检索结果-内蒙古大学图书馆

陆军军医大学学报 2025年第6期47卷 613-622页

作者：李佳芮钱力沈俊杰郭泓麟秦茂洋伍亚舟陆军军医大学(第三军医大学)军事预防系医学系军队卫生统计学教研室重庆

目的旨在对10种癌症转录组学数据开展深度分析与特征提取,进而实现对癌症样本的分期诊断。方法在UCSC Xena网站收集发病率最高的10种癌症转录组学数据(包含4938个样本和59428个基因),以变分自编码器为基础,利用特征重要性排序思想,通过... 详细信息

目的旨在对10种癌症转录组学数据开展深度分析与特征提取,进而实现对癌症样本的分期诊断。方法在UCSC Xena网站收集发病率最高的10种癌症转录组学数据(包含4938个样本和59428个基因),以变分自编码器为基础,利用特征重要性排序思想,通过引入掩码算法和增量特征选择方法(incremental feature selection,IFS),构建了增量特征排序选优变分自编码器(incremental feature ranking and selection variational autoencoder,IFRSVAE);与随机森林(random forest,RF)、支持向量机(support vector machine,SVM)和极限梯度提升树(eXtreme gradient boosting,XGboost)结合测试了该方法的性能,并同其他方法进行比较。结果提取了21个特征用于后续分类,较于传统变分自编码器、递归特征消除和Lasso回归模型,IFRSVAE模型在3种分类器上均取得了较好性能(AUC值最高,其余指标也表现良好);其中IFRSVAE-RF表现最好,AUC达到了85.49%(95%CI:83.24%~87.74%)。此外,还应用了沙普利加性解释(Shapley additive explanations,SHAP)模型对特征贡献进行展示。结论本研究探索并验证了IFRSVAE在特征提取方面具备一定成效。基于此构建的IFRSVAE-RF模型,在癌症分期诊断任务中展现出较好的表现,为深度学习在癌症分期诊断方法的研究方向上,提供了一种可供参考的新思路。

关键词：癌症分期转录组学变分自编码器机器学习

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基于随机生存森林算法的NK/T细胞淋巴瘤患者预后模型的构建与验证

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陆军军医大学学报 2025年第3期47卷 275-284页

作者：黄侦伍亚舟陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院血液病中心重庆

目的探讨NK/T细胞淋巴瘤(natural killer T-cell lymphoma,NKTL)患者的生存预后影响因素。基于随机生存森林(random survival forest,RSF)算法,构建预测NKTL患者总生存期(overall survival,OS)的预后模型。方法从SEER数据库收集2000-2020年的NKTL患者的人口统计学和临床病理资料。按照7∶3的比例将患者划分为训练队列(n=471)和验证队列(n=203)。通过Cox回归分析确定影响患者OS的预后因素,并基于分析结果构建列线图模型。同时,使用RSF算法确定影响患者OS的预后因素,并构建RSF模型。采用ROC曲线、校准曲线和决策曲线、净重新分类指数(net reclassification improvement,NRI)和综合判别改善指数(integrated discrimination improvement,IDI)对模型的预测能力进行评估,并比较2种模型的预测效果。通过2种模型计算每位患者的风险得分,根据风险得分的中位数,将患者分为高风险组和低风险组,并绘制生存曲线进行比较。结果Ann Arbor分期、年龄、放疗、联合治疗和疾病类型是与生存显著相关的预后变量。在验证队列中,列线图模型的1、3和5年ROC曲线下面积(area under curve,AUC)分别为0.745、0.771和0.748,而RSF模型的AUC为0.764、0.792和0.761。ROC曲线显示2种模型在预测OS方面具有良好的准确性和区分性。校准曲线显示2种模型预测的生存与实际生存之间具有良好的一致性。两种模型均能有效地将患者分为预后差组和预后好组,并且预后差组患者的OS显著低于预后好组(P<0.0001)。决策曲线显示RSF模型的净获益优于列线图模型。与列线图模型相比,RSF模型的NRI为0.184(95%CI:0.098~0.267,P<0.01),IDI为0.300(95%CI:0.241~0.359,P<0.01),RSF模型的预测能力优于列线图模型。结论Ann Arbor分期、年龄、放疗、联合治疗和疾病类型是NKTL患者预后的影响因素,本研究据此建立的RSF模型对NKTL患者预后具有很好的预测能力,可有效评估患者预后。

关键词： NK/T细胞淋巴瘤 SEER数据库列线图机器学习随机生存森林生存预测

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外周血piR-hsa-2700592在房颤患者预后中的预测研究

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陆军军医大学学报 2025年第6期47卷 551-560页

作者：杨蕾邬娜杨岚清陈彦秀陈兴华袁志权李成英吴龙曾雨虹王煜钟理杨敬源李亚斐贵州医科大学公共卫生与健康学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵阳陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队流行病学教研室重庆陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院心内科重庆重庆医科大学附属第三医院心血管疾病中心重庆

目的探究外周血piR-hsa-2700592与房颤患者全因死亡和卒中结局的关联,确定piRhsa-2700592是否具有作为房颤生物标志物的潜力。方法纳入127名非瓣膜性房颤患者,检测血浆piR-hsa-2700592相对表达水平,运用Cox比例风险回归分析外周血piR-hs... 详细信息

目的探究外周血piR-hsa-2700592与房颤患者全因死亡和卒中结局的关联,确定piRhsa-2700592是否具有作为房颤生物标志物的潜力。方法纳入127名非瓣膜性房颤患者,检测血浆piR-hsa-2700592相对表达水平,运用Cox比例风险回归分析外周血piR-hsa-2700592的相对表达水平与房颤患者全因死亡和卒中结局的关联。比较分析在CHA_(2)DS_(2)-VASc评分及ABC卒中(或死亡)评分中分别加入血浆piR-hsa-2700592表达水平后,其新预测模型对2种结局预测能力的改善情况。应用受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)、净重新分类指数(net reclassification improvement,NRI)、综合判别改善指数(integrated discrimination improvement,IDI)评估预测能力,通过决策曲线分析(decision curve analysis,DC A)比较临床净收益情况。结果多因素Cox回归分析显示,外周血piR-hsa-2700592高表达水平的患者发生卒中的风险更高(HR:2.203;95%CI:1.120~4.332;P=0.022)。在卒中结局中,将血浆piR-hsa-2700592表达水平分别纳入CHA_(2)DS_(2)-VASc评分及ABC卒中评分相较原评分AUC有显著增加,其新模型AUC分别为0.70(95%CI:0.55~0.85,P<0.001)和0.84(95%CI:0.73~0.96,P=0.02);高血浆piR-hsa-2700592水平与房颤患者全因死亡无显著关联(HR:1.997;95%CI:0.884~4.509;P=0.096)。新模型的重分类能力得到显著改善,与CHA_(2)DS_(2)-VASc评分相比其NRI和IDI分别为44.20%(95%CI:3.40~59.90,P<0.001)和8.20%(95%CI:0.60~15.40,P<0.001);与ABC卒中评分相比,NRI和IDI分别为44.20%(95%CI:9.80~58.90,P<0.001)和10.40%(95%CI:0.70~21.40,P<0.001);DCA曲线显示其新预测模型均有更好的净临床获益。结论外周血高表达的piR-hsa-2700592是房颤患者发生卒中的独立危险因素,并且对房颤患者的预后有较好的预测价值,提示piRhsa-2700592可作为潜在生物标志物,为其在心血管疾病诊断和防治中的应用提供依据。

关键词：心房颤动 CHA_(2)DS_(2)-VASc评分 piRNA 预后

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外周血SNORD55对心房颤动患者预后的预测价值

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陆军军医大学学报 2025年第2期47卷 151-160页

作者：王煜邬娜杨岚清袁志权李成英吴龙曾雨虹杨蕾陈彦秀陈兴华钟理杨敬源李亚斐贵州医科大学公共卫生与健康学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵州贵阳陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队流行病学教研室重庆陆军军医大学(第三军医大学)第一附属医院心内科重庆重庆医科大学附属第三医院心血管疾病中心重庆

目的探索外周血SNORD55相对表达水平与房颤患者全因死亡及卒中结局的关联,并评估其对房颤患者预后的预测价值。方法共纳入2014年1月至2017年12月在陆军军医大学第一附属医院心内科住院的133名非瓣膜性房颤患者。收集基线信息,检测血浆... 详细信息

目的探索外周血SNORD55相对表达水平与房颤患者全因死亡及卒中结局的关联,并评估其对房颤患者预后的预测价值。方法共纳入2014年1月至2017年12月在陆军军医大学第一附属医院心内科住院的133名非瓣膜性房颤患者。收集基线信息,检测血浆SNORD55相对表达水平。运用Cox比例风险模型探索外周血SNORD55相对表达水平与房颤患者全因死亡和卒中结局的关联。分析在CHA2DS2-VASc评分基础上添加SNORD55相对表达水平后,与原评分相比对房颤患者全因死亡和卒中结局预测能力是否改善。应用受试者工作特征曲线下面积(area under curve, AUC)评估区分度,计算净重新分类指数(net reclassification index, NRI)、综合判别改善指数(integrated discrimination improvement index, IDI)评估重分类能力的改善情况。通过决策曲线分析(decision curve analysis,DCA)比较临床净收益的变化情况。结果多因素Cox回归结果表明,外周血中高表达的SNORD55是房颤患者全因死亡和卒中结局的独立危险因素。针对全因死亡和卒中结局,添加SNORD55相对表达水平后的CHA2DS2-VASc评分相较原评分有更高的AUC[分别为0.67(95%CI:0.53~0.81)和0.80(95%CI:0.67~0.93),P<0.05]。加入SNORD55相对表达水平后的CHA2DS2-VASc评分,在全因死亡和卒中结局中,其NRI和IDI都有一定的增加[NRI分别为31.9(95%CI:2.8~47.5)、54.3(95%CI:10.6~61.9),IDI分别为7.9(95%CI:0.5~14.8)、16.1(95%CI:2.4~27.0),P<0.05]。DCA结果显示,添加SNORD55相对表达水平后的CHA2DS2-VASc评分和国外ABC评分,在全因死亡和卒中结局中都较原评分有更高的临床净收益。结论外周血SNORD55水平是房颤患者全因死亡和卒中结局的独立危险因素,且对房颤患者全因死亡和卒中结局有较好的预测能力。

关键词：心房颤动 SNORD55 风险评估预后

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客观测量睡眠模式与各系统疾病谱系风险:英国生物银行87617人队列研究

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陆军军医大学学报 2025年第4期47卷 318-325页

作者：王艺蒙陈卿罗斯文史富全何孟超王圣峰温俏睿代应忠屈壕曹佳陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系毒理学研究所重庆解放军疾病预防控制中心应急处置大队北京北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系北京重大疾病流行病学教育部重点实验室(北京大学) 北京

目的探究睡眠模式对各系统疾病发生风险的影响。方法研究对象来源于英国生物银行一个含有87617名志愿者的子样本数据,使用加速度计获得3个维度(睡眠时长和入睡时间;睡眠节律;睡眠质量)6项睡眠指标,采用潜在剖面分析(latentprofile analy... 详细信息

目的探究睡眠模式对各系统疾病发生风险的影响。方法研究对象来源于英国生物银行一个含有87617名志愿者的子样本数据,使用加速度计获得3个维度(睡眠时长和入睡时间;睡眠节律;睡眠质量)6项睡眠指标,采用潜在剖面分析(latentprofile analysis,LPA)的方法探究人群中存在的睡眠模式,并结合纵向随访医疗记录,分析睡眠模式与467种疾病发生风险的关联。结果LPA将人群分成5个不同睡眠模式的亚群,与参考亚群4相比,其他亚群分别在不同的睡眠维度表现出差异,至少1种睡眠指标呈现不良趋势。不同睡眠模式的亚群在人种构成、倒班工作、社会剥夺指数等方面存在差异。不同亚群在各系统疾病的发生风险上也有明显差异(P<0.05)。与参考亚群4相比,其余各亚群均表现出某些疾病(共计126种)风险上升,以循环系统、消化系统和骨骼肌肉系统关联病种最多;各亚群中,亚群2(睡眠时长较短,入睡较晚)和亚群5(节律指标较差)关联的风险病种最多(分别为85和91种),且两者关联的病种在系统构成上也有一定差异。结论人群中存在不同睡眠模式的群体,其与多系统疾病风险上升有关。针对睡眠的整体模式而非单个维度进行综合干预,可能形成显著的健康收益。

关键词：加速度计潜在剖面分析英国生物银行疾病风险

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垃圾填埋场土壤酶活性与化学性质和微生物数量的关系研究

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生态学杂志 2005年第9期24卷 1043-1047页

作者：李俊舒为群陈济安伍亚舟第三军医大学环境卫生学教研室重庆400038 第三军医大学卫生统计学教研室重庆400038

通过气相色谱/质谱定性分析表明,垃圾填埋场土壤的有机物污染成分复杂,共检出有机物50种。研究表明,随着填埋深度的加深,土壤理化性质,微生物数量和土壤酶活性有很大不同。运用典型相关分析对垃圾填埋场的土壤酶活性与土壤化学性质和微... 详细信息

通过气相色谱/质谱定性分析表明,垃圾填埋场土壤的有机物污染成分复杂,共检出有机物50种。研究表明,随着填埋深度的加深,土壤理化性质,微生物数量和土壤酶活性有很大不同。运用典型相关分析对垃圾填埋场的土壤酶活性与土壤化学性质和微生物数量的关系进行了研究。结果表明,土壤酶活性与化学性质总体上密切相关;土壤酶活性与微生物数量总体上密切相关;但在土壤酶中过氧化氢酶活性与化学性质和微生物数量不相关。

关键词：土壤酶活性土壤化学性质土壤微生物典型相关分析

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X波段微波辐照致心肌损伤及机理研究

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强激光与粒子束 2006年第5期18卷 867-870页

作者：周舟张蕾李茂全张广斌余争平第三军医大学劳动卫生学教研室重庆400038

采用90 W/cm2X波段微波全身一次辐照大鼠10 min,分别于辐照后0,0.5,1,3,6,12,24 h断头处死,取左心室心肌组织,光镜观察心肌组织形态学损伤;TUNEL法检测心肌组织细胞凋亡;RT-PCR检测大鼠心肌组织GSK3,βcaspase-9和caspase-3 mRNA表达水... 详细信息

采用90 W/cm2X波段微波全身一次辐照大鼠10 min,分别于辐照后0,0.5,1,3,6,12,24 h断头处死,取左心室心肌组织,光镜观察心肌组织形态学损伤;TUNEL法检测心肌组织细胞凋亡;RT-PCR检测大鼠心肌组织GSK3,βcaspase-9和caspase-3 mRNA表达水平的变化;Western-blot法检测大鼠心肌组织GSK3β蛋白质磷酸化表达水平的变化;Caspase-9分析试剂盒检测心肌组织中caspase-9酶活性。研究结果表明:90 W/cm2X波段微波辐照可上调心肌组织GSK3β基因表达,使其蛋白磷酸化水平降低,解除了磷酸化对其活性的抑制,使GSK3β活性增强,从而参与了X波段微波辐照致心肌细胞凋亡的启动。90 W/cm2X波段微波辐照同时可使大鼠心肌组织中的凋亡相关蛋白激酶caspase-9和caspase-3基因表达上调,caspase-9酶活性增强,从而造成大鼠心肌细胞凋亡过程的启动,因此,GSK-3β及其下游介导的与凋亡相关的信号分子caspase-9和caspase-3的激活可能是X波段微波辐照致大鼠心肌细胞凋亡的重要途径之一。

关键词： X波段微波心肌损伤细胞凋亡 GSK3β

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降解DBP菌株CQ0302的分离鉴定及其降解特性

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中国环境科学 2005年第1期25卷 47-51页

作者：李俊舒为群陈济安邱志群第三军医大学环境卫生学教研室重庆400038

从垃圾填埋场的土壤中分离到一株降解邻苯二甲酸二丁酯(DBP)的细菌CQ0302.经过对其形态特征、生理生化以及16S rRNA序列分析,该菌株初步鉴定为深红红球菌(Rhodococcus ruber).该细菌利用DBP生长的最适温度为30.0～35.0℃,最适pH值为7.0... 详细信息

从垃圾填埋场的土壤中分离到一株降解邻苯二甲酸二丁酯(DBP)的细菌CQ0302.经过对其形态特征、生理生化以及16S rRNA序列分析,该菌株初步鉴定为深红红球菌(Rhodococcus ruber).该细菌利用DBP生长的最适温度为30.0～35.0℃,最适pH值为7.0～8.5. DBP浓度低于1500mg/L时的降解动力学方程为ln C=-0.02735t+A,半衰期为25.34h.菌株全细胞蛋白SDS-聚丙烯酰胺电泳结果显示,菌株在DBP诱导前后的全细胞蛋白组成有明显的差异.测定了降解途径中相关酶的活性,表明芳环的裂解是由邻苯二酚1,2-双加氧酶催化的.

关键词：邻苯二甲酸二丁酯生物降解深红红球菌

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长时程增强诱导和维持过程中海马CA1区神经细胞粘附分子蛋白水平与mRNA表达的变化

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生理学报 2004年第1期56卷 89-94页

作者：胡志安谭银玲罗峻黎海蒂李希成余争平第三军医大学生理教研室重庆400038 第三军医大学微生物教研室重庆400038 第三军医大学劳动卫生教研室重庆400038

既往研究发现,神经细胞粘附分子(neural cell adhesion molecules,NCAM)对海马CA1区突触传递长时程增强(longterm potentiation,LTP)的诱导和维持极为关键。本文采用原位杂交法和Western blot法,观察了大鼠海马腑片LTP诱导和维持过程中N... 详细信息

既往研究发现,神经细胞粘附分子(neural cell adhesion molecules,NCAM)对海马CA1区突触传递长时程增强(longterm potentiation,LTP)的诱导和维持极为关键。本文采用原位杂交法和Western blot法,观察了大鼠海马腑片LTP诱导和维持过程中NCAM mRNA和蛋白水平的动态变化过程。结果显示,强直刺激诱发fEPSP斜率升高10 min时,海马CA1区NCAM mRNA染色阳性神经元数量显著增加(76.6±11.5个),NCAM蛋白水平亦明显升高(7.190±0.64任意单位/50μg蛋白)。强直刺激诱发fEPSP斜率升高1 h时,NCAM mRNA染色阳性神经元数量为73.3±14.0个,NCAM蛋白量为9.031±0.71任意单位/50 μg蛋白;与强直刺激后10 min比较,NCAM mRNA表达无显著变化,而NCAM蛋白水平变化明显。NMDA受体特异阻断剂AP-5在损害LTP的同时,显著抑制NCAM mRNA和蛋白的增加。实验结果表明,在大鼠海马LTP诱导和维持过程中,NCAM mRNA增强的表达相对稳定,而NCAM蛋白水平呈现先低后高的变化。

关键词：长时程增强神经细胞粘附分子海马大鼠

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基于小波分析的肿瘤基因表达信号突变点检测

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计算机工程与应用 2010年第25期46卷 211-213,222页

作者：陈军伍亚舟易东第三军医大学卫生统计教研室重庆400038

对某肿瘤组织细胞基因表达信号进行突变点检测,分析可疑突变基因,为医学诊断提供参考。先去除原始基因表达信号的高频部分,再对低频进行小波分析,结合模极大值原理检测出各试验细胞所对应的突变基因点。小波变换能方便而有效地检测出信... 详细信息

对某肿瘤组织细胞基因表达信号进行突变点检测,分析可疑突变基因,为医学诊断提供参考。先去除原始基因表达信号的高频部分,再对低频进行小波分析,结合模极大值原理检测出各试验细胞所对应的突变基因点。小波变换能方便而有效地检测出信号的突变成分,它在对肿瘤基因表达信号奇异点进行检测和分析方面是有效的,结论具有一定的医学参考意义。

关键词：基因表达小波分析突变点模极大值

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