检索结果-内蒙古大学图书馆

生物技术 2012年第2期22卷 36-39页

作者：惠嫣婷刘若余张依裕贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025

目的:探究猪apoC3基因多态性,为进一步探讨其对脂肪沉积的影响和表达调控等研究提供依据。方法:选取具有不同脂肪沉积特点的3个猪种(可乐猪、贵州白香猪和大约克猪)构建品种DNA池并进行测序,结合各SNP位点测序峰高比值估算等位基因频率... 详细信息

目的:探究猪apoC3基因多态性,为进一步探讨其对脂肪沉积的影响和表达调控等研究提供依据。方法:选取具有不同脂肪沉积特点的3个猪种(可乐猪、贵州白香猪和大约克猪)构建品种DNA池并进行测序,结合各SNP位点测序峰高比值估算等位基因频率,并利用在线软件对不同基因型的转录结合位点及mRNA二级结构进行预测。结果:在3个猪种的apoC3基因中共发现17个SNPs(2个位于5’侧翼区;1个位于外显子3中,为同义突变;1个位于3’非翻译区,其它13个分别位于3个不同内含子中),其中C813G变异增加了一个转录因子GATA-2结合位点,G2280A变异导致mRNA二级结构最小自由能增加0.4kkal/mol。结论:不同猪种间apoC3基因SNPs位点等位基因频率差异较大,而apoC3基因编码区相对保守。

关键词： DNA池 apoC3基因脂肪沉积

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贵州地方猪脂肪特异蛋白27基因SNPs筛查与生物信息学分析

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中国畜牧兽医 2012年第7期39卷 83-86页

作者：惠嫣婷刘若余张依裕杨永强贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025

以3个贵州地方猪种(可乐猪、贵州白香猪、黔北黑猪)为试验素材构建品种DNA池,采用直接测序技术对猪脂肪特异蛋白27(fat-specific protein 27,Fsp27)基因的第4～5外显子区域进行SNPs快速筛查,共检测出4个SNPs位点:intron3-T2169C,exon4-G... 详细信息

以3个贵州地方猪种(可乐猪、贵州白香猪、黔北黑猪)为试验素材构建品种DNA池,采用直接测序技术对猪脂肪特异蛋白27(fat-specific protein 27,Fsp27)基因的第4～5外显子区域进行SNPs快速筛查,共检测出4个SNPs位点:intron3-T2169C,exon4-G5A,intron4-G21C和exon5-C5G,其中exon4-G5A和exon5-C5G使编码氨基酸发生Arg→Gln,Thr→Ser的改变。进一步的生物信息学分析显示,exon4-G5A位点的变异导致mRNA的二级结构改变,exon5-C5G多态位点使蛋白质的二级结构发生变化,且当exon4-G5A和exon5-C5G位点的碱基分别为A和G时蛋白质三级结构与其它3种碱基组合(G与G,G与C,A与C)的三级结构明显不同。

关键词： Fsp27基因 SNPs 生物信息学 DNA池

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黔北麻羊RERGL基因cDNA克隆与生物信息学分析

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湖北农业科学 2012年第15期51卷 3362-3365页

作者：蔡惠芬陈志罗卫星刘若余张依裕石照应贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025

选择与羊同源性较高的牛RERGL基因组序列设计特异性引物,提取黔北麻羊脾脏总RNA,通过RT-PCR技术对RERGL基因进行克隆测序及序列分析。结果表明,成功克隆了黔北麻羊RERGL基因,其cDNA序列646 bp,GenBank登录号JN 671919,编码205个氨基酸... 详细信息

选择与羊同源性较高的牛RERGL基因组序列设计特异性引物,提取黔北麻羊脾脏总RNA,通过RT-PCR技术对RERGL基因进行克隆测序及序列分析。结果表明,成功克隆了黔北麻羊RERGL基因,其cDNA序列646 bp,GenBank登录号JN 671919,编码205个氨基酸。生物信息学分析表明,黔北麻羊RERGL基因蛋白二级结构α-螺旋占40.68%,延伸链占16.18%,无规则卷曲占43.14%;没有跨膜螺旋结构域且没有糖基化位点。

关键词：黔北麻羊 RERGL基因克隆生物信息学分析

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利用DNA池对3个山羊品种CXCL10基因多态性的研究

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黑龙江畜牧兽医 2012年第1期 44-46页

作者：陈志李敬瑞刘若余张依裕罗卫星蔡惠芬贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵阳550025

为了研究3个山羊品种(黔北麻羊、内蒙古绒山羊、关东奶山羊)CXCL10基因多态性,试验采用构建DNA池并直接对其测序的方法进行分析。结果表明:快速筛查到2个与繁殖性能相关的单核苷酸多态性(T-131-C,G-661-A)。进一步利用测序图中的SNP等... 详细信息

为了研究3个山羊品种(黔北麻羊、内蒙古绒山羊、关东奶山羊)CXCL10基因多态性,试验采用构建DNA池并直接对其测序的方法进行分析。结果表明:快速筛查到2个与繁殖性能相关的单核苷酸多态性(T-131-C,G-661-A)。进一步利用测序图中的SNP等位基因峰高的比值估算各山羊品种等位基因的频率。

关键词： DNA池 CXCL10基因单核苷酸多态性(SNPs)

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牛CRP2基因SNPs筛查及生物信息学分析

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西南农业学报 2012年第5期25卷 1900-1903页

作者：杨永强龚俞焦仁刚惠嫣婷刘若余贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025 贵州省畜牧技术推广站贵州贵阳550001

为遗传效应分析及CRP2基因对牛生长调控的功能研究奠定基础,选取生长发育性状差异明显的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CRP2基因第6外显子序列和部分3’-UTR(总长724 bp),切胶回收后对PCR产物进行双向测... 详细信息

为遗传效应分析及CRP2基因对牛生长调控的功能研究奠定基础,选取生长发育性状差异明显的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CRP2基因第6外显子序列和部分3’-UTR(总长724 bp),切胶回收后对PCR产物进行双向测序,进行不同牛种CRP2基因SNPs筛查。结果表明:在CRP2基因有7个SNPs:T20G,C22G,T151C,T285A,T-157C,G-145A,G-85A,包括3个新的SNP位点(C22G,T-157C,G-85A)。CRP2基因第6外显子编码区有2个SNPs,包含1个错义突变(C22G,Gly→Ala)和1个同义突变(T20G);CRP2基因3’-UTR有2个SNPs(T151C和T285A);CRP2基因内含子区有3个SNPs,分别为T-157C、G-145A和G-85A。T20G、C22G和T151C位点等位基因频率在不同牛种间有较大差异。突变前后CRP2的RNA二级结构和蛋白质二级结构有明显改变,蛋白质三级结构无明显差异。

关键词： CRP2 DNA池务川黑牛贵州荷斯坦奶牛 SNPs

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不同牛种STAT5B基因启动子多态性分析

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生物技术 2012年第6期22卷 5-9页

作者：赵顺林杨永强龚俞焦仁刚惠嫣婷谢海强肖希希肖超能刘若余贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025 贵州省畜牧技术推广站贵州贵阳550001

目的:试验旨在筛选STAT5B基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果:STAT5B基因5'调控区及... 详细信息

目的:试验旨在筛选STAT5B基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果:STAT5B基因5'调控区及第1外显子存在3个SNPs位点,分别为:T-181C、C-31G、T+119C。生物信息学软件预测得到STAT5B基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNP位点导致5个转录因子结合位点消失,而产生8个新的转录因子结合位点。软件未发现可能的CpG岛范围,但STAT5B基因RNA二级结构和最小自由能在突变后显著改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,STAT5B启动子区存在功能性SNP位点。

关键词： STAT5B SNP 启动子贵州荷斯坦奶牛务川黑牛

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DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率

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生物技术 2012年第5期22卷 57-60页

作者：杨永强焦仁刚龚俞惠嫣婷刘若余贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025 贵州省畜牧技术推广站贵州贵阳550001

目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回... 详细信息

目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回收后对PCR产物进行双向测序。结果:在牛STAM1基因中快速筛查到5个SNPs:A33C、C66G、C356T、T523A、T652C,其中A33C(Tyr→Ser)、C66G(Pro→Arg)、C356T(Glu→Lys)为错义突变,T523A为同义突变,T652C位于内含子区。贵州荷斯坦奶牛在T523A和T652C两个位点基因频率为1.000 0,而务川黑牛分别为0.673 0和0.810 6。生物信息学分析表明:突变前后STAM1的RNA二级结构和蛋白质二级、三级结构均有明显改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,检测到STAM1基因第14外显子5个SNPs。

关键词： STAM1 DNA池务川黑牛贵州荷斯坦奶牛 SNPs JAK/STAT

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DNA池快速筛查牛SOCS2、SOCS3和CIS基因SNPs

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广东农业科学 2012年第13期39卷 149-151页

作者：杨永强焦仁刚龚俞惠嫣婷刘若余贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025 贵州省畜牧技术推广站贵州贵阳550001

选取务川黑牛为试验对象构建DNA池筛查SOCS2、SOCS3和CIS基因SNPs,结果首次在牛中发现CIS基因SNPs位点。在SOCS2基因中快速筛查到的3个SNPs均位于第4外显子内,其中G3456A(Glu→Lys)和G3810A(Val→Ile)为错义突变,T3599C为同义突变;在CI... 详细信息

选取务川黑牛为试验对象构建DNA池筛查SOCS2、SOCS3和CIS基因SNPs,结果首次在牛中发现CIS基因SNPs位点。在SOCS2基因中快速筛查到的3个SNPs均位于第4外显子内,其中G3456A(Glu→Lys)和G3810A(Val→Ile)为错义突变,T3599C为同义突变;在CIS基因中发现5个SNPs,其中A4086G(Val→Met)为错义突变,位于第3外显子处,其余4个SNPs(C4410T、G4560A、C4566T和G5251C)均位于3'-UTR序列。

关键词： DNA池务川黑牛 SOCS2 SOCS3 CIS JAK—STAT

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不同牛种CSN1S1基因启动子区SNP研究

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基因组学与应用生物学 2012年第6期31卷 549-553页

作者：杨永强龚俞焦仁刚惠嫣婷刘若余贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵阳550025 贵州省畜牧技术推广站贵阳550001

为研究牛CSN1S1基因启动子多态性,选择产奶性能差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CSN1S1基因5'调控区及第1外显子部分序列总长1035bp。结果表明:CSN1S1基因5'调控区存在3个新SNPs位... 详细信息

为研究牛CSN1S1基因启动子多态性,选择产奶性能差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CSN1S1基因5'调控区及第1外显子部分序列总长1035bp。结果表明:CSN1S1基因5'调控区存在3个新SNPs位点:G-531A、C-706T、T-761C,2个牛品种在各位点表现出不同多态性特征。生物信息学软件预测CSN1S1基因核心启动子区及转录因子结合位点,SNP位点造成核心启动子区2个重要转录因子结合位点消失,而产生3个新的转录因子结合位点。突变前后RNA二级结构有明显改变,目标序列未发现CpG岛。研究结果为进一步确定CSN1S1启动子功能奠定实验基础。

关键词： SN1S1 SNP 启动子贵州荷斯坦奶牛务川黑牛

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鸭CYP7A1基因编码区C129T突变对肉质和脂肪性状的遗传效应分析

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广东农业科学 2012年第24期39卷 158-160页

作者：李万贵张依裕潘兰兵杨廷吉杨福香徐育庆陈进贵州大学动物科学学院贵州贵阳550025 高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室贵州贵阳550025

采用PCR—SSCP法检测3个鸭群体CYP7A1基凶编码区87～246bp区域多态性．分析其多态性对肉质和脂肪性状的关联性。结果表明：金定鸭和兴义鸭群体中没有检测到多态性，全部为｜厂r基因型；樱桃谷鸭群体中检测到TT和TC2种基因型．TT基因型... 详细信息

采用PCR—SSCP法检测3个鸭群体CYP7A1基凶编码区87～246bp区域多态性．分析其多态性对肉质和脂肪性状的关联性。结果表明：金定鸭和兴义鸭群体中没有检测到多态性，全部为｜厂r基因型；樱桃谷鸭群体中检测到TT和TC2种基因型．TT基因型频率为0．8909，T等位基因频率为0．9454；序列比对发现，c．129C〉T沉默突变，表现为低度多态，处于Hardy—Weinberg平衡状态（P〉O．05），T-检验显示，TT基因型个体的肌内脂肪和血清总胆固醇显著低于TC基因型个体，其他指标在两个基因型问的差异均未达到鼹著水平。揭示等位基因C町能是脂肪沉积的有利等位基因，可作为提高肉鸭肌内脂肪的选择性标记。

关键词：鸭 CYP7A1 PCR-SSCP 遗传效应

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