检索结果-内蒙古大学图书馆

第三届全国质谱分析学术报告会

作者：杨皓迟浩曾文锋周文婧刘超贺思敏中国科学院智能信息处理重点实验室中国科学院计算技术研究所

基于质谱数据的蛋白质鉴定算法主要分为两类:数据库搜索和肽段从头测序。肽段从头测序方法不依赖于数据库信息,直接根据谱图中谱峰信息推断肽段序列。尽管该方法已经成为基于质谱数据的蛋白质鉴定的主流方法之一,目前仍然缺乏假发现率... 详细信息

基于质谱数据的蛋白质鉴定算法主要分为两类:数据库搜索和肽段从头测序。肽段从头测序方法不依赖于数据库信息,直接根据谱图中谱峰信息推断肽段序列。尽管该方法已经成为基于质谱数据的蛋白质鉴定的主流方法之一,目前仍然缺乏假发现率的质量控制手段。前人研究表明[1],从头测序方法得到的高分结果,其全长序列正确率不足70%。由于缺乏数据库信息,从头测序方法无法借助反库序列来模拟随机匹配,从而无法基于目标诱饵库的策略[2]来估计并控制FDR(false discoveryrate)。实际上,从头测序得到的结果往往存在部分氨基酸正确、部分错误的情况,所以我们进一步需要去估计氨基酸层次的假发现率(FAR, false amino-acid rate),FAR的概念是由本文第一次提出,其定义为超过某打分阈值的错误氨基酸数目除以所有氨基酸数目。本文提出了一种新的评估方法 p Site,可以估计从头测序结果中每个氨基酸的可信度,从而估计FAR。p Site针对待估计的氨基酸,将其领域氨基酸组成的序列标签进行全枚举,得到质量近似等于原始序列标签的背景序列标签,然后与剩余氨基酸连接得到背景肽段,计算原始肽段与打分最好的背景肽段间的打分分差作为特征,使用机器学习方法 SVM[3]对待估计氨基酸进行可信度的打分(如图1)。对于所有氨基酸的打分分布,使用两个Gamma分布去分别拟合正确、错误氨基酸的打分分布,并且使用EM算法[4]估计分布的参数,从而可以估计任意打分阈值之上的FAR。

关键词：质谱技术肽段从头测序假发现率(FDR) 氨基酸层次的假发现率(FAR) 机器学习

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面向限定领域问答系统的自然语言理解方法综述

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计算机科学 2017年第8期44卷 1-8,41页

作者：王东升王卫民王石符建辉诸峰江苏科技大学计算机科学与工程学院镇江212003 北京工业大学WIC研究院北京100022 中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室北京100190

领域无关的自然语言理解(NLU)技术在最近的十年中取得了长足的进步,然而由于基础研究与现实应用之间存在着强烈的实际需求与当前处理能力不足的矛盾,因此很多通用技术还不能在现实的问答系统中得到有效使用。针对现有的需求,开发面向领... 详细信息

领域无关的自然语言理解(NLU)技术在最近的十年中取得了长足的进步,然而由于基础研究与现实应用之间存在着强烈的实际需求与当前处理能力不足的矛盾,因此很多通用技术还不能在现实的问答系统中得到有效使用。针对现有的需求,开发面向领域的自然语言理解技术显得非常必要。首先对开放领域与限定领域问答系统进行了比较,并对一些典型的面向限定领域问答系统的自然语言理解技术进行了分析,然后介绍了面向限定领域问答系统的自然语言理解技术的评测标准,最后总结了目前限定领域问答系统研究存在的主要问题及未来发展方向。

关键词：限定领域问答系统自然语言理解评测

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基于非局部相似块低秩的压缩感知图像重建算法

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电子学报 2017年第3期45卷 695-703页

作者：宋云李雪玉沈燕飞杨高波长沙理工大学综合交通运输大数据智能处理湖南省重点实验室湖南长沙410114 长沙理工大学计算机与通信工程学院湖南长沙410114 湖南大学信息科学与工程学院湖南长沙410012 中国科学院计算技术研究所北京100190

传统的压缩感知重建算法利用信号在某个特征空间下的稀疏性构建目标优化函数,但没有充分考虑信号的局部特性和结构化属性,影响了算法的重建性能和算法的适应性.本文考虑图像的非局部自相似性(Nonlocal Self-Similarity,NLSS),提出一种... 详细信息

传统的压缩感知重建算法利用信号在某个特征空间下的稀疏性构建目标优化函数,但没有充分考虑信号的局部特性和结构化属性,影响了算法的重建性能和算法的适应性.本文考虑图像的非局部自相似性(Nonlocal Self-Similarity,NLSS),提出一种基于图像相似块低秩的压缩感知图像重建算法,将图像恢复问题转化为聚合的相似块矩阵秩最小问题.算法以最小压缩感知重建误差为约束构建优化模型,并采用加权核范数最小化算法(Weighed Nuclear Norm Minimization,WNNM)求解低秩优化问题,很好地挖掘了图像自身的信息和结构化稀疏特征,保护了图像的结构和纹理细节.多个测试图像、不同采样率下的实验证明了算法的有效性,特别是在低采率下对于纹理较为丰富的图像,提出的算法图像重建质量较明显的优于最新的同类算法.

关键词：压缩感知图像重建非局部自相似低秩优化

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面向大规模图像拷贝检测的一种目标级签名提取方法

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计算机辅助设计与图形学学报 2016年第9期28卷 1543-1549页

作者：王刚刘洋高科李锦涛中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室北京100190 国家计算机网络应急技术处理协调中心北京100029

针对传统的不变量提取方法耗时巨大、对图像背景和前景目标不加取舍、特征冗余多而且区分性差的问题,提出一种目标级签名提取方法——BLIP.首先提出一种快速的仿射不变局部特征检测与描述方法,将提取速度由秒级提升到毫秒级;然后采用改... 详细信息

针对传统的不变量提取方法耗时巨大、对图像背景和前景目标不加取舍、特征冗余多而且区分性差的问题,提出一种目标级签名提取方法——BLIP.首先提出一种快速的仿射不变局部特征检测与描述方法,将提取速度由秒级提升到毫秒级;然后采用改进的二进制化赋范梯度算法检测图像中的前景目标,并将目标区域内BLIP的空间上下文编码为二进制图像签名.实验结果表明,BLIP方法对网络中常见的拷贝攻击具有良好的鲁棒性,提取时间仅需8.9 ms,消耗的内存分别为尺度不变特征变换算法的0.17%,二进制鲁棒尺度不变关键点算法的2%.

关键词：目标级签名局部不变模式目标测量拷贝检测

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基于自然场景统计的无参考图像质量评价（英文）

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系统仿真学报 2016年第12期28卷 2903-2911页

作者：李海洋曹伟国李诗锐陶克路李华中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室北京100190 中国科学院大学北京100049

目前基于自然场景统计的无参考图像质量评价方法 BRISQUE算法(Blind/Referenceless Image Spatial Quality Evaluator)是这类算法的典型代表;但它仅在原始图像基础上做统计分析,且忽略了各特征间的差异性。由此提出了新的改进算法BRISQU... 详细信息

目前基于自然场景统计的无参考图像质量评价方法 BRISQUE算法(Blind/Referenceless Image Spatial Quality Evaluator)是这类算法的典型代表;但它仅在原始图像基础上做统计分析,且忽略了各特征间的差异性。由此提出了新的改进算法BRISQUEs,并通过三个步骤实现:将被测图像的梯度图做去均值对比归一化处理,在此基础上构造新的特征向量来评价图像质量;将BRISQUE中的关键特征进行适当加权,并对图像再次评价;平均上述两次评价来进一步降低算法的偏差。通过LIVE数据库上的实验,BRISQUEs的统计评价性能明显好于之前的无参考评价算法,也要优于多尺度结构相似度指标。

关键词：无参考质量评估自然场景统计梯度图关键特征

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视频检索中图像信息量度量

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通信学报 2016年第2期37卷 80-87页

作者：袁庆升张冬明靳国庆刘菲包秀国中国科学院信息工程研究所北京100193 国家计算机网络应急技术处理协调中心北京100029 中国科学院智能信息处理重点实验室北京100190 中国科学院计算技术研究所北京100190

综合考虑信息量度量的速度、性能要求,提出了相适应的显著图、多特征融合模型;基于区域划分融入空间关系,提出了分块信息熵的图像信息量度量方法(SEII);构建了信息量度量的标注数据集,并设计了性能验证方法。实验结果表明该度量方法符... 详细信息

综合考虑信息量度量的速度、性能要求,提出了相适应的显著图、多特征融合模型;基于区域划分融入空间关系,提出了分块信息熵的图像信息量度量方法(SEII);构建了信息量度量的标注数据集,并设计了性能验证方法。实验结果表明该度量方法符合人眼视觉的评价结果。度量方法在实际视频检索系统中进行对比应用测试,测试表明m AP提高4.4%,检索速度提高1.5倍。

关键词：视频检索关键帧选择图像信息量显著区域多特征融合

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基于Kinect v2的实时精确三维重建系统

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软件学报 2016年第10期27卷 2519-2529页

作者：李诗锐李琪李海洋侯沛宏曹伟国王向东李华中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室北京100190 中国科学院大学北京100190 国家体育总局体育科学研究所北京100061

快速、低成本、精确的三维扫描技术一直是计算机视觉领域研究的热点.首先,分析了新一代Kinect v2(Kinect for Windows v2 sensor)的技术参数、测量原理.设计实验测得其深度精度与测量距离呈线性变换关系.其次,Kinect v2深度数据含有大... 详细信息

快速、低成本、精确的三维扫描技术一直是计算机视觉领域研究的热点.首先,分析了新一代Kinect v2(Kinect for Windows v2 sensor)的技术参数、测量原理.设计实验测得其深度精度与测量距离呈线性变换关系.其次,Kinect v2深度数据含有大量的噪声,尤其是在物体边缘,常用的双边滤波器等去噪算法不能很好地去除这些噪声,对此设计了一种有效的去噪算法,以提高重建质量.最后,实现了一套基于新一代Kinect v2的重建系统.实验结果表明,该重建系统能够实时、精确地重建物体,可以广泛应用于低成本的快速三维成型.

关键词： ToF Kinect 三维重建点云去噪点云配准

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N-糖肽的规模化质谱解析方法进展

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生物化学与生物物理进展 2016年第6期43卷 550-562页

作者：曾文锋张扬刘铭琪吴建强张晓今杨皓刘超迟浩张昆孙瑞祥杨芃原贺思敏中国科学院智能信息处理重点实验室中国科学院计算技术研究所北京100190 中国科学院大学北京100049 复旦大学生物医学研究院上海200032

蛋白质糖基化修饰的鉴定是蛋白质翻译后修饰分析中最具挑战性的任务之一,近几年尤其受到关注.快速发展的质谱技术为规模化的蛋白质糖基化修饰研究提供了有效的手段.与其他基于质谱技术的翻译后修饰鉴定相比,糖基化鉴定的难点在于糖链是... 详细信息

蛋白质糖基化修饰的鉴定是蛋白质翻译后修饰分析中最具挑战性的任务之一,近几年尤其受到关注.快速发展的质谱技术为规模化的蛋白质糖基化修饰研究提供了有效的手段.与其他基于质谱技术的翻译后修饰鉴定相比,糖基化鉴定的难点在于糖链是大分子而且存在微观不均一性,另外糖链本身可以在串联质谱中碎裂且与肽段的碎裂规律不同,导致蛋白质组学的质谱解析方法和软件难以完整地鉴定肽段序列和糖链结构.完整N-糖肽的鉴定是糖基化分析的热点内容之一,针对N-糖肽的鉴定,近年来,人们开发了多种多样的质谱解析方法,其中包括用N-糖酰胺酶切除糖链后鉴定N-糖基化位点的方法、基于电子转运裂解的糖肽肽段鉴定、基于高能碰撞裂解与电子转运裂解联用或碰撞诱导裂解与三级谱联用的完整N-糖肽鉴定等等.本文对这些质谱解析方法进行了整理和综述,简要指出了目前完整糖肽鉴定软件存在的一些不足,展望了未来的发展方向.

关键词：糖蛋白质组学糖肽糖基化质谱

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复杂系统风险评估专家系统

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清华大学学报（自然科学版） 2016年第1期56卷 66-76,82页

作者：马刚杜宇鸽杨熙张博史忠植中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室北京100190 中国科学院大学计算机应用技术系北京100049 中国信息安全测评中心北京100085

为了评估复杂系统的安全风险,基于已有的风险评估算法,在结合面向对象知识处理系统的基础上,设计研发一套简捷、使用方便的基于知识的复杂系统风险评估专家系统。对典型复杂系统进行风险评估的结果证明:该系统能够用于现场收集复杂系统... 详细信息

为了评估复杂系统的安全风险,基于已有的风险评估算法,在结合面向对象知识处理系统的基础上,设计研发一套简捷、使用方便的基于知识的复杂系统风险评估专家系统。对典型复杂系统进行风险评估的结果证明:该系统能够用于现场收集复杂系统数据并且对复杂系统的整体风险进行自动评估,能够指导风险评估分析员对复杂系统中的资产结点制定出合理的安全保护策略,比传统的专家人工分析具有更强的客观性与准确性。

关键词：面向对象知识处理系统风险评估专家系统资产

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结合距离变换和隐层图词包的手绘图像检索方法

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计算机辅助设计与图形学学报 2016年第12期28卷 2168-2174页

作者：刘玉杰庞芸萍路子奇李宗民李华中国石油大学(华东)计算机与通信工程学院青岛266580 中国科学院计算技术研究所智能信息处理重点实验室北京100190

随着触屏设备的广泛普及,基于手绘的图像检索技术受到了越来越多的关注.针对HOG,SIFT,RST-HELO等传统图像描述子在基于手绘图像检索领域的局限性,提出一种基于卷积神经网络构建隐层图词包特征描述子的手绘图像检索方法.首先对数据库图... 详细信息

随着触屏设备的广泛普及,基于手绘的图像检索技术受到了越来越多的关注.针对HOG,SIFT,RST-HELO等传统图像描述子在基于手绘图像检索领域的局限性,提出一种基于卷积神经网络构建隐层图词包特征描述子的手绘图像检索方法.首先对数据库图像提取边缘概率图;其次在边缘概率图上计算Chamfer距离变换图像,通过对距离变换图像提取隐层图词包特征构建预分类检索.在Flickr15K数据集上对文中方法进行了实验,证明基于隐层图词包特征描述子的检索效果比RST-HELO等传统方法有了显著提高;从图像预处理和特征描述子两方面对SBIR进行了改进,实验结果表明,文中方法具有更高的准确率.

关键词：手绘检索卷积神经网络边缘概率检测 Chamfer距离变换隐层图词包

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