子萌发和幼苗生长,不同水稻品种的镉耐性存在显著差异;通过系统聚类,初步筛选出高... 详细信息

为筛选出不同镉耐性的水稻品种,收集了238份我国南方4省主栽的水稻种质资源.通过分析不同浓度镉处理的种子萌发及幼苗生长指标,发现镉污染显著抑制水稻种子萌发和幼苗生长,不同水稻品种的镉耐性存在显著差异;通过系统聚类,初步筛选出高耐性水稻品种43个、低耐性水稻品种67个;通过复筛获得了稳定的高镉耐性水稻品种4个(金丝软占、宜优673、福龙优两优6387和特优671),低镉耐性水稻品种8个(T两优明占、Y两优837、百香139、丰田优553、广8优165、过山香、两优688、隆两优1377).研究结果为水稻镉污染适应机制研究及镉低积累水稻育种提供一定基础.

关键词：水稻镉污染镉耐性发芽率发芽势发芽指数

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基于T-RFLP方法的连栽杉木根际土壤细菌群落变化研究

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生态学报 2019年第19期39卷 7134-7143页

作者：吴则焰赵紫檀林文雄李建鹃刘书影周柳婷罗扬刘金福福建农林大学生命科学学院福州350002 福建省农业生态过程与安全监控中重点实验室福州350002 作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福州350002 福建农林大学海峡自然保护区研究中心福州350002 福建农林大学林学院福州350002

运用末端限制性片段长度多态性技术(T RFLP),研究福建省尤溪国有林场的多代连栽杉木根际土壤细菌群落变化特征。结果表明:杉木多代连栽后根际微生态失衡,表现为碳循环菌和氮循环菌等有益菌数量减少,病原菌数量增加。在不同代数杉木土壤... 详细信息

运用末端限制性片段长度多态性技术(T RFLP),研究福建省尤溪国有林场的多代连栽杉木根际土壤细菌群落变化特征。结果表明:杉木多代连栽后根际微生态失衡,表现为碳循环菌和氮循环菌等有益菌数量减少,病原菌数量增加。在不同代数杉木土壤中,4种内切酶消化后产生的末端限制性片段(T RFs)数量具有显著差异,第一代杉木(first Chinese fir rotation plantation,FCP)最高,第二代杉木(second Chinese fir rotation plantation,SCP)次之,第三代杉木(third Chinese fir rotation plantation,TCP)最少。土壤理化性质结果表明连栽导致土壤养分逐代降低,除土壤碳氮比与细菌群落多样性呈显著负相关外,土壤养分含量指标与细菌群落多样性呈显著正相关。T RFLP实验共鉴定出细菌门类12门,其中厚壁菌门、蓝藻门、放线菌门和变形菌门是主要优势菌群。随栽植代数的增加,变形菌门细菌比例递增,而厚壁菌门细菌比例递减。土壤细菌群落多样性指数,表现为随栽植代数增长而减少,呈现FCP>SCP>TCP趋势,与T RFs片段数量变化趋势基本一致,表明多代连栽降低了杉木根际土壤细菌群落多样性。依据功能性不同,可将鉴定出的细菌划分为5类:碳循环功能菌、硫循环功能菌、氮循环功能菌、纤维降解菌及病原菌。连栽导致碳循环菌和氮循环菌相对含量降低,硫循环菌和纤维降解菌相对含量提高,病原菌相对含量随栽植代数增加而上升。

关键词：连栽杉木土壤微生物群落多样性末端限制性片段长度多态性

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马蓝IGPS基因的克隆、表达分析及原核表达

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热带作物学报 2021年第8期42卷 2167-2174页

作者：蔡国倩宁书菊叶齐胡永乐马小毛魏道智福建农林大学生命科学学院/福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建福州350002 福建农林大学农学院/作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建福州350002 武夷学院生态与资源工程学院福建武夷山354300

吲哚-3-甘油磷酸合酶(indole-3-glycerol phosphate synthase,IGPS)是广泛参与生物体内色氨酸、生长素等吲哚化合物合成途径中重要的关键酶之一。为了研究BcIGPS在马蓝吲哚类生物碱合成中的作用,基于马蓝转录组数据,通过RT-PCR技术从马... 详细信息

吲哚-3-甘油磷酸合酶(indole-3-glycerol phosphate synthase,IGPS)是广泛参与生物体内色氨酸、生长素等吲哚化合物合成途径中重要的关键酶之一。为了研究BcIGPS在马蓝吲哚类生物碱合成中的作用,基于马蓝转录组数据,通过RT-PCR技术从马蓝中克隆得到IGPS基因序列,命名为BcIGPS;利用生物信息学分析BcIGPS序列特性;运用qPCR分析BcIGPS在马蓝不同器官及外源诱导处理下的时空表达情况;构建pET-32a-BcIGPS原核表达载体,并优化诱导表达条件。结果表明:BcIGPS(GenBank登录号:MT210517)全长为1176 bp,包含1个开放阅读框(ORF),编码392个氨基酸,具丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、酪氨酸(Tyr)磷酸化位点31个,无跨膜结构,无信号肽,亚细胞定位于叶绿体中。BcIGPS含有product(indole)活性结构域和IGPS、TrpC特异性位点。qPCR分析结果显示,BcIGPS基因在不同器官的相对表达丰度依次为:叶>茎>花>根;其响应茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)、乙烯利(ETH)外源诱导信号的诱导,经MeJA和ETH处理后,分别在24 h和36 h最高,为初始水平的5.53、6.87倍;在SA处理下,BcIGPS表达响应最为强烈,呈先骤升后骤降的变化趋势,在12 h最高达初始水平的33.13倍;ABA处理后,其表达量变化不显著。所构建的pET-32a-BcIGPS原核表达载体在大肠杆菌BL21中表达,其最适条件为37℃、0.4 mmol/L IPTG培养3 h,BcIGPS重组蛋白主要以包涵体形式存在,且蛋白分子量与预测相符。

关键词：马蓝 BcIGPS 基因克隆表达分析原核表达

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马蓝色氨酸合成酶基因的克隆、序列及表达分析

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分子植物育种 2020年第3期18卷 873-881页

作者：公培民宁书菊叶齐马晓莉赵璇璇沈继伟胡永乐魏道智福建农林大学生命科学学院福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福州350002 福建农林大学作物学院作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福州350002 武夷学院生态与资源工程学院福州354300

通过对马蓝转录组数据分析,从马蓝叶片cDNA中克隆得到了色氨酸合成酶基因完整的编码序列(CDS),长度为807 bp,命名为BcTSA(GenBank登录号:MG857654),可编码269个氨基酸,并对其蛋白质理化性质、结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基... 详细信息

通过对马蓝转录组数据分析,从马蓝叶片cDNA中克隆得到了色氨酸合成酶基因完整的编码序列(CDS),长度为807 bp,命名为BcTSA(GenBank登录号:MG857654),可编码269个氨基酸,并对其蛋白质理化性质、结构域、跨膜区、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点、编码蛋白的二、三级结构、亚细胞定位进行了分析。蛋白序列多重比对结果显示与其他植物的TSA蛋白序列具有一定的同源性,并通过qRT-PCR法检测BcTSA基因在不同器官的表达与外源激素茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)诱导表达情况。推测其编码的蛋白为亲水蛋白,相对分子质量为28.9 kD,理论等电点(pI)为5.65,无跨膜区;亚细胞定位分析结果显示,BcTSA定位在叶绿体中的可能性大,没有信号肽;有18个磷酸化位点,存在6个潜在的糖基化位点,二级结构主要由α-螺旋构成;BcTSA氨基酸序列与其它15种物种氨基酸序列的保守区域达到81.35%的相似性;BcTSA基因在马蓝不同组织中均有表达,在叶中的表达量最高,根中最低;另外,发现BcTSA基因响应外源诱导子对代谢的调控。BcTSA基因的克隆与序列分析,有助于研究BcTSA基因的功能,对提高马蓝有效成分的含量具有重要意义。

关键词：马蓝(Baphicacanthus cusia) 色氨酸合成酶克隆表达分析

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流式细胞术测定马蓝基因组大小

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中成药 2023年第2期45卷 634-636页

作者：胡永乐宁书菊叶齐马小毛蔡国倩魏道智福建农林大学生命科学学院福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建福州350002 武夷学院生态与资源工程学院福建武夷山354300 福建农林大学农学院作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建福州350002

目的采用流式细胞术测定马蓝基因组大小。方法以马蓝幼嫩叶片为材料,水稻日本晴为参照,mGb裂解液解离细胞后通过流式细胞仪检测荧光强度,计算基因组大小。结果 mGb裂解液对细胞核解离效果较好,马蓝基因组大小为(0.99±0.01)Gb。结... 详细信息

目的采用流式细胞术测定马蓝基因组大小。方法以马蓝幼嫩叶片为材料,水稻日本晴为参照,mGb裂解液解离细胞后通过流式细胞仪检测荧光强度,计算基因组大小。结果 mGb裂解液对细胞核解离效果较好,马蓝基因组大小为(0.99±0.01)Gb。结论该方法既丰富了马蓝遗传信息,又为其基因组学研究和流式细胞技术应用提供参考。

关键词：马蓝基因组大小流式细胞术

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马蓝转录组中SSR位点信息特征分析

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分子植物育种 2020年第12期18卷 4000-4008页

作者：公培民宁书菊叶齐于剑赵璇璇沈继伟马小毛蔡国倩胡永乐魏道智福建农林大学生命科学学院福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福州350002 福建农林大学作物学院福建省高校作物生态与分子生理学重点实验室福州350002 武夷学院生态与资源工程学院武夷山354300

本研究利用Illumina HiSeqTM 2000对马蓝转录组进行高通量测序,使用软件MicroSAtellite(MISA)分析转录组中的SSR位点信息。通过组装马蓝转录组数据获得了51381条Unigene,并对获得的Unigene进行SSR检测,共检测到8471个SSR位点,其分布在6... 详细信息

本研究利用Illumina HiSeqTM 2000对马蓝转录组进行高通量测序,使用软件MicroSAtellite(MISA)分析转录组中的SSR位点信息。通过组装马蓝转录组数据获得了51381条Unigene,并对获得的Unigene进行SSR检测,共检测到8471个SSR位点,其分布在6782条Unigene中,出现的频率为16.49%。SSR中以二核苷酸和三核苷酸重复类型为主,其中二核苷酸以重复单元AT/TA为主,占18.14%,其余类型的重复单元相对较少。SSR所在序列功能注释结果显示在Nr和SwissProt中分别有5932和4285条序列被注释,同时SSR所在序列还被注释到47个GO分类,25个KOG分类和29个KEGG代谢通路中。通过设计、筛选,共获得5819对引物组合,随机挑选的18对引物中有13对引物扩增出符合预期大小的条带。马蓝SSR出现的频率高,重复种类丰富,为研究马蓝遗传多样性、基因定位和品质改良等提供了科学依据。

关键词：马蓝(Baphicacanthus cusia) 转录组 SSR

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化感小麦根系分泌物对看麦娘生长及保护酶活性的影响

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福建农林大学学报（自然科学版） 2019年第5期48卷 545-549页

作者：邱秋金洪涌肖清铁林瑞余莆田学院基础教育学院福建仙游351200 福建省农业生态过程与安全监控重点实验室/福建农林大学生命科学学院福建福州350002 福建农林大学作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建福州350002

为阐明小麦化感抑草效应与机制以强化感小麦‘92L89’和弱化感小麦‘抗10103’为材料通过沙培不同密度的小麦分析了根系分泌物对看麦娘根长、株高、根系活力、叶片保护酶活性及 MDA 含量的影响.结果表明化感小麦根系分泌物显著... 详细信息

为阐明小麦化感抑草效应与机制以强化感小麦‘92L89’和弱化感小麦‘抗10103’为材料通过沙培不同密度的小麦分析了根系分泌物对看麦娘根长、株高、根系活力、叶片保护酶活性及 MDA 含量的影响.结果表明化感小麦根系分泌物显著抑制看麦娘根长与株高生长抑制效应随种植密度的增大而增强强化感小麦的抑制率显著高于弱化感小麦.不同密度强化感小麦处理下看麦娘的根系活力比对照下降了30.4%~45.1% 显著高于弱化感小麦的25.9%~28.2% 看麦娘叶片的SOD活性、POD活性、PAL活性及MDA含量分别比对照提高了27.8%~42.8%、18.4%~77.1%、34.2%~70.1%和30.0%~ 78.0% 而弱化感小麦处理后依次提高了5.4%~26.6%、9.6%~24.7%、7.9%~41.1%和4.0%~54.0% 低密度弱化感小麦处理的看麦娘株高、SOD 活性、PAL 活性与对照无显著差异.可见化感小麦通过根系分泌作用抑制了受体植物根系活力和生长刺激叶片 SOD、POD、PAL 活性提高引起脂质过氧化作用及苯丙烷途径代谢增强不利于靶标植物的生长.

关键词：小麦化感作用看麦娘根系活力保护酶活性

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紫苏生长与产量对种植密度、施肥及种植方式的响应

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江西农业大学学报 2018年第1期40卷 15-23页

作者：郑梅琴肖清铁吕荣海郑新宇林瑞余福建农林大学金山学院福建福州350002 福建农林大学生命科学学院/福建省农业生态过程与安全监控重点实验室福建福州350002 福建农林大学作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建福州350002 福建省上杭县农业技术推广站福建上杭364000

为提高紫苏产量、确定栽培方案,通过随机区组田间试验,探讨了种植密度、施肥及种植方式对紫苏生长及产量的影响。结果表明,3个因素对紫苏株高、地径、根长、有效穗数及分支数均无显著影响,对紫苏籽粒千粒质量、理论产量和实测产量均有... 详细信息

为提高紫苏产量、确定栽培方案,通过随机区组田间试验,探讨了种植密度、施肥及种植方式对紫苏生长及产量的影响。结果表明,3个因素对紫苏株高、地径、根长、有效穗数及分支数均无显著影响,对紫苏籽粒千粒质量、理论产量和实测产量均有显著影响。行株距20 cm×20 cm的紫苏生物学产量为13 462 kg/hm^2,依次比行株距30 cm×20 cm、25 cm×20 cm高42.5%和13.3%;有机肥与复合肥混施的紫苏平均产量为12 312 kg/hm^2,分别比单施有机肥、复合肥高16.3%和3.6%;直播紫苏平均产量为12 486 kg/hm^2,比移栽高16.6%。紫苏收获指数只在种植密度和种植方式间存在显著差异;而籽粒产量仅在种植方式间存在显著差异,移栽紫苏籽粒产量为1 050 kg/hm^2,高于直播的998 kg/hm^2。综合考虑生物学产量、收获指数及籽粒产量,以收获地上部为目标的紫苏栽培以行株距20 cm×20 cm、混合施肥的直播组合最佳,生物学产量为13 398 kg/hm^2,茎叶产量9 877 kg/hm^2,籽粒产量1 279 kg/hm^2。

关键词：紫苏种植密度施肥方式栽培方式生物量

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不同栽培措施对紫苏镉富集能力的影响

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福建农业学报 2018年第7期33卷 724-731页

作者：肖清铁郑新宇韩永明朱静静郑梅琴吕荣海林瑞余福建省农业生态过程与安全监控重点实验室/福建农林大学生命科学学院福建福州350002 作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建福州350002 福建省上杭县农业技术推广站福建上杭364000

为探讨种植密度、施肥及种植方式对紫苏镉富集能力的影响,通过田间随机区组试验,分析了不同栽培措施下紫苏各部位的镉含量及镉富集总量。结果表明,种植密度和种植方式显著影响紫苏不同部位镉的吸收和积累,施肥方式显著影响紫苏茎叶和籽... 详细信息

为探讨种植密度、施肥及种植方式对紫苏镉富集能力的影响,通过田间随机区组试验,分析了不同栽培措施下紫苏各部位的镉含量及镉富集总量。结果表明,种植密度和种植方式显著影响紫苏不同部位镉的吸收和积累,施肥方式显著影响紫苏茎叶和籽粒中镉的吸收和积累。低密度种植D1(行株距30cm×20cm)和移栽种植方式(P1)可提高紫苏地上部及全株镉含量,施用有机肥(F1)可提高紫苏籽粒镉含量。镉迁移系数(TF)和富集系数(BCF)随种植密度的增大而减小,移栽紫苏的TF和BCF高于直播紫苏。低密度、移栽种植处理的紫苏镉含量(4.57~5.08mg·kg^(-1))、TF(1.43~1.75)和BCF(2.08~2.24)均处于最高水平。低密度(D1)和高密度栽培D3(行株距20cm×20cm)紫苏镉富集总量无差异,均显著高于中密度D2(行株距25cm×20cm)栽培紫苏镉富集总量。田间栽培条件下镉在紫苏不同部位的分配比例:茎叶>根部>籽粒,其中地上部的平均分配比为83.11%。总之,混合施肥促进直播紫苏镉富集,施用复合肥有利于移栽紫苏镉向地上部迁移,适宜的高密度可提高紫苏对镉污染土壤的修复效率。

关键词：紫苏栽培镉富集植物修复

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马蓝等79种植物分支酸合成酶的生物信息学分析

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中国中药杂志 2018年第4期43卷 721-730页

作者：于剑叶齐宁书菊李卿谭何新冯静娴陈瑞兵马晓莉公培民赵璇璇张磊魏道智福建农林大学生命科学学院福建福州350002 福建省农业生态过程与安全监控中重点实验室福建福州350002 作物生态与分子生理学福建省高校重点实验室福建福州350002 福建农林大学作物科学学院福建福州350002 第二军医大学附属长征医院上海200003 第二军医大学药学院药用植物学教研室上海200433

分支酸合成酶（ehorismate synthase，CS，EC：4．2．3．5）催化5-烯醇式莽草酸-3-磷酸生成分支酸，是生物体内分支酸合成所必须的酶。目前，Genbank报道了79种高等植物cS的氨基酸序列。该研究采用生物信息学方法对马蓝等79种植物共125... 详细信息

分支酸合成酶（ehorismate synthase，CS，EC：4．2．3．5）催化5-烯醇式莽草酸-3-磷酸生成分支酸，是生物体内分支酸合成所必须的酶。目前，Genbank报道了79种高等植物cS的氨基酸序列。该研究采用生物信息学方法对马蓝等79种植物共125条cs氨基酸序列的组成成分、信号肽、导肽、疏水性／亲水性、跨膜结构、卷曲螺旋结构、蛋白二级结构、三级结构及其功能域等进行预测和分析，并构建了cs蛋白家族的系统进化树。进化分析结果表明这79种植物的cs被分为8个类群；而氨基酸序列同源性比对结果显示，马蓝cs的氨基酸序列与芝麻、烟草、马铃薯等植物的同源性比较高。所有植物cs的开放阅读框在1300bp左右，相对分子质量为50kDa左右，等电点（pI）在5．0-8．0，呈微碱性。该研究克隆得到的马蓝cs的开放阅读框为1326bp，氨基酸残基数为442个，相对分子质量47kDa，等电点（pI）为8．11。CS氨基酸肽链表现出明显的疏水区和亲水区，不存在信号肽，可能存在跨膜结构域。蛋白质二级结构中最主要的结构元件是无规则卷曲和d．螺旋，并含有活性结构域、PLN02754保守域和FMN结合位点3个主要的组成结构域。研究所获得的结构信息，可为今后进一步深入研究植物cs的构效关系和结构改造提供一定的科学依据。

关键词：马蓝分支酸合成酶生物信息学构效关系结构改造

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